Protein

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Genbank accession
QOQ37625.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,58
Protein sequence
MRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTAQTIELQLPTDISIGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNNSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLTGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATRSETVAGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTAGSTQDLELYEKNNYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVRVWGNQFSSESDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGSSVTANGEFISKSSNAFRAINGDYGFFIRNDGANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLSINNASGQVTIGESLIIAKGATISSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGAIPSDNGIIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1074 AA
molecular weight: 116556,38100 Da
isoelectric point:5,45679
aromaticity:0,07076
hydropathy:-0,35754

Domains

Domains [InterPro]
DC_1209
STR
127–856
DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
761–877
IPR048390
DC_1209
STR
784–1058
DC_1209
QOQ37625.1
1 1074
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 127-760 | ATT 761-877 | STR 878-923 | ATT 924-1022 | STR 1023-1058 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_WL-3
[NCBI] 		2776769 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QOQ37625.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT968995.1 [NCBI]
CDS location
range 147349 -> 150573
strand +
CDS
GTGCGTAGATTTACTTCCGCTGCGCCGATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAATTAAATCCACTTTATCATACAATTGTCACAACATATGATGAAACAACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCTATTGAAGGCCGTACATCAATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAAAAATTATGGAGACTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACAACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGCGCGAATAACGGAACAGCCCAAACAATTGAACTTCAACTTCCAACCGATATTTCCATTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCACCACCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTCCAAGAATTAGTTTTCAATGGTGAAACTAATTATGTTCCGGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTTGTACAACAAAACGTTCCAACGGTTGAAAGAGTCGATTCTTTAAATAATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATAGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTAGCAATTACACCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCTGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTAGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATACAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGACAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACCTTTGTATCTACTGCGGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGCGAATTAAATGGTACAAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAGATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGCGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAAAGCAACTGAAAGTTTAACTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTGTCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTGGATAATGTTCTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCGCAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCGGTCTGAAACTGTAGCTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACCTCATCCGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGCTGGTTCTACGCAGGACTTAGAACTATATGAGAAAAATAACTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGCGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTTTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCGCAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACACAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGATCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTTATTTTTGAAAAAGGGCCTCAAACTGGGACGAACCCAGCTCAAACGATGACAGTCAGAGTGTGGGGAAATCAATTCAGCAGTGAATCGGACACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACGTCTAGTCACTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCTGGTAATATAACATTTAATATCAATGGTACAGTAACACCGATAAATGTGAATGCTTCAGGAACATTGAATGCGAATGGCGTTGCAACATTCGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTTATCAGTAAATCGTCGAATGCTTTTAGAGCAATAAATGGTGATTATGGATTCTTTATTCGTAATGATGGTGCTAACACCTATTTTATGCTTACTGCATCTGGTGATCAGACCGGTGGATTTAATGGATTACGTCCTTTATCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAGTTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACCTCTGATTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCCGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACTACCCCAGAAGCGCGCACCACTCGCTGGACACGCACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGGGGTAACCCTCCTCAACCTTCGGATATAGGAGCGATCCCATCTGATAACGGAATAATAGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTGCGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
902820d58d3ba335df02c0cb9ea701e79c4ee4b87ab60e141ab6f556d9688e75
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5728
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Bacteriophage-antibiotic combinations against ciprofloxacin/ceftriaxone-resistant Escherichia coli in vitro and in an experimental Galleria mellonella model Wang,L., Tkhilaishvili,T., Bernal Andres,B., Trampuz,A. and Gonzalez Moreno,M. — — GenBank