Protein
View in Explore- Genbank accession
- XZS48072.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTSPTF
- Protein sequence
-
MADQNLKQIQFKRSSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDENDTVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTVSPNKSISFETTDLSGEITRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNSGILEIGTIDDGAETIQFVQRGPGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLSSNKAIKIYSGSTLALEMGVGSNDVYIKNQRGVGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMTGKGPGKDGTLLTNVENERQLKQDNFPVTTGGEVRWTKVALLKDPGLSQSRLQLMVTNGGNYGNTRSSIDFIDCSARSFPTSLTSSNIRTYLQVRRLGDPALDETNQLRYSLVRTSEGLELWFTQRAFIGGVKVALLSIAGGTEYYLPTGYTVSSTEPEGLVESTAIRIYDELNKPNVDGGTEGVLPINRGGTGGTSAAAARSNLGLGTAAIRDVGESSGNLLEVGAFGIGGNGRSLVDITSDVDLMTRLKALGGTVFRANTASGYTGAPYYSHGTGFYGRASDTMAALNIDYATGNVRVFAINDSGLASGRVNSNVLYGTANKPSKADVGLGNLTNDAQVKKAGDTMSGDLLISKESPGLFLNATNDTGNSVIWFRNKGVETGAVWAIPNTESSGEVRIRARTTAGVTGGEFKFKSDGTFTSPGSIDITNGAFNGKTVNTEYANFNNTSSTTTEQTVSISGSQHTPLLLDRPTNANLSIGFKLSGMNMKRLGIDINGDIRYGEAENQANNAWLLTSDTVNRWIVNFGRDIKVAGVVNSTGGFAGPVAAYDLADAKLDLNDLTLTGAAPGHVKVYSCPSMGGGSNITNKPSGVGGNFIVIVECIRKINDTDYTNRQVLRTSDSKRSWERWLTVSGTSKIWTPWRMIVVSGIDSDVSFNSVTTTTGNLNSGNDLIVANNARVGGNLGLGGASSTKYADKGVVIGQGSALLETTDGRVIVGSSGGGNAVELRPGGPTQTNNLVKVTATSGSGGDTAIEYAQGAKIRANNGGALIISSKQGQTIYLRPQGDANGGNEVRIDSNTMVVTGGFEAQNTKIAGNLNVSEDNRMIVLGRNTDIGLVKKSNMPGKMAIGKSNSFTVMVSTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNAQINRQLTVTSNTNLNSVLIVQGNTTLNTDLSVKGNSSFTGVINADGNINVASGKFVIAGQAPTDNSHLTNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGTLIVTGNQLKTTSLWTTGDAAVNGVLTVDGRARFNQEFIVSTSVNVQNTGNSHLVFRKADGTEKGLIWADEPGSVSIRAGGISGKTWNFWNSGSCQFPGAISNFNGISSTTNYPAGQPNGTYSNTAGLVTRFSNGAYASLYFQEYVGHYHQAILNVNGFGRDDNFYFRSGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDNEEDGGMLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1504 AA molecular weight: 158845,47310 Da isoelectric point: 5,86802 aromaticity: 0,06649 hydropathy: -0,29122
Domains
Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–604
ATT
4–604
DC_1159
STR
439–1054
STR
439–1054
IPR030392
CHP
1404–1459
CHP
1404–1459
1
1504
Architecture
ATT 4-604 | STR 605-1054 | RBD 1090-1504
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1504
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 732 | 732 | 0,1971 |
| Central domain | 733 | 948 | 217 | 0,4115 |
| C-terminal | 949 | 1504 | 555 | 0,7379 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 520 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 520 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-732
1-732
Central
733-948
733-948
C-terminal
949-1504
949-1504
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage Kp2Bj_LN294_M23 [NCBI] |
3448945 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Klebsiella sp. [NCBI] |
576 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XZS48072.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV784031.1
[NCBI]
CDS location
range 67898 -> 72412
strand -
strand -
CDS
ATGGCCGATCAGAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAGTACAGAGAATAAAGCACCTGGTGCCGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCATTGAATACCCATGGGCGTACTCTTGCCATTTATACTAAAGATGAAAATGATACCGTAGTACAGCTCGCCGGTAAAGGGGTTCCATTTTTAGATACCTCTGGTACTCTTAGTGTTGATGGAACCACTACATTAAAAGACAACGTAACAGTTTCTCCGAATAAATCGATCAGTTTTGAAACTACTGATTTAAGCGGTGAAATAACTCGTCATATCGTTGGCAAATGCGCCACTAATGACGGTTGGTATATCGGCGCCGGTGGTACAAGCAATAGCGGTATTCTTGAAATCGGTACTATTGATGACGGCGCTGAAACTATTCAATTCGTACAACGCGGCCCGGGCAACGTTGAAGCCCGAAAACTGGTCTTACTTGATGGTTCGGGTAATACTACTCTTCCGGGTGATTTAAGATTATCTAGCAATAAAGCCATTAAAATTTACAGTGGAAGCACTCTTGCTCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTCTATATTAAAAACCAACGAGGCGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAATGATAGCAATCTGACCTTCAGAAATTCCCAGGTTTATTATGCCATGACTGGAAAAGGTCCTGGTAAAGATGGTACTCTTCTGACTAATGTAGAAAACGAGCGCCAACTTAAGCAGGATAATTTCCCTGTAACGACCGGCGGCGAAGTTAGATGGACCAAAGTTGCCCTTTTAAAAGACCCGGGGTTAAGCCAGAGTCGCTTGCAACTGATGGTGACTAATGGCGGTAACTACGGTAACACTCGCAGTTCTATTGACTTTATTGATTGCAGCGCTAGAAGCTTTCCAACCTCGTTAACAAGCAGTAACATTCGTACTTATCTGCAGGTCCGTCGACTTGGTGATCCGGCACTTGATGAGACCAATCAATTGCGTTATAGTCTAGTTCGTACCTCTGAAGGTTTAGAACTGTGGTTTACGCAGCGCGCATTTATCGGTGGAGTTAAAGTTGCACTGTTATCTATTGCCGGTGGTACTGAATACTATTTGCCTACTGGTTACACAGTTTCTTCAACAGAGCCGGAAGGTTTAGTTGAGAGTACGGCTATTCGTATCTACGACGAATTGAACAAGCCTAATGTTGATGGTGGCACTGAGGGTGTTCTGCCTATTAACCGTGGCGGTACTGGTGGTACTTCTGCAGCGGCAGCCCGTAGTAACTTAGGCCTTGGAACTGCGGCTATCCGTGATGTTGGTGAATCTAGCGGAAACTTGTTGGAAGTTGGTGCCTTTGGTATTGGCGGTAACGGAAGATCACTAGTAGATATTACTTCTGACGTTGATTTAATGACTCGCCTTAAGGCTCTTGGTGGTACAGTGTTCAGAGCTAACACAGCGAGTGGTTATACAGGGGCTCCTTATTACTCCCATGGCACCGGATTTTACGGAAGAGCTTCTGACACAATGGCTGCGCTTAATATAGATTATGCAACCGGTAATGTCAGAGTATTTGCTATAAACGATAGTGGTTTAGCAAGTGGAAGAGTAAATTCTAATGTTCTCTACGGCACAGCAAATAAGCCATCTAAGGCCGATGTCGGACTTGGTAATCTGACAAATGACGCCCAGGTTAAAAAAGCTGGTGATACAATGTCTGGTGATTTGCTTATCAGTAAAGAGTCACCTGGGTTGTTTTTGAATGCCACTAATGATACCGGAAACTCTGTAATTTGGTTTAGAAACAAAGGAGTTGAGACAGGTGCTGTATGGGCAATACCTAACACCGAGTCTTCGGGTGAGGTTCGAATTCGTGCTAGAACGACTGCTGGGGTCACAGGCGGCGAGTTCAAATTTAAATCTGACGGTACGTTTACATCTCCAGGTAGTATTGATATTACTAATGGTGCCTTTAATGGTAAAACGGTTAATACCGAATATGCCAACTTTAATAACACAAGTTCAACCACAACCGAACAAACAGTTTCTATTAGTGGTTCACAGCACACTCCTCTGTTACTGGATAGACCGACTAACGCGAACTTGTCTATCGGGTTTAAACTTTCCGGAATGAACATGAAACGTTTGGGTATTGATATAAACGGTGATATTCGTTACGGTGAAGCAGAAAACCAGGCAAACAACGCATGGCTGTTGACTTCGGATACAGTAAACAGATGGATTGTTAACTTTGGTCGTGATATTAAAGTTGCTGGTGTGGTTAATTCGACTGGTGGATTTGCTGGCCCTGTTGCAGCGTACGATTTGGCTGATGCTAAACTAGATCTTAATGATTTAACGCTAACTGGTGCTGCCCCAGGCCATGTTAAAGTTTATTCATGCCCTAGTATGGGTGGCGGTAGTAACATCACCAATAAACCTTCTGGCGTCGGTGGTAACTTTATTGTTATTGTTGAATGTATCCGTAAAATAAACGATACCGATTACACTAACCGCCAAGTATTACGCACATCTGATAGTAAGCGCAGTTGGGAACGTTGGTTAACTGTTAGCGGTACTTCTAAAATCTGGACGCCGTGGAGAATGATCGTTGTTAGCGGAATCGACTCCGATGTATCATTTAACTCTGTTACCACGACTACAGGAAACCTGAACAGCGGAAATGATTTGATTGTTGCTAACAACGCTCGCGTAGGTGGTAACTTAGGGTTAGGTGGTGCTTCTTCAACGAAATACGCTGATAAAGGTGTTGTGATTGGCCAAGGTAGTGCTCTGTTAGAAACTACTGATGGTCGTGTTATCGTTGGTAGTTCTGGTGGTGGTAATGCTGTTGAATTGCGTCCTGGTGGCCCAACTCAAACCAACAACCTGGTCAAAGTAACTGCTACATCTGGAAGTGGTGGTGACACTGCTATCGAGTATGCACAAGGCGCTAAAATTCGGGCTAATAACGGCGGCGCATTAATTATTTCTTCTAAACAAGGCCAAACAATCTATCTGAGACCGCAAGGTGATGCAAACGGTGGAAATGAAGTTCGTATTGATTCAAACACTATGGTCGTCACAGGCGGATTTGAGGCTCAGAACACTAAAATCGCAGGTAATTTAAATGTATCTGAAGATAATAGAATGATTGTTCTTGGCAGAAATACCGATATCGGTTTAGTCAAGAAAAGTAATATGCCAGGAAAAATGGCTATCGGTAAATCTAACTCGTTTACTGTTATGGTATCAACCAATACCAACAACCAAATTAATCCTGCGGATACGTTTAATGATATATTCAAGGTAGATGCTGACGGAAACCAAACCGTTTACGGAAATGCCCAAATTAACAGACAGCTTACAGTAACAAGTAATACTAACTTGAACTCTGTTCTTATTGTTCAAGGTAATACTACTCTTAATACTGATTTGTCTGTTAAAGGCAACTCCAGCTTCACCGGTGTGATTAACGCTGATGGAAACATCAACGTCGCTTCTGGTAAGTTTGTTATTGCGGGTCAAGCTCCTACTGATAACTCGCATCTGACCAACAAAAAATACGTTGACGATAAAGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGTGATACTTATCTTCCGTTAGCGGGTGGTACTGTGACTGGTACATTAATAGTTACAGGTAATCAACTGAAAACTACTTCTCTGTGGACTACCGGAGACGCTGCAGTTAATGGTGTTTTAACTGTTGATGGAAGGGCTAGATTTAATCAAGAGTTCATTGTATCAACTTCAGTTAACGTCCAGAACACCGGTAACAGTCATTTAGTCTTCCGTAAAGCAGATGGTACGGAAAAAGGCCTTATTTGGGCTGATGAGCCTGGTAGCGTTAGTATAAGAGCTGGTGGTATCTCAGGGAAGACGTGGAATTTCTGGAACAGCGGTTCTTGTCAATTCCCAGGTGCTATTAGTAACTTTAACGGAATTAGCTCAACTACTAATTATCCCGCAGGACAGCCTAACGGTACGTACAGTAATACCGCAGGATTGGTAACTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCTTCGTTATATTTCCAAGAGTATGTAGGACATTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAACGGATTTGGTCGAGATGACAATTTCTATTTCAGATCCGGTGGTGACTTCTTCTGTACTCGTAATGGTTCTTTCGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCAGATATTAAAGTTATTGAAAATGCTTTGGAAAAAGTAGAAACCTTATCTGGTAATACTTATGAGCTTCACAATACATCTGGCGGTACTACCCGTTCTGCTGGTTTAATCGCACAAGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCTGAAGCAGTTACTCAGGATAATGAAGAAGATGGTGGTATGCTTCGTCTGAATTATAACTCAGTAATTGCTCTTCTTGTTGAATCAGTGAAAGAACTTTCAGCTGAGGTCAAAGGTCTTAAAGCCGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
1800c57bcd3598b91bbf94ac5cb1af8e58d757b5916a1ee9493f139d85aa95f1
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50