Protein

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Genbank accession
YP_009599721.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDVSGNQTISKDLLVKGSAVITNNLTVGGTINFANATFTQITVTGTANLADVNSTGTAALNNVQVSGNTTLGDSDADSVTVNGTSTFNAPITAKSNVSIEGNTVVGNASTDTLTVNATSTFAAPATFNNNVTVGDAAADALTVNSTSTFKNNVTVGEDATDTLTINSTTNLKNNVTVGEDSTDNLVVNSTSDFKNNVTLGDASTDVLTVNATSNFNNNVVIGSDSADNLTINSTTQITGDVLITGETELEGLTVYGASNFLSNLSMPTGTTATFQDVVINGTLSGDYTIANGNFTTLTVTGQSNLNSVILSGNVTGTTRSATFQTYNVAGASGVVQFTYNDPARPSDIKSSIEPYKVSSNEFQGQKATVGHVIFGDVTYADYGLTALGKASIDYLDIKGNSTTGTTRAQLTVAGKSVLNDVEFTGSVTGLTVDVTGQDITPNSVVADAMVQGAQVKSTGQLTGESLQINGISTFQGDGSFNETLQVKDLVVTGTTTGVTAEANVDGLDIAPKSVNATTSIKGATVESTGSLTVNGSITSTNTNVAIGKNTVISGTLNSGSISSTGDVSATGNFLGAGASLTGPNTALAVTNNAVIGGRLTVDGNTSFGGSTGTTTIHDLVVTGTTTGVAVVADVDGLDIAPNKVTVTTTLGVTGQSTLGAVSASTLSTSGLATLASATVTGVATAGSLVTSSIGNSTNAVNFTSPVTTSGNLTVGGTLILAGGLDLSDVDIEAKSIHTTEQATFDGDVIVGGQISLSSASVAALTFTATDNVNTNTLPVLQSVTATINTADITTLNATGTSTLATASIGTLTGTGTATFAAATVTGAATFNGNITSTNATVAIAKNTAITGNLSVSGTLTPGAVDLSTADVTVKSLTSSGNAHVVGDLTVDGAFDLSATNLVAATLESTGKTTVGADLILTTGVITGAPKISGNTTIAGTLGVTGNTSVSTLSTSGVATLNSAAVTTTLGVSGATTLSTLTTNGLATLNSATVSGALIANGNITLGNASSDTLTVNATSTFAGDVTVNGSFTPAGGLNLGSAALNVASVTTTGAISVGTTLGVTGITTLAAVNSGNHAITGTLSTSGLATLNSASITTTLGVTGNSTMTGTLTVNGSGTSKIQALQVGTGTADTDKVLNVFGDTIITGDLDVTGIINAQIDLTSRDISPRNVTASGNISSAGSLTAATSLTAATAIIGAPSSTNNNLQVNGNVVTNGDFTVTGVINGTLNQTNSDVTFKSVTTSAGVTVGTTLGVTGLSTLAGLNAGNTAITGTLSTSGLAILNSASITTTLGVTGATTLAATSATTLSTSGLATLNSATITGALTANGNTVIGDAAADTLTVNATSNFIGDTTVKNITITGTLTADLSNLTTTSFKTGTYFVAQHAAETVSTATWTPDGTSNVYNVNVTANTSIQPITGVNGAGSWFIYVTQDATGGHTVTWDTAYAIIGGEVNTDPNAVSICQVVYCGIGSKYDVFIAQRP
Physico‐chemical
properties
protein length:1490 AA
molecular weight: 147082,76260 Da
isoelectric point:4,07930
aromaticity:0,03624
hydropathy:0,21691

Domains

Domains [InterPro]
DC_0092
STR
179–487
DC_0092 DC_0092 DC_0931
IPR058970
RBD
1403–1479
IPR058970
YP_009599721.1
1 1490
Architecture
STR
STR
RBD
STR 179-487 | STR 779-985 | RBD 1118-1490
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Serratia phage BF
[NCBI] 		1962671 Uroviricota > Caudoviricetes > Eneladusvirus >
Host Serratia marcescens
[NCBI] 		615 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009599721.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_041917.1 [NCBI]
CDS location
range 134335 -> 138807
strand -
CDS
ATGTATTCTATAAAAACGGATCTTGACGTATCTGGTAATCAAACGATTTCTAAAGATCTTTTGGTTAAAGGTAGTGCAGTCATTACAAATAATCTTACTGTAGGTGGTACGATTAATTTTGCTAATGCTACATTTACACAGATTACAGTCACAGGTACTGCTAATCTAGCTGATGTTAACTCTACTGGTACTGCTGCATTGAACAATGTTCAAGTTTCTGGTAACACAACTCTTGGTGATTCCGACGCCGATTCTGTTACTGTAAATGGAACATCAACATTTAATGCTCCAATTACTGCAAAAAGTAATGTATCAATTGAAGGAAACACAGTAGTAGGTAATGCTAGTACTGACACATTAACTGTCAATGCAACTTCAACATTTGCTGCACCAGCTACATTCAATAATAATGTAACTGTGGGTGACGCTGCTGCTGACGCATTAACCGTTAACTCTACTTCTACATTTAAAAATAATGTAACAGTTGGTGAAGATGCTACTGATACACTAACAATTAATTCAACAACTAACTTAAAAAATAACGTTACCGTTGGTGAAGATTCTACTGATAATCTAGTTGTTAATTCAACTTCAGATTTCAAAAATAACGTTACTTTAGGTGACGCTAGTACTGATGTTCTAACTGTAAATGCTACATCCAATTTTAATAACAATGTAGTAATTGGGTCAGACAGTGCTGATAATTTAACAATAAATTCAACGACTCAAATTACTGGAGATGTTCTAATAACGGGCGAAACTGAACTTGAAGGTTTAACTGTTTATGGAGCTTCTAATTTCCTTAGTAATCTTTCAATGCCTACTGGTACAACTGCAACTTTCCAAGATGTAGTTATTAATGGTACTTTAAGTGGTGATTATACTATTGCAAATGGCAATTTTACAACCTTAACAGTAACTGGTCAAAGTAATCTAAACAGTGTTATTCTCAGTGGTAACGTAACTGGTACAACTCGTTCTGCTACTTTCCAAACTTATAATGTTGCAGGTGCTTCTGGTGTTGTTCAATTTACATATAATGACCCAGCACGTCCATCAGATATTAAATCAAGTATTGAACCTTATAAAGTAAGTTCTAACGAATTCCAAGGTCAAAAAGCTACTGTAGGTCACGTAATTTTTGGTGATGTTACATATGCTGACTATGGTCTAACTGCACTTGGTAAAGCAAGTATTGATTATCTTGATATTAAAGGTAACAGCACTACTGGCACAACTCGTGCACAACTTACCGTTGCAGGAAAATCAGTACTTAATGATGTTGAGTTTACTGGTTCAGTGACTGGTTTAACAGTTGATGTAACTGGTCAAGATATTACACCAAACTCTGTAGTTGCCGATGCAATGGTGCAAGGTGCACAAGTAAAATCAACTGGTCAACTTACTGGTGAAAGTTTACAAATTAATGGAATTTCAACATTCCAAGGTGATGGTAGTTTCAACGAAACTTTACAAGTAAAAGATTTAGTAGTAACTGGTACAACAACTGGTGTAACGGCTGAAGCAAATGTTGATGGTTTAGATATTGCTCCAAAATCTGTAAATGCAACAACATCAATTAAGGGTGCTACCGTAGAAAGTACTGGTTCTCTAACTGTAAACGGATCTATCACTTCTACTAACACAAATGTTGCAATTGGTAAAAATACCGTAATTAGTGGAACACTAAACTCTGGTTCTATATCTTCTACTGGTGATGTTAGTGCGACAGGTAATTTCTTAGGTGCTGGAGCATCATTAACTGGTCCAAATACTGCATTAGCAGTAACAAATAACGCAGTTATTGGTGGACGATTAACCGTTGATGGTAATACTTCATTCGGTGGAAGCACAGGAACAACAACTATTCACGATCTTGTAGTAACTGGTACAACAACTGGCGTTGCTGTAGTTGCTGATGTGGATGGTTTAGATATTGCTCCTAATAAAGTTACAGTTACAACCACTTTAGGCGTAACTGGTCAAAGTACATTAGGTGCTGTTTCCGCTTCTACATTAAGTACTTCTGGATTAGCAACATTAGCATCTGCAACCGTAACTGGTGTAGCTACTGCGGGTTCTTTAGTAACTTCAAGTATCGGAAATAGTACTAATGCAGTAAACTTTACTTCTCCAGTAACTACCTCTGGTAATTTAACAGTTGGTGGAACATTAATTCTTGCTGGTGGTTTAGATCTATCAGATGTAGATATTGAAGCTAAATCTATTCATACTACGGAACAAGCAACTTTTGATGGTGACGTAATTGTTGGTGGACAAATTAGTTTAAGTTCAGCTAGTGTTGCGGCTCTTACATTCACAGCTACTGATAATGTTAATACAAACACATTACCAGTATTGCAAAGTGTTACTGCAACAATCAATACTGCTGATATAACTACATTAAATGCTACTGGTACAAGTACTCTTGCAACTGCTAGTATCGGTACACTAACTGGAACCGGTACAGCGACTTTCGCTGCTGCAACAGTAACTGGTGCTGCAACATTTAACGGAAATATTACTTCAACGAATGCAACTGTAGCAATCGCTAAGAATACTGCAATTACTGGTAACTTATCAGTATCTGGTACTCTAACCCCTGGTGCGGTAGATTTAAGTACTGCTGATGTAACTGTTAAATCATTAACATCTTCTGGTAATGCTCATGTTGTTGGTGACCTAACTGTTGATGGTGCATTTGATTTAAGTGCAACAAATCTAGTAGCTGCAACATTAGAAAGTACTGGTAAAACTACCGTTGGTGCAGATTTAATTCTAACTACTGGTGTTATCACAGGTGCTCCAAAAATCTCTGGAAATACAACAATTGCCGGAACATTAGGTGTAACTGGAAATACTTCTGTAAGTACTCTAAGTACTTCTGGTGTAGCTACTTTAAATAGTGCTGCGGTAACTACAACTTTAGGTGTATCTGGAGCAACAACTCTAAGTACTTTAACTACTAATGGGTTAGCTACTTTAAATAGTGCTACTGTATCTGGTGCATTAATTGCAAATGGTAATATTACTCTAGGTAATGCAAGCTCTGATACTTTAACTGTTAATGCTACAAGTACTTTTGCTGGAGATGTAACTGTTAATGGTTCATTCACCCCTGCTGGTGGATTAAACTTAGGTTCTGCTGCGTTGAATGTTGCTTCAGTAACCACAACTGGTGCAATTTCTGTAGGAACTACTTTAGGTGTAACTGGTATTACAACACTTGCTGCTGTAAATTCTGGTAACCATGCAATCACTGGTACTCTAAGTACTTCTGGTCTAGCTACATTGAATAGTGCCTCTATTACAACTACTTTAGGTGTAACTGGTAATAGTACAATGACTGGTACTCTAACTGTTAATGGATCTGGTACTTCTAAGATTCAAGCATTACAAGTTGGTACTGGTACTGCTGATACTGATAAAGTTCTAAATGTATTTGGTGATACAATCATCACTGGTGATTTAGATGTAACTGGTATTATAAACGCACAGATTGACTTAACATCACGTGATATTTCACCACGTAACGTAACTGCTTCAGGAAATATTAGTTCTGCTGGTTCATTGACCGCTGCAACTTCTCTAACTGCTGCAACAGCAATCATTGGTGCACCATCAAGTACAAATAACAACCTACAAGTTAACGGTAACGTAGTAACTAATGGTGACTTTACAGTAACTGGTGTAATTAATGGTACATTGAATCAAACCAATTCTGATGTAACTTTTAAATCAGTAACTACATCTGCTGGTGTAACAGTAGGAACTACATTAGGTGTAACTGGTTTAAGTACATTAGCTGGATTGAATGCTGGAAATACTGCAATTACTGGTACTCTAAGTACTTCAGGATTAGCAATACTAAACAGTGCTTCAATCACCACTACATTAGGTGTAACTGGTGCAACTACATTAGCTGCAACATCTGCAACCACTTTGAGTACTTCTGGTCTAGCTACATTGAATAGTGCTACAATTACTGGTGCATTAACCGCTAATGGTAACACTGTTATTGGTGATGCGGCGGCAGATACATTAACTGTTAATGCTACAAGTAACTTTATTGGTGATACTACTGTTAAGAATATTACAATCACTGGTACTTTAACTGCTGATTTATCTAACTTAACAACAACATCATTCAAAACTGGAACATACTTTGTTGCTCAACATGCTGCTGAAACAGTAAGTACTGCAACTTGGACTCCAGATGGTACTTCAAACGTTTATAACGTAAACGTTACTGCAAATACCTCAATTCAACCAATTACTGGTGTGAATGGTGCAGGTTCATGGTTCATCTATGTAACACAAGATGCTACTGGTGGACATACTGTAACATGGGATACTGCTTATGCAATCATTGGTGGTGAAGTTAATACTGATCCAAACGCTGTAAGCATCTGTCAAGTAGTGTACTGTGGTATTGGTTCTAAATATGATGTGTTCATTGCACAACGTCCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c576f99afab7e428c933ef61808a0aef82d41143733879781a2264a3d17d5f54
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5578
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome sequence of Serratia marcescens phage BF Casey,E., Fitzgerald,B., Mahony,J., Lugli,G., Ventura,M. and van Sinderen,D. — — GenBank