Protein

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Genbank accession
AHB80721.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGVELDTGRIKIGDGVSGWNNLRYERPIESTSNTAETLVQRDADGNFSAGTVTATLIGNASTASRFASTRQIQLANVGSTVSDVLGSDTFDGSQNVVIAAELRVLPTLPHYDGTDAPTRYYTKVEVDAKGRVIRGNTPEQLTLADYGLDGNNPAVGQVNADLAQPWDADLQALADNNDNGIVIRRQAGAISIREIVGNYEINIDDGDGVNGNPTLRLINTLVVPDPVTYDDGDYNTESLTSVTTTGPKGELVGTETVNATKFTVDKKGRLTSATNLPIATATEGSKYATYNHNLQYARYDIVDHLGNLYQALAQMGTGYAIPFGPVHTSGDAYSWRYLGPALTEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAVGVDNLQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYLKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGALNQTLDKTGDGDLTFQLTQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQISASEAAGKVHVEDARFQDNYIATTNATMNLDPGDDRAATGTVRVWGNLQIDGTTTTVNSTTVTVDDPIITLGGDTAPTTDDNLDRGVEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNTTEVFSGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDTMVLRAASKSLQFQNGAGTVKSEIHTTSGNAEFGGILTVTGATDLNSTLNVASSVHFEATDEPTFALNSETGVWEIQSADYGSFRFDGGGYIAGDFMFDSDVVINGTILQKESAAEDFNEQNFLRVRRKFESGSVQVLTPSYASHTNSNARIFGGAGIGTTLHIGGTSSNEGLFIGKKVNSDTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGEVTIQDSVIINAANEVFSIRNGSGVAKFDVDTDNGNTLIEGTLNVNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGNTDKMTVKSSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDASNEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSNVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAAIGKNLAVSGDARVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDNVTITANNKTFAIQNGSAANKLTVDTDNGNTDIRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKVGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDGALRAGSLNLTGSGTTLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTNKINNLNADLLDSMTTASTATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALRTARTITVDGVVDGSVSFNGSADVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITVTNADGVSGNITINVASASSNSANNLVIRDASGDFAANEITADLIGGVTGDVVGNVTGNLQGSASQVDTVTASSANAAYHLTMVDQHNTVANNETINTDQSLTYNPSTNRLKTKLELQTDAAPASATATGTVGEIRYDANYIYICVATDTWKRSTLDTW
Physico‐chemical
properties
protein length:1680 AA
molecular weight: 175134,33840 Da
isoelectric point:4,24737
aromaticity:0,06250
hydropathy:-0,22423

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–248
SSF69349 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_0574
AHB80721.1
1 1680
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-248 | STR 358-932 | RBD 970-1680
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-MbCM25
[NCBI] 		1340811 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Namakavirus > Namakavirus smbcm6
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHB80721.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF156339 [NCBI]
CDS location
range 87249 -> 92291
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGGAGAGGTGGAGCTCAAGAATGGGCAAACGCAAACCCAACTCTTGCTCAAGGAGAATTGGGAGTTGAGCTAGATACTGGTCGTATTAAAATCGGTGATGGTGTTTCGGGTTGGAATAACCTTAGGTATGAAAGACCTATTGAATCCACATCCAATACCGCAGAAACTCTCGTGCAGAGGGATGCTGATGGTAATTTTTCCGCAGGCACTGTTACTGCAACACTAATTGGTAATGCTTCTACTGCTTCTCGTTTTGCTTCTACCCGTCAGATTCAATTAGCAAACGTTGGTAGTACTGTATCTGATGTTTTAGGAAGTGATACCTTTGACGGATCCCAAAACGTTGTAATTGCAGCGGAGTTAAGAGTATTACCGACTCTGCCACATTATGATGGCACAGATGCACCCACTAGATATTACACTAAGGTAGAAGTTGACGCAAAAGGGCGTGTAATCAGAGGTAACACTCCAGAGCAGTTGACATTAGCAGACTATGGATTGGATGGTAATAATCCTGCTGTAGGTCAAGTGAATGCTGATCTAGCACAACCTTGGGATGCAGACTTACAAGCTCTTGCAGATAATAATGATAACGGCATTGTTATCAGAAGACAGGCAGGTGCAATTTCAATTAGAGAAATTGTTGGTAACTATGAAATTAATATTGATGATGGTGATGGTGTTAATGGAAATCCAACTTTAAGATTAATTAATACTTTAGTTGTCCCAGATCCTGTAACTTATGATGATGGTGATTACAATACAGAGTCATTAACATCTGTAACTACTACTGGTCCAAAGGGAGAGTTAGTTGGCACCGAAACTGTAAACGCTACAAAATTTACAGTTGATAAAAAGGGTCGCTTAACAAGTGCAACAAATCTGCCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGACATATAATCATAATTTGCAGTATGCTAGATATGATATTGTTGATCATCTTGGTAATCTATATCAAGCACTCGCGCAAATGGGTACGGGATATGCAATTCCCTTTGGTCCAGTTCATACTTCTGGAGATGCATATAGTTGGAGATATCTCGGTCCTGCACTGACAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTCGACGTTGACAGCAACGGGCATGTCACAATTGCTGCAGTAGGTGTTGATAACCTACAACTACAAAATAATAGAGTCTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAGCTTGATCAAGAGCTTACTGCAACCACTGGATATAGAGGATTCAATTATCTTAACTATCTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACGGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAACGTACGGTCGTATTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCGACCTAACATTCCAGTTAACACAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAGTGCATCAGAAGCAGCTGGTAAGGTACATGTAGAGGATGCAAGATTCCAAGATAATTACATCGCCACAACCAATGCGACGATGAATCTGGATCCTGGTGATGATCGTGCTGCTACAGGAACAGTTAGAGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACTACCACCACTGTAAACTCAACAACTGTCACAGTTGATGATCCTATCATCACTCTTGGTGGAGATACTGCACCTACAACTGACGATAATTTAGATCGTGGTGTTGAGTTTAGATATTACGACACTGAAGCACGCTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTACTGAAGTCTTTAGTGGCACCGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATTTGGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAACATCGGCGGTTTGTTGGATGTTGATGGCACATTCAGAGCAAATAGCACATCTCGTTTCGACGATACGATGGTGCTCCGTGCTGCTTCTAAGTCACTACAATTCCAGAATGGTGCAGGCACTGTTAAGTCCGAGATTCATACAACTTCAGGTAATGCTGAGTTTGGTGGTATCTTAACAGTTACTGGTGCTACTGACCTCAATAGCACATTGAATGTTGCTAGTTCTGTCCACTTTGAAGCAACTGATGAACCCACCTTTGCATTGAATAGTGAAACTGGTGTTTGGGAAATTCAATCTGCTGACTATGGATCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATATATTGCTGGCGACTTTATGTTTGACAGCGACGTTGTTATCAACGGCACTATTCTACAGAAAGAATCTGCTGCAGAAGACTTCAACGAGCAAAACTTCCTGAGAGTTCGTCGTAAGTTTGAATCTGGATCCGTCCAGGTTCTAACCCCTAGTTATGCTTCACATACTAACTCAAACGCTAGAATCTTTGGTGGTGCTGGTATCGGCACTACTCTTCATATCGGCGGCACATCTTCCAACGAAGGTCTGTTTATTGGTAAGAAAGTCAATTCCGATACGGTCAAATTCTCTGTCCTAGGTGCATCTGGTAACACTGATATTGAAGGCACTCTCAATGTTGAGGGTGAAGTTACTATTCAAGATAGTGTAATTATCAATGCTGCCAACGAAGTATTCTCTATTAGAAATGGTTCTGGTGTTGCTAAGTTTGATGTTGATACTGATAACGGCAATACCTTAATTGAAGGGACTTTAAATGTTAATGGCACTGTCGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACGACGGATAAATTCTTCGTTGATAATGTAACTGGCAATACTGATATCCAAGGCACACTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTCAGCAATGCTGTAACATTCGATCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGCACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAACACGGACAAGATGACCGTGAAGTCTTCATCAGGTAACATTGCAACGGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACCATCAACGATTCACTGATTGTCGATGCTTCCAATGAAGTCTTCTCCATCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCCGATAACGGTAATACAAATATCATTGGCACCTTGACTGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCCTTGGCGTCTCTAATGTTGTAACCTTCACAAGAAATACCCAACAAACTCTAACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGCTATTGGTAAGAATCTTGCAGTTAGTGGTGATGCTAGAGTTTATGGCGGCACTGAATTAACTGGTGCTCTGGATCTTAACAATAGTGCAGACATCTCTGGTGCTCTGGTAACTCACGACAATGTAACTATCACTGCAAATAACAAAACATTTGCTATCCAAAATGGATCTGCTGCTAACAAACTTACAGTAGATACTGATAATGGTAACACTGATATTCGTGGCACCCTAGACATTGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAATCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGATGGTAAGGATCGTGGTGTTGAATTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAGTTGGCTTCTTCGGATACGATAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAGTAGATGCAACTAACTCATCAGAAGTCCTTTCAGGCACTGATGGTGCTCTCCGTGCTGGCAGTCTGAATCTTACTGGTTCTGGCACCACTCTTGATGTTGATGCCAATGCTAATATTGATGGCACCCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTCCTGCACTGGTTATTCCTACAACCAATAAGATTAACAATCTGAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTACAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTGAGGACTGCAAGGACAATCACTGTTGATGGTGTAGTTGATGGTAGTGTATCCTTTAACGGATCTGCTGATGTTACTATTAGCACTACTTACAATGATGCAGACATCACTGCGCTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGGACTGCTGCTAATACTTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTGTTACTAATGCTGATGGTGTATCGGGCAATATCACCATTAACGTCGCTTCTGCAAGCAGCAACTCAGCAAACAACCTTGTCATTCGTGATGCTTCTGGTGATTTTGCTGCCAATGAAATTACTGCTGATTTGATTGGTGGTGTAACGGGTGACGTTGTTGGTAACGTAACTGGTAATCTCCAAGGTAGTGCATCTCAGGTTGATACCGTCACTGCATCCAGTGCCAATGCCGCTTATCATCTGACGATGGTTGACCAACATAATACTGTTGCGAATAACGAAACCATTAATACAGACCAAAGTCTGACTTATAATCCATCTACTAATCGCCTAAAGACTAAACTTGAATTACAGACAGATGCTGCACCCGCCAGTGCAACAGCAACTGGTACTGTTGGCGAAATTCGTTACGATGCAAACTATATTTACATCTGTGTTGCTACTGACACCTGGAAAAGATCCACCCTCGATACTTGGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0387fcc717c98d7d5b07efa18423fe2e2a51c08167bf97815606ff54544c6cbe
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5754
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50