Protein

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Genbank accession
XLQ30925.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,74
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MTTTIEEVDLRLTVTKNELVAEDQRLWESLQNETISRVTGDNANNQLVADVNTANQGTESRLSTEVLHRSEGDLINVNSINALTQALSDYRIKTDLEIATEKLAREQLGIDLDIKISNAVASFDHREHQIYTAIGIVQTDLDDKYISMSQRIAKYEDMLQDITTDSIQITMDNGEINMGAWTILSQAREWDLEILGKFKDYQTVIDGDLDQALQDLQNKLPVEQDIIDKAIEALSQAPIIKELDDKLAQNLTDINSINNKLAQQAQDTAIEMINLSQALSAEVVRKTDEIASTVVAETDARVFEISKETATRVAQVELLNDGLTQETLERIEGDNASIEMINNLKLSNDTSLANIREELTVTTGKVEANAAQLSAIDARVTVAQADASQAMTNAASATQKAEAAAAANEVTAGRVSTVEASLGGKVDTTAFNTLETKVNTIDGKTTTNTADITGLKTRMTAAEGNITTNTTAVNQLQIKNTEQDGKITTLTSDTTTLKADMVVVKNDLTTKASTQSVQNLQNEVTNQGGLITANTQAQTALKASFDNMAVGGDNLLVNGNFAATPDWSNWNVWGNAARNFEVLSGKRYARLIAPDTSLFKGISQTGLVPFIPDTEYTVSFLAYTNSSSAQFIQMLVHQTGGGNNDPQINMTTSQITMSPKRYSLTFRSSSLVNTKSGFNLHIGGKFSTAYDVCISDIQFEVGNKASAWKPSNKELTNNISANATAVASMQAQITTMDGKITSNTSDLTNLTGRVTNVETNTTANTNAINSMQSTITSQGNQITANTGAITGVTTTLNNAADATNNLAINSNVVGTYNGVSYPHVAYALDKACVVGQQYTLLWCGEHQRGTGDTNSNLSVYIGGGQQSVDSITNQAKTVRKVTFTKANSANDPVINFYCINKPTADKGTVATVYWAVLVKGPTILGNDWFPGSYEMKPTVEGHTSAINTLNTNVSLIDGKATAASEASTRVEAKLAEGINTRNYLLDSATGGTKAVLTAAMSKLLFPGSVISMAFDIDITSPVGVGSRNRIGFESSFTIAGATHYCGVWLNNAASQPVGKYRIKNQFTLPATWINGASEFPSTFPFHTQTSGGAFTISNVTMTVSSIPVGWEPAPEDSANAISTLQTQVTNIDGKVTATSNSLTQLQTTVDGHTSTIAIHGQSINGIQAEYSIKLDVNGLVSGIGLINTGTSSAIGINADYFYVGKPANGKKPFMILTSSQTIGGVTYPAGTWIDVALIANATIGTAHIANAAITNAKIANLAVDNAKIANLDASKINAGYIAAARIQAGTITADKMNVTELSAISANLGTLITYKDPAQPLKARMVMQGSLITVYDDNNRVRVRLGLW
Physico‐chemical
properties
protein length:1348 AA
molecular weight: 143958,15520 Da
isoelectric point:4,91353
aromaticity:0,05341
hydropathy:-0,18576

Domains

Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
240–260
Coil DC_1303 IPR008979 DC_1169 DC_2057
G3DSA:1.20.5.340
STR
430–524
G3DSA:1.20.5.340 G3DSA:2.60.120.260 G3DSA:1.20.5.340 DC_0515
DC_1268
STR
500–762
DC_1268 G3DSA:1.20.5.340
IPR003305
CBM
554–675
IPR003305
XLQ30925.1
1 1348
Architecture
STR
RBD
STR
RBD
STR 416-806 | RBD 807-821 | STR 932-1174 | RBD 1175-1348
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage At2
[NCBI] 		3385009 No lineage information
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLQ30925.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ656108 [NCBI]
CDS location
range 35069 -> 39115
strand -
CDS
ATGACTACTACAATTGAAGAAGTAGACTTACGATTAACGGTTACTAAGAATGAATTGGTAGCTGAGGATCAGCGTCTATGGGAAAGTTTACAGAATGAAACTATCTCAAGGGTTACAGGGGATAATGCTAATAACCAGTTGGTTGCAGATGTAAATACTGCTAACCAAGGTACTGAGTCACGTCTGTCTACTGAGGTATTGCACAGGTCTGAAGGTGACCTAATAAATGTTAATTCCATTAATGCATTAACACAAGCCTTATCAGACTACAGAATCAAAACTGACTTAGAGATAGCTACTGAGAAATTAGCACGTGAGCAGTTAGGCATAGATCTTGATATTAAGATCAGTAATGCTGTTGCTAGCTTTGACCATCGTGAGCATCAGATCTATACAGCTATTGGTATTGTTCAGACTGATTTAGATGATAAGTACATCTCAATGAGTCAACGTATTGCTAAGTATGAAGACATGCTCCAAGACATCACTACAGACTCTATTCAGATCACTATGGATAATGGTGAGATTAATATGGGTGCATGGACTATCTTGTCTCAAGCTCGTGAATGGGACTTAGAGATTCTTGGTAAGTTCAAAGACTATCAAACTGTTATTGATGGTGATTTAGATCAAGCCCTTCAAGACTTACAAAATAAGTTACCTGTAGAGCAAGACATTATTGATAAGGCTATCGAAGCATTGTCTCAAGCCCCTATTATCAAAGAGCTAGACGATAAGCTTGCACAGAACCTTACGGATATTAATTCAATCAATAATAAGCTTGCACAACAAGCACAAGATACCGCTATTGAGATGATTAACTTATCTCAAGCATTGTCTGCTGAGGTTGTACGTAAGACAGATGAGATTGCATCAACTGTTGTTGCTGAGACTGATGCTCGTGTTTTTGAAATATCTAAAGAGACTGCTACACGTGTGGCTCAAGTAGAGTTACTTAATGATGGTTTAACTCAAGAGACTCTTGAGCGTATCGAAGGTGATAATGCATCTATTGAGATGATCAACAACCTTAAGCTGTCTAACGATACAAGCTTAGCTAATATCCGTGAAGAGCTTACAGTTACTACTGGTAAGGTTGAAGCTAACGCTGCACAACTGTCTGCTATTGATGCCCGAGTTACTGTAGCTCAAGCAGATGCATCACAAGCTATGACTAATGCTGCTAGTGCTACTCAGAAGGCAGAAGCTGCTGCTGCTGCCAATGAGGTAACTGCAGGACGTGTATCTACAGTAGAAGCTTCTCTAGGTGGTAAGGTAGATACTACTGCCTTCAATACTTTAGAGACTAAGGTTAATACTATTGATGGTAAGACCACAACTAACACTGCTGATATCACTGGTTTAAAGACTCGTATGACTGCTGCAGAAGGCAACATCACTACGAATACTACTGCAGTAAACCAACTACAAATTAAGAATACTGAGCAAGACGGTAAGATTACTACGCTTACTTCTGATACCACTACGCTTAAGGCAGATATGGTTGTTGTAAAGAATGACCTTACTACTAAGGCATCTACACAGTCTGTACAAAACTTACAGAATGAAGTTACTAATCAAGGTGGTTTGATTACAGCTAACACCCAAGCTCAAACAGCATTAAAAGCTAGCTTTGATAATATGGCTGTAGGTGGTGATAACTTATTAGTTAATGGTAATTTTGCTGCTACACCTGATTGGTCAAATTGGAATGTTTGGGGTAATGCAGCACGTAACTTTGAGGTACTATCTGGCAAACGTTATGCAAGACTGATAGCACCCGATACTTCGTTATTTAAAGGTATCTCTCAAACTGGTTTAGTACCCTTCATCCCTGATACTGAATATACTGTTTCATTTTTAGCTTATACAAACTCTTCTAGTGCACAATTTATACAGATGTTGGTACATCAGACTGGTGGTGGTAATAATGACCCTCAGATTAATATGACTACATCTCAAATAACTATGTCACCTAAGAGGTATTCACTAACTTTTAGATCATCAAGCTTAGTTAATACTAAGTCTGGTTTTAACTTGCATATAGGCGGTAAGTTTAGTACAGCTTACGATGTATGCATATCTGATATTCAATTTGAAGTTGGTAATAAAGCTTCTGCTTGGAAACCAAGTAATAAAGAGTTAACTAATAATATTTCAGCTAATGCTACTGCGGTTGCTAGTATGCAGGCTCAGATTACTACTATGGATGGGAAGATAACTTCTAACACGAGTGATCTAACTAACCTAACTGGTAGGGTTACTAACGTAGAGACTAATACTACTGCCAACACTAATGCTATCAATAGTATGCAGAGTACAATCACATCTCAGGGTAATCAGATCACTGCTAACACTGGTGCAATTACTGGTGTAACAACTACTCTGAATAATGCTGCAGATGCTACAAACAACTTAGCAATTAATTCTAATGTGGTAGGTACATACAATGGTGTTTCTTATCCCCATGTAGCTTATGCATTGGATAAGGCTTGTGTCGTAGGACAGCAATATACGTTGCTATGGTGTGGTGAACATCAACGTGGTACTGGAGATACTAACTCTAATCTGTCTGTTTATATTGGTGGGGGTCAACAATCAGTTGATAGTATTACTAACCAAGCTAAAACTGTTCGTAAGGTTACATTCACTAAAGCTAATAGTGCGAATGACCCTGTTATTAACTTCTACTGTATTAATAAACCTACTGCGGATAAGGGTACAGTTGCTACTGTCTATTGGGCAGTGTTGGTTAAAGGCCCAACTATTCTAGGTAATGATTGGTTCCCTGGCTCTTATGAGATGAAACCAACTGTAGAAGGTCACACTTCTGCAATTAATACTTTAAATACAAACGTAAGTTTAATTGATGGTAAAGCTACTGCAGCAAGTGAAGCATCTACACGTGTTGAAGCTAAACTAGCTGAGGGTATTAATACACGTAACTACTTATTAGATAGTGCTACAGGAGGTACTAAGGCTGTATTAACTGCTGCAATGTCTAAGTTACTGTTCCCAGGATCTGTAATCTCAATGGCATTTGATATTGATATTACTTCTCCTGTCGGTGTAGGCTCAAGGAATAGGATTGGGTTTGAGTCAAGTTTCACCATAGCAGGTGCAACACATTACTGTGGTGTATGGTTAAATAACGCTGCATCCCAACCAGTAGGTAAGTATAGAATTAAAAACCAATTCACTTTACCTGCAACTTGGATTAACGGTGCATCTGAGTTTCCTTCAACTTTCCCTTTCCATACCCAAACATCGGGAGGAGCTTTCACTATCTCCAACGTAACGATGACAGTGTCATCAATACCTGTTGGTTGGGAACCTGCACCAGAAGATTCAGCTAATGCTATTAGTACTTTACAGACTCAAGTAACTAACATTGATGGTAAGGTTACTGCTACATCAAATAGCTTAACTCAGTTACAGACTACTGTAGATGGTCATACATCTACCATTGCTATTCACGGTCAGTCTATTAATGGTATTCAAGCTGAATACTCTATCAAGCTTGATGTGAATGGGTTGGTTTCAGGTATTGGTTTAATCAATACTGGTACTAGCTCTGCTATTGGTATTAATGCGGATTACTTCTATGTAGGTAAACCTGCTAATGGTAAGAAGCCATTTATGATTCTTACTTCTAGCCAAACTATCGGAGGTGTGACTTATCCTGCAGGTACATGGATTGATGTTGCACTGATTGCTAATGCTACTATTGGTACAGCACATATTGCCAATGCTGCTATTACTAATGCTAAGATTGCAAACCTTGCAGTAGATAACGCTAAGATTGCTAACTTAGATGCTAGTAAAATTAATGCAGGATACATTGCAGCAGCTAGGATTCAAGCAGGAACTATCACAGCAGATAAGATGAATGTAACTGAACTAAGTGCTATTAGTGCTAATTTAGGTACACTAATAACATACAAAGATCCTGCTCAACCTTTAAAGGCACGTATGGTAATGCAAGGTAGTTTGATTACAGTTTATGATGATAATAACCGTGTACGTGTTCGGTTAGGATTATGGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c2f0a6da7aab5e972d94daf67fbc3aa7b514302df8e606ab2495cd9ac65b5cba
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7175
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Acinetobacter At2 phage isolated from environmental water sample Wee,S.K., Yan,B., Mustaffa,S.B. and Yap,E.P.H. 2022-09-15 — GenBank