Protein

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Genbank accession
WPJ52575.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MADLEKIQFLRSTVAGKTPTTSQLADGELAINMADYAIYTKNGSSIVQLAGKGIPETNTKKLTVDGPSALNDTVTVAEGKTITFTNADLSGGMVRHITGKNALNDGWYIGSGGESNKGFLEIGTIDDGDEEIRFVSRGSGDTIRRTLKLIDSGGNTCVPGNIYIDEALGGGGSAFISKNKAYFGAGGADIYMRNTAGGATNQLTITDGGELLFQAKPVYWDGRKPTLTELGIGRVENARQLEQDNFPVTTGNENRWIKVALLKDPGSGQSRLQLMVTNGGNYGSTRSSIDFIDCSARSIPSTLTSSNIRSYLQIRRLGDPAFDDTNQMRYSLVRTSEGLELWFTQRSFIGSVKVALLSIAGATEYYLPTGYTTSATAPEGLVESVAIRIYDEINKPNLDNGTDGILSIAKGGTGASTADAARTNLGAVARAGDTMSGRLTVDMSDDTNINIQALYIKGNQHTPVMLERNSDANLSIGFRLTGISPVLMRKLGMAKDGTLRWGVNDNQASNPVVYEQSYVDSNTVYLNGGYSGAEVGTDIGGQTISLNDVFIGADGISTSKWGVTKIGHRKVYHCQTMGDGNGITDTPVTSKGNFILIVEVTRRATGLDFRNKQTFISGDTSKTYVRYGAGTGTLAVPTCSWSSWEEVVAGVQPINLGGTGATSVADARNNLGIGESQKPAFGGLTINSVGNTDPTVTFDNGAIIRGGRGSSNGALIMAASATAITAGKYISFRPYGISSNSDIRVKAFGNNETSLEWSQGAGVRSNTDGAFVVYAKTGQALHLRPNGDNSNQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKSNMPGKMAISKSNSFTIMVSTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNAQINRQLTVSSAATVNGVINANCGIIVPTTKYVQIADAPTQNDQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGQLVITGNQLKTTSLWATGNSALNGTLEVGGRANFLNEVTVKTSINVMNDGNSHLFFRKADGTEKGLLYVDDPGNVTIRAKGGSGPTWNFWESGSCQFPGAISNFNGVNSTTNYPGGGIGAYLNTAGLTSRFSNGAYVSLYFQEYVGNYHQAILNVNGYGQDNSFYFRAGGDFICTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVEKLTGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKELKSQLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1249 AA
molecular weight: 132551,99660 Da
isoelectric point:5,59110
aromaticity:0,07206
hydropathy:-0,28783

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
2–1249
DC_1942
IPR030392
CHP
1154–1248
IPR030392
IPR030392
CHP
1154–1209
IPR030392 Coil
WPJ52575.1
1 1249
Architecture
ATT
ATT 2-1249
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WPJ52575.1
1 1249
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 360 360 0,0970
Central domain 361 559 200 0,3591
C-terminal 560 1249 689 0,7015
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-360
Central
361-559
C-terminal
560-1249

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage RCIP0052
[NCBI] 		3094220 Viruses >
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPJ52575.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR532846.1 [NCBI]
CDS location
range 41272 -> 45021
strand +
CDS
ATGGCTGATTTAGAAAAAATTCAATTCCTACGTAGCACAGTTGCGGGGAAAACACCTACTACAAGTCAGCTTGCAGATGGTGAACTGGCGATCAACATGGCTGATTATGCCATTTACACGAAAAATGGTTCTTCGATCGTTCAGTTAGCGGGTAAAGGTATCCCAGAAACAAATACCAAAAAATTAACAGTTGATGGGCCTAGTGCTCTTAATGATACCGTTACCGTAGCGGAAGGTAAAACTATTACTTTCACCAACGCGGATTTGAGCGGGGGTATGGTTCGTCATATCACTGGTAAAAACGCTCTTAACGATGGTTGGTACATCGGTTCTGGCGGTGAGAGTAATAAAGGGTTTTTAGAAATCGGTACAATTGATGACGGTGATGAAGAGATCCGTTTCGTTTCCCGTGGTTCTGGTGATACTATTCGCCGTACTCTGAAACTTATTGATTCCGGTGGTAACACTTGCGTACCTGGTAACATCTATATTGATGAAGCTCTGGGCGGTGGTGGTTCTGCCTTTATTTCAAAAAATAAAGCATATTTCGGTGCTGGCGGTGCTGATATCTATATGCGTAACACGGCTGGCGGTGCGACAAATCAGTTAACGATCACTGATGGTGGTGAATTACTGTTTCAAGCAAAACCTGTATACTGGGACGGTCGTAAACCGACTTTAACCGAATTGGGGATCGGGCGGGTTGAAAACGCGCGTCAGCTTGAACAAGATAATTTCCCTGTAACTACAGGAAACGAAAATCGTTGGATTAAAGTTGCTCTGTTAAAAGATCCGGGTTCCGGTCAGAGTCGCTTGCAACTGATGGTGACTAACGGCGGTAACTATGGTTCTACGCGTAGTTCTATCGACTTTATCGATTGTAGTGCTCGAAGCATTCCATCGACATTAACAAGCAGTAACATACGTTCTTATCTGCAAATTCGTCGTTTAGGGGATCCTGCATTTGATGATACTAACCAGATGCGTTATAGCCTTGTTCGTACCTCCGAAGGTTTAGAACTGTGGTTTACTCAACGCTCATTCATTGGTAGTGTTAAAGTTGCGCTGTTGTCTATTGCTGGTGCTACTGAATATTATCTGCCTACTGGTTACACGACTTCTGCAACTGCTCCGGAAGGTTTAGTTGAGAGTGTGGCTATTCGTATCTATGACGAAATTAATAAACCTAACCTTGACAATGGTACTGATGGTATTCTGTCTATTGCTAAAGGTGGTACAGGCGCAAGTACAGCGGATGCTGCTCGTACAAACTTAGGGGCTGTTGCTCGTGCTGGCGATACTATGTCTGGTCGCCTTACCGTTGATATGTCTGATGATACAAACATTAACATACAAGCCCTGTATATCAAAGGTAATCAACATACACCTGTTATGTTAGAAAGAAATTCCGATGCAAACCTTTCCATCGGTTTTAGATTAACAGGTATCAGCCCAGTTCTTATGCGTAAACTCGGTATGGCTAAAGATGGAACTCTTCGCTGGGGCGTTAATGATAACCAAGCTAGTAACCCGGTTGTTTATGAGCAAAGCTATGTAGATTCTAACACTGTTTATTTGAATGGTGGCTATTCTGGCGCTGAAGTTGGTACTGATATCGGTGGTCAGACAATTTCGTTAAATGATGTATTCATCGGCGCTGATGGGATTTCTACCTCTAAGTGGGGTGTTACTAAAATTGGTCATCGCAAAGTATATCATTGCCAAACTATGGGTGATGGTAACGGAATCACCGATACACCAGTAACTTCTAAAGGCAACTTTATTTTAATAGTCGAAGTAACTCGTAGAGCTACAGGCCTTGACTTTAGAAATAAGCAAACATTTATTTCTGGTGATACTTCTAAAACTTATGTTCGATACGGTGCTGGTACTGGTACTCTAGCAGTTCCTACTTGCAGTTGGTCTTCTTGGGAAGAAGTTGTTGCTGGTGTACAACCGATTAATCTTGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGATGCCCGTAATAACCTCGGTATTGGTGAAAGCCAGAAACCGGCTTTCGGTGGATTGACTATTAATAGTGTTGGAAATACTGATCCGACCGTCACATTTGATAACGGCGCTATAATTCGTGGAGGTCGAGGCTCTAGTAATGGTGCATTAATCATGGCGGCTTCTGCTACAGCTATTACTGCCGGTAAGTATATTTCTTTCAGGCCATATGGAATTTCGTCCAACTCCGATATTAGAGTCAAAGCATTCGGTAATAACGAGACATCGCTTGAGTGGTCGCAGGGTGCAGGTGTTCGTTCAAATACCGATGGCGCTTTCGTAGTTTATGCAAAAACAGGTCAGGCACTCCATTTAAGACCAAACGGTGATAATTCTAACCAAGCCACAGTTATTGATCAAAATGGTAAAATGACAGTCGGTGGTGAATTTGAGGCCCAGAACTCAAAAATCACTGGTAATTTGAATGTATCTGAAGATAACAGAATGATTGTTCTTGGCAAAAACTCCGATATAGGTTTAGTCAAGAAAAGTAATATGCCAGGAAAAATGGCTATTAGTAAATCTAACTCGTTTACTATTATGGTATCAACAAATACCAACAACCAAATTAATCCTGCTGATACGTTTAACGATATATTCAAGGTAGATGCTGATGGAAACCAGACTGTTTACGGAAATGCCCAGATTAACAGACAGCTAACAGTTTCTAGTGCAGCGACTGTTAATGGTGTTATTAATGCCAACTGTGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTGCAAATTGCTGATGCTCCTACGCAGAATGACCAAGCCACCAACAAAAAATATGTTGATGATAAAGTAGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGATACTTATCTTCCGTTAGCCGGTGGTACTGTAACAGGTCAATTAGTTATTACAGGTAACCAATTAAAAACTACATCGCTTTGGGCTACCGGAAATTCGGCGCTTAACGGTACTTTAGAAGTAGGAGGTAGAGCTAATTTCTTAAATGAGGTTACAGTCAAAACTTCTATTAATGTCATGAATGATGGAAATAGTCATTTGTTCTTCCGTAAAGCCGATGGCACCGAAAAAGGTCTTTTATATGTAGATGACCCAGGTAACGTGACTATTCGTGCTAAGGGTGGAAGTGGCCCTACTTGGAACTTTTGGGAATCAGGATCTTGCCAATTCCCAGGTGCTATTAGTAACTTTAATGGTGTTAATAGTACTACTAATTACCCTGGCGGCGGTATTGGCGCGTATTTAAATACCGCTGGCCTAACAAGTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGTTTCCTTATACTTCCAAGAATATGTAGGAAATTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAACGGCTATGGGCAAGATAACAGCTTTTATTTCCGGGCTGGTGGTGATTTCATATGTACCCGTAATGGTTCATTCGATAACGTCGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCCAAATCGGATATCAAAGTTATTGAAAATGCTTTGGAAAAAGTAGAAAAACTAACCGGTAATACTTATGAGCTTCACAACACATCCGGTGGTACTACTCGTTCTGCGGGTTTAATCGCGCAGGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAGGATATTGAAGCAGACGGGGGTTTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTCGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCTGAGGTTAAAGAGCTTAAATCTCAACTGAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
9d99f64e0363ef4af5d86a8da9d20c2534c64c5c09abea10f84d3026828a0f07
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5190
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50