Protein

View in Explore
Genbank accession
XNX25454.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTTGNGAWANQHSNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDYPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYSSNSKMYHYFRGTGRMSVSMGDGLLVEPGILDIKTGSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNSDGTNASLIFKAASGIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKARETVFEVADSQGYYFYSQRVAPSGSETTGPVVTQFAGAVNARGSIITDGSFKVNGLSTLVGNVTMSNGLFVQGGSSILGQAKFGGTADALRIWDAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNAGETGGISNLRPFYITLSNGKVSMDHDVDIGGGRFKVDTTGTTAGQRITVNTASDAIRINAPTQESSNFIQGRKAEVPKWYLGIGDGGNIVRMHSYTYSHGIALNSDTVDIAKPLKVGNAQFGTDGNITGGSGNFANLNTTINNLKIDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAVMEGQTFDTDLYPKLAAVYPSGALPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASNTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHQHARSGPQIQAGIPNNIFYDGYNSVGANANAKFTGTVNGATAGSNIAKTSSDGAHTHSWSGTTSATGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHSHTVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1038 AA
molecular weight: 110175,18920 Da
isoelectric point:8,13960
aromaticity:0,08863
hydropathy:-0,38873

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–1036
DC_0538
G3DSA:6.20.80.10
STR
689–748
G3DSA:6.20.80.10 SSF88874 SSF88874
IPR048388
ATT
691–765
IPR048388 IPR037053
IPR051934
Unmapped
704–1038
IPR051934
IPR011083
ATT
791–838
IPR011083
XNX25454.1
1 1038
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 1-690 | ATT 691-765 | STR 766-785 | ATT 786-839 | STR 840-1037 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage DCP548
[NCBI] 		3396872 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XNX25454.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ671645.1 [NCBI]
CDS location
range 67204 -> 70320
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGTGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAACGGCACGTATAATCTCAATGGAAATCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATACATTGAATTTTTACCTAAAACCACTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACATTCGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCGCTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCAGTATACTCCAACCGAAACGGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGACGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGGGTTATCGATTTAGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAACGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCTGGTTCTACTTGGGATTACCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGACGGTCAGACTCATATCGGTTATAGCAGCAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGTCCGTTAGTATGGGCGATGGGCTTCTTGTTGAGCCGGGTATTTTAGATATTAAAACAGGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGATGGTACCGTCGCTTCTGTTCAAACATTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATAGTGATGGAACTAACGCTTCTCTAATTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGTACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGCGGTACCCGAGCGGGCCAGAATAAGAGTTATGTAACTGTTAAAGCATGGGGTAATTCATTTAACGCCACCGGCGATAAAGCTCGCGAAACGGTTTTTGAAGTAGCTGATAGTCAAGGTTATTATTTTTATTCTCAACGCGTAGCTCCGAGCGGTTCCGAAACTACTGGTCCTGTTGTAACCCAGTTTGCGGGAGCTGTTAACGCTAGAGGAAGTATTATTACTGATGGAAGTTTTAAAGTTAATGGATTAAGCACTTTAGTCGGTAATGTTACTATGTCTAACGGTCTGTTTGTCCAAGGCGGTTCTTCTATTCTTGGACAAGCTAAATTTGGTGGAACGGCAGATGCATTAAGAATTTGGGATGCCGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACTCCGCAGAATGCTGGTGAAACAGGTGGCATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTACATTAAGTAATGGTAAAGTTTCCATGGATCATGATGTAGATATCGGCGGCGGTAGATTTAAAGTAGATACAACCGGTACTACGGCTGGCCAACGTATTACAGTTAATACTGCCTCCGATGCTATTAGAATAAATGCCCCAACACAAGAATCTTCTAACTTCATCCAAGGACGTAAAGCAGAGGTTCCGAAATGGTATTTAGGTATTGGCGATGGCGGTAACATCGTTCGTATGCACAGTTACACCTACTCCCACGGTATTGCATTAAACTCTGATACGGTTGATATAGCTAAACCTCTTAAAGTCGGTAATGCTCAATTCGGTACTGACGGTAATATCACTGGTGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTGAATACCACAATAAATAACCTTAAGATAGATATTGTGTCGAGTTATCCAATTGGTGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTATGCCGTCATGGAAGGCCAGACGTTTGATACTGACTTGTATCCTAAGTTAGCTGCGGTGTATCCTTCCGGCGCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAACACGGATTTGGGTACTAAGACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGTAACCATAACCATACAGTGAGCGGTAATACTAGTTCCGCCGGTGCGCACCAACACGCGCGTTCAGGCCCTCAGATACAAGCCGGCATACCCAATAACATATTCTATGACGGATATAATAGTGTAGGTGCAAACGCCAACGCTAAATTCACTGGAACCGTGAATGGTGCTACTGCAGGGTCGAATATAGCCAAAACTTCTTCAGATGGTGCCCACACTCATAGTTGGTCAGGAACTACTAGCGCTACGGGTAACCATGCTCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATACGCATACTGTGGGTATTGGTGCTCATTCTCATACTGTTGCAATTGGTTCCCATGGACATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f76cc8c07249b38bb00d846de89e900e2b1f429afe007ee997eadaac8201d68a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5268
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50