Protein

View in Explore
Genbank accession
URG14273.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Protein sequence
MAKKEKVDLGRANEYDFEESWGNDLNYNDLQPDNKSRDRNPTIRVGKTVLREMGKSTLTTTMAREILKGALPPSFSVTLENADRAALGTKELLTDVRREAGPAVREFKAAARSLNRLFPKNPFNKRLAKWGQENKQNPYSLNNINVEDAVASRVLEEVFANQENDRLQDQADKTIDRLSELKYRQVVADSLFGIQNELSKQTAYTFNVQRAYQKKSLELRIRQLMVSRATLDVAQKSAIETSNLLRDVVKNTGLPEVVKQRQSEEYMRYAREGVFGKINQTIGEWTRNYRTNITNRAKSAVSRQIQNFQYGLETANSGLEGMEMQRELLESMGIDPLEFAAGAVGNQAALRGGRWLGRRVRNNRFLKRTDGIFQQANYLFNNRERLLSEYGSSGQSYGRWHSPVTNLLKDVLRSGYRDQGTVRATGLNGLKDSAIGFEDRKLRALEEIIPGYLSRILHSIDGIRTGDKNTPRVVYNQQRGTFTTFNESVEDTHNSLIGKDEIERQRRTMSSLLKSIDPNDSLSPQGRDAIIRELMRRGRTSAAFNPNKLMNLNVSGMSEADKDTWRKLLVERYGMTQGNDGRYSTNIFSGRNQNLNRDAGLFNYGSNQTVGIYNRAHALASTGGIEALIATGAVKFRNGRWDINPDYYGNRTDNEGVENGEGGLSGSPSQAPSISSLLSGNTGPLGAARFSQLRNYPGPSSINYSARVDNNSILDLTRRRQAEKGNGVVSAIEEQTAKLLAQLGIQQEFTHHAVGSLADNVEAIRSIIAAGGMGGGSGGGGEGTGSSTSSAARGPWWRRALSTAWRGHKAVWNATGLPFRAFNAALRKSISPAMAVGRTAMNVLTGGLTGVIGRARDRFSDVYIQGAQGFKKVISKEGFGTGRYIDQNSGKVISSIKDITGPVFDTVEQTQVLSADDVKQGLFNKDGKRLSANIFGTVGKVVAGIHNATGVPFRMATGVARGFLNTAKRLLSRMPDVYVAGEKAPRLYSSKLNAGEYYQIATGKIVRSPRDIVGDIGEMDPTTRQLRPVLLDSEIREKGIVDRSGKPIRSGYGTVGALITGGVGTAFRIGKDLLSLPWRAANGVVNMAGNALGAITGIGRRGGKGTDKQTFWLKRIYRLLANQFTGQNPLEGLGDSVEDLRSGGQGALSKLTGWARNVGKNSIDRANDIRERLSARAGSWLNRLKDNGGKAADVAKAEKVAAKTEGGWSKLIWMALSGIGAAIGGIRSGLGKFAGWIKDLPKWLALRKGAVALGDIGDLAGGGRKGGILRRGGRLLGKVGRLAGRGALAAGRFALGGAGTVLRMGAAALGGLVSAPGLAIAAAVAGTGYLIYKGWQMYSNRMTPLRDYRIAQYGADVNDGESRGKILALEEAVLKKTTVMPNGGVRIGSLEFESLLESFGIELQNQRQVVEWMRWYNKRFVPVFSKNLTVLRKMDPKAKLTDADFLEPGQRPQFARETFIESSGENSPYNISASPFPGKRSVVGSGYPAKYRDIVIEKYSQQEKAYQSKKSVDQAKSTFATKPITPVQNALRNMQQQDDRAINPSTDLFYSPGDKVSIPGGITGNVQQDEMIQISNRIDDLSSIRVKTYGLNQLVKEEVNLLLVMESELIKQVQYNAKFQATFNGDMDKTFALWAPRFGINTADKEAKTNWMTWFQHRFLPAFLNFCAQAKKISPQTSPIDSWKTLKSSDLLKIANFLVGAKTEFNGNTYSVWQVLASPWPGRRMNADSSSVNDNLDSLRDQSKKEVYQEKVRTQKEIDKTTFDGKKLDDTKTGQAIKMALQNQIAVSGKYSGSAQGGNTNSYSTSYGTTGTSFENAGTSGIYGNELQHGTGTGGSVNDLPQSQGRGWAENRDLIVAAARMVGVDAGALAAMVAQESRFNPAAKNPKSSAAGFGQFIDSTWKEILPTLVKKYGVNPNATQMDPRANMLATAEYMRKNQEALGSIGRPLTAEDLYAAHFLGTGGARKMLSKSDDTDIRQAMTDYDKVSKANPEIFNGVRTVGDFRRSLSGYLNRNGGQYVDEANALSNRAASEAGDRNVGGTPTTPALPAETPTTPGATASTPTPFDPKGALPKGSTLGTANFTGSTDTVPTITAPSTVAPEIAAAQDQRNESRELQRSSVTRRQEVVREKTKSEMSSVDFMKDSLTYQKLTSENTTGILNALLKHLKGSKTQGEDIPANSKNSDTDDLLRRTSTSGGMPEKTGGLPFDTRVTR
Physico‐chemical
properties
protein length:2213 AA
molecular weight: 241168,74330 Da
isoelectric point:9,78890
aromaticity:0,07185
hydropathy:-0,52282

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–1991
DC_0124 DC_1038
Coil
Unmapped
164–184
Coil G3DSA:1.10.530.10
IPR023346
STR
1850–1971
IPR023346
IPR008258
ENZ
1854–1970
IPR008258
URG14273.1
1 2213
Architecture
STR
RBD
STR 1-1991 | RBD 1992-2213
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pectobacterium phage vB_ParM-25
[NCBI] 		2939654 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
URG14273.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON375847.1 [NCBI]
CDS location
range 268090 -> 274731
strand -
CDS
ATGGCTAAAAAAGAAAAGGTTGATCTCGGTCGTGCTAACGAATACGACTTCGAGGAAAGTTGGGGCAATGACCTCAACTATAATGACCTGCAGCCTGACAATAAAAGCAGGGATCGTAACCCGACAATTCGCGTAGGTAAAACTGTACTTCGCGAAATGGGTAAGAGTACGCTAACGACTACCATGGCGAGGGAAATCCTCAAAGGTGCGTTACCTCCCTCTTTCTCAGTCACTTTGGAAAACGCAGACCGTGCGGCGTTAGGTACCAAAGAATTACTGACCGACGTACGAAGAGAAGCAGGGCCTGCTGTACGTGAATTCAAAGCTGCTGCTCGGTCACTAAACCGATTGTTCCCTAAGAACCCATTCAACAAGCGCTTGGCTAAATGGGGACAGGAGAATAAACAGAACCCTTATTCGCTAAATAACATTAACGTAGAAGATGCTGTTGCTTCTCGTGTCTTGGAAGAAGTTTTCGCTAACCAGGAAAACGATCGCTTACAAGATCAAGCGGATAAGACAATTGATCGTCTCAGTGAACTGAAATATCGTCAAGTAGTTGCGGATAGCCTTTTCGGTATCCAGAACGAACTCAGTAAACAAACCGCGTATACATTCAATGTCCAGCGTGCGTATCAAAAGAAATCGTTAGAGCTCCGTATTCGTCAGCTCATGGTTTCTCGTGCGACATTGGACGTAGCGCAGAAGTCTGCGATTGAAACGTCTAACCTGTTACGTGACGTAGTCAAGAACACCGGCTTACCTGAAGTTGTTAAACAACGTCAGAGTGAAGAGTACATGCGTTATGCGCGTGAAGGTGTCTTTGGCAAGATCAACCAGACCATTGGTGAGTGGACACGTAACTACCGCACCAACATCACTAACCGTGCTAAGAGCGCGGTATCTCGTCAGATCCAAAACTTCCAATATGGTTTAGAGACTGCTAACAGCGGTCTGGAAGGGATGGAGATGCAGCGTGAGCTGTTGGAGTCCATGGGTATTGATCCATTGGAATTCGCAGCAGGTGCGGTCGGTAACCAAGCAGCTCTGCGTGGTGGCCGTTGGTTAGGTCGTCGTGTTCGTAATAACCGTTTCCTTAAAAGGACAGACGGCATATTCCAGCAGGCTAACTATCTCTTCAATAACCGTGAACGTCTGCTTTCCGAATACGGTAGTAGCGGTCAATCATACGGCCGTTGGCATTCCCCGGTAACGAATCTCCTGAAAGACGTATTGCGTTCAGGGTACCGTGACCAGGGAACCGTAAGAGCAACTGGACTCAATGGACTGAAGGATAGTGCGATCGGTTTTGAAGATCGTAAACTCCGTGCTCTGGAAGAGATTATTCCAGGCTACCTCTCGCGGATATTACATAGTATCGATGGTATCCGTACTGGAGATAAAAATACTCCTCGCGTCGTTTACAATCAACAACGTGGTACATTCACGACATTTAACGAGTCCGTAGAAGACACGCATAATTCTCTCATCGGTAAAGATGAGATCGAACGTCAGCGTCGTACCATGTCTTCTTTATTGAAGTCGATTGACCCTAACGATTCGTTGAGTCCTCAAGGTAGGGACGCTATTATTCGTGAGCTGATGCGTCGGGGCAGAACCAGTGCTGCGTTCAACCCTAACAAGCTCATGAACTTAAACGTTTCCGGTATGTCCGAAGCCGATAAGGATACGTGGCGTAAACTCCTCGTAGAGCGCTACGGGATGACTCAGGGTAATGATGGTCGTTATTCGACTAACATCTTCTCTGGTCGTAACCAAAACCTTAACCGTGATGCTGGGTTATTCAACTACGGTTCAAACCAAACCGTTGGGATTTATAATCGTGCACATGCGTTGGCGAGTACCGGTGGAATCGAAGCATTAATTGCAACAGGCGCAGTTAAGTTCCGTAACGGTCGTTGGGATATCAATCCTGACTACTACGGTAATCGTACTGATAATGAAGGGGTTGAAAATGGTGAAGGCGGTTTATCAGGATCTCCGTCACAAGCTCCATCTATTTCGTCGTTGCTTTCTGGAAACACTGGGCCTCTTGGTGCTGCTCGTTTTAGCCAGCTTCGTAATTATCCTGGACCTAGTTCTATTAACTATTCTGCTCGGGTTGACAACAATTCGATACTTGACCTCACTCGTCGTCGACAAGCTGAGAAAGGTAACGGGGTAGTTTCTGCCATTGAAGAACAAACGGCTAAGTTGTTGGCTCAGTTGGGTATCCAACAAGAGTTCACGCATCACGCTGTAGGTTCGTTGGCTGACAACGTTGAAGCTATCCGGTCTATCATCGCCGCTGGCGGTATGGGTGGTGGTTCAGGCGGTGGTGGAGAAGGTACGGGCTCCTCTACTTCAAGTGCTGCTCGCGGTCCTTGGTGGAGACGTGCTCTTAGCACAGCATGGCGTGGGCATAAAGCAGTATGGAACGCTACTGGATTACCTTTCCGTGCATTCAATGCCGCTCTGCGCAAATCGATCTCTCCTGCTATGGCGGTAGGTCGTACTGCCATGAACGTTCTCACCGGTGGATTGACTGGTGTAATTGGTCGTGCTCGTGATCGGTTCAGTGACGTTTACATCCAAGGTGCTCAAGGATTTAAAAAGGTCATCAGTAAGGAAGGCTTCGGGACTGGTCGGTACATTGATCAGAACTCCGGTAAAGTTATTTCCTCTATTAAGGATATCACCGGTCCGGTATTTGATACCGTTGAGCAAACACAAGTTCTGAGTGCAGACGATGTCAAACAAGGTCTGTTCAATAAGGACGGTAAACGCCTCTCTGCCAATATCTTTGGTACAGTAGGTAAAGTAGTTGCCGGTATCCACAACGCAACAGGTGTTCCTTTCAGGATGGCTACTGGTGTTGCGCGCGGTTTCCTTAATACGGCCAAACGACTGCTGAGCAGAATGCCTGATGTTTACGTAGCAGGTGAGAAGGCTCCCCGGCTTTACAGCTCTAAGCTGAATGCTGGTGAATACTATCAAATCGCTACAGGCAAGATTGTTCGTAGTCCAAGGGACATTGTTGGCGACATCGGTGAGATGGATCCTACTACCCGTCAATTGCGTCCTGTACTGCTCGATAGCGAGATTCGCGAGAAGGGGATTGTAGATCGTTCAGGTAAACCTATCCGTAGCGGCTACGGTACCGTAGGGGCGTTAATTACCGGCGGTGTTGGTACTGCGTTCCGTATCGGTAAAGATCTCCTGAGTCTTCCATGGAGAGCGGCTAACGGTGTTGTAAACATGGCAGGTAATGCCCTGGGTGCAATTACTGGCATTGGTCGTCGTGGCGGTAAAGGTACCGATAAACAAACCTTCTGGCTGAAACGTATCTATCGTCTGTTAGCTAACCAATTCACTGGACAGAATCCGTTGGAAGGGTTGGGTGATAGCGTAGAGGATCTGCGTAGCGGTGGTCAAGGTGCGCTTTCCAAACTGACCGGTTGGGCACGTAATGTCGGTAAGAACTCTATCGATCGTGCTAATGACATCAGAGAACGTTTAAGTGCTCGTGCAGGTAGTTGGTTAAACCGTTTGAAAGATAACGGCGGGAAAGCTGCAGACGTAGCCAAAGCTGAGAAGGTTGCTGCTAAGACTGAGGGCGGCTGGTCTAAACTTATCTGGATGGCTCTGTCTGGTATCGGTGCTGCTATTGGCGGCATTCGTTCTGGTCTGGGTAAATTCGCAGGTTGGATCAAAGACTTGCCTAAATGGTTGGCGCTTCGTAAAGGTGCTGTTGCTCTAGGTGACATCGGTGATTTGGCAGGCGGTGGTCGTAAAGGCGGTATCCTTCGTCGTGGTGGTCGTCTCTTAGGTAAGGTTGGTCGTTTGGCTGGTCGCGGTGCATTGGCAGCAGGTCGCTTTGCATTAGGTGGCGCAGGTACAGTTCTCCGTATGGGTGCAGCTGCACTCGGTGGATTAGTCTCTGCTCCTGGTCTGGCTATTGCCGCTGCTGTAGCAGGTACAGGTTACCTGATCTATAAAGGTTGGCAGATGTACAGTAACCGCATGACTCCACTTCGTGACTATCGCATTGCTCAATATGGTGCCGATGTTAACGATGGTGAATCTCGCGGTAAGATCTTGGCGTTAGAAGAAGCTGTACTCAAGAAAACGACGGTCATGCCTAACGGCGGTGTTCGTATTGGCTCTCTTGAGTTCGAGTCTCTCCTCGAGTCGTTCGGTATTGAGTTGCAAAACCAACGTCAGGTCGTAGAGTGGATGCGTTGGTACAACAAACGCTTTGTTCCGGTGTTCTCTAAGAACCTTACGGTACTCCGTAAGATGGATCCTAAAGCTAAGTTGACTGATGCTGACTTCCTCGAACCTGGACAACGACCACAGTTCGCAAGGGAAACCTTTATCGAAAGTTCTGGTGAAAACTCACCTTACAACATCTCCGCCTCACCGTTCCCTGGTAAGCGTTCTGTTGTAGGCTCTGGCTATCCGGCTAAATACCGCGATATCGTTATCGAGAAATATTCCCAGCAAGAGAAGGCGTACCAGTCGAAGAAATCTGTCGACCAAGCTAAGAGTACGTTTGCGACTAAGCCGATCACTCCTGTTCAGAATGCCCTGCGCAATATGCAACAGCAAGATGACCGTGCCATTAACCCATCAACTGATCTGTTCTACAGCCCAGGTGATAAAGTCAGTATTCCTGGCGGTATCACGGGTAACGTCCAGCAAGACGAGATGATCCAAATCTCTAACCGAATTGATGACCTCAGTTCTATCCGTGTAAAAACGTATGGTCTTAATCAATTAGTGAAAGAAGAAGTCAACTTGCTGCTGGTAATGGAATCCGAGCTGATTAAACAGGTTCAGTACAATGCTAAGTTCCAAGCTACCTTCAATGGTGACATGGATAAAACCTTCGCATTGTGGGCACCTCGGTTTGGTATCAACACCGCAGATAAGGAAGCGAAGACTAACTGGATGACTTGGTTCCAGCATCGTTTCTTACCGGCCTTCTTGAACTTCTGCGCTCAGGCTAAAAAGATTTCTCCACAGACATCTCCTATTGATTCTTGGAAAACGCTTAAGTCTAGTGATCTCTTGAAGATTGCTAACTTCCTGGTTGGCGCTAAGACTGAGTTCAATGGTAATACGTATTCTGTCTGGCAAGTACTGGCGTCTCCATGGCCAGGTCGTCGGATGAATGCGGATTCCAGTTCCGTGAACGATAACCTCGACTCGTTGAGGGATCAGTCTAAGAAAGAAGTTTATCAAGAGAAAGTCCGTACCCAGAAAGAGATCGACAAGACTACCTTTGACGGTAAGAAACTTGACGACACTAAGACGGGTCAAGCGATTAAGATGGCGTTGCAAAACCAGATTGCTGTTTCTGGCAAGTACAGTGGATCCGCTCAAGGTGGTAACACTAACTCGTACTCAACCAGTTACGGTACTACGGGCACGTCGTTCGAGAACGCTGGGACTTCAGGTATCTACGGTAATGAGTTGCAACATGGTACAGGTACTGGCGGTAGCGTAAATGACCTTCCTCAGTCCCAGGGCAGAGGTTGGGCAGAGAACCGCGATCTCATCGTGGCTGCTGCTCGGATGGTAGGTGTGGATGCCGGTGCTCTTGCTGCGATGGTTGCACAGGAGTCGAGGTTTAACCCGGCTGCCAAAAACCCTAAGTCCAGTGCCGCAGGTTTCGGTCAGTTCATCGACTCGACTTGGAAGGAAATACTCCCTACTCTGGTTAAGAAGTACGGAGTTAACCCTAACGCTACTCAGATGGATCCTCGTGCTAACATGTTAGCCACAGCTGAGTACATGCGTAAGAACCAAGAAGCTTTAGGTAGCATTGGTCGTCCATTGACTGCAGAAGACCTCTACGCTGCTCACTTCCTAGGAACGGGCGGTGCACGTAAGATGCTAAGTAAATCTGACGATACGGATATTCGTCAGGCGATGACCGACTACGATAAGGTATCTAAGGCTAACCCGGAGATCTTTAACGGTGTTAGAACGGTCGGTGATTTCCGGAGAAGTCTGTCCGGTTATCTGAACCGTAATGGTGGTCAGTACGTGGATGAAGCTAACGCTCTGTCTAATCGTGCTGCTTCCGAAGCGGGCGATCGTAACGTAGGTGGTACGCCAACTACTCCGGCTCTCCCTGCTGAAACACCAACTACCCCTGGTGCTACTGCATCAACTCCTACCCCGTTCGATCCTAAAGGTGCCTTGCCTAAAGGTAGTACGTTGGGTACGGCTAACTTTACCGGTTCTACTGATACGGTTCCAACTATCACTGCACCGAGTACTGTGGCTCCGGAGATTGCTGCAGCGCAAGATCAGCGTAATGAAAGTCGTGAACTCCAACGCAGCTCTGTCACTCGTAGACAAGAAGTCGTGAGGGAGAAAACGAAGAGTGAGATGAGCTCTGTTGATTTTATGAAGGATTCACTCACTTATCAGAAACTGACCAGCGAAAACACCACAGGTATTCTCAATGCTCTCCTTAAGCACTTAAAAGGAAGTAAGACTCAAGGTGAAGACATCCCGGCTAACTCCAAGAACTCTGATACCGATGATTTACTTCGTCGGACATCGACTTCTGGAGGGATGCCAGAGAAGACCGGCGGTTTGCCGTTCGATACCCGAGTGACACGATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4e98bb8b6bd81f4cb2ad9d675b26e7ef55545db5f82d6ea205469158cc6b0641
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4871
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50