Protein

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Genbank accession
YP_002790801.1 [GenBank]
Protein name
glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,69
Protein sequence
MELKGKSSRIQSSLGSKLVESNDSVISTLLIARVKDINYQENYVIFVPITTNSTSRPSTRGTNQALLPSEFAGRNGFGRSYGVINPIHVGDIVLIGLLESDAAKPIVISRYPDTKIASELTDQASEHYEPADFSNYATANKRTIVYPDQGYNIHDGRGNLTLKFSGNTFMLVRPDVPAVSHATDDGDTPINAQNIPGNSDSSGQSRNAIVQNAPEVIYGHRGNINKDGTKDNHAYYVYIGQDGDYRVSMMQDDQDWRTYFEETPDGQIRLRRQEDSKIFGTGSKSSEFLIDNNGYVTIRSQSTGLVLKPDGIYNLDGTKFTVDTDLSGVWDAITKTQNGVKENKAQITVNANEIATKVSTDELPTAINNQLKPYDDSLKSLQDSYTDVKKTIDNMASDGIISGADKKATRTIWLQIQTEYPATVAQAEANGVDHSSLDTSYNTLSAYLEPILNAGGDTTVDPTEWDRNFSNYYNASFNVNTAIVAALRKLAQDGYDKAVQAGEDVGNALTQVSQATSEDYLTGADKATLGHVWTQIQNQYPNDVSSADAVKVDHNALDGAYNDLNTYIQTNKIFADNSTIPIDGETLADKIKAYFKQEAVVLKQVADKNIQTLAEYGQDIDHQATAIKETSTKIALSAENIQKHSDSLSVMQGQLNVMANQISGGVSETDVTGIVNDSLSGTGLGQTNQFVLKTATKGQYMNGNNGSSSASTNGIISDYVAVTAGTAYSAKVYGATGTIKLSVMWYDSNKSFISGTEKTGTGDVTNNGTAPTNASYAKVSTDNYNFNTLFIAGNAPSAWAPSYVDAKGNVDSANQLLKSLTDEQANISASINANGNKKKTNVDNIDSMFANGNLVSTDIGALNGILTDISSDHSSDNSLATQYGVDIAALNNYYGQLKDDINGLLGQAEGSNVDIDSYRAKLTAYYTSRDTFLQAVKGKIDSQVSSAKQALSNASNTANEVITNKYANFAVTVDGISTKVGEVTTTANNASAAASTAQSSANNAQSSANAAKDSAASAASAASTAQVTANAAQASATNAASAASAAASAASATQKSLDTLTDDGNISPIEKQTLAKEYATIKSNKAIDLAQATKYSVDATAYTNAEQAVETMVIPILNDMTTNTAVDRDKYKSTFSTYYNERTNLLNAIADVAKNAASAAASAASVAQGTANSAASAASAAQSDLNNFKTTTTQKFSEIDQTADGIKQSVSDVTTTANNASTAASTAQSSANNAQTTATSAASAASAAQATASAAQASATTANSAASAAASAASTAQASANATQSSLDALTDDGNISPIEKQTLAKEYATIQSNKTVDLAQATKYSVDATSYTNAEAAVEVLANQLLASMSTSTFVNRDSYKSTFATYYNARTQLLNAIADVAKNAASAAASAASAAQGTANTAQSTASAAQATANAAQSDLNGFKTTTTQKFSEIDQTADGIKQSVSAVTTTANNASDKINNLQVGGTNMLPNTIDFSSWQMSSGVSVDKTVYPGVAHYPSNKAGSDDNFLHYDSLTSLVANNTYTFSFSAKGSGPLSVYIYPSVAATGAADNFHQYALTSTYQKYSFTFTASSTISGTKSVLFRNSNGNTLEAYITQVKLEQGNTATDWSPAPADNATLATVNNIGQKNLVYNSEITSLDGWTTDTGISVNSNQWDSYNGSNSLGIHATGLGANDWRYVYSNPVNVIAGQEYSVMGTLFFTGPLGNPLPASIFLETDFFDASGTRVGFPSVGFDMTRPYDKQVLKLEGIMPPSTAVTMRLAVQVQGGTYNFMLNHPMLVAFPTIGPYQPDTASTSDLAATNKTVKTVQTQTANNWSIFAQGIGGTSAGISVDGNGTVTISGNKLVIGSDFIAGNITGKTITGSSFINYYQHVKVDNPNIVRLNYITNSDQDVVVGNASGQAFTILPTQLGTFSGPYVFTAQLTNANAGQTGVTIGRCDPSNGNNNVETSDVSIVNGTITKKFTGTDNPNYTALILYPNTGAWGGSNGKVITYHHYKLQPGSNPTPWITPSSENIIYATGETQIADHNMESKGAIEDSNSQDTGYRYDTAISPVGFTNHIDTPDGAGSVYNLKVSNGILNMTSLVNDVAAINKKYISSSFRATDNVTYYWNNTTAYTDADVAWGYIYYARRGNLCTAAFDILAKGAQGWLDLAQPRPGYKPYLAQATGGTLASVSYPSDKCAVYYVAGGYWRLIPSAGRGEYRGSVSYITQDDYPTGDPFF
Physico‐chemical
properties
protein length:2222 AA
molecular weight: 234818,21480 Da
isoelectric point:4,81991
aromaticity:0,08056
hydropathy:-0,34739

Domains

Domains [InterPro]
DC_0015
STR
3–519
DC_0015 Coil DC_0015 G3DSA:2.60.120.260 DC_1001
DC_0855
STR
463–953
DC_0855 DC_0015
IPR003305
CBM
1475–1579
IPR003305
IPR008979
STR
1484–1604
IPR008979
YP_002790801.1
1 2222
Architecture
STR
STR
STR 3-953 | STR 1020-2159 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage Lb338-1
[NCBI] 		2892342 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_002790801.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_012530 [NCBI]
CDS location
range 79589 -> 86257
strand +
CDS
TTGGAACTAAAAGGGAAATCATCAAGAATACAGTCAAGCCTAGGTTCAAAATTAGTAGAGTCTAATGATAGTGTTATTTCAACTTTGCTTATTGCAAGAGTGAAAGATATTAATTATCAAGAAAACTATGTAATATTTGTTCCTATCACAACTAATAGTACAAGTCGTCCCTCTACTAGGGGAACAAATCAAGCACTTTTGCCAAGTGAGTTTGCAGGTCGTAATGGATTTGGCAGATCCTACGGGGTTATAAATCCGATTCATGTTGGCGATATTGTTCTGATTGGCCTTCTTGAATCCGATGCGGCCAAGCCGATTGTGATTTCAAGATACCCAGACACTAAAATAGCATCAGAATTAACGGATCAGGCTTCTGAACACTATGAACCTGCTGACTTTTCAAATTATGCAACTGCTAACAAACGAACAATTGTTTATCCTGATCAAGGATACAATATTCATGATGGTAGAGGAAATCTTACCTTAAAATTTTCTGGTAATACATTTATGTTAGTACGTCCAGATGTTCCTGCTGTATCTCATGCTACAGATGATGGCGATACTCCTATTAACGCACAAAACATTCCTGGAAATTCAGATAGTAGTGGTCAGTCTAGAAATGCTATAGTTCAAAATGCACCAGAGGTTATCTACGGACATCGTGGCAACATCAATAAAGATGGAACTAAAGATAATCATGCTTACTATGTTTATATAGGGCAGGATGGTGATTATCGTGTATCTATGATGCAGGATGATCAAGATTGGCGTACCTACTTTGAAGAAACTCCTGACGGCCAAATAAGGCTACGTAGGCAGGAAGATTCTAAGATATTTGGTACTGGATCAAAATCAAGTGAGTTTCTCATTGATAACAATGGCTATGTAACGATAAGATCTCAGTCTACAGGTTTGGTTCTTAAACCCGATGGTATTTATAACTTAGACGGTACAAAGTTTACTGTTGATACTGATCTTAGTGGTGTATGGGACGCTATTACTAAGACACAGAATGGTGTTAAAGAAAACAAAGCTCAGATAACTGTTAATGCTAATGAAATTGCTACAAAAGTAAGTACAGATGAACTTCCAACTGCTATTAATAATCAATTAAAGCCTTACGATGACAGCTTAAAAAGCCTTCAGGATAGCTATACAGATGTTAAAAAGACTATTGACAATATGGCAAGTGACGGCATTATTTCTGGGGCTGACAAGAAAGCCACCAGAACAATATGGTTGCAAATACAAACTGAATATCCGGCCACGGTTGCACAGGCAGAGGCTAATGGTGTTGACCATAGTTCCTTAGACACGTCTTATAACACTTTGTCAGCATACTTGGAACCAATTTTAAATGCTGGCGGGGATACAACTGTTGATCCTACTGAGTGGGACAGGAATTTTTCTAACTATTACAATGCTTCTTTTAATGTCAATACGGCTATAGTTGCCGCTTTAAGAAAGCTTGCGCAGGATGGGTATGATAAGGCTGTACAAGCCGGAGAAGATGTAGGGAACGCGCTTACGCAAGTTTCACAAGCAACTAGTGAAGACTATCTTACAGGGGCAGATAAGGCCACTCTTGGACATGTGTGGACACAGATACAGAATCAGTACCCTAATGATGTATCTAGTGCTGATGCAGTAAAGGTAGACCATAATGCACTTGATGGTGCTTACAATGACCTTAATACCTATATACAAACAAATAAGATTTTTGCAGATAATTCAACAATTCCAATTGATGGCGAAACCTTAGCAGATAAAATAAAAGCTTACTTTAAACAAGAAGCAGTTGTGTTAAAGCAGGTTGCTGATAAAAACATTCAGACTTTAGCAGAGTATGGACAAGACATTGACCACCAAGCCACAGCCATTAAAGAAACTAGTACTAAGATTGCATTAAGTGCTGAGAATATTCAAAAGCATAGTGACTCTCTATCGGTTATGCAAGGCCAGTTAAACGTGATGGCCAATCAAATATCAGGTGGAGTATCAGAAACGGATGTTACTGGTATTGTTAATGACTCTCTATCTGGAACGGGTTTAGGGCAGACTAATCAATTTGTTTTAAAGACTGCCACTAAAGGCCAGTATATGAATGGTAACAATGGTAGTAGTTCTGCATCTACCAATGGTATTATTAGTGACTATGTAGCTGTAACCGCAGGAACAGCATACTCTGCAAAGGTTTACGGAGCTACTGGAACAATAAAGCTAAGTGTAATGTGGTATGATAGTAATAAGAGCTTTATTAGTGGCACAGAGAAAACAGGAACAGGTGACGTTACTAATAATGGAACAGCCCCTACAAATGCTAGTTATGCAAAAGTAAGTACAGACAACTATAATTTCAATACACTGTTTATTGCAGGTAATGCGCCTAGCGCATGGGCACCATCATATGTAGATGCTAAGGGCAATGTTGATAGTGCTAACCAATTATTAAAGTCGCTTACTGATGAACAGGCAAATATTAGTGCAAGTATTAATGCAAATGGCAACAAGAAAAAGACCAATGTAGACAATATTGATAGCATGTTTGCAAATGGAAACCTTGTATCAACTGATATTGGTGCACTAAACGGTATTCTTACAGATATTTCTAGTGACCACAGCAGTGATAACTCCCTAGCAACCCAGTATGGAGTTGATATAGCAGCACTTAACAACTACTATGGGCAGTTAAAAGATGATATTAATGGCCTATTGGGTCAGGCAGAGGGTTCTAATGTTGACATTGATAGCTATAGGGCAAAACTAACTGCTTATTACACTAGCAGAGACACTTTTTTACAAGCTGTTAAGGGTAAGATTGATTCACAAGTAAGTTCAGCTAAGCAGGCTCTTAGTAACGCTAGTAATACGGCTAATGAAGTTATTACAAATAAATATGCTAACTTTGCAGTTACCGTTGATGGTATTTCAACAAAAGTAGGCGAAGTAACCACAACAGCAAACAACGCAAGTGCAGCGGCAAGCACAGCACAAAGTTCAGCTAACAATGCACAGAGTTCCGCTAATGCAGCTAAAGATAGTGCTGCAAGTGCTGCAAGTGCAGCGTCCACAGCTCAAGTAACTGCTAACGCTGCACAGGCATCAGCCACTAACGCAGCTAGTGCCGCCAGTGCAGCAGCATCTGCTGCAAGTGCAACTCAAAAGTCATTAGACACCTTAACTGATGATGGAAACATAAGTCCCATAGAAAAGCAGACGCTTGCAAAAGAGTATGCAACCATTAAGTCAAATAAGGCTATTGACTTAGCACAAGCCACTAAATATTCAGTGGATGCAACAGCTTATACTAATGCTGAACAGGCCGTTGAAACAATGGTTATCCCAATACTTAATGATATGACCACTAATACAGCCGTTGACAGGGATAAGTATAAGTCAACATTTTCTACGTATTACAACGAGCGGACAAACTTACTAAATGCCATTGCAGATGTAGCAAAGAATGCGGCAAGTGCTGCCGCAAGCGCTGCAAGCGTAGCTCAAGGAACAGCAAATAGCGCGGCAAGTGCCGCAAGCGCGGCTCAGAGTGACTTAAACAACTTTAAGACCACAACCACACAGAAATTTAGTGAGATAGACCAGACTGCTGATGGAATCAAGCAGTCTGTAAGTGACGTTACAACAACAGCAAATAATGCAAGTACCGCAGCAAGCACAGCACAGAGTTCTGCTAATAACGCACAGACGACTGCAACGAGTGCCGCTAGTGCTGCAAGCGCAGCTCAGGCAACTGCAAGTGCAGCCCAAGCATCTGCAACAACAGCAAACAGTGCTGCGAGTGCTGCGGCTTCCGCCGCTTCCACTGCCCAAGCTAGTGCTAATGCAACGCAGAGTTCATTAGACGCCCTTACAGATGATGGTAATATTAGTCCAATTGAAAAGCAGACTCTTGCAAAAGAATATGCTACTATCCAGTCTAACAAGACTGTTGACTTAGCACAAGCCACTAAATATTCTGTAGACGCTACTAGTTACACTAATGCAGAGGCAGCAGTAGAAGTGCTTGCTAACCAGCTATTAGCAAGCATGTCAACCAGCACCTTCGTCAACCGAGACAGCTATAAATCAACATTTGCTACCTACTATAATGCAAGAACACAGTTACTTAACGCAATTGCTGATGTAGCAAAGAACGCCGCCAGTGCCGCGGCTAGTGCCGCAAGCGCGGCGCAAGGTACTGCTAACACAGCACAAAGTACAGCTAGTGCAGCTCAAGCAACTGCTAATGCTGCACAGAGTGACCTTAACGGGTTCAAGACCACAACCACACAGAAATTTAGTGAGATAGACCAAACAGCAGATGGCATTAAGCAGTCCGTAAGTGCAGTAACAACAACAGCTAATAATGCCAGTGATAAGATTAATAACTTGCAAGTCGGTGGCACTAACATGTTACCAAATACCATAGACTTTTCATCATGGCAGATGTCTAGTGGAGTGTCTGTTGATAAGACTGTTTATCCAGGGGTTGCTCATTATCCATCTAATAAAGCAGGTTCAGATGATAACTTTTTACACTATGATAGTTTGACAAGTCTTGTTGCCAATAATACTTACACATTTTCTTTTAGCGCTAAAGGTAGTGGTCCTCTGAGTGTGTATATATATCCAAGTGTTGCAGCAACCGGCGCCGCAGACAACTTTCATCAATATGCTTTAACGTCTACATATCAAAAGTACAGTTTTACCTTTACAGCAAGTTCCACCATTAGTGGTACTAAGAGTGTTCTTTTTAGGAATAGTAATGGTAATACTTTAGAGGCATATATAACACAGGTCAAATTAGAGCAAGGAAACACAGCAACAGACTGGTCTCCTGCACCAGCAGACAATGCTACCCTAGCAACAGTTAATAATATTGGGCAGAAGAACCTTGTTTACAATAGTGAAATAACAAGTTTAGACGGCTGGACAACTGATACAGGTATAAGTGTTAATAGTAACCAGTGGGATAGCTATAATGGTTCAAATAGTTTAGG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b130da260a4c8b98f0e6d74a2ff8228adab12c558d7b64660a93aaa7de777aab
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6999
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50