Protein

View in Explore
Genbank accession
AIX32180.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MAYLLSNGGVIINDSREIVNAGVVTATAFFGDGSGLSGIATISDGGISIGDANITGNLNVSGISTVEFLNASDINVGGALTVTGDLSVGGDLSFEVSGRNLNITGISTLGTVKISNGIVTATSGVVTYYGDGSNLTGIDITDSDVRLRNLSVTGVSTFTGDVSFGANASLVGDLTSGRNANLSGIATVNDIYIDNLLYDSNNNVGAAGSILVTAGGKLQWLPPDQAGIATVFQPGNTFFVSKNGDDSSDGLSMEKSFATISYALSQISSGTNNVLLITAGDYEEVFPLSVPDGLTVKGVGQRAVLVRPTSATETNDGFQLGNASTVEDLTIGQMFKPQGASNNNYAFTYRSGATISSRGPYVSRVTVLNKGSVTSTSDPFGYGSADAYPTTAPGGAGVLADGSVLNSASLEASFLLNEVTTFTAGNIGIDMVNGARVEWLNGFSYFASEGVKGRADQSTGLYGAGKTRLRVENASGGLVNGNTIELYDIDGTTSLASGTIDGTSGAYTTLTTGGTGTFAIAGSRKAKAASFVDTASLSTTQAKFGNASLDVTGQSTDCINVDPSSDFGFGTGDFTAEFWLYRTSATAGATILDMRDAADTDSALSIRENTSDVIEVLVGNSVVLTSSTSAIGNAAWYHIAVARLGSTMELFINGAQEASASNSSDLGLSQSLTFGADYANANGTIAFLDELRIEKGAAKYTNPFTPSTVPLEGDRGTAILLHFDGSNGATEAPDDIQIFQDIRISGGNTADRLSLADYSQFGAELRSSGCAVEYGNKGVVGDGAGVALRLIGINFSFVGALGDLTNDPNLAVQANEVTETNNAEVSFTSIDQGGDFRVGESFYVNQETGDVSFNNTTTDLTSLSSLTITDGTNNSLITPTSGRFGNVQISGQQVASVSGDLDLVTAGGGEVNIYGNTNVVGILTAQVVEINAIQKGDTSIALDDTGTDGTIRFNTDGSEAGRFTKDNDLAVTHNFRVGGIGTIPNLVSTTATITTLNVENLVSSGSTSGGGGTGIGSTAINSPNLNISGQANFNNVNVSGVATVPDLTVTNSFTNTGYSTITGDAEVGGNLWLKGDLNVIGSQNVSEFFATNMEISGIATFGTVKVNSNVHCDDTVFVGGAVTITGPITAVDIFATGIGTIPVADVGHADVDSINVTGISTISQVDIGKITVGDFTVTGFATVTDGLEVIGPVSFGGSITQLPLPTGQGGVWFDNSVVGVGTLLATNASISGLLGVGNSLGVAGDAYIDGNIIGSGGTISNYNEIITPLLTATDIDAATLDVSGNVTIDGNVDLGDTSADFVRINGRVSTSFIPSTDSATDLGSNGLRWKELFVDKLTLTDDAAIGGDLSVGGSVSADYVDTTELNVSGVATFAQISIGGGGGGISTNGVIINNVTVTDQSTLNNLIVSGVSTFVGVSTFKGDVYIDGNLIIDGDNSQDLISGTNLLVSGIATIGTLGVTTNLTVGGDVLVSGAMTAGSYNGDGSQLDNLPAASITTSITPTTRVNGDTLQTGDLWYDSSELRQYTYYDDGGSVQWVPSAPEPTIPDFTYAGNTGIGTLSLGDDTFSVVGDGTNVVTTASGVTTTVTISLSDSVAIAGSMTAGSFLGENLNVSGVSTFVGVTTFRGDVFIEGNLIIDGDESQDLVSGTNLIITGIATIGTLGVTTTTTNTLTVLDTFTLDNPVNSIGISSDLGGAGAAHTALASQLAIKQYIDANNSDQNLNFTGDTGSGSIGLGTEFLEVRGTAQQVTTIGVGNSVVIGLPNTVRVPQRLYVGGGAFTQVMDANSASGVVFANKIVTINKGLTLSSSDLTGVRNLVQTGIATLGTVNFSGVTTTVGNAFVGNDLSVLGTVNANDFNSTSDATRKEDVVEIEDALAKVLDLRGVTFNWKNGEGSSAGVLAQEVQMVLPEIVKGDVGNMSVQYNGIIALLVQAVKELSSEVEELKRTKSDKRRKKS
Physico‐chemical
properties
protein length:1955 AA
molecular weight: 199219,90860 Da
isoelectric point:4,06071
aromaticity:0,06292
hydropathy:0,10900

Domains

Domains [InterPro]
DC_0763
STR
2–900
DC_0763 DC_0407 DC_1671
G3DSA:2.60.120.200
STR
503–702
G3DSA:2.60.120.200 IPR030392
IPR013320
STR
538–695
IPR013320 IPR030392 Coil
PF13385
LEC
567–696
PF13385
AIX32180.1
1 1955
Architecture
STR
STR
RBD
STR 2-900 | STR 909-1155 | RBD 1258-1949 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Atlauavirus > Atlauavirus tusconc8
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX32180.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019102 [NCBI]
CDS location
range 207633 -> 213500
strand +
CDS
ATGGCATATTTACTTTCTAATGGGGGCGTTATTATTAACGACTCCAGAGAAATCGTAAATGCTGGGGTTGTAACTGCTACTGCGTTCTTTGGGGACGGTTCTGGTTTATCTGGAATCGCAACCATTTCTGATGGGGGAATCTCCATCGGCGACGCAAACATCACTGGAAACTTAAATGTTTCTGGTATTTCTACCGTAGAATTCTTAAACGCTTCTGACATTAATGTCGGCGGTGCTTTAACAGTCACAGGTGATCTATCTGTCGGTGGTGATTTATCTTTTGAGGTTTCTGGTAGAAACCTAAACATCACTGGTATTTCCACACTCGGAACAGTTAAGATTTCAAATGGCATTGTAACCGCCACTAGTGGCGTTGTTACATATTACGGTGATGGTAGCAATCTAACCGGCATTGACATCACAGATAGTGATGTAAGACTCAGAAACCTTTCGGTTACTGGTGTCTCTACATTCACAGGTGATGTATCTTTTGGAGCAAACGCTTCTCTAGTAGGCGACCTAACTTCTGGTCGTAACGCAAACCTTTCAGGTATTGCGACAGTAAATGATATCTATATTGATAACTTACTTTATGATTCCAACAATAATGTTGGAGCAGCTGGTTCAATTCTTGTAACCGCAGGTGGAAAGTTACAGTGGCTACCGCCCGATCAAGCGGGTATTGCTACAGTATTCCAACCAGGAAATACATTCTTTGTTTCTAAGAATGGTGATGATAGTAGTGATGGTCTCTCCATGGAGAAATCATTTGCTACCATTTCCTACGCTCTGTCTCAGATTTCATCAGGGACAAACAACGTTCTCTTAATCACCGCTGGTGATTATGAAGAAGTATTCCCACTATCAGTTCCCGATGGACTGACTGTTAAGGGTGTTGGACAACGTGCGGTTCTAGTTAGACCCACTTCAGCTACAGAAACCAACGATGGTTTCCAACTTGGTAACGCATCCACAGTTGAAGATTTGACCATTGGTCAGATGTTTAAACCTCAAGGTGCTTCCAATAATAACTACGCTTTCACATATAGAAGTGGTGCTACCATTTCATCTCGTGGACCTTATGTTTCTAGAGTTACGGTTCTAAACAAAGGTAGCGTAACTTCTACCTCTGACCCATTTGGATATGGTTCAGCTGATGCTTATCCAACGACTGCCCCTGGTGGTGCTGGTGTATTGGCTGATGGTAGTGTTCTTAACTCCGCCTCACTAGAAGCCTCATTCCTACTTAACGAAGTCACCACCTTCACTGCCGGTAACATCGGTATTGATATGGTCAACGGTGCTCGTGTTGAGTGGTTGAATGGTTTCTCCTACTTCGCATCCGAGGGTGTTAAAGGTAGAGCTGACCAGTCAACTGGTTTGTATGGTGCAGGTAAGACGAGACTAAGAGTTGAGAACGCCTCTGGTGGTCTAGTCAATGGTAATACCATTGAACTCTATGATATTGATGGCACGACTAGCCTTGCTAGTGGTACTATTGACGGCACCAGTGGTGCATACACGACCCTGACTACTGGTGGTACTGGTACCTTCGCTATTGCAGGAAGTCGTAAGGCGAAAGCTGCCTCATTCGTTGATACAGCCTCTCTATCTACAACACAAGCCAAATTCGGGAATGCTTCACTAGATGTAACTGGTCAGTCTACTGATTGTATCAATGTTGATCCAAGCAGTGACTTCGGTTTCGGTACTGGTGACTTTACAGCTGAATTCTGGTTGTATAGAACATCAGCTACTGCTGGTGCTACTATTCTCGATATGAGAGATGCAGCTGATACTGATTCAGCTCTATCTATTAGAGAGAACACTAGTGATGTTATTGAAGTTCTTGTCGGCAACTCTGTTGTTCTAACTTCATCCACAAGTGCTATTGGTAATGCCGCTTGGTATCACATTGCTGTTGCCCGTTTGGGTAGCACAATGGAACTATTCATTAATGGTGCCCAGGAAGCTTCAGCATCCAATTCATCTGACTTAGGTCTAAGCCAGTCACTCACCTTTGGTGCTGACTATGCTAACGCCAATGGTACTATTGCGTTCTTAGATGAACTCCGTATCGAGAAGGGTGCTGCTAAGTACACGAATCCGTTTACTCCTTCCACTGTACCCCTTGAGGGTGACCGTGGTACAGCTATCCTACTCCACTTTGATGGATCAAATGGAGCAACTGAAGCTCCTGATGATATTCAGATATTCCAGGATATCCGTATCAGTGGTGGTAACACAGCTGATAGACTATCACTTGCTGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGAGTTGCGTTCCTCTGGTTGTGCTGTTGAGTATGGTAACAAAGGTGTCGTCGGAGACGGTGCTGGTGTTGCTCTAAGACTCATCGGTATTAACTTCAGTTTCGTAGGTGCCCTAGGTGATCTAACTAACGATCCAAACCTAGCCGTTCAGGCTAATGAAGTTACAGAAACCAACAATGCTGAGGTATCTTTCACCAGTATTGATCAAGGTGGTGACTTCCGTGTTGGTGAATCCTTCTATGTTAACCAGGAAACTGGTGATGTATCATTCAACAACACAACAACTGATCTAACCTCACTATCTAGTCTAACCATCACTGATGGTACTAACAACTCACTTATCACTCCTACCTCTGGTAGATTTGGTAATGTTCAGATCTCTGGACAGCAAGTTGCTTCTGTATCTGGTGACCTAGACCTAGTAACCGCTGGTGGTGGTGAAGTTAACATCTACGGTAATACTAACGTTGTTGGTATTCTAACCGCACAGGTTGTTGAGATCAACGCTATCCAGAAGGGTGATACTTCTATCGCTCTAGATGATACCGGTACTGATGGTACTATCCGGTTTAACACCGATGGTTCTGAGGCAGGTAGATTCACTAAGGATAACGACCTTGCAGTAACACACAACTTCCGCGTTGGTGGAATTGGTACTATTCCAAACTTGGTAAGTACTACTGCAACCATCACAACTCTAAATGTTGAGAACCTTGTCAGTAGTGGTAGCACTAGTGGCGGTGGCGGAACTGGTATCGGTTCTACCGCTATCAATTCACCTAACCTTAATATTTCTGGTCAGGCAAACTTCAACAACGTCAACGTTTCTGGTGTTGCCACGGTTCCTGATCTAACTGTAACCAACTCCTTTACTAATACTGGTTATTCAACCATCACTGGTGACGCCGAAGTTGGTGGAAATCTATGGTTGAAGGGTGACCTCAATGTTATCGGTTCCCAGAATGTTAGCGAGTTCTTCGCTACCAATATGGAGATCTCTGGTATCGCTACCTTCGGTACCGTAAAGGTCAACAGTAATGTCCATTGTGACGATACTGTATTTGTTGGCGGTGCTGTAACAATCACTGGTCCAATCACAGCAGTGGATATCTTTGCCACTGGTATTGGAACCATTCCTGTAGCAGATGTTGGACATGCCGATGTTGATTCTATCAATGTCACTGGTATCTCTACTATCTCTCAGGTTGATATCGGTAAGATTACCGTAGGTGACTTCACTGTAACTGGATTTGCAACTGTCACTGACGGACTTGAAGTTATCGGTCCTGTCTCATTTGGTGGTTCTATCACACAACTACCTCTACCAACTGGTCAAGGTGGTGTTTGGTTTGACAACTCTGTTGTGGGTGTCGGCACACTACTCGCCACTAATGCATCAATTAGCGGACTCCTCGGAGTTGGTAATTCATTGGGTGTTGCTGGTGATGCCTACATCGATGGAAACATCATTGGTTCTGGTGGTACTATCTCTAATTACAACGAGATTATTACACCTCTCCTAACCGCAACTGATATCGATGCAGCTACACTCGATGTTAGTGGTAACGTAACCATTGATGGAAACGTAGACCTTGGTGACACATCTGCCGACTTCGTTAGAATCAACGGTAGAGTAAGTACTTCCTTTATTCCTTCTACTGATAGTGCAACTGACTTAGGTAGCAATGGTCTCAGGTGGAAAGAACTCTTCGTTGATAAACTCACCCTCACAGATGATGCTGCTATTGGTGGTGATCTATCTGTTGGTGGTAGTGTATCTGCCGATTATGTAGATACTACTGAACTCAATGTCAGTGGTGTTGCAACCTTCGCTCAGATTTCAATTGGTGGTGGCGGCGGTGGTATTAGTACCAACGGCGTTATTATTAACAATGTTACTGTTACTGACCAGAGTACTCTTAACAACCTCATTGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGTGTTTCTACCTTCAAGGGTGATGTCTATATCGATGGTAACCTAATCATTGATGGTGATAACAGTCAGGATCTAATCAGTGGTACTAACCTACTCGTCAGTGGTATTGCTACCATCGGCACACTAGGTGTAACTACAAACTTAACTGTTGGTGGTGATGTACTTGTCAGTGGTGCTATGACCGCTGGTTCATACAATGGTGATGGTTCTCAGTTAGATAATCTACCTGCAGCATCAATCACAACCTCCATAACACCTACAACTAGGGTGAATGGTGATACACTACAGACTGGTGATCTATGGTATGACTCTTCTGAGTTACGCCAGTATACTTACTATGATGATGGTGGATCCGTTCAGTGGGTACCTTCAGCCCCAGAACCTACTATTCCTGATTTTACCTACGCAGGTAACACAGGTATTGGTACTCTATCCTTAGGGGATGATACTTTCTCTGTTGTTGGTGATGGTACAAACGTAGTCACTACTGCAAGTGGTGTAACTACTACCGTAACCATTTCACTATCCGATAGTGTGGCAATCGCCGGTTCTATGACCGCTGGTAGCTTCCTTGGTGAGAACCTCAATGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGCGTTACAACCTTCAGAGGTGATGTCTTCATCGAAGGTAACCTAATCATTGATGGTGATGAGAGTCAGGATCTAGTCAGTGGTACTAACCTAATTATTACTGGTATTGCTACCATTGGTACATTAGGAGTAACTACTACTACTACCAATACTCTCACCGTACTCGATACCTTCACTCTAGATAACCCAGTCAATTCTATCGGAATTAGTTCTGATCTAGGTGGTGCCGGTGCTGCTCACACAGCTCTTGCTTCCCAGTTAGCAATCAAACAATACATTGATGCTAATAACTCAGATCAAAACCTAAACTTCACTGGTGATACTGGTTCTGGCTCGATTGGTCTTGGTACTGAATTCCTAGAGGTTCGTGGTACAGCACAACAGGTTACAACCATTGGTGTTGGTAACAGTGTTGTTATTGGACTACCTAACACAGTAAGAGTACCACAGAGACTATATGTTGGTGGTGGTGCCTTTACTCAGGTTATGGATGCCAACTCCGCTTCTGGTGTGGTATTTGCCAATAAGATTGTTACGATCAACAAAGGTCTAACCCTCAGTAGTAGTGACCTAACCGGAGTTCGTAACCTAGTTCAGACTGGTATTGCAACTCTTGGTACAGTTAACTTCTCTGGTGTAACAACCACTGTAGGTAACGCATTCGTTGGTAATGACTTAAGTGTCTTAGGCACAGTCAACGCTAATGACTTCAACTCTACTTCTGACGCTACTAGAAAAGAAGACGTAGTTGAGATTGAAGATGCACTCGCTAAGGTCCTAGACCTACGTGGTGTAACATTCAACTGGAAGAATGGTGAAGGATCATCTGCTGGTGTTCTTGCACAAGAAGTTCAGATGGTTCTACCTGAGATTGTTAAGGGTGATGTAGGCAATATGTCCGTTCAGTATAACGGTATTATAGCACTTCTCGTCCAAGCAGTCAAGGAACTCTCTTCTGAAGTTGAAGAACTCAAGAGAACCAAGAGTGACAAGAGAAGGAAGAAATCCTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
93445e55d989c73ee78ee2e5473d636a28e15c1d3d30d5ab2339615a8271cf78
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6385
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank