Protein

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Genbank accession
UPW39488.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSGLNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLRLTIADASRAATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYSRLAANNTFSGTQAILSDNEALIFKNITQGMPLYIRGQDADGTNRWYLGNDNRDTDNLVLKNVKSGAYVAILANLISVNKSIQITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNTFIGTNTFTNFVAKKNAEAITLQNVDTAPSLYIRARKSDGDYKWYIGNDGDENILKIYNYLTKTQVSLGNTITMSKTVQIDGQVQPSDWANIDSRYIPAATLSNLAKLSDVNTFRSAQVINQNGSLLRLKNTTQDNELYIAGHNADNARRWYIGSGERDNPTRLIIHNDRTLTTIYMQDDFLLNKTVRITGQVQPSDWSNLDARYFTQAAANQRFMVAGSTGEATEQNADGVAWNAKTGLYNVTSTNADYTALVFQMYQGVNSSTACAQLKFQYKNGGMWYRTSVDSKGFEAKWSKIYTEAQKPTPSELGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHTVSGSAASAGNHNHAISWIGQNSTHYSGGGGGKIGTGPGYTDSAGAHTHTISGTAASNGNHAHSVGIGAHTHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:783 AA
molecular weight: 84916,01110 Da
isoelectric point:8,45047
aromaticity:0,08812
hydropathy:-0,43448

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–269
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
G3DSA:6.20.80.10
STR
158–219
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 IPR048388 IPR048388 IPR022246
UPW39488.1
1 783
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-361 | STR 362-380 | ATT 381-471 | STR 472-779 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_ESCO49
[NCBI] 		2918871 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus ESCO49
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UPW39488.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM386663.1 [NCBI]
CDS location
range 62 -> 2413
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGGATTAAACTCAATCGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAGATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAACGCAAACGGCCTTAGACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGGCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGGTACTCAAGATTAGCTGCAAATAACACCTTTAGCGGTACTCAAGCTATTCTCTCTGACAATGAAGCCCTTATTTTTAAGAATATCACACAAGGGATGCCACTCTATATTCGTGGTCAAGATGCAGATGGCACTAACAGATGGTATCTAGGTAATGATAATAGAGACACAGACAACCTTGTTTTAAAAAACGTTAAATCTGGTGCATACGTAGCGATTTTAGCTAACCTAATCTCTGTGAATAAATCAATTCAAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCGGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGGTTTGCGCAGTTAGCTGCGAATAACACTTTTATTGGCACTAATACTTTCACTAATTTTGTTGCTAAGAAGAATGCTGAAGCCATCACTCTGCAAAATGTGGACACTGCCCCCTCTTTATATATCCGAGCAAGAAAGTCAGATGGGGATTATAAGTGGTACATTGGTAATGACGGCGATGAGAACATTTTAAAAATCTATAACTATCTAACAAAAACACAAGTCTCACTAGGTAACACCATTACCATGAGCAAAACAGTTCAAATTGATGGTCAAGTACAACCTTCCGATTGGGCTAACATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGCTACTTTGAGCAATCTTGCTAAGCTAAGCGATGTAAACACTTTCAGGTCTGCGCAAGTTATCAACCAGAATGGCTCACTGTTACGGCTAAAGAACACCACACAAGATAATGAGCTATACATTGCTGGTCATAATGCTGATAATGCGAGAAGATGGTACATTGGTAGCGGGGAAAGAGACAACCCAACAAGGCTTATTATCCACAACGACAGAACTTTAACTACGATTTATATGCAAGATGATTTCTTGCTGAATAAAACTGTTAGAATTACTGGTCAAGTTCAACCATCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGGCAGCAGCTAATCAGAGATTCATGGTTGCAGGTTCTACAGGAGAAGCTACAGAGCAGAATGCAGATGGTGTGGCATGGAACGCTAAAACAGGCTTATATAATGTAACCTCAACAAATGCTGATTACACAGCACTTGTGTTTCAAATGTATCAGGGGGTTAACTCTTCTACTGCCTGTGCGCAATTAAAGTTCCAGTATAAGAACGGTGGGATGTGGTACAGAACATCTGTAGATAGTAAAGGCTTTGAAGCTAAGTGGTCTAAGATTTACACAGAAGCACAGAAGCCAACACCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAAATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAACAACGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACAGGTGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTTGGAAACTTACCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACCCACACTGTAAGTGGTTCTGCTGCATCTGCTGGTAACCACAACCACGCTATCTCATGGATTGGTCAGAACTCTACACACTATTCTGGTGGTGGTGGTGGTAAAATCGGTACAGGACCGGGTTACACTGATTCTGCTGGTGCTCACACCCACACAATCTCTGGTACTGCTGCATCAAATGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACACCCATACAGTAAGCGGTAACACTGGCGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGCTGATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
438d56c41b480b76184fa046804a82be18bdc7cd9701dedcc26ff408f000d581
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6849
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Avian Pathogenic Escherichia coli bacteriophages Nicolas,M., Trotereau,A. and Schouler,C. 2015-06 — GenBank