Protein

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Genbank accession
BBI57598.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,55
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIDAPAGAFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTVVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMLIFANRLWHFWESGNEERGIRVEPNTAQFQAQAGDNILRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTADIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKLGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDLKTRLRVIRDDVELLANESIIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGNLSYTPVIELSYIEDITTGGKYWVVAQNVPTVERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETNAGIDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTTPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQSASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQTETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLTGIARIATQVEFDAGVLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEAALTYSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTATFTDVTATNSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSTGTTLTIGDTTTNVLTMNTATGNVAALNNLSAGNDVQAKNNFVLNGRTIATTTGEASGATLSLGDNSQNLVLKTLDAGNIVANGGGAYKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMTGVLRVNAPVRAFGTKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDEATYSKFPGYWTMVTKRQINIDTVQTKPAGMSYKDWNNSGWLTESGTNGRDENNDPIKGPDNQPIQVVPIRYRKPDGTLGDPVSTPEAPIRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1339 AA
molecular weight: 145276,41380 Da
isoelectric point:5,45225
aromaticity:0,07692
hydropathy:-0,34040

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1117–1179
IPR048391 IPR048391
BBI57598.1
1 1339
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1116 | ATT 1117-1179 | STR 1180-1225 | ATT 1226-1287 | STR 1288-1320 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage KIT01
[NCBI] 		2382092 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BBI57598.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AP019521 [NCBI]
CDS location
range 153199 -> 157218
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCGATGCTCCGGCAGGAGCCTTTGTACCAGGTTATTGGACTGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACTGTAGCGTCTCCTACACGCCAACTGGCTTCTGGTGAATATATTGCGGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCTAACCCTACAGATGGCGATACCGTTGTAATTAAAGATATCGGTGGACGTGTTGGTTATAATGAAATAAAGGTCCAATCTAGTTCTGCTCCTGGCGGCGGTAACCAGAAAATTGTTCGTTTTGGTAATCAGTTTACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCTTATAACATGCTTATCTTTGCTAACCGTCTTTGGCATTTCTGGGAATCGGGTAACGAAGAACGTGGTATCCGTGTAGAACCTAACACCGCTCAGTTCCAAGCTCAAGCCGGTGATAACATTCTCCGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGCGATATTATTAAAACCGCTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCACTTAATCGTTGAAACATTCGATGCGTCATCTTCATTAGGTAAGCTAGGTCAGCATAGCATGGAATTCCGTACCTCCGGTGACGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGCGACCTTAAAACCCGTTTACGTGTAATTCGCGATGATGTTGAACTCTTGGCTAATGAAAGTATTATTGTTTTTGGTCCTAATAATACAACGCCACAGACGATTAATATCACATTACCTACAGGCGTAGCCCAAGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACGGTAAATATTAAGGCTGCTGTAGGAGATAAAATAGCTTCTTCGGTTCAATTGCTCCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCGCCGGATACTGAATGGGTATTGAATGATGTATTGACCTTCAATGGTAACTTAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACATCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCTCAAAACGTTCCTACTGTAGAACGTGTGGATTCTAAAGATGATTTAACCCGTGCTCGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCGTCACAGACCCAAGCAAACGTCGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTTGCAATTACTCCTCAGACTTTAGCTAATCGTGTAGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGATACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGTCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACCAATGCTGGTATAGATGACACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCGCGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCACTCCTGCGACTGCTAGGGACACCGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACGGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGCCAATCGGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCTGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAAACAGAGACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTGTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGCGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACACAACGTGGCACTGCTCGCCTGGCAACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGACAAAACTATCATCACTCCTTTGAAATTACATTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACGAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTCTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAGACCGAAACCACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAATTAACTGAAGCTGCTTTAACTTACTCAGGAAATAAAGTTACTGGTTCTGGTGTTAAATTTAACTCAGGTACAGGCCTTTATGAGAATGACGATACTGTTCTGAATGCAGCTAACTACCCTAAAACAGGTTATGCTGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGAGACGTCGACCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACCCTGACCAAACAATTGAACCTGGCAGCACCTCTAGTGTCTTCTAGTACTGCTACATTTACGGATGTTACGGCTACAAATTCTACCTTTGGTACAGTGAACGTTGTTAATGGAACCAATAAATGGAAAATAACAGCTCCATCTACCGGAACTACATTAACCATTGGTGATACGACTACTAACGTATTGACTATGAACACCGCTACAGGTAATGTGGCTGCTCTGAATAACCTTAGTGCTGGAAATGATGTCCAGGCCAAAAATAACTTTGTCCTGAATGGAAGAACCATCGCAACCACCACCGGTGAAGCTTCTGGTGCTACATTGTCTTTAGGCGATAATTCTCAGAATTTGGTTCTTAAAACATTAGATGCAGGAAATATCGTAGCTAATGGTGGTGGTGCTTATAAAGTTCTGACCGAGAAAAACGCTGTAGAAATTGTAGACCGAAACTTTGTTAACCAGGCCGGCGACACAATGACAGGTGTTCTCCGTGTTAATGCTCCGGTACGTGCATTTGGTACTAAGCCTACATTAGCATCCCAGGCTCCTACTGCAGAAACAGTTGGCTTCTGGTCTGTTGATATCAATGACGAGGCTACTTATAGTAAGTTCCCTGGTTATTGGACAATGGTTACCAAGCGCCAGATTAATATTGATACGGTCCAGACTAAACCTGCTGGGATGTCTTATAAAGATTGGAACAACTCTGGGTGGTTAACTGAAAGCGGTACAAATGGAAGAGATGAAAACAACGACCCTATAAAAGGCCCGGATAACCAACCGATTCAGGTTGTACCTATTCGTTATCGTAAACCGGATGGAACTTTAGGTGACCCAGTTAGTACACCAGAGGCTCCTATACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGATTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACCGCAGATAACCCTCCTTCTGCTGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCTACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCTGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c3e65b72f99ef58669cc35a9a15897bdf61062c034cb4df65b80edb8832a8061
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5427
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of bacteriophage KIT01, a JS98virus, infected both Escherichia coli and Salmonella enterica Pham-Khanh,N.H. and Kamei,K. 2019-07-24 — GenBank