Protein

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Genbank accession
YP_009833776.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAKKEKVDLGRANEYDFEESWGNDLNYNDLQPDNKSRDRNPTIRVGKTVLREMGKSTLTTTMAREILKGALPPSFSVTLENADRAALGTKELLTDVRREAGPAVREFKAAARSLNRLFPKNPFNKRLAKWGQENKQNPYSLNNINVEDAVASRVLEEVFANQENDRLQDQADKTIDRLSELKYRQVVADSLFGIQNELSKQTAYTFNVQRAYQKKSLELRIRQLMVSRATLDVAQKSAIETSNLLRDVVKNTGLPEVVKQRQSEEYMRYAREGVFGKINQTIGEWTRNYRTNITNRAKSAVSRQIQNFQYGLETANSGLEGMEMQRELLESMGIDPLEFAAGAVGNQAALRGGRWLGRRVRNNRFLKRTDGIFQQANYLFNNRERLLSEYGSSGQSYGRWHSPVTNLLKDVLRSGYRDQGTVRATGLNGLKDSAIGFEDRKLRALEEIIPGYLSRILHSIDGIRTGDKNTPRVVYNQQRGTFTTFNESVEDTHNSLIGKDEIERQRRTMSSLLKSIDPNDSLSPQGRDAIIRELMRRGRTSAAFNPNKLMNLNVSGMSEADKDTWRKLLVERYGMTQGNDGRYSTNIFSGRNQNLNRDAGLFNYGSNQTVGIYNRAHALASTGGIEALIATGAVKFRNGRWDINPDYYGNRTDNEGVENGEGGLSGSPSQAPSISSLLSGNTGPLGAARFSQLRNYPGPSSINYSARVDNNSILDLTRRRQAEKGNGVVSAIEEQTAKLLAQLGIQQEFTHHAVGSLADNVEAIRSIIAAGGMGGGSGGGGEGTGSSTSSAARGPWWRRALSTAWRGHKAVWNATGLPFRAFNAALRKSISPAMAVGRTAMNVLTGGLTGVIGRARDRFSDVYIQGAQGFKKVISKEGFGTGRYIDQNSGKVISSIKDITGPVFDTVEQTQVLSADDVKQGLFNKDGKRLSANIFGTVGKVVAGIHNATGVPFRMATGVARGFLNTAKRLLSRMPDVYVAGEKAPRLYSSKLNAGEYYQIATGKIVRSPRDIVGDIGEMDPTTRQLRPVLLDSEIREKGIVDRSGKPIRSGYGTVGALITGGVGTAFRIGKDLLSLPWRAANGVVNMAGNALGAITGIGRRGGKGTDKQTFWLKRIYRLLANQFTGQNPLEGLGDSVEDLRSGGQGALSKLTGWARNVGKNSIDRANDIRERLSARAGSWLNRLKDNGGKAADVAKAEKVAAKTEGGWSKLIWMALSGIGAAIGGIRSGLGKFAGWIKDLPKWLALRKGADALGDIGDLAGGGRKGGILRRGGRLLGKVGRLAGRGALAAGRFALGGAGTVLRMGAAALGGLVSAPGLAIAAAVAGTGYLIYKGWQMYSNRMTPLRDYRIAQYGADVNDGESRGKILALEEAVLKKTTVMPNGGVRIGSLEFESLLESFGIELQNQRQVVEWMRWYNKRFVPVFSKNLTVLRKMDPKAKLTDADFLEPGQRPQFARETFIESSGENSPYNISASPFPGKRSVVGSGYPAKYRDVVIEKYSQQEKAYQSKKSVDQAKSTFATKPITPVQNALRNMQQQDDRAINPSTDLFYSPGDKVSIPGGITGNVQQDEMIQISNRIDDLSSIRVKTYGLNQLVKEDVNLLLVMESELIKQVQYNAKFQATFNGDMDKTFALWAPRFGINTADKEAKTNWMTWFQHRFLPAFLNFCAQAKKISPQTSPIDSWKTLKSSDLLKIANFLVGAKTEFNGNTYSVWQVLASPWPGRRMNADSSSVNDNLDSLRDQSKKEVYQEKVRTQKEIDKTTFDGKKLDDTKTGQAIKMALQNQIAVSGKYSGSAQGGNTNSYSTSYGTTGTSFENAGTSGIYGNELQHGTGTGGSVNDLPQSQGRGWAENRDLIVAAARMVGVDAGALAAMVAQESKFNPAAKNRNSSAAGFGQFIDSTWKEILPTLVKKYGVNPNATQMDPRANILATAEYMRKNQEALGSIGRPLTAEDLYAAHFLGTGGARKMLSKSDDTDIRQAMTDYDKVSKANPEIFNGVRTVGDFRRSLSGYLNRNGGQYVDEANALSNRAASEAGDRNVGGTPTTPALPAETPTTPGATASTPTPFDPKGALPKGSTLGTPNFTGSTDTVPTITAPSTVAPEIAAAQDQRNESRELQRSSVTRRQEVVREKTKSEMSSVDFMKDSLTYQKLTSENTTGILNALLKHLKGSKTQGEDIPANSKNSDTDDLLRRTSTSGGMPEKTGGLPFDTRVTR
Physico‐chemical
properties
protein length:2213 AA
molecular weight: 241181,63280 Da
isoelectric point:9,77955
aromaticity:0,07185
hydropathy:-0,52765

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–1991
DC_0124 DC_1038
Coil
Unmapped
164–184
Coil G3DSA:1.10.530.10
IPR023346
STR
1850–1971
IPR023346
IPR008258
ENZ
1854–1970
IPR008258
YP_009833776.1
1 2213
Architecture
STR
RBD
STR 1-1991 | RBD 1992-2213
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Serratia phage vB_SmaM_ 2050HW
[NCBI] 		2024252 Uroviricota > Caudoviricetes > Chimalliviridae > Moabitevirus mv2050HW >
Host Serratia marcescens
[NCBI] 		615 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009833776.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048668.1 [NCBI]
CDS location
range 84181 -> 90822
strand -
CDS
ATGGCTAAAAAAGAAAAGGTTGATCTCGGTCGTGCTAACGAATACGACTTCGAGGAAAGTTGGGGCAATGACCTCAACTATAATGACCTGCAGCCTGACAATAAAAGCAGGGATCGTAACCCGACAATTCGCGTAGGTAAAACTGTACTTCGCGAAATGGGTAAGAGTACGCTAACGACTACCATGGCGAGGGAAATCCTCAAAGGTGCGTTACCTCCCTCTTTCTCAGTCACTTTGGAAAACGCAGACCGTGCGGCGTTAGGTACCAAAGAATTACTGACCGACGTACGAAGAGAAGCAGGGCCTGCTGTACGTGAATTCAAAGCTGCTGCTCGGTCACTAAACCGATTGTTCCCTAAGAACCCATTCAACAAGCGCTTGGCTAAATGGGGACAGGAGAATAAACAGAACCCTTATTCGCTAAATAACATTAACGTAGAAGATGCTGTTGCTTCTCGTGTCTTGGAAGAAGTTTTCGCTAACCAGGAAAACGATCGCTTACAAGATCAAGCGGATAAGACAATTGATCGTCTCAGTGAACTGAAATATCGTCAAGTAGTTGCGGATAGCCTTTTCGGTATCCAGAACGAACTCAGTAAACAAACCGCGTATACATTCAATGTCCAGCGTGCGTATCAAAAGAAATCGTTAGAGCTCCGTATTCGTCAGCTCATGGTTTCTCGTGCGACATTGGACGTAGCGCAGAAGTCTGCGATTGAAACGTCTAACCTGTTACGTGACGTAGTCAAGAACACCGGCTTACCTGAAGTTGTTAAACAACGTCAGAGTGAAGAGTACATGCGTTATGCGCGTGAAGGTGTCTTTGGCAAGATCAACCAGACCATTGGTGAGTGGACACGTAACTACCGCACCAACATCACTAACCGTGCTAAGAGCGCGGTATCTCGTCAGATCCAAAACTTCCAATATGGTTTAGAGACTGCTAACAGCGGTCTGGAAGGGATGGAGATGCAGCGTGAGCTGTTGGAGTCCATGGGTATTGATCCATTGGAATTCGCAGCAGGTGCGGTCGGTAACCAAGCAGCTCTGCGTGGTGGCCGTTGGTTAGGTCGTCGTGTTCGTAATAACCGTTTCCTTAAAAGGACAGACGGTATATTCCAGCAGGCTAACTATCTCTTCAATAACCGTGAACGTCTGCTTTCCGAATACGGTAGTAGCGGTCAATCATACGGCCGTTGGCATTCCCCGGTAACGAATCTCCTGAAAGACGTATTGCGTTCAGGGTACCGTGACCAGGGAACCGTAAGAGCAACTGGACTCAATGGACTGAAGGATAGTGCGATCGGTTTTGAAGATCGTAAACTCCGTGCTCTGGAAGAGATTATTCCAGGCTACCTCTCGCGGATATTACATAGTATCGATGGTATCCGTACTGGAGATAAAAATACTCCTCGCGTCGTTTACAATCAACAACGTGGTACATTCACGACATTTAACGAGTCCGTAGAAGACACGCATAATTCTCTCATCGGTAAAGATGAGATCGAACGTCAGCGTCGTACCATGTCTTCTTTATTGAAGTCGATTGACCCTAACGATTCGTTGAGTCCTCAAGGTAGGGACGCTATTATTCGTGAGCTGATGCGTCGGGGCAGAACCAGTGCTGCGTTCAACCCTAACAAGCTCATGAACTTAAACGTTTCCGGTATGTCCGAAGCCGATAAGGATACGTGGCGTAAACTCCTCGTAGAGCGCTACGGGATGACTCAGGGTAATGATGGTCGTTATTCGACTAACATCTTCTCTGGTCGTAACCAAAACCTTAACCGTGATGCTGGGTTATTCAACTACGGTTCAAACCAAACCGTTGGGATTTATAATCGTGCACATGCGTTGGCGAGTACCGGTGGAATCGAAGCATTAATTGCAACAGGCGCAGTTAAGTTCCGTAACGGTCGTTGGGATATCAATCCTGACTACTACGGTAATCGTACTGATAATGAAGGGGTTGAAAATGGTGAAGGCGGTTTATCAGGATCTCCGTCACAAGCTCCATCTATTTCGTCGTTGCTTTCTGGAAACACTGGGCCTCTTGGTGCTGCTCGTTTTAGCCAGCTTCGTAATTATCCTGGACCTAGTTCTATTAACTATTCTGCTCGGGTTGACAACAATTCGATACTTGACCTCACTCGTCGTCGACAAGCTGAGAAAGGTAACGGGGTAGTTTCTGCCATTGAAGAACAAACGGCTAAGTTGTTGGCTCAGTTGGGTATCCAACAAGAGTTCACGCATCACGCTGTAGGTTCGTTGGCTGACAACGTTGAAGCTATCCGGTCTATCATCGCCGCTGGCGGTATGGGTGGTGGTTCAGGCGGTGGTGGAGAAGGTACGGGCTCCTCTACTTCAAGTGCTGCTCGCGGTCCTTGGTGGAGACGTGCTCTTAGCACAGCATGGCGTGGGCATAAAGCAGTATGGAACGCTACTGGATTACCTTTCCGTGCATTCAATGCCGCTCTGCGCAAATCGATCTCTCCTGCTATGGCGGTAGGTCGTACTGCCATGAACGTTCTCACCGGTGGATTGACTGGTGTAATTGGTCGTGCTCGTGATCGGTTCAGTGACGTTTACATCCAAGGTGCTCAAGGATTTAAAAAGGTCATCAGTAAAGAAGGCTTCGGGACTGGTCGGTACATTGATCAGAACTCCGGTAAAGTTATTTCCTCTATTAAGGATATCACCGGTCCGGTATTTGATACCGTTGAGCAAACACAAGTTCTGAGTGCAGACGATGTCAAACAAGGTCTGTTCAATAAGGACGGTAAACGCCTCTCTGCCAATATCTTTGGTACAGTAGGTAAAGTAGTTGCCGGTATCCACAACGCAACAGGTGTTCCTTTCAGGATGGCTACTGGTGTTGCGCGCGGTTTCCTTAATACGGCCAAACGACTGCTGAGCAGAATGCCTGATGTTTACGTAGCAGGTGAGAAGGCTCCCCGGCTTTACAGCTCTAAGCTGAATGCTGGTGAATACTATCAAATCGCTACAGGCAAGATTGTTCGTAGTCCAAGGGACATTGTTGGCGACATCGGTGAGATGGATCCTACTACCCGTCAATTGCGTCCTGTACTGCTCGATAGCGAGATTCGCGAGAAGGGGATTGTAGATCGTTCAGGTAAACCTATCCGTAGCGGCTACGGTACCGTAGGGGCGTTAATTACCGGCGGTGTTGGTACTGCGTTCCGTATCGGTAAAGATCTCCTGAGTCTTCCATGGAGAGCGGCTAACGGTGTTGTAAACATGGCAGGTAATGCCCTGGGTGCAATTACTGGCATTGGTCGTCGTGGCGGTAAAGGTACCGATAAACAAACCTTCTGGCTGAAACGTATCTATCGTCTGTTAGCTAACCAATTCACTGGACAGAATCCGTTGGAAGGGTTGGGTGATAGCGTAGAGGATCTGCGTAGCGGTGGTCAAGGTGCGCTTTCCAAACTGACCGGTTGGGCACGTAATGTCGGTAAGAACTCTATCGATCGTGCTAATGACATCAGAGAACGTTTAAGTGCTCGTGCAGGTAGTTGGTTAAACCGTTTGAAAGATAACGGCGGGAAAGCTGCAGACGTAGCCAAAGCTGAGAAGGTTGCTGCTAAGACTGAGGGCGGCTGGTCTAAACTTATCTGGATGGCTCTGTCTGGTATCGGTGCTGCTATTGGCGGCATTCGTTCTGGTCTGGGTAAATTCGCAGGTTGGATCAAAGACTTGCCTAAATGGTTGGCGCTTCGTAAAGGTGCTGATGCTCTAGGTGACATCGGTGATTTGGCAGGCGGTGGTCGTAAAGGCGGTATCCTTCGTCGTGGTGGTCGTCTCTTAGGTAAGGTTGGTCGTTTGGCTGGTCGCGGTGCATTGGCAGCAGGTCGCTTTGCATTAGGTGGCGCAGGTACAGTTCTCCGTATGGGTGCAGCTGCACTCGGTGGATTAGTCTCTGCTCCTGGTCTGGCTATTGCCGCTGCTGTAGCAGGTACAGGTTACCTGATCTATAAAGGTTGGCAGATGTACAGTAACCGCATGACTCCACTTCGTGACTATCGCATTGCTCAATATGGTGCCGATGTTAACGATGGTGAATCTCGCGGTAAGATCTTGGCGTTAGAAGAAGCTGTACTCAAGAAAACGACGGTCATGCCTAACGGCGGTGTTCGTATTGGCTCTCTTGAGTTCGAGTCTCTCCTCGAGTCGTTCGGTATTGAGTTGCAAAACCAACGTCAGGTCGTAGAGTGGATGCGTTGGTACAACAAACGCTTTGTTCCGGTGTTCTCTAAGAACCTTACGGTACTCCGTAAGATGGATCCTAAAGCTAAGTTGACTGATGCTGACTTCCTCGAACCTGGACAACGACCACAGTTCGCAAGGGAAACCTTTATCGAAAGCTCTGGTGAAAACTCACCTTACAACATCTCAGCCTCACCGTTCCCTGGTAAGCGTTCTGTTGTAGGCTCTGGCTATCCGGCTAAATACCGTGATGTCGTTATCGAGAAATATTCCCAGCAAGAGAAGGCGTACCAGTCGAAGAAATCTGTCGACCAAGCTAAGAGTACGTTTGCGACTAAGCCGATCACTCCTGTTCAGAATGCCCTGCGCAATATGCAACAACAAGATGACCGCGCCATTAACCCTTCAACTGATCTGTTCTACAGCCCAGGTGATAAAGTCAGTATTCCTGGCGGTATCACGGGTAACGTCCAGCAAGACGAGATGATTCAAATCTCTAACCGAATTGATGACCTCAGTTCTATCCGTGTAAAAACGTATGGTCTGAATCAATTGGTGAAAGAAGACGTCAACTTGTTGCTGGTAATGGAATCCGAGCTGATTAAACAGGTTCAGTACAATGCTAAGTTCCAAGCTACCTTCAATGGTGACATGGATAAAACCTTCGCATTGTGGGCACCTCGGTTTGGTATCAACACCGCAGATAAGGAAGCGAAGACTAACTGGATGACTTGGTTCCAGCATCGTTTCTTGCCTGCCTTCTTGAACTTCTG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7c47a754adef37bc416209254f028e34d76689a8fbcff3a70aedea9409408a11
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4901
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50