Protein
View in Explore- Genbank accession
- XHH86369.1 [GenBank]
- Protein name
- central straight tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MISNIAPAKMVLQNIVTGYTIASIQHSIFSDYDVIGRTFWLTTGGVTTRRDFTGVDTFIATINNLIAGATYSAQGAFYDSMVDAELMAAKVGMNLSSTVNFKMKTAPKITKVSSFAESVDVGVGAPMVVVELSGEAEYVTIEMKPEGSSTWTKYYRGPITEQIIFGGVPVGRYNIRVSGVVTMPDGVTVDVSGYDTWPSLFNLTYNFTPPSAPTNLRFKTAHIQDGMERFDVRLEWDWTRGTGANVREFIIQYISNDEFAKTGWTKANKLNVGAAKAGTITSFPYKIRHRFRVLSVAWGPDTQSITNSNEVTYIIDESTTFDNAFINETGVEMTYAGIKGKLWNSNTKQWEQTFLVDAATGAVVLGTLDENGKAPISFDPVNKIVNVDGKVITKDINAANVILTNLTGKDNPAIFTQGKKYGNNAGGVWMGVDNVDGKAKFDLGNNTQYVRWDGDTLRISGNVVIGTPGGDVDLETGMQGKQTVFAYKLGTSLPSRPLDQVYPPAGWSAFPPNRTAQNQNVYVVQGTLDPKKSPPALVDGTNYSAASQWSGVPGTGGTDGSNGDYTVQIYQISASKPTKPGNINDPSGWSRTPPTGTPLWMCSGRFNGDTNALTVEGWSDPIRVDGEKGATGATGATGPQGPQGPAGGSVEVQWSKDGTTNWHANFTTGDIYMRQRVGTGGWSSAIRAVGEDGTNGTPGSKGNYIGMRFRVAAEKPATPTGQTPSGWSDAPPQGNPLWMVKAEFNGQTNALVGTWSEPVRIDGDTVNQNLLSTKKWLASLTGTNGNGASIVKNPTDLRLKIVAGSTNDAYTVPSGGNGTYFIPVTAGKKYTFSFETDTAVEVRTHLFLIQAGANSSSVFTNTSSLTPGLTTHTFAVPAGVDRISLRFSVNEAGKENTIGKIKLEEGVFPTAFIRNEFDTIGEEGATGATGPQGPQGVQGNQGPQGAKGDNAKGFSISSLSQTFTYDAEGKLKSDATILFQAFRQNTAANVTWSARDEKGGNITLTSVSNSGASLTAANFKTSKSVIVTAVCDGITDQITIVRLDDGSNALVGLLTNEGSTVLANYAGYVQNYSTGSGDFKVFYGARDITSECTFSTMEKNNLDADITSAGKYTLKGMPAGTDVINGWVDLRAVHPTYGAVVRRVATTKSILAKGYDRVITTSFENGNKGSWSVGVVQDVTGASILAAGFSKALVLSSRDALEDANTFPVVAGQKYKLCLWIMASEAKVNVAMGMRIVRASTGGVDWQGTTVAAAGASGWNYVEKEFTVGSSNTGLAIPWIQMSGPYGSDLGKVYVTDIHIFALEMDGVDGATGAQGPQGSKGDTGSQGPQGPQGSKGDKGDTGATGAQGPAGSSVNVQWSKDGSNWHAGFQTGDIFMRQQVNGAWGGAIRAVGEDGTDGDYISMKFIVQDTKPSTPTGNSPSGWSDAPPVGSPLWMTKGTMNASGQLQGTWSNPIRLDGTINPNLFAVRKWMALLTGTDSGTSKNDIEKLTHSLTRTSGTNNASPGCYATPFVGASAFSHPVTPGKRYTLTYNIDAASEVQTRDIIFWQAAPNSPQSTFIEELNTGTSIKVKRTFVVPAGINYLTLRPSILTLNVETTWSKIKLEEGGEKTEYQVEYSDSIGIVGKSVLVQWSKDSSASNWHDNFQTGDLFMRQNVDGVWGPAIRAIGEKGEIGPDGKKGNYTNIIFRISETKPAKPTGNKPTDWFDAPPDGSPLWMATATFNGDTNAIIGTWSDPVRIDASGVGENFWAFKEWMRSITSVNGTGSSMSKNEEQMRFRITTTGSTDGYTIPYQGNGTHFIEVQPNTMYTVSFDVETAVTTRMFIMQFDNGNGNSYSRTNSVTTSTAGRQSLTFTTGAATTHVALRWSVNEANSSNVLSRAKLELGAYATAYVVHPSDAMGKDGATGPQGPQGNTGATGATGSQGPQGSKGDTGATGPQGPQGPKGNAGDNAKGFALTSDYQSFVYDTAGDIKSAATVLFKGLKQNTTAGITWSAVNDKGAAVTLMNSGDNRQLTAANFGASKWVTVTATCDGLSDQITVVRLQDGENVLTAVLTNEAATVLSNYSGYWQSLENAKGQMRVWYGSTDVTGQCTFSEGGRSNATPSINSSNGNYSVTDMANGTDITEGWVDIKATHPKYGAITKRFAVTKVFLAKSYEMIITNTFENGKKGSWGGAVQDVTGPTNQSITKALRITSRDTLEGKNTIPVVAGQKVRIRFWYNAEGLQEAHFRAGFIVQRNDGNRRYPSRTILTGPSSNSSWVYFDQELTLGTADEGIAWPWFQLDNKTTGAPLGSVLIGDIHFEDLTMDGADGATGATGPQGPQGGKGDTGATGPQGSKGDTGPQGPQGPAGASVGVQWSKTGNANDWHTNYATGDIYMRQQVNGVWSSAIRAVGEDGQVGPDGKYTSLKFQVAATKPAKPTGNSPANWSDAPPDGSPLWMVKGEFNSSNQLQGTWSDPVRLDGETVNLNLFASKAWINSLTGASGSGSTITKNPDELRLRINSGAGVGDSYTGPYSGGGTAFTKVTAGKRYTMSFDTDSALEMRMHVFFIPVGASGSNVFSWVASNSAGRTSWSFTIPEGCDRISVRVSLNVPGSTNVISNIKLEEGDFATAFIRNELDTIGADGSQGPQGPQGNKGDTGATGATGPQGPQGPSGTNAKAFALTSDSLSFSFDTNGNLKSNGTIKIDSWRQNTSAAITWTAKNQAGANISLGGTATNKTITSAQFGSSDYVTVAATCDGMTDTITIVRLQDGVNSLVGYLTNESASILCNPYGFIQNWNGTNGYFKVFYGTVDVTSQCTFGVEVVGGVDQKENLNGNINSSGYYTPSGMPDGIDVVSGWVNYQASHPKYGTLVKRYTLKKSIPGIGYDRVMTGSFDNGSSNSWGKPIVDVTGGDPGGHKKAFSVNSRDTYEGNNWFPTKKGMKYRITAWVNNSEGEYALNLGLHCRSADKDNTGWPAATAAPAKDATGWRLESRVITVGDRSDGKPTVEARPFIQMGGSATPFGIAYIAAIAIEDLSMDGEDGATGPQGPQGNTGATGPQGNKGDTGPQGNKGDTGATGPQGPAGNSVNVQWSKDGSTNWHSTFTSGDLYMRQQVNGSWGPAIRAVGENGANGTPGSKGNYVSMKFAVMASTPSRPSGSNPAGWSDSPPPGSPLWMVKAEFNGETNAIMGNWSDPIRLDGDSINENLFYFKAWLDSITGVAGNGSSIGKNYELLRARIIAGTGVTDAYTHPSDGPTSMFTYLPPNTTYTMSFETDNAVEVRCHVFWYAKGSNTTGGVLKTIASTTAGLSSFTFTTPANSDRISVRFSVNQSEGNNVVGRCKIEKGAFVTSYVRNQYDAVGDRGPGFYTQPISNLTAWNDTQAASFFQSTFAGPPVKYDVLTQYKSGSPQNSWTRQWNGSAWTAPALTVHGDMIVSGSITADKIIANNAFLAQIGVDILYNRAAALSSNPEGTYTMKIDLANGYIHIR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 3465 AA molecular weight: 367206,56410 Da isoelectric point: 5,82579 aromaticity: 0,09149 hydropathy: -0,37108
Domains
Domains [InterPro]
IPR057550
STR
10–96
STR
10–96
IPR057551
STR
104–194
STR
104–194
DC_0392
STR
554–642
STR
554–642
DC_0456
STR
1949–2080
STR
1949–2080
1
3465
Architecture
STR 10-96 | STR 103-194 | STR 209-642 | STR 653-1123 | STR 1141-3465
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage Shiner [NCBI] |
3344725 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Klebsiella pneumoniae [NCBI] |
573 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XHH86369.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ283208.1
[NCBI]
CDS location
range 80805 -> 91202
strand -
strand -
CDS
ATGATTTCAAACATAGCACCAGCTAAAATGGTACTGCAGAATATCGTGACCGGCTATACGATTGCGAGTATTCAGCACTCAATCTTTTCCGATTACGACGTAATTGGTAGAACTTTCTGGCTAACTACGGGTGGGGTAACTACCCGTAGGGACTTTACCGGCGTTGATACATTCATTGCCACAATTAACAATCTAATCGCTGGCGCTACCTACTCTGCCCAGGGTGCTTTCTATGACTCGATGGTTGATGCAGAGCTGATGGCTGCTAAAGTAGGTATGAACCTCTCTAGCACCGTTAACTTCAAGATGAAAACTGCTCCGAAGATTACCAAAGTGTCCTCTTTTGCAGAATCTGTTGACGTGGGTGTGGGTGCTCCTATGGTTGTCGTAGAGCTTTCTGGTGAGGCCGAATACGTTACCATCGAAATGAAACCTGAGGGCTCTAGCACCTGGACTAAGTACTACCGTGGTCCAATCACTGAGCAGATCATCTTTGGTGGTGTTCCAGTTGGCAGATACAATATCCGGGTATCTGGTGTTGTCACTATGCCAGATGGTGTTACTGTGGATGTTTCTGGGTATGATACCTGGCCGTCACTGTTTAACCTGACCTACAACTTCACTCCACCGTCTGCCCCAACTAACCTGCGTTTCAAAACTGCCCACATCCAAGATGGTATGGAGCGTTTTGACGTTCGCCTGGAATGGGATTGGACTCGTGGTACGGGTGCTAACGTTCGTGAATTTATCATCCAGTATATTAGTAACGATGAGTTTGCAAAAACTGGATGGACTAAGGCCAACAAGCTAAACGTGGGTGCAGCTAAAGCTGGTACTATCACTAGCTTCCCTTACAAAATCCGCCACCGCTTCCGTGTACTATCGGTTGCTTGGGGCCCAGATACTCAGTCTATAACTAACTCTAACGAGGTTACTTATATTATAGACGAGAGCACCACTTTCGACAATGCATTCATTAACGAGACCGGTGTAGAAATGACCTACGCAGGTATCAAGGGTAAACTCTGGAACTCTAACACCAAACAGTGGGAGCAGACTTTCTTAGTCGATGCTGCTACTGGTGCAGTAGTTCTTGGTACACTCGATGAAAATGGTAAAGCGCCGATTTCATTCGACCCTGTTAATAAGATTGTAAACGTCGATGGTAAAGTTATCACTAAAGACATTAATGCTGCTAACGTAATTCTTACTAACCTGACCGGTAAAGATAACCCGGCAATCTTCACTCAGGGTAAGAAGTACGGTAATAACGCAGGTGGTGTCTGGATGGGTGTTGACAACGTTGACGGTAAGGCCAAATTTGACCTCGGTAATAACACTCAGTATGTGCGCTGGGACGGTGATACTCTTCGCATTTCTGGTAACGTTGTAATCGGTACTCCTGGAGGCGATGTAGACCTTGAAACCGGTATGCAGGGTAAGCAGACTGTATTTGCTTATAAACTTGGTACATCTCTGCCAAGTCGCCCGCTTGACCAAGTTTATCCACCAGCTGGATGGTCCGCATTCCCGCCTAACCGCACTGCTCAGAATCAGAACGTGTACGTTGTGCAGGGTACTCTGGATCCTAAGAAGAGTCCTCCTGCTCTAGTAGACGGTACCAACTACTCAGCTGCATCCCAGTGGTCTGGTGTCCCAGGTACTGGTGGTACTGATGGTTCTAACGGTGATTACACTGTTCAGATTTACCAGATCAGTGCTAGTAAGCCCACGAAACCAGGCAATATCAATGACCCTAGTGGTTGGAGTCGTACCCCACCGACTGGAACCCCTCTTTGGATGTGTTCTGGTAGATTCAATGGCGATACTAACGCTCTAACTGTTGAGGGTTGGTCAGACCCGATCCGAGTAGACGGCGAGAAAGGGGCTACGGGTGCAACAGGGGCTACCGGTCCACAGGGGCCACAAGGGCCTGCAGGTGGCTCTGTAGAAGTACAGTGGTCCAAAGATGGTACTACTAACTGGCATGCAAACTTTACTACTGGTGATATCTACATGCGTCAGCGTGTTGGTACAGGTGGGTGGAGTTCAGCTATCCGTGCAGTTGGGGAAGATGGTACTAATGGTACTCCTGGGTCTAAGGGTAACTACATTGGGATGCGCTTCCGAGTGGCGGCTGAGAAACCTGCCACTCCGACTGGCCAGACCCCTTCAGGTTGGTCAGATGCACCTCCTCAGGGAAACCCTCTATGGATGGTTAAAGCTGAGTTCAACGGTCAAACCAACGCCCTAGTAGGTACGTGGTCAGAACCAGTTCGTATTGATGGTGATACGGTTAACCAGAACCTACTGTCTACTAAAAAGTGGCTAGCATCTTTGACAGGTACTAATGGTAACGGGGCTTCTATCGTTAAGAACCCTACCGATTTGAGGTTAAAAATCGTTGCAGGGTCCACCAATGATGCGTATACCGTACCTTCAGGTGGAAACGGAACGTACTTCATACCGGTTACTGCTGGTAAAAAGTACACTTTCTCCTTTGAGACAGACACTGCTGTAGAGGTTAGGACCCACCTGTTCTTAATTCAAGCAGGGGCCAACTCTTCGAGCGTTTTCACTAACACGTCTTCGCTTACACCGGGCCTTACAACCCATACTTTTGCAGTCCCTGCCGGAGTAGATAGAATCTCATTACGATTCTCTGTGAACGAAGCTGGTAAAGAAAATACCATTGGTAAGATAAAACTTGAAGAGGGAGTATTCCCTACCGCCTTCATCCGTAATGAGTTCGATACTATCGGTGAAGAGGGGGCAACAGGTGCTACTGGTCCTCAGGGTCCACAAGGTGTTCAGGGAAACCAAGGCCCACAAGGTGCAAAAGGGGACAATGCAAAAGGATTCAGCATCTCTTCTCTATCCCAGACGTTCACTTATGACGCAGAAGGTAAACTGAAGTCTGACGCAACCATCCTGTTCCAGGCCTTCCGTCAGAACACTGCGGCTAACGTAACATGGAGTGCTAGAGATGAGAAGGGCGGTAATATTACCCTGACCAGCGTTAGCAACTCAGGAGCTTCTCTTACTGCTGCCAACTTCAAAACATCTAAGTCTGTAATAGTCACAGCCGTTTGTGATGGTATCACAGACCAGATCACTATTGTTCGTCTGGATGATGGTTCCAACGCTCTAGTAGGGCTTCTGACTAATGAAGGCTCCACAGTTCTAGCAAACTATGCCGGCTACGTCCAGAACTACAGTACTGGTTCGGGTGATTTTAAAGTGTTCTACGGAGCGCGCGATATCACTTCTGAATGCACTTTCAGTACTATGGAGAAGAATAACCTTGATGCTGATATTACTTCAGCTGGCAAATACACTTTAAAAGGTATGCCGGCGGGTACTGACGTTATCAACGGTTGGGTCGACCTACGTGCTGTACATCCTACTTACGGTGCTGTGGTTCGTAGAGTGGCAACTACTAAGTCTATCCTTGCAAAAGGGTATGATCGCGTTATTACCACTTCATTCGAGAATGGGAATAAAGGTTCATGGAGTGTAGGCGTCGTACAGGATGTAACAGGTGCATCAATCCTGGCGGCAGGATTCAGCAAAGCATTGGTGCTATCTAGTCGTGATGCTTTAGAGGATGCAAATACATTCCCAGTAGTGGCTGGACAGAAATACAAGCTCTGCCTGTGGATAATGGCGTCCGAGGCTAAAGTAAACGTAGCCATGGGTATGCGTATAGTTCGCGCAAGTACCGGTGGAGTAGACTGGCAGGGCACTACGGTGGCAGCTGCTGGAGCTAGTGGCTGGAACTACGTAGAGAAAGAGTTTACTGTTGGGTCGTCGAATACTGGACTAGCTATACCTTGGATTCAGATGTCTGGGCCTTACGGGTCTGATCTGGGTAAGGTATACGTGACGGATATTCATATCTTCGCTCTAGAGATGGATGGGGTGGACGGTGCTACTGGTGCTCAAGGACCACAGGGTAGTAAAGGGGACACCGGTTCTCAAGGTCCACAGGGGCCACAGGGTAGTAAAGGGGACAAGGGTGACACTGGTGCAACTGGTGCTCAAGGCCCAGCGGGTAGCTCTGTAAACGTTCAATGGTCTAAAGATGGATCTAACTGGCACGCCGGCTTCCAAACTGGTGATATCTTTATGCGTCAGCAGGTTAATGGTGCTTGGGGCGGTGCTATTCGTGCAGTTGGTGAAGATGGTACTGACGGTGACTACATTTCGATGAAGTTTATCGTTCAGGACACTAAGCCAAGCACACCTACTGGGAACAGTCCTAGTGGTTGGAGTGATGCTCCTCCTGTTGGCAGTCCTCTATGGATGACTAAAGGTACGATGAACGCTAGCGGTCAGCTGCAAGGTACATGGTCTAACCCAATTCGTCTGGACGGTACTATCAACCCTAACTTGTTCGCAGTTCGCAAATGGATGGCATTGCTGACTGGTACGGACTCTGGTACATCAAAGAACGACATTGAGAAGCTGACTCATTCTCTGACCCGTACTTCTGGAACTAATAACGCATCCCCTGGATGTTATGCGACTCCTTTTGTTGGTGCAAGTGCCTTCTCTCATCCGGTAACTCCGGGTAAGCGTTACACTCTAACCTACAATATCGATGCAGCGAGCGAAGTCCAAACCAGAGATATTATTTTCTGGCAGGCTGCCCCGAACTCCCCGCAGTCCACGTTCATAGAAGAACTTAACACCGGAACATCGATTAAGGTTAAACGCACTTTTGTAGTTCCGGCAGGTATTAACTACTTAACCCTACGTCCTTCAATTCTTACTCTCAACGTAGAGACCACTTGGAGTAAGATCAAACTGGAAGAGGGCGGAGAGAAAACCGAGTATCAGGTCGAGTACTCAGATAGTATAGGTATAGTAGGTAAATCAGTTCTAGTTCAGTGGTCTAAGGACAGCTCTGCTAGTAACTGGCACGATAACTTCCAAACAGGCGACTTATTCATGCGTCAGAACGTTGATGGTGTTTGGGGCCCTGCAATTCGTGCTAT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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
3654f5a67e17883bc4369ff1a1296120529bb08765a1c914501c0e3e5c7914b2
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome of Klebsiella pneumoniae phage Shiner | Eckrote,R.M., Mora,D.A., Lessor,L. and Gill,J.J. | — | — | GenBank |