Protein

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Genbank accession
YP_010675901.1 [GenBank]
Protein name
putative BspA family leucine-rich repeat surface protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MKIDKDKPLVPVERTSPIGVVLDAFIRVDRKIQEKSSGSSDEDRIILDVIVNNTWPRSDGITDPEVPIPAPGEVIEITQEEIIEEVRNVISTKLDEMGASIDEHLLQHTNKVGPVHGETKSTVGLGKKDNWDMATIQQHIDGVAQNLYCNPAGLSAIIDERVKVDPRSYIPARSLPIASGGILGEIPQWHYDFYKGELVQSPSDPKQFIGDTAWYFGTQIGMHIFPNLNQSPELGRYTATPSGTAPEVQTSRGGTKVRAYAKRIDVRRSRPAQLRGWRSPGSLGTVMKVSDNLFGRSAFSYMEGNKVCLRSFNKSVLPFDVLETTGNSIPFEGIFESAEDYLYHFILKINKGSYPGESSSVPYLKLSLTGLKLNPWSMDLQEGPPNRLAEFITKDPIKYQTNQITVPVNSKILAVDTNGTGEVNLVIPFKNLFNIQDEENEEFFNSLDIKRLNKLTFGWEMRIRHKGLMRIYFGWFNKDKTKYWHGYLDFRLDFVFNDATKQMSVNIVTDQVFEQAKQTLDSNWDLTDTGLFKAYTPHVKEQPEHPLCQDGVFDPAGGHLKTFTFYNRQYIGSYDHSISSVTSFIDNGNNYFPKPTKYSYVAQSNIEHDGMYGDHLRHIPVKIALGTATEQERAILDIAMNNRWPRYDGLTDDPVPVPDPGVATKLKITYLTYSRDYRNRYKWGLVTVDAGTSYLQGNPYGSYLGPKTDSVNWITGSMEDIPSFLIENDDLSSTMNINNMVFNDGNGYTNYLNYEVDPNNLETPITFNNPVSIHEDILNWISKNAGGWFKQHKTFFFFKSTLFWMNQCVGHGDYPTNEKDCYYGIIKNCYVHTDGTGRKTIKPQGSIASSIVVNTMNVNKKSTLQINHGAILGYDSFKSQDVYIMKMSDALNQVKYDVMLNVAPFNNFYIELQIVHNPLTGSFTFGPKLDSVDPIFPYDPEHGYQIDYDKEICYGTKLPHRLHINYQSPVMLSKGMWAFRKTPNNYGVFTREHGFLTLTGGVMGTTEGFTLYPVGGVIMVNGKNTLVKKPVKARVEEFFGYDELFVTQIGNELYAYGRYNNPTGYEIEPQLGSVPAGFINGTEFSYQDQSGWRNSLLPVIARKRMNVSSDGSSFPVFLGKPGSGLPINRFFKQTVATRLLWDTSKGRVIPIINRVGGSPYLLVNGTVYQLSGLNSFTIPGSYTGIVTIDIFGVSVLKWGLGLTELLTIGSRVTELDFSNSEGFKITATLSKNIANFNGVFKNSVATSYPGLEFWDVGHVYTMNECFFGASNFNQDLSNWYMNRVATFFNWDNGTTAWTLPKPTFPTYTR
Physico‐chemical
properties
protein length:1309 AA
molecular weight: 147475,83610 Da
isoelectric point:6,12641
aromaticity:0,12070
hydropathy:-0,36883

Domains

Domains [InterPro]
DC_0481
STR
1–1307
DC_0481
IPR005046
STR
1227–1287
IPR005046
YP_010675901.1
1 1309
Architecture
STR
STR 1-1307 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_010675901.1
1 1309
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 271 271 0,8670
Central domain 272 482 212 0,6828
C-terminal 483 1309 826 0,0433
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-271
Central
272-482
C-terminal
483-1309

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Aeromonas phage ZPAH34
[NCBI] 		2924888 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Aeromonas hydrophila
[NCBI] 		644 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Aeromonadales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010675901.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_071007 [NCBI]
CDS location
range 123281 -> 127210
strand -
CDS
ATGAAAATTGATAAAGATAAACCTTTAGTTCCTGTCGAACGGACAAGCCCTATTGGGGTGGTTTTAGATGCCTTTATCCGAGTAGATAGAAAAATACAAGAAAAGTCTTCTGGATCTTCGGATGAAGACCGGATTATTTTGGACGTCATTGTCAATAATACTTGGCCCAGAAGTGACGGGATTACAGATCCTGAAGTTCCTATCCCAGCCCCAGGTGAAGTCATTGAGATTACCCAAGAAGAAATCATCGAGGAAGTTAGAAACGTTATTAGTACCAAGCTTGATGAAATGGGTGCTTCAATAGATGAACATTTATTGCAACATACTAATAAAGTTGGTCCGGTCCATGGTGAAACAAAAAGTACCGTTGGATTAGGTAAAAAAGATAACTGGGACATGGCAACAATCCAGCAACATATCGATGGTGTTGCTCAAAATTTATATTGCAATCCAGCAGGTCTGTCAGCAATCATTGACGAACGTGTCAAAGTGGATCCTCGGTCTTATATCCCAGCTCGGTCATTACCGATTGCATCAGGCGGTATTTTAGGTGAAATACCACAATGGCACTATGATTTTTATAAAGGCGAATTAGTACAAAGCCCGAGTGACCCTAAACAATTTATTGGGGATACAGCGTGGTACTTTGGAACACAAATTGGGATGCATATTTTCCCTAATTTAAATCAATCCCCTGAATTAGGTCGATACACAGCTACCCCATCTGGGACAGCGCCAGAAGTACAAACTTCCCGTGGCGGTACAAAAGTTCGTGCCTACGCTAAACGTATTGATGTTCGTCGATCTAGGCCAGCCCAGTTAAGAGGTTGGAGATCTCCGGGAAGTTTGGGTACTGTAATGAAAGTTTCAGATAACCTTTTTGGACGATCTGCATTTTCGTACATGGAAGGGAATAAAGTTTGTTTACGTTCTTTTAATAAAAGTGTTCTTCCTTTTGATGTATTAGAAACAACAGGAAACTCAATTCCTTTTGAAGGTATATTTGAAAGTGCAGAAGACTATCTTTATCATTTTATTTTGAAAATTAATAAAGGTAGTTACCCAGGGGAAAGTTCGTCAGTACCATATTTAAAACTGTCATTAACAGGTTTAAAACTGAATCCGTGGTCAATGGATTTACAAGAAGGTCCTCCTAATAGATTAGCTGAATTCATCACCAAAGATCCTATTAAATACCAAACTAATCAAATAACAGTCCCGGTTAATTCTAAAATTCTGGCTGTTGATACTAACGGTACAGGTGAAGTAAATTTAGTCATTCCATTTAAAAATCTTTTTAATATCCAAGATGAAGAAAATGAGGAATTTTTTAATTCATTAGATATTAAGCGATTAAATAAATTAACGTTTGGGTGGGAGATGCGTATTAGACATAAAGGTCTGATGCGGATTTACTTTGGTTGGTTTAATAAAGATAAAACAAAATACTGGCATGGTTATCTTGATTTCCGTTTAGATTTTGTCTTTAATGACGCTACTAAACAAATGTCAGTAAATATTGTTACTGATCAAGTTTTTGAACAAGCAAAACAAACCCTGGATAGTAATTGGGATTTAACCGACACTGGCTTGTTTAAAGCTTATACCCCTCATGTCAAAGAACAGCCTGAACACCCTCTTTGTCAAGATGGTGTGTTTGATCCTGCTGGCGGACATTTAAAAACATTTACTTTTTATAATCGTCAGTACATAGGGAGTTACGACCATTCTATTTCGTCAGTAACTAGCTTTATTGATAATGGTAATAATTATTTTCCAAAACCAACAAAATACAGTTACGTCGCGCAATCCAACATCGAACATGATGGAATGTATGGTGACCATTTAAGGCACATACCGGTAAAAATTGCATTGGGAACTGCAACAGAACAAGAACGTGCCATTCTTGATATTGCAATGAATAACCGTTGGCCAAGGTATGATGGTTTAACTGATGATCCTGTCCCTGTTCCAGATCCTGGTGTCGCTACTAAATTAAAGATTACATATTTGACTTATAGTCGCGATTATCGTAATCGTTATAAGTGGGGGTTAGTAACTGTTGATGCAGGAACTAGTTATTTACAAGGAAACCCTTATGGTAGTTATTTAGGTCCCAAAACAGATAGCGTAAATTGGATAACCGGTTCAATGGAGGATATTCCATCTTTCTTAATTGAAAATGATGATCTTTCTAGCACTATGAATATTAACAATATGGTATTCAATGATGGGAATGGGTACACTAACTATCTGAATTATGAAGTTGATCCCAATAATCTTGAAACCCCCATTACGTTTAACAATCCAGTTTCTATCCATGAAGATATTTTAAATTGGATTAGTAAAAATGCCGGCGGATGGTTTAAACAGCATAAAACATTCTTTTTCTTTAAATCAACTTTATTTTGGATGAACCAGTGTGTTGGTCATGGCGATTACCCTACAAATGAAAAAGATTGTTATTACGGGATCATCAAAAACTGTTATGTTCATACTGACGGAACTGGCCGCAAAACGATTAAACCGCAGGGATCAATTGCTAGTAGTATTGTTGTTAACACAATGAATGTTAACAAAAAGTCAACTCTTCAGATTAACCATGGTGCAATTCTTGGATACGATAGTTTTAAATCCCAAGATGTTTATATCATGAAGATGTCAGATGCGTTGAACCAAGTTAAATATGATGTCATGCTTAATGTGGCACCTTTTAATAACTTCTATATTGAACTGCAAATTGTCCATAATCCCTTGACAGGAAGTTTTACCTTTGGTCCAAAGTTAGATTCAGTAGATCCCATTTTTCCTTATGATCCTGAACATGGATACCAGATAGATTATGATAAAGAAATTTGTTATGGAACCAAACTTCCGCACAGATTACATATCAATTATCAAAGTCCTGTAATGTTATCTAAAGGAATGTGGGCGTTTAGAAAGACACCTAATAATTACGGTGTATTTACCAGAGAACATGGTTTCTTAACCTTGACAGGTGGTGTAATGGGCACTACAGAAGGATTTACTCTTTATCCTGTCGGTGGTGTAATTATGGTCAATGGTAAAAATACATTGGTCAAGAAACCGGTTAAGGCTAGAGTTGAGGAGTTCTTCGGATACGATGAACTATTTGTAACACAAATCGGTAATGAATTGTACGCATATGGTCGGTATAATAATCCAACTGGTTATGAAATAGAACCACAACTTGGTTCTGTTCCTGCTGGATTTATTAACGGAACAGAATTCAGTTACCAAGATCAGTCTGGGTGGCGAAACTCTTTGTTACCTGTGATCGCTAGGAAACGAATGAATGTCAGTAGTGACGGTAGTTCTTTCCCCGTTTTCTTAGGAAAACCTGGTAGCGGCCTTCCTATAAACCGATTCTTTAAACAAACCGTTGCAACTCGATTACTTTGGGATACGTCAAAAGGTCGTGTGATACCCATTATTAATCGCGTGGGTGGATCTCCATACCTATTAGTTAATGGAACAGTATATCAGTTATCTGGATTAAATAGTTTTACTATTCCAGGTAGTTATACTGGAATTGTTACTATTGATATTTTTGGAGTTTCAGTATTAAAATGGGGTCTGGGTTTAACTGAACTTTTAACCATCGGCTCACGAGTGACTGAATTAGATTTCAGTAATTCAGAAGGGTTTAAAATTACAGCTACCCTTTCTAAAAATATTGCAAACTTCAATGGGGTATTTAAGAACTCAGTTGCCACTTCTTACCCTGGATTAGAGTTTTGGGATGTCGGACATGTCTATACCATGAATGAATGTTTCTTTGGTGCAAGTAATTTTAACCAAGATCTTTCTAATTGGTACATGAATCGAGTCGCAACATTCTTTAATTGGGATAATGGAACAACTGCTTGGACACTTCCAAAACCAACGTTCCCGACTTACACACGTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
474be936cba69385217754351e5fb2d6d892670693674ba5a2dbb49aa14beee3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6446
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50