Protein

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Genbank accession
WAX23229.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MPHLKAYDKYGNILAIGYNVELHEEVGSVIIPNLAPHTHYPQGEFYVSWEAEKYETDKVVVPGFTTLESSFKEITLYFKDHILVNAKSAYDVAVDNGFVGSEEEWVKSIKGEKGEKGDQGKQGLSAYEVAVNNGFTGSVTDWLKTGKNPYIYSNEYVKQKDDTSDVQRLRRAIKDTSEGNTLYIPSSESPIRIDDTLVIDKNINIVSDAKIVYNGSKDKPAIKLDSLSYSNVTIKGIYDDSSYPTYGGGYHSFKSQNYIGLELVNCRNVNTNINEIIGFTVGNKHKATGGKGHWFNNTIINFFINNETHIELNTDGIGSNGEQSWMNSNYFYKSAFSYSGTEFNKHPNTYYNIKQTLTNANTYGGNSNVFDSLKFETASTTSENYVMVYLKKAVGFIFKNYRFEFNNKATFAIIDLETQDMTKSYVTHSKDIKFIPEFVLGNGHKLTFTNINTAKIPRSSIAKIVDEYKTTLLYKNNDFSKDYRRLGGNYHTVKNVFRKPLQSTSLTDEVSYDYNTTPSLVDDKGLLTFTGSYPMALYVNNVSVGDELIINKLSFIGNSSGIFIKCFDKDGNILDKISNNYDTILLDGYYNDKYKAFTFNNAQKDTFTVNSEDVKSIVILISGTMQGLLVDSTNPSNIIKSSNDSSKNKTDVFYSHVKPSSVEDFKYDEKVYNNGTTQVYGWVLKGNDWKELGKDTNSKSKVIVNIEDYPRINDEDNDYPRFQRALDYLTSTKGGTLIVPKGTEDYLFKTKTPTVQNPSRVKVTGSNIHIKGEGNPTFIMSGITKNYLDSIDDISSSGRDMFTGFSFINCDNILVEGLTFKGEWDGKGEFRYASPRSIGIAFKGSRNCKVYNVHGYNIMGNVVNAVNTMQAVDGVYDYSDNITIDSCSATQCLENGFNFMGGTKNGYYVNNVSTGNGSSGFESGTENVIISNNIHTNNKYSGLSISGTNYTITNNVIYGNSNKGELSNKPSNGIAITGGSKGIISNNNVSGNEGYELYLYPGVNNIDIQNNVLKQDTTSLKTSIIYVSGTTSKPVSEINFKNNTLRSTNTALDKAMFLNFVMDSTITNNDIKTDKGNDSLSVQGSCSNLFVLNNNMNKNLSISGNAFNVISKDNIAYNLPKVLNGTSIPTTGSWRLGDIVVNTSRTLTSGSPEKWRCISDGVATNTKWTTNTDYTQGQIVYNGNYVYKAVGSGTSGATQPTHSNGIISDGSILWEFISTKANFEVVSQIGVTESISNTPLYKGQIAVVGSSVYVAKGTSSNSDWLQLN
Physico‐chemical
properties
protein length:1268 AA
molecular weight: 140302,22800 Da
isoelectric point:6,06491
aromaticity:0,10962
hydropathy:-0,46341

Domains

Domains [InterPro]
DC_0876
STR
6–1025
DC_0876 IPR006626 G3DSA:2.10.10.90
IPR006626
Unmapped
545–566
IPR006626 IPR011050
IPR012334
STR
704–1056
IPR012334 DC_0276
IPR006626
Unmapped
810–844
IPR006626 IPR006626 IPR039448
IPR006626
Unmapped
925–946
IPR006626 IPR006626 IPR006626
WAX23229.1
1 1268
Architecture
STR
RBD
STR
STR 6-1097 | RBD 1098-1134 | STR 1135-1268
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
WAX23229.1
1 1268
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 166 166 0,9846
Central domain 167 492 327 0,9789
C-terminal 493 1268 775 0,2361
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-166
Central
167-492
C-terminal
493-1268

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage vB_SauM_VL10
[NCBI] 		3003699 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WAX23229.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP940114 [NCBI]
CDS location
range 18877 -> 22683
strand -
CDS
ATGCCTCATTTAAAAGCATATGATAAATACGGTAATATATTGGCAATAGGTTACAATGTAGAGTTACATGAAGAAGTAGGGTCTGTAATTATACCTAACTTAGCTCCTCACACACATTACCCGCAGGGTGAGTTTTATGTGTCATGGGAAGCAGAAAAGTATGAAACTGATAAGGTAGTAGTTCCTGGTTTCACAACTCTAGAATCATCATTCAAAGAAATAACACTATATTTTAAAGACCATATACTTGTAAATGCTAAGTCTGCTTACGATGTAGCGGTAGATAATGGTTTTGTAGGTTCTGAAGAAGAATGGGTTAAATCTATCAAAGGTGAGAAAGGTGAGAAAGGAGACCAAGGTAAGCAAGGATTAAGTGCTTATGAAGTAGCTGTAAATAATGGTTTTACAGGCTCAGTTACAGACTGGCTTAAAACGGGTAAAAACCCTTACATATATTCTAATGAGTATGTAAAACAAAAAGATGATACTTCGGATGTTCAAAGGCTAAGACGTGCTATCAAAGATACAAGTGAAGGTAATACCTTATATATTCCTTCTAGTGAATCACCTATTAGAATAGATGATACTTTGGTAATAGATAAGAATATTAATATTGTATCTGATGCTAAGATTGTTTATAATGGTAGTAAGGATAAACCAGCTATTAAACTAGATAGTTTATCATATTCTAATGTTACAATTAAAGGTATTTATGATGATAGTTCTTATCCAACTTATGGTGGAGGCTATCATAGTTTTAAGAGTCAAAACTATATAGGACTAGAATTAGTTAACTGTAGAAATGTTAATACTAATATTAATGAAATTATTGGTTTTACAGTCGGTAATAAACATAAAGCTACTGGTGGTAAAGGTCATTGGTTTAATAATACTATTATTAATTTCTTTATTAATAATGAAACACATATAGAATTAAATACAGATGGTATAGGTTCTAATGGTGAGCAATCTTGGATGAATAGTAATTACTTCTATAAATCAGCTTTTTCATATAGTGGCACTGAGTTTAATAAACACCCTAACACATACTATAACATCAAACAAACTCTAACAAATGCTAATACCTATGGAGGAAATAGCAATGTATTCGATTCACTTAAATTTGAAACTGCTTCCACAACATCTGAAAATTATGTTATGGTGTATCTTAAAAAAGCAGTAGGATTTATATTTAAGAATTACAGATTTGAATTTAATAACAAAGCTACCTTTGCTATTATAGATTTAGAAACACAAGACATGACAAAATCTTATGTAACACATAGTAAAGATATTAAGTTTATTCCTGAATTTGTTTTAGGTAATGGACATAAACTAACGTTTACAAATATTAATACTGCTAAAATACCTAGAAGTAGTATTGCTAAAATAGTAGACGAATACAAAACAACATTATTGTATAAAAATAATGATTTTAGCAAAGACTATAGAAGATTAGGGGGTAACTATCACACAGTCAAAAATGTATTTAGAAAACCATTACAGTCAACTTCTCTGACAGATGAAGTATCTTATGACTATAATACTACACCTAGTTTAGTAGATGATAAAGGACTACTTACCTTTACAGGCTCGTACCCTATGGCTTTATATGTTAATAATGTTAGTGTTGGTGACGAGCTAATTATTAACAAGTTATCATTTATAGGTAATTCTAGTGGTATATTTATTAAATGTTTTGATAAAGACGGTAATATATTAGACAAAATATCTAATAATTATGACACAATATTACTGGATGGTTATTATAATGATAAATATAAAGCGTTCACTTTCAATAACGCCCAAAAAGATACTTTTACTGTTAATAGTGAAGATGTTAAGTCTATCGTTATTTTAATATCTGGAACTATGCAAGGTTTACTTGTAGATTCAACTAATCCATCCAATATTATTAAGTCTTCAAACGATAGTAGCAAGAATAAAACTGATGTTTTTTATTCTCATGTTAAACCTTCTAGTGTTGAAGATTTTAAATATGATGAAAAAGTATACAACAATGGTACAACACAAGTATATGGTTGGGTACTAAAAGGTAATGATTGGAAAGAACTAGGTAAAGACACTAATTCTAAGAGTAAAGTAATAGTTAATATAGAAGATTACCCAAGAATTAATGATGAAGATAATGACTACCCTAGATTCCAAAGAGCTTTAGATTATTTAACAAGTACTAAAGGTGGTACTCTTATAGTACCTAAAGGAACAGAGGACTATTTATTCAAAACTAAGACACCTACTGTACAAAACCCATCACGTGTAAAAGTAACAGGAAGTAATATACACATTAAAGGTGAAGGTAATCCTACATTTATTATGTCAGGAATCACTAAAAACTATTTAGACTCTATAGATGATATTTCTTCTAGTGGTAGAGATATGTTTACAGGATTCTCATTTATCAACTGTGATAACATTCTTGTAGAAGGATTAACATTTAAAGGGGAATGGGATGGTAAAGGTGAATTTAGATACGCATCTCCTCGTTCTATTGGAATAGCATTTAAAGGAAGTAGAAACTGTAAAGTATATAATGTACATGGTTATAATATTATGGGTAACGTTGTAAATGCAGTAAACACTATGCAAGCGGTAGATGGTGTTTATGATTACTCAGACAACATTACTATAGATAGTTGCTCAGCTACACAATGTTTAGAGAATGGTTTTAACTTTATGGGTGGCACTAAAAATGGTTACTATGTTAATAATGTATCTACAGGGAATGGTTCAAGCGGTTTTGAATCAGGAACAGAAAATGTTATTATAAGTAATAACATACATACAAACAATAAGTACTCAGGACTGAGTATATCAGGTACTAATTATACAATTACTAATAACGTAATTTATGGTAATAGTAATAAAGGAGAGTTAAGTAATAAACCATCTAATGGTATTGCTATTACAGGAGGTAGTAAAGGAATTATTAGTAACAATAATGTATCAGGTAATGAGGGTTACGAGTTGTACCTTTATCCAGGAGTTAATAACATAGATATACAAAATAATGTATTAAAACAAGATACAACAAGTTTAAAAACAAGTATTATTTATGTTTCAGGAACAACTAGTAAACCTGTGTCAGAAATTAACTTTAAAAATAATACATTAAGAAGTACAAATACTGCTTTGGATAAAGCTATGTTCTTAAATTTTGTTATGGATAGTACAATTACTAATAATGATATAAAAACAGATAAAGGTAATGATTCATTAAGTGTTCAAGGTTCTTGTAGTAATCTATTCGTATTAAATAACAATATGAATAAAAATTTAAGTATATCTGGTAATGCTTTTAATGTTATAAGCAAGGATAATATAGCTTATAATTTACCTAAAGTATTGAACGGTACCTCAATACCAACAACAGGAAGTTGGAGATTAGGAGACATTGTTGTTAATACTAGTAGAACCTTAACGTCAGGTAGTCCTGAGAAATGGAGATGTATTAGCGATGGTGTTGCAACTAATACAAAGTGGACAACTAATACAGATTACACACAAGGTCAAATTGTTTACAATGGTAACTACGTATATAAAGCGGTAGGTTCAGGTACGAGTGGAGCAACACAACCTACTCATAGTAATGGTATTATATCAGATGGTTCTATACTTTGGGAATTCATATCTACAAAAGCTAATTTTGAAGTTGTGAGTCAAATAGGTGTAACAGAAAGTATTAGTAACACACCATTATACAAAGGTCAGATTGCTGTAGTAGGGTCATCTGTATATGTAGCTAAAGGTACATCGTCTAATAGTGATTGGTTACAACTTAATTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
82fb80fa397124e3396cd680c4eeccbcf1fd093bd42252f172e38d66d021ce54
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2609
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50