Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A1D8KIR4 [UniProt]
- Protein name
- Putative short tail fiber
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MSFYQEAKSARGAAIGTIMPWGGGLTSIPAGWLICDGQFVEANDFPLLAQTIGDTYNAGTSDFIGTGSNSFPNYGGSIKLPNLNGKTLMDMEGSYFAGADASGGTDRDADKDAVAYTLMDPLIGTNEDQGITTIFNDVYVDLVFNINADDRTGYQGRIKGNTLINGEGFKTVYVAPRKLGRCHVKRHNHTGKLETIDKTAESQPGDGVVPYGTIYYTLFATAVDNDGSNRDEGENVDEMTGETYYFGYTNDDEGWKEDSPAEANGDGSTVSVTTSENSNEYGGIVAGRLSNPGATPSSSNIVDTYTLQWPTSDLLSGFLSGTRGTTVAKATSEQPPINMKPRDVTYSPLSNIQEFVQGKHLEGIVESGIGGNTVTIPPGYRNNYSNSQSQVGDTLISNTGINFTNETSDDTIIAHTHDEFDVSFDSTRMRAQSNLTVDVNLPNTVNLDNIANKNALQIDFNIEQPRMTSIYIIRAY
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 476 AA molecular weight: 51304,51120 Da isoelectric point: 4,39572 aromaticity: 0,08824 hydropathy: -0,47101
Domains
Domains [InterPro]
IPR037053
ATT
5–83
ATT
5–83
IPR037053
ATT
5–90
ATT
5–90
SSF88874
STR
13–63
STR
13–63
IPR011083
ATT
16–65
ATT
16–65
1
476
Architecture
ATT 5-90 | STR 91-476
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-CAM3 [NCBI] |
1883366 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Charybdisvirus > Charybdisvirus scam3 |
| Host |
Synechococcus sp. [NCBI] |
1131 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV58527.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686197
[NCBI]
CDS location
range 30758 -> 32188
strand +
strand +
CDS
ATGTCTTTTTACCAAGAAGCTAAAAGTGCAAGAGGTGCCGCCATCGGCACCATTATGCCATGGGGGGGAGGATTGACATCAATCCCCGCAGGTTGGTTAATTTGTGATGGACAATTTGTAGAAGCTAATGATTTTCCTTTATTAGCACAAACTATTGGTGATACTTATAATGCTGGAACCAGCGATTTTATTGGAACTGGTTCTAATTCCTTTCCCAACTATGGTGGCAGTATTAAACTTCCCAATTTAAACGGGAAGACATTGATGGATATGGAGGGTTCATATTTTGCTGGAGCAGATGCATCTGGTGGAACAGATCGTGATGCTGATAAAGACGCAGTAGCATATACATTAATGGATCCATTGATTGGAACTAATGAAGATCAAGGAATTACTACTATCTTTAATGATGTTTATGTTGATTTAGTATTCAACATTAACGCGGATGATAGAACAGGATATCAAGGAAGAATTAAAGGTAATACACTAATTAATGGAGAAGGATTTAAAACAGTTTATGTTGCTCCTCGAAAATTAGGTAGATGTCATGTTAAACGACATAACCACACAGGTAAACTTGAGACTATTGATAAAACAGCGGAATCTCAACCTGGAGATGGTGTAGTTCCATATGGAACTATCTACTATACTTTATTTGCAACTGCTGTTGATAATGACGGATCTAACCGTGATGAAGGTGAGAATGTCGATGAAATGACTGGAGAAACCTACTACTTTGGATATACCAATGATGATGAAGGTTGGAAAGAAGATTCTCCTGCTGAAGCCAATGGTGATGGTAGTACGGTTTCTGTAACTACATCTGAAAACTCTAATGAATATGGTGGTATTGTAGCTGGTAGACTTTCTAATCCTGGTGCTACACCATCAAGTTCTAATATTGTAGACACTTATACATTGCAATGGCCTACTTCTGATCTTTTATCGGGATTTCTTTCGGGAACCAGAGGTACAACTGTTGCTAAAGCAACATCAGAGCAACCTCCGATTAACATGAAACCCCGAGATGTCACTTATTCTCCGTTGAGTAATATTCAGGAATTTGTTCAAGGTAAACATTTAGAAGGTATTGTTGAATCTGGCATTGGTGGTAATACCGTTACCATTCCTCCAGGATATAGAAATAATTACAGCAATAGTCAGAGTCAAGTCGGAGATACTTTAATTAGCAATACTGGAATTAACTTTACTAATGAAACATCTGATGATACAATCATTGCTCATACTCATGATGAATTTGATGTTTCATTTGATAGCACCAGAATGAGAGCTCAAAGTAATCTCACTGTAGATGTAAACTTGCCAAATACTGTCAATCTTGATAACATTGCAAATAAAAATGCTTTACAGATTGACTTTAATATCGAGCAACCAAGAATGACCTCTATATACATTATCAGGGCATATTAA
Genbank protein accession
AOV58766.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686198
[NCBI]
CDS location
range 30765 -> 32195
strand +
strand +
CDS
ATGTCTTTTTACCAAGAAGCTAAAAGTGCAAGAGGTGCCGCCATCGGCACCATTATGCCATGGGGGGGAGGATTGACATCAATCCCCGCAGGTTGGTTAATTTGTGATGGACAATTTGTAGAAGCTAATGATTTTCCTTTATTAGCACAAACTATTGGTGATACTTATAATGCTGGAACCAGCGATTTTATTGGAACTGGTTCTAATTCCTTTCCCAACTATGGTGGCAGTATTAAACTTCCCAATTTAAACGGGAAGACATTGATGGATATGGAGGGTTCATATTTTGCTGGAGCAGATGCATCTGGTGGAACAGATCGTGATGCTGATAAAGACGCAGTAGCATATACATTAATGGATCCATTGATTGGAACTAATGAAGATCAAGGAATTACTACTATCTTTAATGATGTTTATGTTGATTTAGTATTCAACATTAACGCGGATGATAGAACAGGATATCAAGGAAGAATTAAAGGTAATACACTAATTAATGGAGAAGGATTTAAAACAGTTTATGTTGCTCCTCGAAAATTAGGTAGATGTCATGTTAAACGACATAACCACACAGGTAAACTTGAGACTATTGATAAAACAGCGGAATCTCAACCTGGAGATGGTGTAGTTCCATATGGAACTATCTACTATACTTTATTTGCAACTGCTGTTGATAATGACGGATCTAACCGTGATGAAGGTGAGAATGTCGATGAAATGACTGGAGAAACCTACTACTTTGGATATACCAATGATGATGAAGGTTGGAAAGAAGATTCTCCTGCTGAAGCCAATGGTGATGGTAGTACGGTTTCTGTAACTACATCTGAAAACTCTAATGAATATGGTGGTATTGTAGCTGGTAGACTTTCTAATCCTGGTGCTACACCATCAAGTTCTAATATTGTAGACACTTATACATTGCAATGGCCTACTTCTGATCTTTTATCGGGATTTCTTTCGGGAACCAGAGGTACAACTGTTGCTAAAGCAACATCAGAGCAACCTCCGATTAACATGAAACCCCGAGATGTCACTTATTCTCCGTTGAGTAATATTCAGGAATTTGTTCAAGGTAAACATTTAGAAGGTATTGTTGAATCTGGCATTGGTGGTAATACCGTTACCATTCCTCCAGGATATAGAAATAATTACAGCAATAGTCAGAGTCAAGTCGGAGATACTTTAATTAGCAATACTGGAATTAACTTTACTAATGAAACATCTGATGATACAATCATTGCACATACTCATGATGAATTTGATGTTTCATTTGATAGCACCAGAATGAGAGCTCAAAGTAATCTCACTGTAGATGTAAACTTGCCAAATACTGTCAATCTTGATAACATTGCAAATAAAAATGCTTTACAGATTGACTTTAATATCGAGCAACCAAGAATGACCTCTATATACATTATCAGGGCATATTAA
Genbank protein accession
AOV59005.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686199
[NCBI]
CDS location
range 30746 -> 32176
strand +
strand +
CDS
ATGTCTTTTTACCAAGAAGCTAAAAGTGCAAGAGGTGCCGCCATCGGCACCATTATGCCATGGGGGGGAGGATTGACATCAATCCCCGCAGGTTGGTTAATTTGTGATGGACAATTTGTAGAAGCTAATGATTTTCCTTTATTAGCACAAACTATTGGTGATACTTATAATGCTGGAACCAGCGATTTTATTGGAACTGGTTCTAATTCCTTTCCCAACTATGGTGGCAGTATTAAACTTCCCAATTTAAACGGGAAGACATTGATGGATATGGAGGGTTCATATTTTGCTGGAGCAGATGCATCTGGTGGAACAGATCGTGATGCTGATAAAGACGCAGTAGCATATACATTAATGGATCCATTGATTGGAACTAATGAAGATCAAGGAATTACTACTATCTTTAATGATGTTTATGTTGATTTAGTATTCAACATTAACGCGGATGATAGAACAGGATATCAAGGAAGAATTAAAGGTAATACACTAATTAATGGAGAAGGATTTAAAACAGTTTATGTTGCTCCTCGAAAATTAGGTAGATGTCATGTTAAACGACATAACCACACAGGTAAACTTGAGACTATTGATAAAACAGCGGAATCTCAACCTGGAGATGGTGTAGTTCCATATGGAACTATCTACTATACTTTATTTGCAACTGCTGTTGATAATGACGGATCTAACCGTGATGAAGGTGAGAATGTCGATGAAATGACTGGAGAAACCTACTACTTTGGATATACCAATGATGATGAAGGTTGGAAAGAAGATTCTCCTGCTGAAGCCAATGGTGATGGTAGTACGGTTTCTGTAACTACATCTGAAAACTCTAATGAATATGGTGGTATTGTAGCTGGTAGACTTTCTAATCCTGGTGCTACACCATCAAGTTCTAATATTGTAGACACTTATACATTGCAATGGCCTACTTCTGATCTTTTATCGGGATTTCTTTCGGGAACCAGAGGTACAACTGTTGCTAAAGCAACATCAGAGCAACCTCCGATTAACATGAAACCCCGAGATGTCACTTATTCTCCGTTGAGTAATATTCAGGAATTTGTTCAAGGTAAACATTTAGAAGGTATTGTTGAATCTGGCATTGGTGGTAATACCGTTACCATTCCTCCAGGATATAGAAATAATTACAGCAATAGTCAGAGTCAAGTCGGAGATACTTTAATTAGCAATACTGGAATTAACTTTACTAATGAAACATCTGATGATACAATCATTGCTCATACTCATGATGAATTTGATGTTTCATTTGATAGCACCAGAATGAGAGCTCAAAGTAATCTCACTGTAGATGTAAACTTGCCAAATACTGTCAATCTTGATAACATTGCAAATAAAAATGCTTTACAGATTGACTTTAATATCGAGCAACCAAGAATGACCTCTATATACATTATCAGGGCATATTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
e278ecbbdd6541a8491c412b6ba5f6530833c03f04b6f4f45ebd7373cd1179e2
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50