UniProt accession
E3SKD4 [UniProt]
Protein name
LamG-like jellyroll fold domain-containing protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,56
Protein sequence
MNINKVSQSIVSQTPDFIENDYPLFNKFIEYYYRSQEKTGLGQNILNEFLQYLDIDKLNIDILDGATKLVEPISTTTDEIVVESVDAFLKTDGSVLIGNEVVYYESTTASPNIALSPGISYEQVKLKWTTLANLIDSFDGTTTRFNLTSQDSPIAAPSAQHLIVSNYGDILTPGVDYTVDGTQIVYTTAPRQRIPADDSTSTYVTYLSGFVENSIVAIDNLSGGFGDGKRQFTMTRNGSPYEPTVDEYVLAIYDKRLLVPKVDFFIDGDQFIFLTAPLNGRFLSVYSIEAPIPSFGSGALGYSRVDNNGTLTSVSINATGSNYRFEYPPKVSVNSENGSGASVSTLVNGIKSVTLLDGGKGYSDTNPPVVQVQSPTKPGSTAATLKATVTNGSISNLEVVGSGSGYTFTPRITFKQPGGAVLGTPTITNGQITGTIPITNGGFGYTTVPTIYVDEPTGTNPIKATLIPVLTDGVITSVTIANAGQGYTSAPRISVIDPVGAQVLATTVDSNGRLIGIELLDGGSGYDDVPSVYVVDNRTDNQGNYAGGTGATASAAIFNGRITDINITAFGSGYSQTNPPTIVIQSPPEAKASAEIGLNEVTGFKVNQAGKGYLKAKLVGCSRAASGITAYTEDGNAVFTNNTVASASDANTPVKCLDALFVKRLLDKYTEQFLPDVPELDYKKIDVRTAIKTIKDFYTAKGTSFSISYLFKLLYGEQVSITYPKDQIIKPSAATWSIDTILRATLVSGNPIDIRDGLLTQDADIADTNVQAASALIENYISIKTSDVEIYELVLSEETINGTFTVPYKTKLAEPLGTEDSIITVDSTIGWPERNGEFIIGNGEVVRYKEKSLNQFIECTRSVNGIVEDWDSATEVSSNFQVSVNKGTPQEVVMKIVGIVDAQQTNLTDTGSYYLPGDKLTVSKLGGTGTNAELTTWLYNVKKLITVSGITFGGVNNQSATVTCSNNHGLLVGDQVTIYGANPIIYNGTFLVTSRDSSTVFQYQLPQPATVVPQGNILVSVDLNKGKSDDAPVLNSIGPYTTNIQNSFFNDNYVYVASTGIPNYKIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPLASTTISTKNDIVSGPIGTWVNGVSVWSYKSTIKKTFGAVTAINISNAGSGYDAASPPNITISGGGGSGAASTVTVNGSVSEITVNNGGSGYTSSPLVSIAGGGGSGAAATAIITKGVVSRVLINDGGTGYTSQPTITIVGGGGSGATGTASVRGPIKTVSITNGGASYTSNPTVTLSSGSGAVAQAIVQNGRIISIAIISAGSGYTTAPEITIQGDGFGAVARATIDVDGENAGRVTGIEIVNRGIGYIQGTTVISLNSVGSGATFSPNVFQWTYNLQETSTLDSAKGGVFEGFNNQYGGEYAHISNPQRLRYILGDNLFENTSGQIKEQEDQLDHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYSDPTDQNSSITKLNTSYRLKTNLVFDAINNPYPVRTAGPLLTDEAAGKFVEDYEYVFSLGDLDQYNGRFCKTPDYPQGRYCYFVTIDSTEDGNPLFPYVLGPSFNSVVDSWNLNANAVQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNALTLENGDVLLFEVEDEDRSGIIDQSEIDDPDQVFEESPLQLFDYFPKVKLDSKVDIEVETITKFEDASVTGFTIENAGISYQVNDRLVFDNTDTDGSGVSARVSRIKGESVLTYGFENTSGVNYGLLKTTNPHNLVAGDTVFVDYSPVMDNTNKSYVVRQYKGIEEIVIDQTGSGYNTDIPPTIIIDGNGSDGKLEAVVSSVGSIDTVNILNSGSGYTSNPRVILSHPQVFKKADYYVSLIENENYVSINDVFVNDNKEVYVCGKTHDTSDNIVAFVAKLSATGVKEWEATLELTGGLDDAEFQKIYVDGKDIWIAGRNYPNSTILNAYNPDIILVKYVEATNGLSATLAFQKAYAGISGSTRSDEVTALTKYSDTRFILGGFTNTNSGVPYDAFLALVDTTGTFAIKRKLTSANSSEKITDIVVNGTDVFYSMEIAATASATAIDVGFGKATIGTNVIEIPWIKRISNTLYSFLDTSLAIDEFNEAYITATTRLKSDNTTKTGFWVGKFDTTGDLIYNKRYAVSGGTITAASKCVIDIFGDLNVAISKIATTDGLRTAECIKLGYDGVIKNHTTQQFNINNIEGITVNSLDVDNSGDIHLFGQTSWNRNEFIFPFTSGSNADTTGHYTLTSTSTTNSITYADNVAKIYGYNPAGSNSTWVNSHLKITSAQLGTKLAGDWTIEFALYKEASSSGTLSQTQHTLVSIGDAENATGGLWLYYDVSSGKLELVVTNNTTKLNSAGSALQSTLTTMFADNTWQYIGLKKEGNQFTAYVNGLQAFTGSVSNTALGGKDLLFGQISGKDTTAGSFRKNEQGQYFIDHLRLRNRAVTPTVPTDVTAFPTAGAFAFAYTWVDSAWFTTNLNKYDYIDYVGWGLKIDKNADAARIGTQTAQTNTQVGFVRASVAAVTPATLTVTNTGFSLGDAGFQNLDFDDSTITMTAGTESLTYKQDIWSSRTATVPSPGSRKLKVTAVVKDRYYFKVTPTSKIDNIQELTINQAFNFTVGTKLRLNNNSGSFINSGYIVSKDTVNNKVYLAVNNNTWTNDLNTGQLVTEQFSEQSTYGIVGPIPNDINEITSYNFAQVNNTTPGTFNIDLDKYNLDGTYNAAGGQNLDSFAKFKPHSDTDYSIRIDEVSGSSPYIVGSVITITASDISFNSAYSTAQITNLTGVLKITLIANLTKILQVTAVANSDQVYVITGTNHYLSEGSMLYIDGNPSQTVNSVVYDEYDGSFAVSSIVSAREFVYKLPQAAITEPATTAANVSIYVKSPVLKMYYGHQYLFDVSHSSMAGGNLSFSKDNLNKLEYSFNSIERVGTPGITGAGIANPTVKLKVDEGIVTNISYYFDPSRTGADSPVSDGSYLDVTNSPYKGTFLVESVQGATITRGADIIKFPLLNEPEAAADVNQASYTTSSVKAVGSIGAIRIVNPGGFYTRLPVVTGIQSTRQIERVAINAPGTEYAVGTYTGVPIGGDGEGGFVQITVADGTDAEGVSIPGQIQSVVVTSPGKNYTTATIDVEAITGILGAGLTGSGAELEVVIPASGTGASIFTQGDKVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILDSITVTDPGSGYSQAPAVVITGGGGTGAVAEATIKNGRLDQIIVKDPGAGYSSTPTVALRSSFNYVVNLDLGLLQFAFPHGIANGSQVTLNVVDTGDGADFPLAAGAVGRLNGTTTYFAITGSANSLEPDQLKLAITSANAELGDAISYVNAGTGRQQLLTESFGGGATANVITSTFLEGELVYQGSSLENATATGFVSTNSGWQIGPRVLKIVDYTGDFVQGQKVTGVISKSSGTISDLNIAKGVLEIGSLTKTTGQFIDDVGKPSEIIEKIQDSYYYQDFSYAIKSAVSIGEWKDILIKNVHPASFKVFGELNLSDYGFIPNKETDFQLTKSVELAREAIVPNIQSFALAEPVYSEFNNTEILFRQKRLTSSENILTSVVQRIDDISSLFDGERIAFPLTVGGNNLVANANQLMIVLNGVVQNPGTSFNIQGDSIVFNEPPQPPASVKYVNVTIQQINTVQVQFNNISGIFPNVGNVMVGTASGTRLTVTSVVGNDVFGYYSEGTAFITNELVTVGATGFASNVAAVTPVNNIGLFTFGEKVTDFQGDTAKVESINLQKGQETPLAQLRYTIGPSTTSFEVIAYKTDNTAADAPVTAGTFTTGQNYQFGSEIFLLNSITQGSESTTLGVTRAQSGTAAVSQQEDIPLYGTQISVNDQLTLSKTTGTYQSTPGLYDIQLNEVIIGSQSGVVARITATSAYQDPVTQEFISQVNISEGSSFFGLLFNRITSQTYPNVVLDDISKSQVRIVDFTDNNTDYNTKFPANEEINNYIIPYDNASGTLQNEVIRNYKIEYGNNDGEFTVGEGAVVRRLTYRDTVGTGLFVPGQVIRTRDTKAEVIGANQARKTVYVGKIGRSLRNGGDYHTFTFNAGTALNAYNKRFGSACLGLSPGNAAHTFVSGTADSITAGGGATGTFTAAAGTTYDPFTGNLVINIGTHSLTTSNTVLISDNSIGFTCAQDGNSSTKTYPRSTDPASGSARSITAVTSNTITVNVGTVPIDESVTIPASDEFGFGTGAFTVECWIKPITVAAGSRSVFDFRTAATELAPYLYVDGANLKYYNNGAVVITGTATLAADTWYHVAISRTGTTTKMFVNGAQDGSSYTDSSNYGTNKPLRIGDDTAGNNHFVGYIDEFRVSTTARYTAPFTAPTGIFQGDSNTKLLVHFDGVEGQNHTDDWSGGESFTKGEYFNNDAILETSRKTGAPSGFQGRTHRYYNAADLIEDNIDFIKKEAVYLLTQQYSSLVIPGGNINCEDDIRDVLQALVQDLRNGSNEHIWDASALYVNRTTNPIQLSHVESQITETIWAFNKVDEILQYIINNVIWTVQGNHGLTQTTDTTITDSSYTTLNQFTPSAATYNPATGDMVLTIGSHSMTTSSQVSIATGGVTFTCDKDGNDRPTAYPRATDPAAGAVLKVSAVTGTTITVNVGASPANQQYAHTFSSAVTNSVTELNYTTGDCADVYATVQTLIDILTDTLTQANAGTPVDHLATVTRVTPAYEFVGGTVDAYLETTLAVNYHDSANDVSYTNQIDGDAQYRFRDAANLIRQNRTPIVDKAAYDMLQRYPELAQDMPRNQGGGSTDGTIRCKTDLGLFLDAIANDIENGGNLETVTGTGFYINNQGGLRYIRLQVFQSVYAHERLGYYAKQAITGDLDDTNTNSIVVGDWGITQDGGNCANVQTAIDTLIGTINDIIAPTGADFATGADRLYFNKQFIKEEVNGLVLQFLGYVLNGVTYNAGSWNDELDVEDLIVALISDLQTGATDSTIQEANTYLTAALNIQTIDNVLPAALYAIEQVGVLGEYAIENALYAQGNTVSSGQY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Physico‐chemical
properties
protein length:6171 AA
molecular weight: 659597,01240 Da
isoelectric point:4,57909
aromaticity:0,09626
hydropathy:-0,13280

Domains

Domains [InterPro]
DC_1338
ATT
1400–2674
DC_0069
STR
4186–4655
IPR006558
LEC
4198–4326
E3SKD4
1 6171
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
RBD
ATT 1-3183 | STR 3184-3976 | STR 4181-4655 | RBD 4656-5010 | RBD 5378-6170 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SSM5
[NCBI]
445685 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Glaucusvirus > Glaucusvirus ssm5
Host Synechococcus sp. WH 8102
[NCBI]
84588 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO97976.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071097 [NCBI]
CDS location
range 56339 -> 74854
strand +
CDS
ATGAATATCAATAAGGTCTCCCAGTCTATTGTCTCTCAGACACCAGATTTTATTGAGAACGATTATCCACTATTCAATAAATTTATTGAATATTACTATCGTTCTCAAGAAAAGACGGGTTTAGGTCAGAATATCCTCAATGAGTTTTTACAATATCTTGATATTGATAAACTTAACATTGATATTTTAGATGGTGCTACTAAGTTGGTAGAACCTATTTCTACGACTACTGATGAAATCGTAGTTGAAAGTGTTGACGCCTTCTTGAAAACAGATGGTTCGGTTTTAATTGGTAACGAGGTTGTATATTATGAGTCTACTACTGCTTCTCCTAACATTGCCCTGAGTCCTGGCATTTCTTACGAGCAAGTAAAATTAAAGTGGACAACCCTTGCAAATTTAATTGACAGTTTTGATGGCACTACAACCAGATTCAATCTGACCTCTCAAGACAGTCCTATTGCAGCACCCTCTGCACAGCATTTAATTGTCTCTAATTATGGAGATATTTTAACACCTGGTGTTGATTACACTGTTGATGGTACGCAGATTGTATATACTACTGCACCTAGACAAAGAATTCCTGCTGACGACAGTACCTCAACGTATGTTACATATTTGAGTGGATTTGTCGAAAATAGCATTGTTGCTATTGATAATCTTTCTGGAGGATTTGGTGACGGAAAGAGACAATTTACTATGACGAGAAATGGTTCTCCTTACGAACCTACTGTAGATGAATATGTTCTTGCAATTTATGACAAGCGTTTATTAGTTCCAAAAGTTGATTTTTTCATTGATGGTGATCAGTTTATCTTTTTAACTGCACCTCTTAATGGTCGTTTCTTATCAGTATATTCTATCGAAGCACCTATTCCTTCCTTTGGTTCTGGTGCTCTAGGATATTCTCGTGTTGATAATAATGGAACTCTTACCAGTGTTTCTATCAATGCAACTGGTAGTAACTATCGTTTTGAATATCCCCCTAAAGTTTCTGTCAACTCTGAAAATGGCAGTGGCGCGTCTGTATCTACTCTTGTAAATGGTATTAAATCCGTAACACTGCTAGATGGTGGTAAAGGATATAGTGACACCAACCCTCCTGTTGTTCAGGTTCAATCTCCAACAAAACCTGGTTCTACAGCAGCAACTCTTAAAGCGACTGTAACTAACGGCAGTATTTCCAATTTAGAAGTTGTAGGATCTGGTAGTGGATATACATTCACTCCTAGAATTACATTCAAACAACCTGGTGGTGCTGTATTAGGAACACCCACGATTACCAATGGTCAAATTACTGGAACTATCCCTATTACCAATGGTGGTTTCGGATATACTACCGTTCCTACAATTTATGTTGATGAACCTACAGGAACTAACCCAATCAAGGCAACTCTTATTCCTGTTTTAACTGATGGTGTTATTACATCAGTAACTATTGCCAATGCAGGTCAGGGTTATACCTCTGCTCCTAGAATTTCTGTAATTGATCCTGTTGGTGCTCAAGTATTAGCAACCACTGTTGATAGTAATGGTAGACTAATCGGTATTGAATTATTAGATGGTGGTAGTGGATATGATGATGTACCTTCTGTGTATGTTGTAGATAATAGAACTGATAATCAGGGTAATTATGCTGGCGGCACAGGTGCAACAGCATCTGCTGCTATATTCAACGGCAGAATTACTGATATCAACATCACAGCATTTGGTTCTGGATATAGTCAAACTAATCCACCTACAATTGTCATTCAGAGTCCTCCTGAGGCAAAAGCATCTGCCGAAATTGGTTTGAATGAAGTTACTGGTTTTAAAGTAAATCAGGCAGGTAAAGGATACTTAAAAGCAAAACTAGTTGGTTGTTCTAGAGCAGCAAGTGGTATCACGGCTTATACAGAAGACGGCAATGCTGTATTTACCAATAATACTGTTGCGTCTGCATCTGATGCCAATACTCCTGTAAAATGTCTTGATGCATTGTTTGTCAAGAGATTACTTGACAAATATACAGAACAGTTCTTACCAGATGTTCCTGAACTCGATTATAAGAAAATCGATGTTAGAACTGCAATCAAAACAATTAAAGATTTTTACACTGCAAAGGGTACATCTTTTAGTATTAGTTATTTGTTCAAACTGCTTTATGGTGAACAAGTAAGTATTACATATCCAAAAGATCAGATTATTAAACCATCTGCAGCAACTTGGTCTATTGATACTATTTTGCGTGCAACTCTGGTAAGTGGTAATCCTATCGATATCAGAGATGGTCTTTTAACTCAAGACGCAGATATTGCCGACACTAATGTTCAAGCAGCAAGTGCTCTGATTGAAAACTATATTTCTATTAAAACTTCTGATGTAGAGATCTATGAATTAGTTCTTTCGGAAGAAACCATTAATGGAACGTTTACAGTTCCATATAAAACAAAACTTGCCGAACCTTTGGGAACAGAAGACAGCATCATCACTGTTGACTCTACTATTGGTTGGCCAGAAAGAAACGGTGAGTTTATTATTGGAAATGGTGAAGTTGTAAGATATAAAGAAAAATCTCTTAACCAGTTTATTGAGTGTACACGTTCTGTTAACGGTATTGTTGAAGATTGGGATTCTGCAACCGAAGTATCTTCAAATTTCCAAGTGTCAGTTAACAAAGGCACTCCTCAGGAAGTTGTCATGAAAATTGTTGGTATCGTTGATGCACAACAAACTAATCTTACTGACACTGGTTCATACTACCTTCCTGGCGACAAATTAACAGTTTCTAAGTTAGGTGGAACAGGAACTAACGCTGAATTGACAACTTGGTTGTATAATGTTAAAAAATTAATCACTGTATCTGGTATTACGTTTGGTGGTGTTAACAATCAATCTGCAACTGTAACTTGTTCTAATAATCATGGTTTGTTAGTTGGTGATCAAGTTACAATTTATGGTGCCAATCCAATCATCTATAATGGAACTTTCTTAGTTACATCTAGAGACAGTAGCACTGTATTCCAATATCAACTACCACAACCTGCTACAGTTGTACCTCAAGGTAATATTCTTGTATCGGTTGACCTTAATAAAGGTAAGTCTGATGATGCACCAGTCTTAAATTCTATTGGTCCTTATACAACTAATATTCAAAACTCTTTCTTTAACGATAATTACGTTTATGTTGCCTCCACAGGTATTCCGAACTATAAGATCGGTCCTTTTCCTGGTTCGGCACTCTTACCTGGCAACCAACGTAAGTTAAATCGTTTCCCCTTAGCATCTACTACAATCTCTACAAAAAATGATATTGTATCTGGTCCTATTGGAACATGGGTAAATGGTGTCTCTGTATGGTCTTATAAGTCTACAATCAAGAAAACTTTTGGTGCTGTTACTGCCATCAATATTTCTAATGCTGGTTCTGGTTATGATGCCGCTTCTCCTCCAAATATTACTATTTCAGGTGGTGGTGGATCTGGTGCTGCCTCTACAGTAACCGTCAATGGTTCTGTTAGTGAAATCACAGTAAACAATGGTGGATCTGGATATACTTCATCTCCTCTTGTTTCTATTGCAGGTGGTGGTGGATCTGGTGCTGCAGCAACTGCTATTATCACAAAAGGTGTTGTATCTAGAGTTCTCATTAACGATGGTGGAACAGGATATACATCTCAACCTACAATTACTATTGTTGGTGGTGGAGGATCTGGTGCAACTGGTACAGCATCGGTTCGTGGTCCTATCAAAACTGTTAGTATCACCAACGGTGGTGCATCTTATACTTCTAATCCTACCGTTACATTAAGTTCTGGTAGCGGTGCAGTTGCTCAAGCAATTGTACAGAATGGTCGTATCATCTCTATTGCAATTATTTCCGCTGGTTCTGGATATACAACTGCTCCTGAAATTACTATTCAGGGTGATGGATTTGGTGCTGTTGCTCGTGCAACTATTGATGTTGATGGTGAAAATGCTGGTAGGGTTACTGGAATTGAAATTGTCAACAGAGGTATTGGATATATTCAGGGCACAACTGTTATCAGTCTGAACTCTGTTGGTTCTGGTGCTACATTTTCTCCCAATGTATTCCAATGGACATACAACTTACAAGAAACTTCTACACTTGATTCTGCTAAGGGTGGAGTATTTGAAGGATTTAATAATCAGTATGGTGGTGAATATGCACATATTTCCAACCCACAAAGACTGAGATATATTCTTGGTGATAACCTGTTTGAAAATACTTCAGGACAAATCAAAGAACAGGAAGATCAACTTGATCACTCTCCGATTATTGGTTGGGCATTTGATGGTAATCCGATTTATGGTCCTTATGGATACTCTGATCCTACTGATCAGAACTCATCTATTACAAAGTTGAATACGTCTTATCGTCTCAAAACTAATCTTGTATTCGATGCTATTAATAATCCATATCCTGTAAGAACTGCTGGTCCTCTGTTGACTGATGAAGCAGCAGGTAAGTTTGTTGAAGACTATGAGTATGTCTTTAGCTTAGGTGATTTGGACCAATATAATGGTCGCTTCTGTAAAACTCCTGACTATCCTCAGGGAAGATATTGTTATTTTGTAACCATTGATTCTACTGAAGATGGTAATCCCCTCTTCCCGTATGTTCTTGGTCCTAGTTTCAACTCTGTTGTTGATAGTTGGAACTTAAATGCTAATGCAGTACAACAAAATATTCCTACTGGTGTTGTTAGATATCGTGATCCTTATGAAAATGTAGATATCGATGTTGAACGTGCTCCTAATGCATCTACGAATGCATTAACGCTAGAGAACGGCGATGTTCTTCTGTTTGAAGTAGAAGATGAAGATAGAAGTGGAATTATCGATCAATCTGAAATTGATGATCCAGATCAGGTCTTTGAAGAATCTCCTCTTCAACTCTTTGATTATTTCCCGAAAGTAAAACTCGACTCTAAAGTTGATATTGAAGTTGAGACAATTACTAAATTTGAAGATGCATCTGTAACAGGATTCACTATTGA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