Protein
View in Explore- UniProt accession
- E3SKD4 [UniProt]
- Protein name
- LamG-like jellyroll fold domain-containing protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MNINKVSQSIVSQTPDFIENDYPLFNKFIEYYYRSQEKTGLGQNILNEFLQYLDIDKLNIDILDGATKLVEPISTTTDEIVVESVDAFLKTDGSVLIGNEVVYYESTTASPNIALSPGISYEQVKLKWTTLANLIDSFDGTTTRFNLTSQDSPIAAPSAQHLIVSNYGDILTPGVDYTVDGTQIVYTTAPRQRIPADDSTSTYVTYLSGFVENSIVAIDNLSGGFGDGKRQFTMTRNGSPYEPTVDEYVLAIYDKRLLVPKVDFFIDGDQFIFLTAPLNGRFLSVYSIEAPIPSFGSGALGYSRVDNNGTLTSVSINATGSNYRFEYPPKVSVNSENGSGASVSTLVNGIKSVTLLDGGKGYSDTNPPVVQVQSPTKPGSTAATLKATVTNGSISNLEVVGSGSGYTFTPRITFKQPGGAVLGTPTITNGQITGTIPITNGGFGYTTVPTIYVDEPTGTNPIKATLIPVLTDGVITSVTIANAGQGYTSAPRISVIDPVGAQVLATTVDSNGRLIGIELLDGGSGYDDVPSVYVVDNRTDNQGNYAGGTGATASAAIFNGRITDINITAFGSGYSQTNPPTIVIQSPPEAKASAEIGLNEVTGFKVNQAGKGYLKAKLVGCSRAASGITAYTEDGNAVFTNNTVASASDANTPVKCLDALFVKRLLDKYTEQFLPDVPELDYKKIDVRTAIKTIKDFYTAKGTSFSISYLFKLLYGEQVSITYPKDQIIKPSAATWSIDTILRATLVSGNPIDIRDGLLTQDADIADTNVQAASALIENYISIKTSDVEIYELVLSEETINGTFTVPYKTKLAEPLGTEDSIITVDSTIGWPERNGEFIIGNGEVVRYKEKSLNQFIECTRSVNGIVEDWDSATEVSSNFQVSVNKGTPQEVVMKIVGIVDAQQTNLTDTGSYYLPGDKLTVSKLGGTGTNAELTTWLYNVKKLITVSGITFGGVNNQSATVTCSNNHGLLVGDQVTIYGANPIIYNGTFLVTSRDSSTVFQYQLPQPATVVPQGNILVSVDLNKGKSDDAPVLNSIGPYTTNIQNSFFNDNYVYVASTGIPNYKIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPLASTTISTKNDIVSGPIGTWVNGVSVWSYKSTIKKTFGAVTAINISNAGSGYDAASPPNITISGGGGSGAASTVTVNGSVSEITVNNGGSGYTSSPLVSIAGGGGSGAAATAIITKGVVSRVLINDGGTGYTSQPTITIVGGGGSGATGTASVRGPIKTVSITNGGASYTSNPTVTLSSGSGAVAQAIVQNGRIISIAIISAGSGYTTAPEITIQGDGFGAVARATIDVDGENAGRVTGIEIVNRGIGYIQGTTVISLNSVGSGATFSPNVFQWTYNLQETSTLDSAKGGVFEGFNNQYGGEYAHISNPQRLRYILGDNLFENTSGQIKEQEDQLDHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYSDPTDQNSSITKLNTSYRLKTNLVFDAINNPYPVRTAGPLLTDEAAGKFVEDYEYVFSLGDLDQYNGRFCKTPDYPQGRYCYFVTIDSTEDGNPLFPYVLGPSFNSVVDSWNLNANAVQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNALTLENGDVLLFEVEDEDRSGIIDQSEIDDPDQVFEESPLQLFDYFPKVKLDSKVDIEVETITKFEDASVTGFTIENAGISYQVNDRLVFDNTDTDGSGVSARVSRIKGESVLTYGFENTSGVNYGLLKTTNPHNLVAGDTVFVDYSPVMDNTNKSYVVRQYKGIEEIVIDQTGSGYNTDIPPTIIIDGNGSDGKLEAVVSSVGSIDTVNILNSGSGYTSNPRVILSHPQVFKKADYYVSLIENENYVSINDVFVNDNKEVYVCGKTHDTSDNIVAFVAKLSATGVKEWEATLELTGGLDDAEFQKIYVDGKDIWIAGRNYPNSTILNAYNPDIILVKYVEATNGLSATLAFQKAYAGISGSTRSDEVTALTKYSDTRFILGGFTNTNSGVPYDAFLALVDTTGTFAIKRKLTSANSSEKITDIVVNGTDVFYSMEIAATASATAIDVGFGKATIGTNVIEIPWIKRISNTLYSFLDTSLAIDEFNEAYITATTRLKSDNTTKTGFWVGKFDTTGDLIYNKRYAVSGGTITAASKCVIDIFGDLNVAISKIATTDGLRTAECIKLGYDGVIKNHTTQQFNINNIEGITVNSLDVDNSGDIHLFGQTSWNRNEFIFPFTSGSNADTTGHYTLTSTSTTNSITYADNVAKIYGYNPAGSNSTWVNSHLKITSAQLGTKLAGDWTIEFALYKEASSSGTLSQTQHTLVSIGDAENATGGLWLYYDVSSGKLELVVTNNTTKLNSAGSALQSTLTTMFADNTWQYIGLKKEGNQFTAYVNGLQAFTGSVSNTALGGKDLLFGQISGKDTTAGSFRKNEQGQYFIDHLRLRNRAVTPTVPTDVTAFPTAGAFAFAYTWVDSAWFTTNLNKYDYIDYVGWGLKIDKNADAARIGTQTAQTNTQVGFVRASVAAVTPATLTVTNTGFSLGDAGFQNLDFDDSTITMTAGTESLTYKQDIWSSRTATVPSPGSRKLKVTAVVKDRYYFKVTPTSKIDNIQELTINQAFNFTVGTKLRLNNNSGSFINSGYIVSKDTVNNKVYLAVNNNTWTNDLNTGQLVTEQFSEQSTYGIVGPIPNDINEITSYNFAQVNNTTPGTFNIDLDKYNLDGTYNAAGGQNLDSFAKFKPHSDTDYSIRIDEVSGSSPYIVGSVITITASDISFNSAYSTAQITNLTGVLKITLIANLTKILQVTAVANSDQVYVITGTNHYLSEGSMLYIDGNPSQTVNSVVYDEYDGSFAVSSIVSAREFVYKLPQAAITEPATTAANVSIYVKSPVLKMYYGHQYLFDVSHSSMAGGNLSFSKDNLNKLEYSFNSIERVGTPGITGAGIANPTVKLKVDEGIVTNISYYFDPSRTGADSPVSDGSYLDVTNSPYKGTFLVESVQGATITRGADIIKFPLLNEPEAAADVNQASYTTSSVKAVGSIGAIRIVNPGGFYTRLPVVTGIQSTRQIERVAINAPGTEYAVGTYTGVPIGGDGEGGFVQITVADGTDAEGVSIPGQIQSVVVTSPGKNYTTATIDVEAITGILGAGLTGSGAELEVVIPASGTGASIFTQGDKVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILDSITVTDPGSGYSQAPAVVITGGGGTGAVAEATIKNGRLDQIIVKDPGAGYSSTPTVALRSSFNYVVNLDLGLLQFAFPHGIANGSQVTLNVVDTGDGADFPLAAGAVGRLNGTTTYFAITGSANSLEPDQLKLAITSANAELGDAISYVNAGTGRQQLLTESFGGGATANVITSTFLEGELVYQGSSLENATATGFVSTNSGWQIGPRVLKIVDYTGDFVQGQKVTGVISKSSGTISDLNIAKGVLEIGSLTKTTGQFIDDVGKPSEIIEKIQDSYYYQDFSYAIKSAVSIGEWKDILIKNVHPASFKVFGELNLSDYGFIPNKETDFQLTKSVELAREAIVPNIQSFALAEPVYSEFNNTEILFRQKRLTSSENILTSVVQRIDDISSLFDGERIAFPLTVGGNNLVANANQLMIVLNGVVQNPGTSFNIQGDSIVFNEPPQPPASVKYVNVTIQQINTVQVQFNNISGIFPNVGNVMVGTASGTRLTVTSVVGNDVFGYYSEGTAFITNELVTVGATGFASNVAAVTPVNNIGLFTFGEKVTDFQGDTAKVESINLQKGQETPLAQLRYTIGPSTTSFEVIAYKTDNTAADAPVTAGTFTTGQNYQFGSEIFLLNSITQGSESTTLGVTRAQSGTAAVSQQEDIPLYGTQISVNDQLTLSKTTGTYQSTPGLYDIQLNEVIIGSQSGVVARITATSAYQDPVTQEFISQVNISEGSSFFGLLFNRITSQTYPNVVLDDISKSQVRIVDFTDNNTDYNTKFPANEEINNYIIPYDNASGTLQNEVIRNYKIEYGNNDGEFTVGEGAVVRRLTYRDTVGTGLFVPGQVIRTRDTKAEVIGANQARKTVYVGKIGRSLRNGGDYHTFTFNAGTALNAYNKRFGSACLGLSPGNAAHTFVSGTADSITAGGGATGTFTAAAGTTYDPFTGNLVINIGTHSLTTSNTVLISDNSIGFTCAQDGNSSTKTYPRSTDPASGSARSITAVTSNTITVNVGTVPIDESVTIPASDEFGFGTGAFTVECWIKPITVAAGSRSVFDFRTAATELAPYLYVDGANLKYYNNGAVVITGTATLAADTWYHVAISRTGTTTKMFVNGAQDGSSYTDSSNYGTNKPLRIGDDTAGNNHFVGYIDEFRVSTTARYTAPFTAPTGIFQGDSNTKLLVHFDGVEGQNHTDDWSGGESFTKGEYFNNDAILETSRKTGAPSGFQGRTHRYYNAADLIEDNIDFIKKEAVYLLTQQYSSLVIPGGNINCEDDIRDVLQALVQDLRNGSNEHIWDASALYVNRTTNPIQLSHVESQITETIWAFNKVDEILQYIINNVIWTVQGNHGLTQTTDTTITDSSYTTLNQFTPSAATYNPATGDMVLTIGSHSMTTSSQVSIATGGVTFTCDKDGNDRPTAYPRATDPAAGAVLKVSAVTGTTITVNVGASPANQQYAHTFSSAVTNSVTELNYTTGDCADVYATVQTLIDILTDTLTQANAGTPVDHLATVTRVTPAYEFVGGTVDAYLETTLAVNYHDSANDVSYTNQIDGDAQYRFRDAANLIRQNRTPIVDKAAYDMLQRYPELAQDMPRNQGGGSTDGTIRCKTDLGLFLDAIANDIENGGNLETVTGTGFYINNQGGLRYIRLQVFQSVYAHERLGYYAKQAITGDLDDTNTNSIVVGDWGITQDGGNCANVQTAIDTLIGTINDIIAPTGADFATGADRLYFNKQFIKEEVNGLVLQFLGYVLNGVTYNAGSWNDELDVEDLIVALISDLQTGATDSTIQEANTYLTAALNIQTIDNVLPAALYAIEQVGVLGEYAIENALYAQGNTVSSGQY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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 6171 AA molecular weight: 659597,01240 Da isoelectric point: 4,57909 aromaticity: 0,09626 hydropathy: -0,13280
Domains
Domains [InterPro]
DC_0042
ATT
1–437
ATT
1–437
DC_0042
ATT
427–515
ATT
427–515
DC_1338
ATT
1400–2674
ATT
1400–2674
DC_0069
STR
4186–4655
STR
4186–4655
IPR006558
LEC
4198–4326
LEC
4198–4326
1
6171
Architecture
ATT 1-3183 | STR 3184-3976 | STR 4181-4655 | RBD 4656-5010 | RBD 5378-6170 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-SSM5 [NCBI] |
445685 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Glaucusvirus > Glaucusvirus ssm5 |
| Host |
Synechococcus sp. WH 8102 [NCBI] |
84588 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO97976.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071097
[NCBI]
CDS location
range 56339 -> 74854
strand +
strand +
CDS
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