Protein

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Genbank accession
XYM58363.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MAKEIGYLGGRELKKELGVEQHSENRKTLGVIGRVGVGTTSYSPVYDMEVRGDFKPGELVDSSDNKGTLGLYLSKDAGGIKWVQVEPTGLGAIFVTEDDQIVGVSSFTGINFRGGEFVSVSTNTSNNSFVDIDFSEADSREWVEYSTVGIFTTKFVGIGSTQPDTPLDIIGDGNIVGTLTATQFVGPLTGNVVGNLTGLAQTASFATTAFGLQGEPDLMVGIVTTNNAYYVDANEVLNGTTLGTGVTISSLTQLGTLTGLTVDGNVTFNGDSYDVVWDKSANSLEFGDNARAVFGGGDDLRIYHNGSNSYIDDLGNGDLYIRGGSNIRFTKTDNEAMALFANDGSVTLYHNGSAKFNTTISGIDVTGNMVSDGATIDGDVNVTGVTTSVGGFVGDLTGTATTATNLADAANITTGTIDRARLTGDYDIGITGFAQTSGFATTAFTLDGKIEQDLVVSFASSSSFATTAFTLDGKLESELNVAVADTAGYATTSYDLFYSSYAIDITGTATTATNLADAANITTGTISRDRLTGDYDIGITGLAQTASFATTAFTLDGKVEEDLVVSSASTANFATTSFFLDDATGILNGRIDNARLSGSYDIDITGNAATAGSATTASAADVAYALEGAPDITIGNLTGIGATFSGNVSVGGTLTYEDVNNIDSTGFITARTGIHVGFDIGIGITFLPSGTGSFAGVVTAAQFVGPLEGDVTGTATTATNLADAANITTGTISRDRLTGDYDIGITGLAQTASFATTAFTLNDKFESELNVAFADTAGFATTSFGLQGVPDIEVGLVTATDIDAEDATFSGIVTATGGFVGDLTGTATTATNLADAANITTGTVNRDRLTGDYDIGITGLAQTAGYATTAYGLDGRPDIDVSEINCTRIELSYDTPQSVIITDAQLDIENISPKISGQNVAIEFFADVSNIDYEQGIHWYEGNTDPDARMKLDYNAEDDLPSNGAIEIFGYNLGGSSSPPGLPSGENLLFCVNRYGEVGIGSTRPAGFLDVGGDPTRPSALFNHYVGIGLTQPTTHLQVEGNASFTGVITATTLIGDVTGTASTASFATTAYGLEGTPDLNVGTVTGASFVGDGSGLTNITATGSGIGVRDDDSVVGTAQTINFGSNLSVTAVSAGIVTITATGGNTGAAGTWAVTSAGIHTTKNVGVGTTNPQSTLQVERFGIQTGFGTFTAVAGIAHTIDTYDISVTDFKTAEYTLFFEYNNDIQSQKVMIMQNGTTAYAQEWAVMSHTDLIVTATGTLSGNDCKLEITPETGVSGLTTYRFTRQAML
Physico‐chemical
properties
protein length:1290 AA
molecular weight: 133031,20660 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,08217
hydropathy:0,02760

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH8
[NCBI] 		3413216 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM58363.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340853.1 [NCBI]
CDS location
range 161499 -> 165371
strand +
CDS
ATGGCAAAAGAGATTGGTTACCTCGGTGGAAGAGAACTAAAAAAGGAACTTGGAGTAGAGCAACACTCTGAGAATAGAAAAACTCTTGGTGTCATTGGTAGAGTTGGTGTAGGTACGACTTCGTACTCCCCGGTATATGACATGGAAGTCCGTGGTGACTTCAAACCGGGTGAACTTGTAGACTCTTCAGACAATAAAGGTACATTAGGATTATATCTATCTAAAGATGCTGGTGGTATTAAGTGGGTTCAGGTAGAACCTACTGGACTTGGTGCTATCTTTGTAACGGAAGATGATCAAATCGTTGGTGTCAGTTCATTCACTGGTATCAACTTTAGAGGTGGTGAATTCGTATCTGTTTCAACGAATACATCAAATAATAGTTTTGTAGATATTGATTTTTCAGAGGCTGATTCAAGAGAGTGGGTAGAATACTCTACAGTTGGTATCTTCACGACTAAGTTCGTAGGTATCGGTTCTACTCAACCTGATACTCCTCTGGATATTATTGGTGATGGTAATATTGTTGGTACTCTTACTGCAACTCAGTTTGTAGGACCTCTAACTGGTAATGTTGTTGGTAACCTAACTGGTCTCGCTCAGACTGCCTCATTTGCTACGACTGCATTTGGATTGCAGGGTGAACCCGATCTTATGGTCGGTATTGTTACCACAAATAATGCGTATTATGTTGATGCCAATGAAGTTCTGAATGGAACAACTCTTGGTACGGGCGTAACTATATCTTCTCTAACTCAACTTGGAACTCTAACTGGTCTCACAGTTGATGGTAATGTCACATTTAATGGAGACAGTTATGATGTAGTATGGGATAAGAGTGCTAATTCACTTGAATTTGGAGATAATGCTAGAGCAGTATTTGGTGGAGGTGATGATCTAAGAATTTATCATAATGGATCGAATTCTTATATTGATGATCTAGGAAACGGGGACTTATATATTCGTGGTGGAAGTAATATTCGCTTCACTAAAACTGATAATGAAGCAATGGCATTGTTTGCCAATGATGGATCAGTCACTCTATATCATAATGGTTCTGCTAAATTCAACACAACAATTAGTGGTATTGATGTCACTGGAAACATGGTTTCCGATGGTGCCACAATTGATGGAGATGTAAATGTAACTGGAGTCACTACATCTGTTGGTGGATTTGTAGGAGATCTAACTGGTACTGCCACTACTGCAACCAACCTTGCAGATGCAGCCAACATCACCACCGGCACAATTGATCGTGCAAGACTAACTGGTGATTATGATATTGGCATTACTGGGTTTGCTCAGACATCTGGATTTGCCACTACTGCTTTCACTCTAGATGGCAAAATTGAGCAAGATCTTGTCGTATCATTTGCATCTAGTTCTTCTTTTGCTACGACAGCATTTACACTAGACGGAAAACTTGAAAGTGAACTCAACGTTGCTGTTGCAGATACTGCAGGATATGCAACAACTTCATATGATTTGTTCTATAGTTCCTATGCAATTGATATTACTGGAACTGCTACTACTGCAACAAATCTAGCAGATGCCGCCAATATCACTACCGGAACAATCTCTAGAGACAGATTGACTGGTGATTATGACATTGGTATCACTGGTCTTGCTCAAACTGCGTCTTTCGCAACCACAGCATTCACTCTCGACGGAAAAGTTGAGGAAGATTTAGTTGTTTCTTCCGCATCTACCGCAAACTTTGCGACAACTTCATTCTTCTTAGATGATGCTACAGGAATTCTAAACGGAAGAATTGATAATGCCAGACTATCTGGAAGTTATGATATTGATATTACTGGTAATGCTGCTACCGCAGGATCTGCTACAACTGCATCAGCTGCAGATGTTGCATATGCACTAGAAGGTGCTCCAGACATTACGATTGGAAACCTGACTGGCATTGGCGCAACATTCTCTGGTAACGTTTCTGTTGGCGGAACTCTTACATATGAAGATGTAAACAACATTGACTCTACTGGTTTCATCACCGCAAGAACTGGTATTCATGTAGGATTTGATATTGGTATTGGTATTACTTTCCTACCATCTGGAACTGGATCATTTGCTGGTGTTGTAACTGCCGCGCAGTTTGTAGGACCTCTAGAAGGCGATGTAACAGGCACTGCTACAACAGCGACTAATCTAGCAGATGCAGCTAACATCACCACTGGTACGATCTCCAGAGATAGACTCACGGGTGATTATGACATTGGTATCACTGGTTTAGCACAGACTGCATCTTTTGCTACCACTGCCTTTACTCTTAATGATAAGTTTGAGTCAGAACTAAATGTAGCATTTGCTGATACTGCAGGATTTGCTACAACTTCTTTCGGTCTTCAGGGTGTCCCTGATATTGAAGTTGGTCTTGTAACTGCAACTGATATTGATGCTGAGGATGCAACTTTCAGTGGAATTGTAACTGCCACTGGCGGATTTGTTGGTGATCTGACTGGTACTGCTACTACTGCTACTAATTTGGCAGACGCTGCTAATATCACCACTGGTACAGTTAATCGCGATAGACTAACTGGTGACTATGATATTGGTATCACGGGTCTAGCACAAACAGCTGGATATGCTACGACTGCATATGGACTAGATGGTCGTCCTGATATTGATGTTAGTGAAATTAACTGTACTAGAATTGAACTATCTTACGATACTCCACAGAGTGTAATCATTACTGACGCTCAGCTTGATATCGAAAACATTAGTCCTAAGATTTCTGGACAAAATGTTGCGATTGAATTTTTTGCTGATGTATCCAACATTGATTATGAGCAAGGTATTCACTGGTATGAGGGTAACACTGATCCTGATGCCAGGATGAAACTTGATTATAATGCTGAAGATGATCTACCTTCTAATGGTGCGATTGAAATCTTCGGTTATAATCTTGGCGGATCATCTTCACCACCAGGACTACCTTCTGGAGAGAACCTACTATTCTGTGTTAACAGATATGGTGAGGTTGGAATTGGTAGTACCAGACCAGCTGGTTTCTTAGATGTTGGTGGTGATCCAACCAGACCTAGTGCTCTGTTCAACCACTATGTTGGTATCGGTCTCACACAACCCACCACTCACTTACAAGTTGAAGGTAATGCATCCTTCACTGGTGTCATTACAGCAACAACACTTATCGGTGATGTAACTGGTACTGCTTCTACAGCATCATTTGCAACCACTGCATATGGTTTGGAAGGAACTCCAGACTTGAATGTTGGTACTGTTACTGGTGCAAGTTTTGTTGGTGATGGTTCTGGTCTAACAAACATTACGGCAACTGGGTCTGGTATTGGTGTTCGTGATGATGATTCAGTAGTTGGTACTGCACAAACCATCAACTTCGGATCAAATCTATCCGTAACTGCCGTTTCTGCTGGTATCGTTACAATCACTGCAACTGGTGGCAATACTGGTGCCGCTGGAACATGGGCAGTAACTAGTGCAGGTATTCATACCACGAAGAATGTGGGAGTGGGTACGACCAATCCCCAAAGCACCTTACAAGTTGAAAGATTTGGTATTCAGACTGGATTTGGTACTTTCACTGCAGTGGCTGGTATCGCACATACGATTGATACCTATGATATTAGTGTAACTGACTTCAAGACTGCTGAATATACATTATTCTTCGAGTACAATAACGATATTCAGTCCCAGAAAGTAATGATCATGCAGAATGGAACTACTGCATATGCACAAGAGTGGGCAGTAATGTCTCATACGGATCTAATTGTCACTGCAACTGGCACTCTATCTGGAAATGATTGCAAACTAGAGATTACACCAGAGACTGGAGTTTCTGGTCTAACAACTTACAGGTTCACTAGACAAGCAATGCTCTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1739c1da39b11fcba6d4899c7f7bb224641e88523e851710db34462e772307cb
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5443
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50