Protein
View in Explore- Genbank accession
- AJW77005.1 [GenBank]
- Protein name
- central tail fiber J
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MFESLNIDTNFLSYYRHKTKYKKILFYAKIDGVNWYDLSDYVQNVKTNNKIQLLNNAVIDTATITVKNENNAFTSTQYNDVFDPTVGKINGAINDGYLNKVWEVKLYVIVNKFQNGIELPANAIEYWRETLLGALNNTLPAGYIEQPEDTFTIAIPLFHGWKTQRAIKEKHKKAEIELKDILWITTQKKLEYPLLYTQMTPNAIISDLLNRCGLDVNYQDLQSLTTTFDVFIADKDRTYWQVIQKIVEATAGRISTTPDGKVIYRTRIENFIEPSPVITINQEDFKNYNLSNQKKYNRIKLESEGFEIGATTEAVIDTDLQGDNAIIKATKQGRFELEYTSDYIKNPDTTVFLTVYQGETLVSDREAFTAGSDNGLIRLDELTAYPDKLILKITNLSSTVAYTIKHVKFNAIPIKKISLNNVIRPNLTSEPDSEIGLKSHYSSEAMLSNVADVVEDNLNKEINFNLQMNEFYPDIYAGNLVNLSISAKGITSGVFIIDKVEHSLEANKFETKLNVVEWKNINFDISNKEITQQIVSKEIQKPNVAKTVEEISGAVQELQTQTQEVDERTSFLDRAEPSAPANLALTTINENGLSFIKASWDANMETDLIGYELAWSYDSIDWNYIKTSETLVKFEVAGNKTVYAKVRALDAEGKKSVWSAVQQITSAKDEIPPAIPTGLIATGLFQKIQLKWNENTEDDFKEYELQVATDNTFTLNVENIKISATNFVYAGNTNATYYFRIRAIDESGNMSAWSAAVNGTTAKVYDEDLESQRLTDAENAINQNATDIATLNNSTIPNLQIDIQNNRTDIDSLNNTTIPNLQNDISNNQTQIDDLNNNTIPELNEKLSYKAIALPEGAIGYWTTSLLDDVNNIKPVGYDYVNLKSIIQVVEDNIPNGTITETKIADNSISTPKLQANSISSDKIITGAITTAKIAAGAVTANEIAANSISATHIQTDAITADKISVGAVIAEKIATGAILAEKIAAGAITTEKIAAGAITANEIATSAITADKIAAGAITADKISASAVTAEKIDVSAITSDKIATGAITTEKVAANAITANEISAGAITAEKVGTNEIIANIANIKAGIIQEAHIADAAIAEAKIKDAAITNAKIADLAVDDAKIASLDASKITTGFLDADRIEAGSITADKLIMQPAFGLPKGAIAYFTNSLVDEINQIMPVGYTEVNLAPTITLTPENAPAGSIIGDLMVADKIYANHMNVSQLSAITGNVGILNSGKIQGNTGTTEFDLDNDKISISNGDIEIGKGVLSDSSDGIKVNGKIEINDSSGNKSILSGTGIRQIYALTAIDQIDSAKSLSIPIYIPDNASGTTTGTGIARIIVKAEKFRAYSKGASSGGSSSVTSGSSLPTNMTVATGGATWLNIDVNIGDTFSADAAGSHTHSYSDWTYTNGYHSHTLKDDFSGTNSAGSHQHSFSGSTGSAGSHAHSIGVSQFNHTHDVSISDLNHTHSVSIPSHTHSLTYGIYESTATATITIKKGTTTLGTVATDNEITITNQTVSNGDKIEISADNLTRVQVYIFVEYLLQY
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1548 AA molecular weight: 167922,72750 Da isoelectric point: 4,82520 aromaticity: 0,07041 hydropathy: -0,20730
Domains
Domains [InterPro]
DC_2198
ATT
1–576
ATT
1–576
DC_0140
STR
522–975
STR
522–975
IPR036116
STR
577–762
STR
577–762
IPR003961
STR
672–764
STR
672–764
IPR003961
STR
673–761
STR
673–761
1
1548
Architecture
ATT 1-576 | STR 577-1046 | RBD 1047-1548
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Marinitoga camini virus 2 [NCBI] |
1629953 | No lineage information |
| Host |
Marinitoga camini [NCBI] |
106262 | cellular organisms > Bacteria > Thermotogati > Thermotogota > Thermotogae > Petrotogales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AJW77005.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP836356.2
[NCBI]
CDS location
range 32282 -> 36928
strand +
strand +
CDS
ATGTTTGAATCACTTAATATAGATACAAATTTTCTAAGTTACTACAGACACAAAACAAAATACAAAAAAATACTATTTTATGCAAAAATTGATGGTGTAAATTGGTATGATTTGAGCGATTACGTGCAAAATGTAAAAACAAATAACAAAATACAATTACTTAATAATGCGGTAATAGATACAGCAACAATAACGGTAAAAAATGAGAATAACGCTTTTACTTCTACACAATACAATGACGTATTCGACCCAACAGTTGGAAAAATTAATGGAGCAATAAACGATGGCTATCTTAATAAAGTGTGGGAAGTGAAATTATATGTTATAGTTAATAAATTTCAGAATGGGATAGAATTACCAGCAAATGCAATAGAATATTGGAGAGAAACTCTACTTGGAGCTTTAAATAATACTTTACCAGCTGGATATATAGAACAACCAGAAGATACTTTCACGATTGCTATACCTTTGTTTCACGGTTGGAAAACACAAAGAGCTATAAAAGAAAAACACAAAAAAGCAGAAATAGAGTTAAAGGATATACTATGGATAACAACACAAAAAAAATTGGAATACCCATTATTATATACACAAATGACACCAAATGCTATAATCTCGGATTTACTTAATAGGTGTGGTTTAGATGTTAATTATCAAGATTTGCAAAGTTTAACGACCACATTTGATGTTTTTATTGCGGATAAGGATAGGACATATTGGCAAGTAATTCAAAAAATAGTAGAAGCAACCGCTGGGAGAATAAGCACAACGCCAGACGGAAAAGTAATATATAGAACAAGAATTGAAAACTTTATTGAGCCAAGTCCTGTTATAACAATTAATCAGGAAGATTTCAAAAATTATAATCTTTCAAATCAAAAAAAATATAACAGAATAAAACTTGAAAGTGAAGGTTTTGAAATAGGAGCAACAACCGAAGCAGTAATTGATACAGACTTACAAGGAGATAATGCGATAATTAAAGCAACAAAACAAGGAAGATTTGAATTAGAATATACAAGTGATTATATCAAAAACCCTGATACTACAGTATTCTTAACGGTATATCAAGGTGAAACATTGGTTTCTGACAGAGAAGCTTTCACGGCTGGGAGTGATAACGGATTAATTAGATTGGATGAACTTACAGCATATCCAGACAAATTAATCTTAAAAATCACAAATTTATCTTCGACTGTAGCTTATACAATTAAACATGTTAAATTCAACGCAATACCAATCAAAAAAATAAGTTTGAATAATGTAATAAGACCAAACCTTACAAGCGAACCGGATTCTGAAATTGGCTTAAAATCTCATTATTCATCTGAGGCGATGCTTTCAAATGTCGCTGATGTAGTAGAAGATAATTTAAACAAAGAAATTAATTTTAATTTGCAAATGAATGAGTTTTATCCGGATATTTATGCTGGAAATCTTGTTAATTTGAGTATATCCGCAAAAGGTATTACAAGTGGTGTTTTCATTATCGATAAAGTAGAACATTCGCTTGAAGCAAACAAATTCGAAACGAAATTGAATGTCGTAGAATGGAAAAATATAAACTTTGATATATCAAACAAAGAAATAACACAACAAATAGTTTCAAAAGAAATACAAAAACCTAATGTTGCAAAGACTGTAGAAGAAATTTCTGGGGCAGTTCAAGAGCTTCAAACACAAACGCAAGAGGTAGATGAAAGAACGAGCTTTTTAGATAGAGCAGAACCTTCAGCACCTGCAAATCTTGCGTTAACAACGATAAATGAAAATGGATTAAGCTTTATAAAAGCATCTTGGGATGCAAATATGGAAACAGACTTGATTGGTTACGAATTAGCTTGGAGCTATGACAGTATTGATTGGAATTATATTAAAACATCAGAAACTCTTGTGAAGTTTGAAGTAGCAGGAAACAAAACAGTTTACGCAAAAGTTAGAGCATTAGATGCAGAAGGCAAAAAATCGGTATGGAGTGCAGTGCAACAAATAACAAGCGCAAAAGATGAAATACCGCCAGCAATACCAACCGGTTTAATTGCAACAGGATTGTTTCAAAAAATACAATTAAAATGGAATGAAAACACAGAAGATGATTTCAAAGAATATGAGTTACAAGTTGCAACCGATAATACTTTTACATTGAATGTTGAAAATATCAAAATTTCGGCAACTAATTTTGTTTATGCTGGAAATACAAACGCTACTTATTATTTTAGAATAAGAGCAATTGACGAAAGTGGAAACATGAGCGCATGGAGTGCTGCGGTTAATGGGACTACAGCAAAGGTATATGATGAAGATTTAGAAAGCCAAAGACTTACAGATGCAGAAAATGCAATTAATCAAAATGCAACAGATATTGCGACTTTGAATAATAGCACAATACCGAATCTACAAATTGATATACAAAATAATAGAACAGATATAGATAGCTTGAATAATACAACAATACCAAACTTGCAAAATGATATATCTAATAATCAAACTCAAATCGATGATTTGAATAATAACACAATACCAGAATTAAATGAAAAACTTTCATATAAAGCGATAGCACTTCCGGAAGGTGCAATAGGATATTGGACTACATCTTTGCTTGATGACGTGAATAATATAAAGCCGGTTGGGTATGATTATGTAAATCTAAAAAGTATTATTCAAGTAGTAGAAGATAATATACCAAACGGAACAATAACAGAAACTAAAATAGCTGATAATTCTATTTCTACACCAAAATTACAAGCGAATTCTATATCTTCTGATAAAATAATTACAGGAGCTATAACAACAGCAAAAATAGCAGCTGGAGCAGTTACTGCAAATGAAATAGCGGCAAATTCTATATCAGCAACTCATATCCAAACAGATGCAATTACAGCAGATAAAATTTCAGTAGGGGCAGTAATAGCGGAAAAAATAGCAACAGGCGCTATATTAGCAGAAAAAATTGCAGCTGGAGCAATTACAACTGAAAAAATAGCTGCTGGAGCTATAACCGCAAATGAAATAGCAACGAGTGCTATAACGGCGGATAAAATAGCGGCAGGAGCAATTACAGCGGACAAAATTTCAGCAAGTGCGGTAACTGCAGAAAAAATAGATGTAAGTGCTATAACTTCCGATAAAATCGCAACAGGAGCTATAACAACGGAAAAGGTTGCAGCGAACGCAATAACTGCAAATGAAATTTCTGCAGGAGCAATTACGGCGGAGAAGGTAGGAACAAATGAAATAATTGCAAATATAGCTAATATAAAAGCTGGAATAATACAAGAAGCGCATATTGCGGATGCTGCAATTGCAGAAGCAAAAATAAAAGATGCAGCAATAACAAATGCAAAAATAGCAGATTTAGCAGTGGATGATGCAAAAATAGCAAGTTTAGATGCGAGTAAAATTACGACAGGTTTTTTGGATGCGGATAGAATAGAAGCAGGAAGCATTACAGCGGATAAATTAATAATGCAACCAGCTTTCGGACTTCCAAAAGGTGCTATTGCTTATTTTACAAATAGTCTTGTAGATGAAATTAATCAAATTATGCCAGTTGGATATACAGAAGTTAATCTTGCACCAACAATCACACTAACGCCAGAAAATGCGCCAGCGGGAAGTATAATTGGTGATTTGATGGTAGCAGATAAAATATATGCAAATCATATGAATGTTAGCCAATTGTCAGCAATTACAGGCAACGTCGGGATTTTAAATTCTGGAAAAATTCAAGGAAATACAGGAACAACAGAATTCGATTTAGATAATGATAAAATCTCAATAAGTAATGGAGATATTGAGATCGGGAAAGGAGTATTGTCAGATAGTTCTGATGGAATAAAAGTAAATGGAAAGATTGAAATAAATGATTCTTCAGGTAATAAAAGTATTTTGTCAGGAACAGGTATTAGGCAGATTTATGCTTTAACAGCAATAGACCAAATAGATAGTGCGAAAAGTTTATCGATACCAATTTACATCCCGGATAACGCTTCAGGAACAACTACAGGAACAGGAATAGCTAGAATAATAGTAAAAGCGGAAAAATTCAGAGCATACTCAAAAGGAGCATCTTCTGGAGGTAGTTCGTCAGTTACTTCGGGCTCGAGTCTCCCAACAAATATGACAGTAGCAACAGGTGGTGCAACTTGGTTGAACATAGATGTGAATATTGGAGACACTTTTTCGGCTGATGCAGCAGGGAGTCATACACATTCATACTCAGATTGGACGTATACGAATGGTTATCATAGCCATACTCTTAAAGATGATTTTTCAGGTACAAATTCTGCAGGTTCTCATCAACATTCATTTAGTGGTTCAACAGGAAGTGCAGGAAGTCATGCACATTCTATCGGTGTATCGCAATTTAATCATACGCATGATGTTTCAATTTCAGATTTAAATCATACGCATTCAGTATCTATTCCATCGCATACACATAGTTTAACGTATGGAATTTATGAAAGTACAGCAACAGCAACGATTACAATAAAAAAAGGAACAACAACTTTAGGAACAGTGGCGACTGATAATGAAATAACTATAACAAATCAAACTGTGTCTAATGGAGATAAAATAGAAATTTCAGCGGATAACCTTACGAGAGTACAGGTTTATATATTTGTAGAATATCTACTACAATATTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
0d14e6d694624aeaec8108ef4523422c49a9869994a8035bd934e3587056b945
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Thermotogae viruses | Nesbo,C.L., Haverkamp,T.H.A. and Geslin,C. | — | — | GenBank |