Protein
View in Explore- Genbank accession
- XOD41590.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MATKKTKLPKPAGMNAQNRIGVLDLNELDDLFDDVGETTKPGDPVTDFKSGLKEGFLGGLKTKDIVRNFLRSAAPDGFARLFGAYDDVMASVTDIKDTVERVNASDLDYLGRKAQDYLPQLKDRIPNALYENISDTLTRKVEQYQYEVDSQRDQIAIRRRRQENDDANVIKAALDQNTLVSRENFQRSEQGAVARAAVERAERGIRDKVSAGRFDFMSRSMGMAVDSLTRLVGYNEQVNYGIQRKGLELQFRTYMGIRDLVKVQEANLELQNKAYEALVRNTGLPDYKKGNVGDLTSFGSGRGRGNMLGRLAGGAAQGLHGFLGSYGNKVNERVASGLGGRLSEIVAGLRMGDMAGSSVWDNRYKFAGQIAGEYGADILKSSIVPWAGRKVRPTMEKLSNRFGGRHHQVGYALDNVPAYLQEFVNNYQNTYGFRGVIRDAIMPFVPQYHMNDRLENGNYQTIDQGAAFNQLTQRSIVEVIPGYLSRQLQELRMIRTGRDDIEREVFDITTGRFEVQSLSDDRLQKKIIPAAAIRSASGAINDTLNLMDEEGKLSPAARKALGERMLRDASTNRRFDPEAYLKSGGYMDGLDATTTDEIQRFFKSKFQYDDKGKMADNAENHRLRDEYSRAFLDIRSVSRDPVKEVHRLINAGQTEPLRMLGIIITEQGQDRINYNRIWEIMRSGVTDTNPWVNGDYQPEASGDMNDKNFFGPAYPGAAKANALNAMRRFRNKHAPQEDRIKKELSRYSRIAQGKFQYLNNKHGAGIHDFANNMRNGQFGPYVAGLQGAWNDANVMGQDLYSKTRAKFGEHMDQFQNDPTQYAIGQKDKIIDVFTKFNPNEPIIKGIDFVQGNLVDFNTKKIIESVHDITGKVVSTTGTTVLTASEVAQGLFDKKGMRLELPAFMSNAADKIRGALMGGQTPPAQQFAEGENAQQKQAAEDDKHDWYLDGEQEPTISARGLKNGEYFNADGDQINSMQDIKGDVLDKNGSIIATAKELASGLWSRATRKRWRLTKTGRRLANVAGWGAKFMATNTSTLAWNALKFGAKTAIGMGSALFNFAIETQNAYLPGDDVPVLERRLVNAGKYFDDKGRVIENFGDVYGTIFNERGEPVIEPSLYKDLKNYDGTKHILAKNKGIIRKTVWRGIRAARSKYIDASMKYMGWALKKTGKFYGGAAKKVLGGFAKAGGNVLGRIFERVPYEDFETTDQVLLGRILETLQAQVPEKLRAGSWQDKAEKAKEGAAGLMDKLKGKGDGDTGKAENKVLKGLSDGLKGIFSKLTGTEGEEGSGAFDVLMGGGMKGGAKGRLMGLAKRAVPWLLGGTAAAVGTGAMAYGYSKDGMDAKQTGILTAMSLNPLGQLTARYILKPIFGQMNDQRAEFRRLRMLQYGITDHDQQQKVSALEDAFDRVTERTEEPDFNISGVGGKAILDILGIDVKNEVQVMRMSRWLEMRFRPVFLTWVKALAKLKKNEVKLVDIDSKFPQELKGPLVKAVKISVSGDTPMQYRVDPFSEEGELEDTIPAADQLWKALYVRYKAGEKKEDAVPATAANTEVATKAQDIAKKAADTATGKTTPSPMDPTKSAMPLAAAKKAFPGLGGSTGAPIVATSAATTKLTALQSIRMRAYGLEVLSFYNVYPLLNAEAMVFDGLSIQGGIPEFRGDLESIMQETAPLFGKDIVGSDEDRSAYYDWFVGRFMPVARAYYGAMRSSTQGTTIANMESKLKPSDAVIVGNAVLGVTDFDGSSVWQVDSIFPIKGSKDDLKKMAEADLEQLKKDASKDIMSTPTQSAGDQAAGTQSAAAGGSFAERAMASISNTWESTKETVSNAWNNTKAAGAKAMDYMSDATATAQYKLGMAGEVSATGRTYGTLTKGNGGAWEQIPYPKANKSRQAAAETFQAVAAMVGIPVELLFIFASLESGFDYTVKAKTSSATGWFQFINSTWDAMLAKHGSKFGIPPDDAQRSLRVDPRINALMGACFLKDNYTYLKDALGRDPTDVDLYIAHFMGPGGARKFLTRNQDTIGASVFPEAASANRPIFYKKGGQPRTLGEIYQMFEEKIAKHRGGAEGSSVATQEAGKTMTTDEATEEQAKANAKASAAELWNTDDSNNAGNAAVAREEAYSATGTAAQTPVLPGITPMNPVGGTTTSGANPSADSGGNVVQAQQEAALQAAQQYNSTRQAEVRRNNEKAQQIDDIQAEQLKTLIEMRDHLKRLVQLNEQKDSGTKEASKTQAGGNNSMTSTLMRSTSAQNRPSPLSLT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2256 AA molecular weight: 247044,82770 Da isoelectric point: 8,91503 aromaticity: 0,07979 hydropathy: -0,50913
Domains
Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–917
STR
1–917
DC_0124
STR
901–1994
STR
901–1994
IPR023346
STR
1892–2025
STR
1892–2025
1
2256
Architecture
STR 1-2025 | RBD 2026-2256
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudomonas phage HHBS36_1 [NCBI] |
3390392 | Viruses > |
| Host |
Pseudomonas aeruginosa [NCBI] |
287 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOD41590.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ287642.1
[NCBI]
CDS location
range 110521 -> 117291
strand -
strand -
CDS
ATGGCTACAAAAAAGACCAAGCTGCCAAAACCTGCTGGGATGAATGCCCAGAACAGAATTGGTGTACTTGACCTTAATGAGCTGGACGACCTGTTTGATGATGTCGGTGAAACCACCAAACCTGGTGATCCAGTAACCGATTTCAAATCTGGTCTGAAAGAGGGCTTCCTCGGTGGATTGAAAACCAAAGACATCGTAAGGAATTTCTTACGAAGCGCAGCGCCTGATGGTTTCGCGCGTCTTTTTGGTGCCTATGATGATGTAATGGCTTCGGTAACCGATATCAAAGATACGGTCGAAAGAGTCAATGCATCCGACCTAGATTACCTTGGTCGTAAAGCACAGGATTATCTACCCCAGTTAAAAGATCGCATTCCAAATGCCTTATACGAAAATATCTCTGATACGCTCACCAGAAAGGTTGAACAATATCAGTACGAAGTGGATTCCCAAAGGGACCAAATCGCTATTCGTCGTCGTCGGCAAGAAAATGATGATGCAAATGTAATTAAAGCTGCTCTCGATCAGAATACGCTGGTAAGCAGAGAAAACTTCCAACGTAGTGAACAGGGTGCAGTTGCCCGCGCTGCCGTTGAAAGAGCAGAACGTGGAATCCGTGATAAAGTAAGTGCTGGACGCTTTGACTTTATGTCCCGTTCGATGGGGATGGCTGTAGATAGTCTAACTCGTCTTGTAGGATATAACGAACAAGTTAATTATGGAATTCAACGTAAAGGCCTTGAACTTCAGTTCCGTACCTACATGGGTATTAGGGATCTTGTTAAAGTACAAGAAGCTAATCTTGAATTGCAGAATAAGGCTTATGAAGCATTAGTTCGTAATACCGGCTTACCAGACTACAAGAAAGGCAATGTTGGCGATCTAACCAGTTTTGGTTCAGGTCGCGGCCGGGGCAACATGCTCGGACGCCTAGCTGGCGGAGCTGCACAGGGCCTTCATGGCTTCTTGGGTAGTTATGGTAACAAAGTAAACGAACGTGTTGCCAGCGGCCTGGGCGGACGTCTATCGGAGATCGTAGCCGGTCTACGCATGGGCGATATGGCTGGTTCATCCGTTTGGGATAATCGCTATAAGTTCGCTGGTCAAATCGCCGGTGAATACGGTGCCGATATCCTTAAATCGTCTATTGTTCCATGGGCAGGTCGTAAAGTTCGTCCGACTATGGAAAAACTATCCAACCGTTTTGGTGGACGCCATCATCAGGTAGGGTATGCCCTAGACAACGTTCCAGCATATCTACAAGAGTTCGTTAATAACTACCAAAACACTTATGGTTTCCGTGGCGTTATTCGTGATGCTATTATGCCATTCGTTCCTCAGTACCACATGAACGATCGTTTGGAAAACGGAAACTATCAAACAATTGATCAAGGCGCGGCCTTTAACCAATTGACGCAGCGTAGTATCGTTGAAGTCATCCCAGGTTACCTGTCTCGCCAGCTTCAAGAATTGCGAATGATTCGCACTGGTCGCGATGATATCGAGCGTGAAGTATTCGATATTACAACTGGTCGATTCGAAGTTCAATCGCTGTCGGATGATCGTCTTCAGAAGAAGATTATTCCAGCAGCAGCAATTCGAAGTGCGAGTGGTGCCATTAATGACACATTGAACTTGATGGATGAAGAGGGTAAACTTTCTCCAGCTGCACGTAAGGCACTTGGTGAACGTATGCTTCGCGATGCGTCTACAAACCGTAGATTTGATCCAGAAGCTTACCTTAAATCCGGCGGTTATATGGATGGCTTGGATGCCACAACCACGGATGAAATTCAAAGGTTCTTTAAGAGTAAGTTCCAGTATGACGATAAAGGTAAAATGGCAGATAATGCTGAAAACCATCGTCTACGGGATGAATACTCTCGTGCCTTCCTTGACATTCGTTCTGTAAGTCGTGACCCAGTTAAAGAAGTACATCGTCTTATTAATGCTGGTCAAACTGAACCTTTACGGATGCTCGGTATCATCATTACTGAACAAGGACAAGATAGGATAAACTATAACCGTATTTGGGAGATCATGCGCTCTGGCGTTACTGATACCAACCCATGGGTTAATGGTGACTATCAACCTGAAGCTTCTGGTGATATGAATGATAAGAACTTCTTTGGTCCTGCTTACCCAGGTGCAGCTAAAGCCAATGCGCTTAATGCAATGCGTCGTTTCCGAAATAAACATGCACCACAAGAAGATCGAATCAAGAAAGAACTATCTCGCTACAGCCGTATTGCACAGGGGAAATTCCAGTACCTGAACAATAAGCACGGCGCCGGTATCCATGACTTTGCTAACAACATGCGTAATGGCCAATTTGGTCCTTACGTTGCTGGTCTGCAAGGAGCTTGGAATGATGCGAATGTAATGGGTCAAGATCTCTATTCTAAGACACGTGCTAAGTTTGGAGAACACATGGATCAGTTCCAGAATGATCCAACCCAATATGCAATCGGTCAGAAAGATAAGATCATTGATGTGTTCACAAAGTTTAATCCAAATGAACCCATCATTAAAGGTATTGATTTTGTTCAAGGTAACCTTGTTGACTTTAATACCAAAAAGATTATCGAATCTGTACACGACATTACCGGTAAGGTTGTTTCTACAACTGGCACGACGGTTCTAACAGCATCTGAAGTTGCACAAGGTCTGTTTGATAAGAAAGGAATGCGTCTTGAATTACCTGCCTTCATGAGCAACGCAGCGGATAAAATCCGCGGTGCTTTAATGGGTGGACAAACGCCTCCTGCTCAACAGTTTGCTGAAGGTGAAAACGCACAGCAAAAACAAGCAGCTGAAGATGATAAGCACGACTGGTATTTGGATGGTGAGCAAGAACCCACTATCTCTGCTCGTGGTCTAAAGAACGGTGAATACTTCAACGCAGATGGTGACCAGATTAATTCGATGCAAGACATCAAAGGTGATGTACTTGATAAGAATGGATCTATTATCGCAACTGCTAAGGAACTAGCTTCCGGTCTATGGTCGCGTGCTACTCGTAAACGTTGGCGTCTTACCAAGACAGGTCGGCGTCTAGCAAATGTAGCGGGTTGGGGTGCCAAGTTCATGGCAACGAATACATCTACCTTAGCGTGGAACGCACTGAAGTTTGGTGCTAAGACAGCGATCGGTATGGGTTCGGCCCTATTCAACTTCGCGATTGAAACTCAGAACGCTTATTTACCTGGTGATGATGTACCTGTACTCGAACGAAGACTAGTTAATGCCGGTAAGTACTTCGATGATAAAGGTCGCGTCATTGAAAACTTTGGTGATGTGTATGGCACGATCTTTAACGAGAGAGGCGAACCTGTAATAGAACCATCTCTGTATAAAGACCTTAAGAACTACGACGGTACCAAACATATCTTAGCTAAGAATAAAGGTATCATCCGTAAGACTGTATGGCGTGGTATTCGCGCTGCTCGTTCGAAGTATATCGATGCTTCCATGAAGTACATGGGTTGGGCATTGAAGAAGACGGGTAAGTTCTATGGAGGTGCAGCTAAGAAAGTGTTAGGTGGTTTCGCTAAAGCGGGTGGTAACGTTCTTGGACGTATCTTTGAACGCGTACCATACGAAGACTTCGAAACAACTGATCAAGTACTATTGGGTCGCATTCTTGAAACTCTTCAAGCACAAGTTCCAGAAAAGCTCCGAGCTGGTAGTTGGCAGGATAAAGCAGAAAAGGCCAAAGAAGGCGCTGCTGGCTTGATGGATAAATTGAAGGGGAAAGGAGATGGGGATACTGGTAAAGCTGAAAATAAAGTCCTGAAGGGGTTATCCGATGGACTGAAAGGTATCTTCAGTAAACTTACCGGTACCGAAGGTGAAGAAGGCTCTGGTGCGTTCGACGTGCTTATGGGCGGAGGTATGAAAGGTGGCGCTAAAGGTCGTTTAATGGGCCTTGCTAAACGCGCAGTTCCTTGGCTCCTTGGAGGTACCGCTGCTGCTGTAGGTACAGGCGCCATGGCGTATGGTTATAGTAAAGATGGAATGGATGCAAAGCAGACAGGTATCCTGACTGCGATGAGTCTTAATCCACTTGGACAATTAACTGCACGTTATATCCTGAAACCTATCTTTGGTCAAATGAATGACCAGAGGGCAGAGTTCCGTCGTCTTCGAATGCTGCAATACGGTATCACTGATCATGATCAGCAACAGAAAGTCTCTGCGCTTGAAGATGCTTTTGATCGCGTAACTGAACGGACAGAAGAACCTGACTTTAATATCAGTGGAGTTGGTGGTAAGGCTATTCTTGACATTCTTGGTATTGACGTTAAGAATGAAGTCCAAGTAATGCGGATGTCTCGCTGGTTGGAAATGCGTTTCCGTCCTGTCTTCCTGACTTGGGTTAAGGCATTAGCTAAACTCAAGAAGAATGAAGTTAAACTCGTTGATATCGATAGTAAGTTCCCACAAGAACTGAAAGGACCATTAGTTAAAGCTGTTAAGATTTCTGTATCTGGTGATACACCGATGCAGTATCGTGTCGATCCATTCTCTGAAGAAGGTGAATTGGAAGATACCATCCCAGCAGCCGATCAACTATGGAAAGCTCTATACGTTCGCTATAAAGCGGGTGAGAAGAAAGAAGATGCTGTACCGGCTACAGCGGCTAATACCGAAGTAGCTACTAAAGCTCAGGATATCGCCAAGAAAGCGGCGGATACTGCAACTGGTAAAACTACACCGAGTCCAATGGATCCTACTAAATCAGCAATGCCTTTGGCTGCTGCTAAGAAAGCTTTCCCTGGCCTAGGTGGTTCAACTGGTGCACCCATAGTCGCAACCTCGGCAGCTACCACTAAACTAACTGCACTCCAATCCATCCGGATGCGTGCTTACGGTTTAGAAGTACTGAGTTTCTACAATGTCTATCCTCTTCTAAATGCTGAGGCAATGGTATTTGATGGTCTATCTATTCAGGGTGGTATTCCTGAATTCCGTGGTGACCTAGAATCTATCATGCAAGA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
2df5ccf4396e1be80486d5c354694cb4ee915eef8c6ed709d762d5c091c41954
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50