Protein

View in Explore
Genbank accession
XYO05532.1 [GenBank]
Protein name
side tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADLAKIQFLRSTVAGKTPTTSQLADGELAINMADYAIYTKNGSSIVQLAGKGIPETNTKKLTVNGPSALNDTVTVAEGKTITFTNADLSGGMVRHITGKNALNDGWYIGSGGESNKGFLEIGTIDDGDEEIRFVSRGSGDTVRRTLKLIDSGGNTRVPGNIYIDEAMGGGGSAFISKNKAYFGAGGADIYMRNMAGGATNQLTITDGGELLFQAKPVYWDGRKPTLTELGIGRVENARQLEQDNFPVTTGNESRWIKVALLKDPGSGQSRLQLMVTNGGNYGSTRGSIDFIDCSARSIPATLTSANIRSYLQIRRIGDPGIDNTNQMRYSLVRTSEGLELWFAQRAFIGGVKVALLSIAGGTVTEYYLPTGYTISATAPEGLVESVAIRIYDEMNKPNLDNGTDGILSIAKGGTGASTADAARTNLGLGTAATRDVGEGDGNVLERGAFGLGGTVGAGNIAKGSLAETVKYLNTYGTCFFRVEDNIATIPQYSPSIYVKTGSNQLILSANHRNGVISVVTTDKVDGTNLTVSQVYTTLNKPSPSDVNAVARTGDMMSGDLTISKVSPGFHLNSESGNSVIWFKYKGAETGAVWALPNTASSGEVRIRARTSGGTTGGEFSFKSDGTFTSPSDINITSGAFNGKSVNTQYANFNNTSSTTTEQTVSISGSQHTPLLLNRPTNSNLSIGFKLSGMNMKRLGIDVNGDIRYGEAENQTQNAWLLTSDTINRWTVNFGRDINVAGVVNSTGGFTGPVTAYDLTGVTQDLDALTLNYTEPGHIKVYSCRSMGGGDNITNKPSGVGGNFIVIVECLRKVSGTDYTNRQVLRASDNSRSWERWLTVSGTTKAWTPWRMNVVNGNDDDVSFKSVTTTTGNLNSGNDLIVANNARVGGNLGLGGASSTKYADKGVVIGKGSALLETTDGRVIIGSSGGGNAVELRPGGPTQTNNRIKVTATSGSGGDTAIEYEQGAKIRSNNGGDLIVSAKAGQAIYLRPQGDASSTNETRIDANGSITINGNINANGTLTCTGGAVNGDLTVSGKVDITGNQLKTTSLWVTGDTAVNGALTVDGNVVSNYGIGSFVGAVDVKAPAADNGTTHLWFRHSNGGERGVIYMPRDNNTMMGLRAGGSEWQLDGPTGQMLGPGARWRIHSDGNLQGDVYGGYITNYINDRFNQCAQWVRTGAQQDFGPIGRPAPGKTVPAGWVLVGLNGNSKEANQNMQLIGGRLQVWKPGVQWVDSAT
Physico‐chemical
properties
protein length:1237 AA
molecular weight: 130107,09350 Da
isoelectric point:6,76653
aromaticity:0,06791
hydropathy:-0,30671

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XYO05532.1
1 1237
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 364 364 0,0793
Central domain 365 563 200 0,2009
C-terminal 564 1237 673 0,6377
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-364
Central
365-563
C-terminal
564-1237

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage vB_KpnP_KM2
[NCBI] 		3446102 Viruses >
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYO05532.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV833077.1 [NCBI]
CDS location
range 34896 -> 38609
strand +
CDS
ATGGCTGATTTAGCAAAAATTCAATTCCTACGTAGCACAGTTGCGGGGAAAACACCTACTACAAGTCAGCTTGCAGATGGTGAACTGGCGATCAACATGGCTGATTATGCCATTTACACGAAAAATGGTTCTTCGATCGTTCAGTTAGCGGGTAAAGGTATCCCAGAAACAAATACCAAAAAATTAACAGTAAATGGGCCTAGTGCTCTTAATGATACCGTTACCGTAGCGGAAGGTAAAACTATTACTTTCACCAACGCGGATTTGAGCGGGGGTATGGTTCGTCATATCACTGGTAAAAACGCTCTTAACGATGGTTGGTACATTGGTTCTGGTGGTGAGAGTAATAAAGGGTTTTTAGAAATCGGTACAATTGATGACGGTGATGAAGAGATCCGTTTCGTTTCCCGTGGTTCTGGTGATACTGTTCGCCGTACTCTGAAACTTATTGATTCCGGTGGTAACACTCGCGTACCAGGTAACATCTATATTGATGAAGCTATGGGCGGTGGTGGTTCTGCTTTTATTTCAAAAAACAAAGCATATTTCGGCGCTGGCGGTGCTGATATCTATATGCGTAACATGGCTGGCGGTGCGACAAATCAGTTAACGATCACTGATGGCGGTGAATTACTGTTTCAAGCCAAACCTGTATACTGGGACGGTCGTAAACCGACTTTAACCGAATTGGGGATCGGACGGGTTGAAAACGCGCGTCAGCTTGAGCAAGATAATTTCCCTGTAACTACAGGCAACGAATCTCGTTGGATTAAAGTTGCTCTTTTAAAAGACCCTGGCTCAGGGCAGAGTCGCTTGCAACTGATGGTGACTAACGGCGGTAACTATGGTTCTACGCGTGGCTCTATCGACTTTATCGATTGTAGCGCTAGAAGTATTCCCGCAACATTAACAAGCGCAAACATTCGTTCTTATCTGCAAATTCGTCGAATCGGCGATCCTGGAATTGATAATACTAACCAGATGCGTTATAGCCTGGTTCGTACCTCCGAAGGTTTAGAACTGTGGTTTGCTCAACGCGCATTCATTGGTGGTGTTAAAGTTGCTCTGCTGTCTATCGCTGGCGGTACTGTTACTGAATATTATCTGCCTACTGGTTACACAATCTCTGCAACTGCTCCGGAAGGTTTAGTTGAGAGTGTGGCTATTCGTATCTATGACGAAATGAATAAACCTAACCTTGACAATGGTACTGATGGTATTCTGTCTATTGCTAAAGGTGGTACAGGTGCAAGTACAGCGGATGCTGCTCGTACAAACTTAGGGTTGGGTACTGCTGCAACCCGTGATGTTGGCGAAGGCGATGGTAATGTTCTCGAAAGAGGTGCATTTGGTCTTGGTGGTACGGTAGGCGCTGGAAATATTGCAAAGGGATCTTTAGCAGAGACCGTTAAGTATCTTAATACATACGGAACATGCTTCTTTAGGGTAGAAGATAACATTGCTACAATACCACAGTATTCTCCTAGCATTTATGTTAAAACTGGAAGCAACCAGTTAATTCTTTCAGCTAACCACAGAAACGGTGTTATTAGTGTCGTCACTACGGATAAAGTTGATGGTACTAATTTAACGGTATCTCAAGTATATACTACGTTGAATAAGCCATCACCGTCTGATGTTAATGCTGTTGCTCGTACTGGTGATATGATGTCTGGCGATCTAACGATCTCCAAAGTGTCTCCCGGATTCCATTTAAATTCTGAGAGCGGAAACTCCGTAATTTGGTTTAAGTATAAAGGGGCTGAAACTGGTGCTGTGTGGGCGTTGCCTAACACTGCCTCTTCTGGTGAAGTTCGCATTCGTGCCAGAACGTCGGGTGGAACGACTGGTGGAGAATTCTCGTTTAAATCAGACGGTACATTTACATCACCTAGTGATATCAATATCACTAGCGGCGCTTTCAACGGTAAAAGTGTCAATACTCAGTATGCGAACTTTAATAACACAAGTTCAACCACAACCGAACAAACCGTTTCTATTAGTGGTTCGCAGCACACTCCGCTGTTACTGAATAGACCGACTAACTCGAACTTGTCTATCGGGTTCAAACTTTCCGGAATGAACATGAAACGTTTGGGTATTGATGTAAACGGTGATATTCGTTACGGTGAAGCAGAAAACCAGACACAAAACGCATGGCTGTTGACTTCGGATACGATAAACAGATGGACTGTTAACTTCGGTCGTGATATTAACGTTGCTGGTGTGGTTAATTCAACTGGTGGATTTACTGGCCCTGTTACTGCATATGATTTGACTGGGGTAACTCAGGATCTTGATGCTTTAACATTGAACTATACCGAACCAGGTCATATTAAAGTTTATTCGTGTCGTAGTATGGGTGGCGGTGATAACATCACCAATAAACCTTCTGGCGTCGGTGGTAACTTTATTGTTATCGTTGAATGTCTCCGTAAAGTGAGCGGTACTGATTACACTAACCGTCAAGTATTACGCGCATCGGACAATAGCCGCAGTTGGGAACGTTGGTTAACTGTTAGCGGTACTACTAAAGCCTGGACACCGTGGAGAATGAACGTTGTTAACGGAAACGATGATGATGTATCATTTAAATCTGTTACCACGACTACAGGAAACCTGAACAGCGGAAATGATTTGATTGTTGCTAACAACGCTCGCGTAGGTGGTAACTTAGGGTTAGGTGGTGCTTCTTCAACGAAATACGCTGATAAAGGTGTTGTGATTGGCAAAGGTAGTGCTCTGTTAGAAACTACTGATGGTCGTGTGATTATTGGTAGTTCTGGTGGTGGTAATGCTGTTGAATTGCGTCCTGGTGGCCCAACTCAAACCAACAACAGGATCAAAGTAACTGCTACCTCTGGAAGTGGTGGTGATACTGCGATCGAGTATGAACAAGGGGCGAAAATTCGTTCTAATAATGGTGGTGATTTGATTGTTTCTGCTAAAGCAGGTCAAGCAATTTATCTGCGACCGCAAGGTGATGCATCCAGCACAAACGAAACCCGTATTGATGCAAACGGTAGTATCACGATTAACGGCAATATTAACGCCAACGGTACATTAACTTGTACTGGTGGTGCTGTTAACGGAGACTTGACTGTATCAGGAAAAGTAGATATCACTGGAAACCAGTTAAAGACTACATCGCTCTGGGTTACTGGAGATACTGCTGTTAATGGTGCTTTAACTGTTGACGGTAATGTTGTTAGTAATTACGGTATTGGTAGCTTTGTTGGTGCTGTCGATGTTAAGGCCCCTGCCGCAGATAATGGTACAACCCACCTTTGGTTCCGACATTCTAACGGTGGTGAGCGTGGTGTGATTTATATGCCGCGTGACAATAATACCATGATGGGATTAAGAGCTGGCGGTAGTGAATGGCAATTGGATGGCCCTACAGGTCAAATGCTAGGACCAGGAGCACGCTGGAGAATTCATTCTGATGGTAACTTACAGGGTGATGTTTACGGTGGTTATATCACTAACTATATCAACGATAGGTTTAACCAATGTGCTCAATGGGTTCGTACTGGTGCTCAACAAGACTTTGGTCCAATTGGTCGTCCAGCACCTGGTAAAACTGTTCCTGCTGGTTGGGTGCTTGTTGGTCTTAACGGTAACAGCAAAGAAGCTAACCAGAACATGCAACTTATCGGCGGACGGTTACAAGTATGGAAACCGGGCGTTCAATGGGTTGATTCTGCTACTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
28210bc4e756a24f6f6ed8bccbeef8692c834fcf00ea81a532a2d6b786eee429
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7429
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50