Protein

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Genbank accession
WYN04953.1 [GenBank]
Protein name
alanyl-tRNA synthetase
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,58
Protein sequence
MKHTGIHILDFNDKIIDYISRDDGALLNAVMSTNAEEKSETFDFTMLNDRAEHLRERNRIIAQDNNGVYREFIISHVVDNFDGTTDVESNASYLEDIDKSRPIKPGKYSSYSTSQALNETLRNTGWEMSDDTEHGGMRTTSWTSYSTPYEVINMLCTTYGMVAEYYIELGSHTVEHRYVTLKKPVSLFKGKEITKGKDLTGMTRTVDMSEVRTALYAIGPENDTGQRLEKIVTDDDAQAQFGLPGRYLWSVYEPESDDSNMTDERLTTLAKTELNKRNKSAISYEITSTDIHRHYPEMVVSLHDTVRIKDRDFRPPLYIEAEVIGVDYNLLTDESNYKFGNVVEYEENNLRDIFNKKLADISKKLNDNVSNVNTIVKDAVAGQLEYFERKIFKQDTPPENPVNDMLWYDTSNPNVAVLRRYWNGEWLNETVDDVEKIGGVTREKALYDSIKNAFENLSIQHAKLMDETYAVLNNEYLIDTDLKTKLQTELNNVDGIYQKINSDLGSITSDTATIGTLIDIQSQFSSYRQKLQNLYKAMRNAQISADKRLKLLQSQYTDEKFNDALNKVASKFGLTVDSNNNMVGTPNVIEKAIQASREDTAEQLKSYVKSMDYQTDKNGIVERLDSADSERKQLNNLISDKVSLSEYKNMAIGTRNLIANSDFLAGLTYWRNVGATTPANSYDTTLTDMPNGFTSVAVYESNDASKEKGIAQDNLSLEIGKEYVLSAWVKILNGAPTFRLQAGKTKWINQNFEGNNTWQRYEFVFTAYESPMNIYILKPNNIVDSKVAITGVQLVQGNKNTDWKASDKDTDTKLTNMTTSITQNGQDIQQRATKEEFNASKKTLSKTISDFTNNVATGMTFTYDKDGAIQNMNIGQDGIKLKGDKVDITVNKDFNVTTQKLDNKVGKDEIVNRLNLSNEGLNIDVNKLGIRGGDDKTYLTIQNKRILSKGYFTRTWANVTDTSNLTVGIRDGYIMASNEDTGYNLYMTEKGLSTMMSGAGDKTAGTLEFHSTKYNDRSRGVRLHSTYGAVALESDYSRIILNSNLTVNIESNSGSVYVRPMKDNRTGTNEFRFWVKNNDTGADTDGVLSYGLITGTNNSPYDFGSGIRFDKSPKTNYVYATDKDGNIGSGDFYARALLGDWFAKSSNLYACVDDKLRITNKLSYNNGNPNYRDLQCRDIQSNSIRLNDTNGKDFYIGVSSNELRVTNNLFWNGGDTGYKPVRASDFIKASSEKYKKEIQEWNYDALSVLSNELKLYSYKYKDDEKEVIHHGPVIGDNYDTPVEFILQDGVNTNEMLSWSLRAIQQLNEKVEKLEEQINER
Physico‐chemical
properties
protein length:1320 AA
molecular weight: 149425,31020 Da
isoelectric point:5,13889
aromaticity:0,09167
hydropathy:-0,67242

Domains

Domains [InterPro]
DC_1274
ATT
1–650
DC_1274 G3DSA:2.60.120.260 DC_0203
IPR007119
Unmapped
36–337
IPR007119 DC_1746 IPR030392
IPR008979
STR
657–769
IPR008979 Coil
WYN04953.1
1 1320
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 1-650 | STR 651-886 | RBD 1196-1320
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage vB_G30_01
[NCBI] 		3136186 Viruses > unclassified bacterial viruses >
Host Staphylococcus warneri G30
[NCBI] 		3238738 Basidiomycota > Agaricomycetes > Russulales > Russulaceae > Russula >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WYN04953.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP213047 [NCBI]
CDS location
range 31674 -> 35636
strand +
CDS
TTGAAACATACAGGCATTCATATTTTAGATTTTAATGACAAAATTATTGATTATATTAGTCGTGATGACGGCGCATTATTAAATGCAGTGATGAGTACCAACGCCGAAGAAAAATCAGAAACATTCGATTTCACAATGTTAAATGATCGAGCTGAACATTTGCGTGAACGTAATCGTATTATTGCACAAGATAATAATGGTGTTTATCGTGAGTTCATTATTTCTCATGTGGTAGATAACTTTGATGGTACAACTGATGTAGAAAGTAATGCTTCATATTTAGAAGATATCGATAAATCACGTCCAATTAAACCCGGGAAATATAGTTCGTATAGCACTTCTCAAGCCTTGAATGAGACGCTACGTAATACTGGTTGGGAAATGTCAGATGACACTGAACATGGTGGTATGAGAACAACATCATGGACATCTTATTCAACACCATATGAAGTTATCAACATGTTATGCACAACATACGGTATGGTGGCAGAATACTATATAGAACTTGGTTCTCATACGGTAGAACATAGATATGTAACGTTAAAGAAACCAGTTAGTCTATTTAAAGGTAAAGAAATTACTAAAGGTAAAGATTTAACAGGAATGACACGTACCGTTGATATGTCAGAAGTACGGACTGCATTATATGCGATTGGTCCTGAAAACGACACTGGACAACGATTAGAAAAAATAGTTACAGATGATGACGCTCAGGCACAGTTTGGATTGCCTGGGCGTTACTTATGGAGTGTGTATGAACCAGAATCAGACGATAGCAATATGACTGATGAGCGTTTAACCACGCTTGCTAAAACTGAACTTAACAAGCGTAATAAATCGGCAATCAGTTATGAAATCACTTCTACAGATATTCATAGACACTATCCAGAAATGGTTGTATCCCTCCACGACACAGTACGTATTAAAGATAGAGATTTCAGACCACCGCTTTATATAGAAGCAGAAGTCATCGGCGTTGATTACAACTTACTCACTGATGAAAGTAACTATAAATTCGGCAACGTAGTTGAATATGAAGAAAATAACTTAAGAGATATATTCAATAAAAAACTTGCCGATATAAGTAAGAAATTGAATGATAATGTGAGTAATGTTAATACGATTGTTAAAGATGCAGTAGCAGGCCAATTAGAATACTTTGAACGTAAGATATTTAAACAAGATACGCCACCGGAAAATCCGGTTAACGATATGCTTTGGTACGATACGAGCAATCCAAATGTTGCAGTATTAAGACGATATTGGAACGGTGAATGGTTAAATGAAACTGTAGATGATGTTGAGAAAATTGGTGGTGTAACTAGGGAAAAAGCACTATACGATAGCATAAAAAATGCTTTTGAAAATCTATCAATCCAACATGCCAAATTAATGGATGAAACTTATGCGGTATTAAATAACGAATATCTCATTGATACAGATTTAAAAACAAAATTACAAACTGAATTAAATAATGTTGATGGTATCTATCAAAAAATCAATAGTGATTTAGGTTCTATCACAAGTGATACTGCCACTATAGGTACATTAATAGATATTCAAAGTCAATTTAGTTCTTATCGACAAAAGTTACAAAACTTGTATAAAGCTATGCGTAACGCTCAAATATCTGCAGATAAACGTTTGAAATTACTTCAATCACAATACACTGATGAGAAATTTAATGACGCATTGAATAAGGTAGCTAGTAAGTTTGGTCTAACTGTTGATAGTAATAACAATATGGTTGGCACACCGAATGTGATTGAAAAGGCAATACAAGCCTCACGAGAAGATACTGCCGAGCAATTAAAAAGTTATGTAAAGAGTATGGATTATCAAACTGATAAGAACGGCATTGTCGAACGTTTAGATAGCGCAGATAGTGAACGTAAACAGTTAAATAATTTAATTAGCGATAAAGTGAGCTTGAGTGAGTACAAGAATATGGCTATTGGTACAAGAAATTTAATTGCTAATAGTGATTTTTTAGCGGGATTAACATATTGGCGAAATGTTGGAGCTACTACACCCGCAAATTCTTATGATACAACTCTTACAGATATGCCAAATGGTTTTACTAGTGTGGCAGTGTATGAAAGTAACGACGCTTCAAAAGAAAAAGGGATAGCTCAAGACAACTTATCTCTTGAGATCGGTAAAGAGTATGTATTGAGTGCTTGGGTTAAAATTTTAAATGGCGCACCGACATTCAGGTTGCAAGCAGGTAAAACGAAATGGATTAATCAAAATTTTGAAGGCAATAACACATGGCAAAGATACGAGTTTGTATTTACTGCTTATGAATCGCCAATGAACATCTATATTTTAAAACCTAATAACATAGTAGACTCTAAAGTTGCTATTACCGGAGTTCAACTCGTTCAGGGTAATAAAAATACGGATTGGAAAGCTTCAGATAAAGACACCGACACAAAACTAACCAACATGACGACCTCTATTACACAAAATGGTCAAGATATTCAACAAAGAGCGACTAAAGAAGAATTTAATGCTAGTAAGAAAACGTTAAGCAAAACAATTAGTGATTTCACAAACAACGTCGCAACAGGTATGACCTTTACTTACGACAAAGACGGTGCCATTCAGAACATGAATATCGGTCAAGATGGCATTAAATTGAAAGGCGATAAAGTCGATATCACAGTGAATAAAGACTTTAATGTGACAACACAGAAGTTAGACAACAAAGTTGGTAAAGATGAAATTGTAAATAGACTTAACCTTTCAAATGAGGGTTTAAATATAGATGTAAACAAATTAGGTATTCGTGGTGGAGATGATAAGACCTATCTTACTATCCAAAATAAACGTATTTTATCTAAAGGTTATTTCACTAGAACTTGGGCGAACGTAACAGACACATCAAATTTAACGGTTGGTATTAGAGATGGTTATATTATGGCTTCAAATGAAGATACAGGATATAACTTATATATGACAGAAAAAGGTTTGTCCACAATGATGAGTGGTGCAGGAGATAAAACTGCAGGAACGTTAGAGTTTCATTCAACTAAGTATAATGATCGTTCGAGAGGTGTTAGATTACATTCGACTTATGGAGCTGTAGCATTAGAGAGTGATTATAGTAGAATAATTCTTAACTCTAACCTAACTGTTAATATTGAAAGTAATTCCGGTTCTGTTTATGTTAGACCGATGAAAGATAACAGAACAGGTACCAATGAGTTTAGATTTTGGGTTAAAAATAATGATACAGGAGCCGATACCGATGGTGTTTTATCCTATGGTTTGATCACTGGTACGAATAATAGTCCTTATGACTTTGGTTCGGGTATCAGATTTGATAAATCGCCAAAAACGAATTATGTATACGCAACTGATAAAGATGGAAATATTGGCTCAGGAGACTTCTATGCTAGAGCTTTATTAGGTGATTGGTTTGCTAAAAGTTCAAACTTATATGCTTGTGTCGATGACAAGTTAAGAATAACTAATAAATTAAGTTACAATAACGGAAATCCTAATTATAGAGATTTACAATGTAGAGATATCCAATCTAATTCAATAAGACTTAATGATACGAATGGTAAAGACTTTTATATTGGGGTGTCATCAAACGAATTACGTGTAACGAACAATTTATTTTGGAATGGTGGAGACACTGGGTATAAACCGGTTAGAGCAAGTGACTTTATTAAAGCCTCAAGTGAGAAGTATAAAAAAGAAATTCAAGAATGGAATTATGACGCATTATCAGTGTTGAGCAACGAACTAAAACTCTATAGTTATAAGTATAAAGATGATGAAAAAGAAGTAATTCATCATGGCCCTGTTATTGGAGATAACTATGATACCCCAGTCGAATTTATACTACAAGATGGCGTTAACACTAACGAAATGTTGTCATGGTCTTTAAGAGCGATACAACAATTAAACGAAAAAGTTGAGAAACTGGAGGAACAAATCAATGAAAGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
915aac50de9f4f585aa4fcb1054c2d3ea8ccc3b9551c8ff5a0ff1d67c5edf6fe
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7784
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Deciphering the Genetic Architecture of Staphylococcus warneri Prophage vB_G30_01: A Comprehensive Molecular Analysis Pu,F., Zhang,N., Pang,J., Zeng,N., Baloch,F.B., Li,Z. and Li,B. 2024 39459963 GenBank