Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A1D8KR42 [UniProt]
- Protein name
- Uncharacterized protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MPLYSSFSAGGGVRSAGFGIGRAAAGGGGPGEAVFTTPTTHSWTVPAGVTTVHVVAVGAGAAGTGDNSWGGGGGGLGWRNNISVNPGSTYTVVVGAGTVSSGPNQGRAGSSYFINTSTVRGQGGTVGPGGGGGYTAPGGGGGSGGQGGTGGSGIEGGGGGAGGYSGTGGSGAPQNGGASSGSGGAGGGGGRGDMSGGGGGGVGLYGQGPSGPGGPNGGQQGTGGGGGSGGQQGESTRGSDPRDSYGDGTRGGLYGGGAYGRFGNGGQSIGAHGAVRIIWGDGRAFPSTNTSQAASGGIIYGPF
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 303 AA molecular weight: 27260,48180 Da isoelectric point: 9,39132 aromaticity: 0,06931 hydropathy: -0,33168
Domains
Domains [InterPro]
DC_0475
STR
30–206
STR
30–206
PR01228
Unmapped
46–62
Unmapped
46–62
1
303
Architecture
STR 30-206 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-CAM22 [NCBI] |
1883365 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Alisovirus > Alisovirus socal22 |
| Host |
Synechococcus sp. [NCBI] |
1131 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV60868.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686207
[NCBI]
CDS location
range 29875 -> 30786
strand +
strand +
CDS
ATGCCATTATATTCCTCATTCTCAGCAGGTGGCGGCGTTAGATCCGCTGGTTTTGGTATCGGTAGAGCAGCAGCAGGCGGCGGTGGTCCTGGCGAAGCGGTATTTACAACTCCAACGACACATAGTTGGACAGTTCCTGCTGGTGTAACAACAGTTCACGTTGTCGCAGTTGGTGCTGGTGCTGCTGGTACTGGTGACAACTCTTGGGGCGGTGGCGGAGGTGGTCTCGGTTGGAGAAATAACATCTCTGTAAACCCTGGATCTACTTACACTGTTGTTGTTGGAGCAGGAACTGTTTCTAGTGGACCTAACCAAGGCAGAGCAGGTAGTTCATACTTCATCAACACCAGTACAGTTCGTGGTCAAGGTGGAACCGTTGGACCTGGCGGTGGCGGTGGTTATACTGCGCCTGGTGGTGGCGGTGGTTCAGGTGGTCAAGGTGGTACTGGTGGCAGTGGTATTGAAGGCGGCGGAGGCGGCGCTGGAGGTTACAGCGGTACTGGCGGTTCTGGTGCTCCTCAAAACGGCGGTGCATCTAGTGGCAGCGGTGGTGCTGGCGGCGGTGGAGGTCGTGGTGACATGTCTGGTGGCGGTGGTGGAGGCGTAGGTCTCTACGGTCAGGGTCCGAGTGGTCCTGGTGGTCCTAATGGCGGTCAGCAGGGCACTGGTGGCGGTGGCGGATCAGGCGGTCAGCAGGGTGAAAGCACTAGAGGTAGTGACCCTAGAGATAGTTACGGTGATGGTACTCGTGGCGGTCTGTATGGTGGTGGTGCTTACGGTAGATTTGGTAACGGTGGTCAATCTATTGGTGCTCATGGTGCTGTTAGAATTATTTGGGGTGATGGTAGAGCGTTCCCATCAACCAACACCAGTCAGGCAGCATCTGGGGGTATCATCTACGGACCTTTCTGA
Genbank protein accession
AOV61082.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686208
[NCBI]
CDS location
range 29869 -> 30780
strand +
strand +
CDS
ATGCCATTATATTCCTCATTCTCAGCAGGTGGCGGCGTTAGATCCGCTGGTTTTGGTATCGGTAGAGCAGCAGCAGGCGGCGGTGGTCCTGGCGAAGCGGTATTTACAACTCCAACGACACATAGTTGGACAGTTCCTGCTGGTGTAACAACAGTTCACGTTGTCGCAGTTGGTGCTGGTGCTGCTGGTACTGGTGACAACTCTTGGGGCGGTGGCGGAGGTGGTCTCGGTTGGAGAAATAACATCTCTGTAAACCCTGGATCTACTTACACTGTTGTTGTTGGAGCAGGAACTGTTTCTAGTGGACCTAACCAAGGCAGAGCAGGTAGTTCATACTTCATCAACACCAGTACAGTTCGTGGTCAAGGTGGAACCGTTGGACCTGGCGGTGGCGGTGGTTACACTGCGCCTGGTGGTGGCGGTGGTTCAGGTGGTCAAGGTGGTACTGGTGGCAGTGGTATTGAAGGCGGCGGAGGCGGCGCTGGAGGTTACAGCGGTACTGGCGGTTCTGGTGCTCCTCAAAACGGCGGTGCATCTAGTGGCAGCGGTGGTGCTGGCGGCGGTGGAGGTCGTGGTGACATGTCTGGTGGCGGTGGTGGAGGCGTAGGTCTCTACGGTCAGGGTCCGAGTGGTCCTGGTGGTCCTAATGGCGGTCAGCAGGGCACTGGTGGCGGTGGCGGATCAGGCGGTCAGCAGGGTGAAAGCACTAGAGGTAGTGACCCTAGAGATAGTTACGGTGATGGTACTCGTGGCGGTCTGTATGGTGGTGGTGCTTACGGTAGATTTGGTAACGGTGGTCAATCTATTGGTGCTCATGGTGCTGTTAGAATTATTTGGGGTGATGGTAGAGCGTTCCCATCAACCAACACCAGTCAGGCAGCATCTGGGGGTATCATCTACGGACCTTTCTGA
Genbank protein accession
AOV61296.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686209
[NCBI]
CDS location
range 29839 -> 30750
strand +
strand +
CDS
ATGCCATTATATTCCTCATTCTCAGCAGGTGGCGGCGTTAGATCCGCTGGTTTTGGTATCGGTAGAGCAGCAGCAGGCGGCGGTGGTCCTGGCGAAGCGGTATTTACAACTCCAACGACACATAGTTGGACAGTTCCTGCTGGTGTAACAACAGTTCACGTTGTCGCAGTTGGTGCTGGTGCTGCTGGTACTGGTGACAACTCTTGGGGCGGTGGCGGAGGTGGTCTCGGTTGGAGAAATAACATCTCTGTAAACCCTGGATCTACTTATACTGTTGTTGTTGGAGCAGGAACTGTTTCTAGTGGACCTAACCAAGGCAGAGCAGGTAGTTCATACTTCATCAACACCAGTACAGTTCGTGGTCAAGGTGGAACCGTTGGACCTGGCGGTGGCGGTGGTTATACTGCGCCTGGTGGTGGCGGTGGTTCAGGTGGTCAAGGTGGTACTGGTGGCAGTGGTATTGAAGGCGGCGGAGGCGGCGCTGGAGGTTACAGCGGTACTGGCGGTTCTGGTGCTCCTCAAAACGGCGGTGCATCTAGTGGCAGCGGTGGTGCTGGCGGCGGTGGAGGTCGTGGTGACATGTCTGGTGGCGGTGGTGGAGGCGTAGGTCTCTACGGTCAGGGTCCGAGTGGTCCTGGTGGTCCTAATGGCGGTCAGCAGGGCACTGGTGGCGGTGGCGGATCAGGCGGTCAGCAGGGTGAAAGCACTAGAGGTAGTGACCCTAGAGATAGTTACGGTGATGGTACTCGTGGCGGTCTGTATGGTGGTGGTGCTTACGGTAGATTTGGTAACGGTGGTCAATCTATTGGTGCTCATGGTGCTGTTAGAATTATTTGGGGTGATGGTAGAGCGTTCCCATCAACCAACACCAGTCAGGCAGCATCTGGGGGTATCATCTACGGACCTTTCTGA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
1e03f083d2771004d98daa17a38813c44f7a3d3da1170f6799e4856bbc16893d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50