Protein

View in Explore
Genbank accession
AGH57453.1 [GenBank]
Protein name
outer membrane protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGSQEWRNANPTLAQGEVGIDLDSGRIKIGDGSTAWNSLAYERPVESVANTANSLVQRDADGNFQAGTITGTVIGNASTASRLANVRQIQLTQDIVASGTFDGSQNLNLAAELQEIPTLPHFGADPAQGTYTSVTVDAKGRIINAANPSTIQDYNLDGVVEGQSAQPYDNDLSAVSGLTGTGISIRIGDGNWTTRSILSTAGQVVVSNGSGTAGNPQIDLATTTVVDGDYNTESLTSVIANGPAGEPFGTETVNAVKFTVDDRGRLQSATNVPIATATEGSKYANYDAGTSYSRYAIIQNASKVYQAYESVSAGAGAPAHTSGDSGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAALGVDNLQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLFGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPNIDLDGAVDQIVSKYGDGHWTVSHVQNVATPRNLNILATNSGSGSANIVITSDDTVQISASDAAGKVWVEDYRFQENYIATTNATLNIDPGDDRAVTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQVDDPIITLGGDTDPVADDNLDRGIEFRYYDSQARRGFFGYDDSYTDLGGHSGGYAFYYNATNTAEVFSGTDAGVLAGNLKLTTNTNSTTNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGSVDIDTNLTVHGTTLHDDNIVIQGASKVLQLNNGTGTTRVELQSTTGNASFYGVVDITNNLNINTNKFNVVAATGNTAIAGTLNVEGITTITDAVDLNSTLNVASSVHFEATDEPTFALNGGTGLWEIQSADYGSFRFDGGGYIAGDFMFDSDVVINGTILQRESSTEVFNEQNFLRVRRKFESGSVQVLTPSYASHSSSNARIFGGAGIGTSLHIGGTSASEGLFIGKKVNSDTVKFSVLGASGNTDIQGTLNVXGASVIDDTLNVTGAVDLDSTLNVDADATFQSNVTINGDNLLFTIEAQNGTDAFTVDSDNGNTIIAGTLDVDDATQITNTLNVTNGVDFDQTLNVDGAVDFNSTLVVDGQTTIYNSIYLNASNEEFAIQNGSGVDKFTVDSDNGNTVISGTVDISGATGITNSLTTSGVNTFTNFTQQTLTGSYSADGAFRLTGGAGIGKNLAVSGDTRVYGATELTGALDLNNSADISGIVTITNTSDITSYGDASVSLVTAGGLRVNKNAYVGGDFYVYDNGNSRAAFSVDNSTGNGEFHNNLIVGGDLTVNGTTTTVNSTTVTIDDPVFTLGGDTAPGSDDNKDRGIEFRYHTGSTAALGFFGYDDSASEFVFLTASTNSSEVFTGTDGNLRANQLHLTGSGTTLDVDADAIINGDLTVDDQIISTVTGKPPLVVASNSKVNNLNADLLDGLTTSSTDTTGTSVVSRSNGDFSANQITVNNGIGALAGIQGNATTADELRTARTVTIDGVVNATVSFDGSQNVTLTTTFDDADMDGLAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLITSPASGSGITVTQGDGVAGNPTINILSATTNAANNLVLRDGSGSFASNQITMVTSTVSGNATIGGTLGVTGITSLTDLLNADGGIAVDGTNFTVDGTTGAVSTASTLNADAAVTFGSTLGVTSNATIGGTLGVTGTVTASANLDVTVDATVGGTLGVTGITTLSNNLTVTGTSAFTGAITATNGVVGNITGQVSDISNHDTDALTEGSTNIYFTDERVDDRVAALISGGTGITATYNDAGNLLTLSATQADISTDLITEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIEHDGSGALSVTQVDIDTDNVTEGSVNLFTTAARTRTHFTYGTGIEHDGSGALSVTQADIDTDNVTEGSTNIFYTEARFDASLAGKNTANLTEGTNLYYTDARAEASFDTKIAAADTDALSEGSTNLYYTDARADARVANATGAALDLSSKSTADLAEDTNLYFTDARADARVDVGFAAKSTTDLAEGTNQYYTEARVQDKLDNAFAQLQAMLTNLATTTTLTLNLSGDPTPGAVVTTGSISASGLGGFTAGTAVATTSDGAGTGLTVDTTVDASGAITAVAANAGGTDYLIGETITLTNPNLGGAATFDFASLVGGSNYVTATGLTTTSSGSGNNLTVDITASAGVITNITVNVAGDGYSIGDTITIVQPVGSDPLGPGAGGTIDLSTVFTNATFALSDITTMEVGATVTGSTSGTTGVITALAASAITVDTVDGFFKVGEVVSANDVTTLTVQSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2228 AA
molecular weight: 228151,11920 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06421
hydropathy:-0,10355

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–241
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1617 DC_0029
AGH57453.1
1 2228
Architecture
ATT
STR
STR
STR
RBD
RBD
ATT 4-43 | STR 44-241 | STR 330-1050 | STR 1094-1574 | RBD 1801-1880 | RBD 1912-2228
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-SSM2
[NCBI] 		536464 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Ahtivirus > Ahtivirus sagseatwo
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH57453.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JF974292 [NCBI]
CDS location
range 142762 -> 149448
strand -
CDS
ATGGCAAATAGAATCCAACTTAGAAGAGGCGGTTCACAGGAATGGAGAAACGCTAACCCAACACTAGCGCAAGGTGAGGTAGGTATTGACCTAGACTCTGGTCGTATCAAAATTGGTGATGGTTCCACTGCATGGAACTCACTGGCGTATGAACGTCCTGTAGAATCTGTTGCTAACACTGCAAATTCCCTCGTACAAAGAGACGCTGATGGTAACTTCCAAGCGGGTACGATTACAGGAACTGTTATTGGTAATGCCTCTACTGCATCTCGTCTAGCAAATGTTAGACAGATTCAACTTACTCAAGATATTGTTGCCTCTGGTACTTTTGACGGTTCTCAAAACCTCAACCTTGCTGCAGAACTGCAAGAGATCCCCACGCTGCCTCACTTTGGTGCGGATCCTGCACAAGGTACATACACCAGCGTTACTGTGGACGCAAAGGGTAGAATTATCAATGCCGCAAACCCATCTACTATTCAAGACTATAACTTAGATGGTGTTGTAGAAGGTCAGTCTGCACAACCTTATGACAATGACCTCAGTGCAGTTTCAGGTCTGACTGGTACTGGTATCAGTATTCGTATTGGTGATGGTAACTGGACTACTAGGAGTATTCTATCTACTGCTGGTCAAGTTGTTGTCAGTAATGGTTCTGGTACTGCAGGTAACCCACAAATTGACTTAGCAACTACAACAGTTGTTGACGGTGATTACAACACAGAATCCCTAACGTCAGTAATTGCTAACGGTCCAGCAGGTGAACCTTTCGGTACAGAGACCGTAAACGCAGTCAAATTTACTGTTGACGACAGGGGTCGTCTTCAAAGCGCAACAAATGTGCCTATTGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTATGCTAACTATGATGCAGGTACTTCTTACTCTAGATATGCAATCATTCAGAATGCATCAAAGGTTTATCAAGCGTATGAATCAGTTAGTGCTGGTGCTGGTGCTCCTGCTCATACCAGTGGCGATTCTGGAGGATGGCGCTACCTCGCGGCTGAAGCGACAGAGCAGAAGGGACTGGCTAGTTTTGCACAAGAGGATTTCGATGTTGACAGTAACGGGCATGTAACTATTGCTGCCCTAGGCGTAGATAATTTACAATTACAAAATAATAGAGTTTCTTTTGCGGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTGGATCAAGAACTCACTGCAACCACTGGATACCGAGGATTCAATTACCTCAACTATATCAAAGTCAATGATACAAGCGGCAATTTACTTTTTGGCGCTAATAATACAGGCGATAGTGGCGCTGGTGAACTTGATGTCAACGTCCGTTCCTATTTTTCTGATCCTAATATTGATCTTGATGGAGCAGTTGATCAGATCGTTAGTAAGTATGGCGATGGTCACTGGACCGTAAGTCATGTTCAAAATGTCGCGACTCCCAGAAACCTCAATATTCTTGCAACGAACTCTGGTTCAGGAAGTGCAAATATTGTAATTACATCTGATGACACTGTACAGATTAGTGCATCAGATGCAGCAGGTAAAGTTTGGGTAGAAGACTATAGATTCCAAGAAAATTATATTGCTACAACCAATGCCACTCTCAACATTGATCCTGGTGATGATAGGGCGGTTACTGGAACCGTCAGAGTTTGGGGTGATCTTCAGGTTGACGGCACCACGACGACAGTCAACTCTACTACCCTTCAAGTTGACGACCCAATCATTACTCTTGGTGGTGATACTGATCCAGTTGCTGACGATAATCTTGATCGTGGTATTGAGTTTAGATACTATGATTCTCAAGCGCGTCGAGGCTTCTTTGGTTACGATGATTCGTATACTGATCTCGGAGGACACTCTGGTGGATATGCATTCTACTACAATGCTACCAACACTGCAGAAGTCTTTAGCGGTACTGATGCAGGTGTCTTAGCAGGTAACCTAAAACTTACTACTAATACTAACTCCACTACTAATACAACGGGTGACCTTGTGGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTGGACAAGATGTGAATATTGGTGGTAGCGTTGATATCGATACCAACCTGACTGTTCATGGCACGACTCTCCATGATGACAACATTGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGGTTCTGCAACTGAACAATGGCACTGGTACAACTCGTGTTGAACTGCAGAGCACTACAGGTAATGCATCATTCTATGGTGTTGTTGATATTACTAACAACCTGAACATCAACACTAATAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTACTGGTAATACTGCTATTGCAGGTACGCTGAATGTTGAAGGTATCACTACAATTACTGATGCTGTTGATCTCAATAGCACACTAAATGTTGCTAGTTCTGTGCATTTTGAAGCAACTGATGAACCCACATTTGCATTGAATGGTGGCACTGGTCTTTGGGAAATTCAATCCGCTGACTATGGTTCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATATATTGCTGGCGACTTTATGTTCGACAGCGACGTTGTTATCAACGGTACTATTCTCCAGAGAGAATCATCTACTGAGGTCTTCAACGAGCAAAACTTCCTGAGAGTTCGTCGTAAGTTTGAATCTGGATCTGTTCAGGTTCTAACCCCTAGTTATGCTTCACATTCTAGCTCAAACGCTAGAATCTTTGGTGGTGCTGGTATCGGCACTAGTCTCCACATCGGGGGCACAAGTGCTAGCGAAGGTCTGTTTATTGGTAAGAAAGTCAATAGCGATACTGTCAAGTTCTCTGTCTTAGGTGCATCTGGTAATACTGATATTCAAGGCACACTGAATGTTNAGGGTGCATCTGTTATTGATGATACTCTGAATGTAACTGGTGCAGTTGATCTTGACAGCACTCTGAACGTTGATGCTGATGCAACATTCCAAAGCAATGTTACAATCAATGGTGACAATTTACTGTTTACCATTGAGGCACAGAATGGCACTGATGCATTTACAGTAGACTCTGACAATGGCAATACAATCATTGCTGGTACATTAGATGTAGATGATGCAACACAAATCACAAACACCCTCAACGTCACTAACGGCGTTGACTTTGATCAAACTCTCAATGTTGATGGTGCCGTTGACTTCAATAGCACTTTGGTTGTGGATGGTCAAACAACAATTTACAACTCCATTTACCTGAATGCTTCCAATGAGGAGTTTGCTATTCAGAACGGTTCTGGTGTAGACAAGTTCACTGTAGATAGTGACAATGGCAATACTGTAATCTCTGGCACTGTTGATATTAGTGGTGCTACAGGTATTACAAATAGCCTGACTACATCAGGTGTCAATACATTTACAAATTTTACTCAACAAACCCTCACTGGTTCATACAGTGCAGATGGTGCATTCCGTTTGACAGGTGGTGCTGGTATTGGCAAGAATCTTGCAGTTAGTGGTGACACTAGAGTCTATGGTGCTACCGAACTTACAGGTGCTCTTGATCTCAATAACTCTGCAGATATTTCTGGTATTGTTACTATTACTAATACCAGTGACATTACCTCTTATGGTGATGCATCTGTCTCTCTAGTCACCGCTGGTGGTCTAAGAGTCAACAAGAATGCATACGTTGGTGGTGACTTCTACGTCTATGACAACGGAAATTCTCGTGCTGCATTTAGTGTAGACAACAGCACTGGTAATGGCGAGTTTCATAACAATCTAATTGTTGGTGGTGATCTAACGGTCAACGGTACAACTACTACCGTCAACAGCACTACCGTCACAATTGATGACCCCGTATTTACTCTTGGTGGTGACACTGCTCCTGGTTCCGATGACAACAAAGATCGTGGTATTGAGTTCCGTTATCACACGGGTTCTACCGCTGCTCTTGGTTTCTTCGGTTATGACGATTCTGCTTCGGAGTTTGTCTTCCTTACTGCATCTACAAATTCAAGTGAAGTATTCACTGGTACAGATGGAAACCTGAGAGCAAATCAGTTACATCTGACAGGTAGTGGAACAACTCTCGATGTTGATGCTGATGCAATTATCAATGGTGATCTGACTGTTGATGATCAAATTATTTCTACCGTAACTGGTAAACCACCTTTGGTTGTTGCATCAAACTCTAAGGTCAATAACCTGAATGCGGACTTGCTAGATGGTCTGACCACAAGCAGCACTGATACAACTGGTACTTCTGTTGTTAGTAGAAGTAATGGTGACTTCTCTGCTAATCAGATCACTGTAAACAATGGTATCGGTGCTCTTGCTGGTATCCAAGGTAACGCAACAACTGCGGATGAACTTCGCACTGCTCGTACCGTCACAATTGATGGTGTCGTCAATGCAACAGTCTCCTTTGATGGTTCTCAGAACGTAACTCTGACAACTACATTTGATGATGCAGACATGGATGGTCTGGCAGCGATGGCAGGAACAGGTTTCGTCAGCAGAACTGCTGCCAATACCTATGCTCAGCGTACGCTGATTACTTCTCCTGCATCTGGATCTGGTATTACTGTCACTCAAGGTGATGGTGTTGCTGGTAATCCAACGATCAATATTCTGTCTGCTACTACCAACGCTGCAAACAACTTGGTCCTGAGAGATGGAAGCGGTAGTTTTGCTTCTAATCAGATCACTATGGTGACCTCCACAGTGAGCGGAAACGCTACGATTGGTGGAACACTCGGTGTAACTGGTATAACGTCCCTCACAGACCTCCTGAACGCCGATGGTGGCATTGCAGTTGACGGTACTAACTTCACTGTAGATGGTACAACAGGTGCCGTTTCTACTGCTAGCACACTGAATGCTGATGCTGCAGTAACTTTCGGTAGCACACTGGGAGTTACTTCTAACGCAACTATCGGTGGCACACTAGGTGTTACTGGAACTGTAACTGCTAGTGCAAACCTAGATGTAACAGTCGATGCAACTGTCGGCGGTACTCTGGGTGTCACGGGTATTACAACTCTAAGTAACAACCTGACAGTAACTGGAACCTCTGCATTCACTGGTGCTATTACAGCAACTAATGGTGTTGTTGGTAACATCACTGGTCAAGTATCTGATATCAGCAATCATGATACGGATGCACTGACCGAAGGTTCTACTAATATCTACTTCACTGATGAGAGAGTAGATGATCGCGTTGCTGCATTGATCTCTGGTGGTACAGGTATTACTGCTACCTATAACGATGCTGGTAACCTCCTGACCTTGAGTGCTACTCAAGCAGACATCTCCACTGATCTTATTACTGAAGGTTCCACGAATCTCTTTACTACTGCTGCTAGAACTCGTACACACTTTACATACGGTACAGGTATTGAGCATGATGGATCTGGTGCTCTTTCTGTAACACAAGTAGACATCGATACTGACAATGTAACTGAAGGTTCTGTCAATCTGTTTACCACTGCTGCAAGAACCAGAACCCACTTCACATATGGTACTGGTATTGAGCATGATGGTTCAGGTGCTCTGAGTGTTACTCAGGCAGACATTGATACTGATAATGTAACTGAAGGTTCTACAAATATCTTCTATACAGAGGCACGCTTTGATGCAAGTCTCGCAGGTAAGAATACTGCTAATCTGACAGAGGGTACTAACCTCTACTACACAGACGCTCGTGCTGAGGCATCCTTCGATACCAAGATTGCTGCTGCTGACACTGATGCATTGAGTGAGGGTTCTACTAACCTTTACTACACCGATGCTCGTGCTGATGCAAGAGTTGCTAATGCAACTGGTGCTGCTCTTGACCTTAGCAGTAAGTCTACTGCTGACTTGGCAGAGGATACCAACCTTTACTTTACTGATGCTCGTGCTGATGCAAGAGTCGATGTAGGATTTGCTGCTAAGTCAACTACTGATCTTGCTGAAGGTACTAATCAATATTATACCGAGGCAAGAGTACAAGATAAACTGGATAATGCATTCGCTCAACTACAAGCAATGCTTACCAACCTTGCAACTACTACCACTCTTACATTGAACCTCTCTGGCGACCCTACACCTGGTGCAGTGGTTACTACTGGTTCTATCAGTGCTAGTGGTCTTGGTGGTTTCACTGCTGGAACTGCTGTTGCTACCACCTCTGATGGTGCTGGTACTGGATTGACTGTTGATACTACAGTTGATGCTTCTGGTGCTATCACTGCAGTCGCTGCTAACGCAGGTGGCACTGATTATCTGATCGGTGAAACAATTACCCTTACCAACCCTAATCTGGGCGGTGCTGCAACATTCGACTTTGCTTCGTTGGTTGGTGGATCTAACTACGTTACCGCAACTGGTTTGACAACTACTTCATCAGGTTCTGGAAATAATCTCACCGTAGACATCACCGCATCTGCTGGTGTTATTACCAACATTACTGTAAATGTAGCAGGAGATGGTTACTCAATTGGTGACACTATTACTATTGTTCAACCTGTTGGTTCCGATCCATTAGGTCCTGGTGCTGGTGGTACTATTGATCTTTCAACAGTATTCACCAATGCAACCTTTGCACTTTCTGATATCACAACGATGGAAGTTGGTGCAACTGTCACGGGTTCTACCAGTGGCACCACAGGTGTTATCACCGCTCTCGCTGCTAGTGCTATTACCGTCGATACCGTTGATGGATTCTTCAAAGTTGGAGAAGTCGTCAGTGCTAATGATGTTACTACTTTGACTGTCCAATCATTCGCTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0809fe8f93a28b03521787bbcb81d19a36b1ddf77359383ab10597530080554f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4858
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage S-SSM2 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank