Protein

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Genbank accession
UWJ03865.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
Protein sequence
MTVSTTIIKNSHNGNGSTTNFAYQFKILQDSDLTVIIRSSTGTETTKSLSTHYTVAGAGDASGGSITFTSGNTPASGETVVIRRNVPQTQAIDYIANDPFPAETHEEGLDRATMVAQQVSEEADRSIKLSRTNTMTSTEFTVGATARASKVLGFDANGELTVTQELGTNRGNWSSGTDYSARDIVKDTSTNNIFLVNTAHTSSGSQPLTSNANSAKYDLIVDAATATAAASTATAQATISTTKAGEAATSASTATTQANTATTKASEAATSATSAASSFDSFDDRYLGAKSSDPSVDNDGDALITGALYFNSSDNVMKNYTGSAWQTLKPTSSEQTNINTLSASAVVTDMSILATTDVVADMNTLASADIVADMNTLATADVVSDMNTLATADIVSDMNTLATADVVSDMNTLGTADVVSDMNTLGTSTNVTNMATVATNITGVNSFAERYRVASSDPTSSLDEGDLAFNTTDNNLKFYNGTAWTSISPGIANVVDDSTPQLGGNLDVQTNQIVTTSNRNVKVYPNGTGVLEVGGDGSSNDGTIQLNCSQNSHGVKIASPAHSAGQSYTLILPTSVGSANQVLASNGNSTNQLSWIDAAETKPTVADVSQTIAPATATTINITGSNFVSIPQVQFINGSTGAITNANTVSFTNATTLSVNVTLASGNYFVRIENPDGNAGRSTNNILTASTAPSFTTAAGSLGTIAGDFSGTVATVTGSSDSAISFSEVTSGGNVLTASSGANCTLATNGVITTSDFGGTSTAATLYNFTLRITDAEGQTVDRDFSLQSSFGATGGGQFN
Physico‐chemical
properties
protein length:800 AA
molecular weight: 81875,83320 Da
isoelectric point:4,23584
aromaticity:0,05375
hydropathy:-0,16100

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage Skadi-10 EXVC110P
[NCBI] 		2971108 No lineage information
Host Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062
[NCBI] 		335992 Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Pelagibacterales > Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UWJ03865.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP131295 [NCBI]
CDS location
range 28425 -> 30827
strand -
CDS
ATGACAGTATCAACTACAATTATTAAGAATTCCCACAATGGTAATGGCAGTACCACTAACTTTGCCTATCAATTTAAAATTTTGCAGGACAGCGATCTAACAGTAATTATTAGATCATCTACAGGTACAGAGACAACTAAAAGTCTATCTACACACTATACAGTAGCTGGTGCGGGTGATGCTAGTGGAGGTTCAATTACTTTCACTTCTGGTAACACTCCGGCTTCTGGTGAAACTGTAGTAATTAGAAGGAATGTCCCGCAAACTCAAGCGATAGATTATATTGCTAATGATCCATTCCCTGCGGAGACACATGAAGAGGGTTTGGATCGTGCTACTATGGTTGCACAACAAGTATCTGAAGAAGCTGATAGATCAATAAAATTATCAAGAACAAACACTATGACTTCTACAGAATTTACTGTAGGTGCTACTGCAAGAGCTAGTAAAGTTTTAGGATTTGATGCTAATGGTGAATTAACAGTTACACAAGAACTTGGTACAAATAGAGGAAACTGGTCATCTGGTACAGATTATAGTGCTAGAGATATAGTTAAAGATACCTCAACAAATAATATTTTTTTAGTAAACACAGCTCACACATCTTCTGGCTCACAACCACTAACATCAAATGCTAATTCAGCAAAATATGATTTAATTGTAGACGCAGCAACTGCCACAGCCGCAGCCTCAACTGCTACAGCTCAAGCAACAATCTCAACCACAAAGGCTGGTGAAGCTGCAACATCTGCATCAACTGCTACAACACAAGCAAACACAGCGACTACAAAAGCTAGTGAAGCCGCAACCTCTGCAACTTCTGCAGCATCTTCTTTTGACAGTTTTGATGACAGATATTTAGGTGCTAAATCTTCTGATCCTTCAGTAGATAATGATGGGGATGCTTTAATAACTGGAGCATTATACTTTAATTCTTCAGATAATGTAATGAAAAATTACACAGGTTCTGCTTGGCAAACTTTAAAACCTACTTCTTCTGAACAAACAAATATTAATACTTTATCTGCTAGTGCAGTAGTTACTGATATGTCAATATTAGCTACAACAGATGTTGTTGCTGATATGAATACTTTAGCTTCAGCAGACATTGTTGCAGACATGAATACTTTAGCAACTGCTGATGTAGTTTCGGATATGAATACTCTTGCAACAGCAGACATTGTATCTGATATGAACACTCTTGCTACTGCAGATGTTGTAAGTGATATGAACACATTAGGAACTGCGGATGTTGTATCTGATATGAATACTTTGGGTACATCAACTAATGTAACTAACATGGCAACTGTTGCTACAAACATTACAGGAGTTAATTCTTTTGCAGAAAGATATAGAGTTGCTAGTTCTGATCCCACTTCTAGTTTAGATGAGGGTGATCTTGCTTTTAATACGACAGATAATAATTTAAAATTTTATAATGGAACAGCTTGGACATCTATATCTCCGGGTATAGCAAATGTTGTTGATGATTCTACTCCACAACTAGGTGGTAATTTAGATGTACAAACCAATCAGATTGTAACAACAAGTAATAGAAATGTTAAAGTTTATCCTAATGGTACAGGTGTTTTAGAGGTAGGTGGTGATGGTTCATCTAATGATGGTACTATTCAATTAAACTGTTCTCAAAATTCTCATGGTGTTAAGATTGCTTCACCAGCTCACTCTGCTGGACAATCATACACTTTAATTTTACCAACGTCAGTTGGATCAGCAAATCAAGTTTTAGCTAGTAATGGTAATTCTACAAACCAATTATCTTGGATTGATGCAGCAGAAACTAAACCAACTGTAGCAGACGTATCTCAAACTATTGCTCCAGCTACAGCTACAACTATAAATATTACAGGTTCAAATTTTGTTTCAATACCACAAGTACAATTTATTAATGGTTCTACTGGTGCTATTACAAATGCTAACACAGTTTCATTTACAAATGCTACAACACTTTCAGTTAATGTAACTTTAGCATCTGGAAATTATTTTGTAAGAATAGAAAATCCAGATGGTAATGCTGGAAGATCAACAAACAATATTTTAACAGCATCTACTGCACCATCATTTACAACTGCTGCAGGATCATTAGGTACGATTGCAGGAGACTTTAGTGGTACAGTTGCAACAGTTACAGGCTCATCAGATAGTGCTATATCATTTAGTGAAGTTACATCTGGTGGAAATGTTTTAACTGCATCATCTGGTGCTAATTGCACTTTAGCTACAAATGGTGTAATAACTACAAGTGATTTTGGTGGAACTTCTACAGCAGCAACTTTGTATAATTTCACATTAAGAATTACAGATGCTGAAGGTCAGACAGTAGACAGAGATTTCTCTTTACAATCTAGCTTTGGTGCAACAGGTGGAGGACAATTTAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c0a33d5ceb2c304cc789de7a27ff8d7ba7442984c1666b74c4a09b84f7362080
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7158
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50