Protein

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Genbank accession
UYE98652.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDVSGNQTIQKDLLVNGSAVITNDLTVGGTINFANATFTQITVTGAANLNNVTSTGTATLNNVNVSGNTVLGDSGTDTVTVNGVSTFNADITAKSNVSIEGNTVVGNASSDTLTVNATSIFVAPATFNGDVTIGDAAADALTVNSTTNLKNNVTIGEDATDVLTVNSTSNFANNVTLGSDGTDSLTVNSATNIKNNMIIGEDATDTLTINSTTTIAGPVTATDLDVGGDLSVTGGTTLESLVVNGTSNLNGDLILASGTTATFDDVVINGALSGSFTLANGSFQTLNVSGASTLNSISATGNSSLTNVTVSGNVTGTNSQATFNIYNVAGSTGILQFSYNDPARPNDIKSSVEPYQVSSHEFQGQLADIDRITVGDVTFNDAGLTAAGLAKIDYLDIVGNATTGSTRPQLTVAGKTLLNDLEVTGTVSGITFDLTGQDINVNSLTATAGVSADTLASSGNATVGGTLTVTGDASLGGSTGTTTIHNLNVTGTTTGVTVAANVDGLNIAPATVTSTGNISVGGNLAVTGDVTGTLKTTNVTTSGTLGVTGATTLAGLTAGTTTLGATTVSSLNDTGNATITGTLGVTGIATFGNNVTVNGQTVTVKDLVVTGTTTGVTAVANVDGLDIAPNSVDVTTTLNVSGATTLAGLTAGATTVSSLTSSGNAQAASGTITGALTAGSLTTGTIGNSTNPVNFTSDVTMAQDLTVTGTLSAGGIDLSGTTIAATGLNTTGDVNVGGNLTVAGTFDLSASNVTVNTLTSTGIITVNDTTNPSVLPRVSSNAITTGTITATGTSTLAAVSATNVTASGTLGVTGATTLAGLTAGATTVSSLTNSGTATFNGNITSANTNVAIAKSTAITGDLSVSGTITPGALDLSTTDVTVQSLTSSGNAHIVGDLTVDGAFDLSATNISAASLASASTVTVGTDLVLTTGVITGAPQISGNTTIGGTLGVTGATTLAGVTATSLTVPTINGNTTFANNVTVTGTFTPAGGLDLSGADISANSIALAAGATVGTTLGVTGNTTVGGTLGVTGLTTLAGVNSGNHAITGTLSVSGASTLAAVSATNVTASGTLGVTGNTTVGGTLTVSGSGVSTIPNLQVGTGTADSNYIVNVFGDSVLNGNLDVTGTINAQINLTGRDIAPRGVTASANISAAGSITAGTSITAATAVLGAPGSTNNNLQVNGNATYTGDLTVGGVIFGSFDQTNSDVTMKSLTTTQGATIGTTLAVTGTSTLAGVSATTLSTSGAATLASAGITGNATVGGTLGVTGATTLAGLSATNITASGTLGVTGLSTLGSLTVTGAVALNGNTVIGDASSDTLTVNATSTFSGDTTVNNLTVNGTLTYDLSNVNTTSVTTGTYYVKQHAAETTSATTWTPDGTSNVYNLTVGGSGTTTTIQPITGATTKGAGSWFIYVTQDATGNHTVNWDSSYKIIGGSVSTTANAVSICQVVYCGIGSTFDVFIAQRP
Physico‐chemical
properties
protein length:1474 AA
molecular weight: 143087,87420 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,03053
hydropathy:0,26601

Domains

Domains [InterPro]
IPR006626
Unmapped
67–90
IPR006626 IPR006626 DC_0092 IPR006626 DC_0092 IPR006626 IPR006626 DC_0931
IPR006626
Unmapped
307–334
IPR006626 IPR006626 DC_0092 IPR058970
UYE98652.1
1 1474
Architecture
STR
STR
RBD
STR 191-511 | STR 640-977 | RBD 1082-1474
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Xanthomonas phage XbC2
[NCBI] 		2978503 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Xanthomonas vesicatoria
[NCBI] 		56460 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Lysobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYE98652.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP292654.1 [NCBI]
CDS location
range 134972 -> 139396
strand -
CDS
ATGTATTCTATAAAAACTGATCTTGACGTATCTGGTAATCAAACGATCCAAAAAGATCTTTTGGTTAACGGTAGTGCAGTCATTACGAATGATTTGACCGTAGGTGGTACAATCAATTTCGCTAATGCTACATTTACACAGATTACTGTCACTGGAGCAGCGAATCTTAACAACGTAACCTCAACAGGTACAGCTACATTGAATAATGTAAACGTTTCTGGTAATACAGTACTTGGTGATTCCGGCACTGATACTGTTACTGTAAACGGCGTTTCTACATTCAATGCTGATATCACTGCCAAAAGCAATGTATCTATTGAAGGAAATACAGTTGTAGGTAACGCAAGTTCCGACACGCTAACAGTTAATGCAACAAGTATATTTGTAGCTCCAGCTACTTTTAATGGTGACGTTACCATTGGTGATGCTGCTGCTGATGCTTTAACTGTAAATTCTACAACGAATTTAAAAAATAACGTAACTATTGGTGAAGACGCAACTGACGTTTTAACTGTTAATAGTACCTCTAACTTTGCTAACAATGTTACTCTTGGTTCAGATGGCACTGATTCACTAACCGTGAACTCTGCGACAAATATTAAGAACAACATGATTATCGGTGAAGATGCTACCGATACTCTAACAATTAACAGTACTACAACTATTGCTGGTCCAGTAACTGCTACTGATCTAGATGTTGGCGGTGATCTATCCGTAACTGGTGGTACTACTTTAGAATCCCTAGTAGTAAATGGAACTTCCAACCTAAATGGTGATTTGATTCTAGCATCTGGCACAACTGCTACTTTTGATGATGTAGTAATTAATGGTGCTCTAAGCGGTTCTTTCACTCTTGCTAATGGTAGTTTCCAAACTTTAAACGTTAGCGGAGCATCAACCCTTAATAGTATTTCTGCTACTGGTAACAGTTCACTAACTAACGTAACCGTTAGTGGTAACGTTACTGGTACAAATAGCCAAGCTACATTCAACATTTATAATGTTGCTGGTAGTACTGGTATTCTACAATTTAGTTATAACGACCCTGCACGTCCAAATGATATTAAATCATCAGTTGAACCATATCAAGTGAGTTCTCATGAATTCCAAGGTCAACTAGCTGATATTGATCGTATTACTGTTGGTGATGTAACATTTAATGATGCTGGTCTAACCGCTGCTGGCTTAGCAAAAATTGATTATCTTGATATTGTTGGTAACGCAACTACTGGTTCAACTCGTCCACAACTAACTGTTGCTGGAAAAACACTTCTTAATGATCTAGAAGTAACTGGTACTGTTTCTGGTATTACTTTTGATTTAACTGGTCAAGATATTAATGTTAACTCATTAACTGCTACTGCTGGTGTTTCTGCTGATACTCTTGCTTCCTCTGGTAACGCAACTGTTGGTGGCACTCTAACTGTAACTGGTGATGCTTCACTTGGTGGTTCAACTGGTACTACAACAATTCATAACTTAAATGTTACTGGTACTACCACTGGTGTAACTGTTGCTGCTAACGTTGACGGATTAAACATTGCTCCAGCAACTGTAACTTCAACAGGTAATATTTCTGTCGGTGGAAATTTGGCAGTAACTGGTGATGTGACTGGTACACTAAAAACAACTAACGTAACTACTTCAGGTACTCTAGGTGTTACTGGTGCTACTACTCTAGCAGGTCTAACCGCTGGCACAACTACCCTTGGTGCTACAACTGTAAGTTCATTGAATGATACAGGTAACGCAACTATCACTGGTACTTTAGGCGTAACTGGTATTGCTACATTTGGTAACAATGTAACTGTTAATGGACAAACTGTAACTGTTAAGGATTTAGTTGTAACTGGTACTACCACTGGTGTAACTGCTGTTGCTAACGTTGATGGTCTTGATATTGCTCCTAATTCAGTAGATGTAACTACTACATTAAATGTATCGGGTGCTACTACACTAGCAGGTCTAACCGCTGGTGCTACAACTGTAAGTTCACTAACAAGTTCTGGTAATGCTCAAGCAGCATCTGGTACTATCACTGGTGCTCTAACTGCTGGTTCTTTGACTACAGGTACAATAGGAAACAGTACTAATCCAGTTAACTTTACCTCAGATGTTACTATGGCACAGGATTTAACTGTAACTGGTACACTATCTGCTGGCGGTATTGATTTAAGTGGTACTACTATTGCTGCTACTGGTCTAAACACAACTGGTGATGTAAACGTTGGTGGAAATCTAACTGTTGCTGGTACATTTGATCTAAGTGCTTCAAATGTTACTGTTAATACCTTAACAAGTACTGGTATTATCACTGTAAACGATACAACCAACCCATCAGTTCTACCACGTGTAAGCAGTAATGCTATTACAACTGGTACTATTACTGCTACTGGTACAAGTACTTTGGCTGCGGTTTCAGCAACAAACGTAACTGCTTCAGGTACACTAGGTGTTACTGGTGCTACAACCTTAGCTGGTCTAACTGCTGGTGCTACAACTGTAAGTTCACTAACAAATTCTGGTACTGCTACTTTTAATGGCAACATTACTTCAGCAAATACAAACGTAGCGATTGCTAAATCAACAGCAATTACAGGTGATCTATCAGTAAGTGGTACAATTACCCCAGGTGCTCTAGATTTAAGTACTACTGATGTTACTGTTCAATCTCTAACTTCAAGTGGAAATGCTCATATTGTTGGTGATCTAACAGTTGATGGTGCTTTTGACCTATCAGCAACTAACATTAGTGCTGCTTCTCTGGCTTCTGCTAGTACTGTTACTGTAGGTACTGATTTAGTACTAACTACTGGTGTAATTACTGGTGCTCCACAAATTTCTGGAAACACTACTATCGGTGGTACTCTAGGTGTTACTGGTGCTACTACACTTGCTGGCGTTACTGCTACAAGTCTAACAGTTCCAACTATTAACGGAAACACAACTTTCGCTAATAACGTAACTGTAACTGGTACATTCACTCCTGCTGGTGGTTTAGATCTAAGCGGAGCAGATATTTCTGCGAACAGTATTGCTCTTGCTGCTGGTGCTACCGTTGGTACAACACTAGGTGTAACTGGTAATACTACTGTTGGTGGTACACTAGGTGTAACTGGATTAACTACCCTTGCTGGAGTTAACTCAGGAAACCATGCAATTACTGGTACACTATCAGTTTCCGGTGCTTCAACACTTGCTGCTGTATCTGCTACTAACGTAACAGCTTCTGGCACATTAGGTGTAACTGGTAATACTACTGTTGGTGGTACTCTAACTGTTTCTGGTTCTGGAGTTTCAACAATTCCAAATCTACAAGTTGGTACTGGTACTGCTGATTCAAACTATATCGTTAACGTATTTGGTGATTCTGTACTAAATGGTAACTTAGATGTTACTGGTACAATTAATGCTCAAATTAACTTAACTGGTCGTGATATTGCTCCACGTGGGGTAACTGCTTCTGCTAACATCAGTGCTGCTGGTTCTATTACTGCTGGTACTTCTATTACTGCGGCTACCGCTGTACTAGGTGCTCCTGGCTCAACCAACAACAACCTACAAGTTAATGGTAACGCAACTTATACTGGCGATCTAACGGTTGGTGGTGTAATCTTCGGTTCATTTGATCAGACAAACTCTGACGTAACCATGAAGTCATTAACTACTACACAAGGTGCTACAATTGGTACTACTTTGGCAGTAACTGGTACTTCTACCCTAGCAGGTGTTTCAGCAACTACTCTAAGTACTTCTGGTGCGGCAACTCTAGCATCTGCTGGTATTACAGGTAACGCAACCGTTGGTGGTACATTAGGTGTAACTGGTGCTACTACTCTAGCTGGCCTATCAGCAACTAACATAACCGCAAGCGGTACATTAGGTGTAACTGGTTTATCAACACTAGGTAGTCTAACTGTAACTGGTGCTGTGGCTCTAAATGGTAACACTGTTATCGGTGACGCAAGTTCTGATACATTGACTGTTAACGCAACAAGCACATTCTCAGGTGACACAACTGTTAATAATCTAACAGTCAACGGTACTCTAACATATGACTTGTCAAATGTTAATACTACATCTGTTACTACTGGTACTTACTATGTTAAACAACATGCTGCTGAAACAACAAGTGCTACAACGTGGACTCCAGATGGAACTAGTAACGTGTACAACCTAACTGTTGGTGGAAGTGGTACAACTACTACCATTCAACCAATTACTGGTGCTACAACTAAAGGTGCTGGTTCATGGTTCATCTATGTAACACAAGATGCTACAGGAAACCACACAGTGAATTGGGATTCTTCTTATAAAATCATTGGTGGTTCCGTAAGTACTACTGCTAACGCTGTAAGTATCTGTCAAGTAGTATATTGTGGTATTGGTTCAACATTTGATGTGTTCATCGCACAGCGTCCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1df0884b09c61358a8c58c21d83aaf784286a478a67a7f498cf618e4f973bbff
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5579
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterization of two novel jumbo bacteriophages infecting Xanthomonas vesicatoria isolated from agricultural regions in Mexico Rubi-Rangel,L., Villicana,C., Leon-Felix,J., Amarillas,L., Carrillo-Fasio,A. and Lightbourn-Rojas,L. 2024-07-15 — GenBank