Protein

View in Explore
Genbank accession
QHR74360.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLRLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVNNTFRGTQTILSDNEALIVKNNTQGMPLGIRGRDADGTSRWYFGNDNRDSNALVLSNVKTGVSIGILENLVSVNRTFQITGQVQPSDWSNLDARYFTQTVANQRFAQLAADNTFSGSNTFNKLSVFKKDGEAIRLQNANAAQPLYIKAIDSAGVKRWYIGNSNEGDNVALENYKTSGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYVLIGSYANLAKKNEANTFTLQQNIQSDGEALRIYSKAQNNSSYIVGKNTDNTNKWFIGCGTNGSGTASFHNYLTGARLDLADEVLLSKSLQITGQVKPSDWSNLDARYFTQSAANQRFMVAGSTGQATEQNADGVAWNAKTGLYNVTSTNADYTALVFQMYQGVNSSTACAQLKFQYKNGGMWYRTSVDSKGFEAKWSKIYTEAQKPTPSELGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGHHNHAISWIGQNSTHYSGGGGGRIGTGPGYTDGGGDHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:783 AA
molecular weight: 84222,93120 Da
isoelectric point:8,82709
aromaticity:0,08685
hydropathy:-0,45006

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–272
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
G3DSA:6.20.80.10
STR
158–219
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 IPR048388 IPR048388 IPR022246
QHR74360.1
1 783
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-363 | STR 364-380 | ATT 381-471 | STR 472-779 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage dune
[NCBI] 		2696392 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus dune
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR74360.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850636.1 [NCBI]
CDS location
range 50396 -> 52747
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGCTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCTACAGGTTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATCAACGCAAACGGCCTTAGACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACCGTTTATCATACCCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGACTGGCTGTAAATAACACCTTTAGAGGTACTCAAACCATCCTATCTGATAATGAAGCACTTATTGTTAAGAATAACACACAGGGTATGCCACTAGGTATTCGTGGTCGAGATGCAGATGGAACTAGTAGATGGTATTTTGGCAATGATAACAGAGACTCAAATGCTCTTGTATTGTCGAATGTAAAGACTGGTGTTTCAATTGGTATTCTTGAAAATTTGGTGTCAGTCAACAGAACTTTTCAAATCACTGGTCAAGTTCAACCATCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGGTTTGCGCAGCTAGCTGCGGATAATACTTTTAGTGGCTCTAACACATTCAACAAACTGAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGCAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAAGCGATTGATAGCGCAGGTGTCAAAAGATGGTACATTGGTAATAGTAACGAAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTAGTGGCAAGATTACTGTAGGAACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATTGACTCTCGTTATGTTCTTATCGGTTCATACGCAAATCTTGCTAAGAAGAATGAAGCTAACACATTCACTTTACAGCAGAATATTCAATCTGATGGTGAAGCATTAAGAATCTACAGCAAGGCTCAGAATAATTCTTCTTACATTGTTGGTAAGAATACTGATAACACAAATAAGTGGTTTATCGGTTGTGGTACTAATGGTTCTGGTACGGCATCATTCCATAACTACTTGACTGGTGCAAGACTCGATTTAGCTGACGAAGTTCTTCTGTCTAAATCTCTACAGATTACTGGACAGGTAAAACCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGTCAGCAGCTAATCAGAGATTCATGGTTGCAGGTTCTACAGGACAAGCTACAGAGCAGAATGCAGATGGTGTGGCATGGAACGCTAAAACAGGCTTATATAATGTAACCTCAACAAATGCTGATTACACAGCACTTGTGTTTCAAATGTATCAGGGGGTTAACTCTTCTACTGCCTGTGCGCAATTAAAGTTCCAGTATAAGAACGGTGGGATGTGGTACAGAACATCTGTAGATAGTAAAGGCTTTGAAGCTAAGTGGTCTAAGATTTACACAGAAGCACAGAAGCCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTACCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTTAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGGAACTTGCCTTCACACACTCACAGTTTTTCTGCTACCACTTCATCTTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACTCACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTCACCACAACCACGCTATCTCGTGGATTGGTCAGAACTCTACACACTATTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGAATCGGTACAGGTCCGGGTTACACTGATGGGGGTGGTGACCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCTGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a474e65b5f610f92a8fd68abbcadb10f71547f64c8faff5049e9bee9cd9b3318
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6958
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank