Protein
View in Explore- Genbank accession
- UGO53401.1 [GenBank]
- Protein name
- L-shaped tail fiber protein
- RBP type
-
TFTSPTF
- Protein sequence
-
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIALNTHGRTLAIYTKDEADNVVQLAGKGVPFLDTSGTLSVDGTTTLKDNVTISPNKAISFETTDLSGEITRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNNGILEIGTIDDGTETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLTTNKTVKISNGSTLTLEMGVGANDAYIKNLRGSGVLQLTNDGNLTFRNSQVYYATAGKGPGKDGTLLTNVENERQLKQDNFPVTTGSEVRWTKVALLKDPGSSQSRLQLMVTNGGNYGSTRSSIDFIDCSARSFPTSLTSSNIRTYLQVRRLGDPALDETNQLRYSLVRTSEGLELWFTQRAFIGGVKVALLSIAGGTEYYLPTGYTSSSTEPEGLVESTAIRIYDELNKPNIDGGTEGILPISRGGTGGTSSAAARNNLGLGTAAIRDVGESTGNLLENGAYGLGGNGGKSINDIVSNADMLNRLKAYGGTFWRGDVKSGVSFQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNSGLAAGNVNYNELYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTVPNLHASSTGTASLYINAGTGNAHIWFRTGGNERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGDVSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKIGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGTFVDLGSENSDKYSRLTLARKVGSGAAVAMLKVTPEGYVQFGYQDAVATPSPSKYILVKSNGLEVEGDLVFNQTYRGAEEAVDITDKTVDLNDLVIKGSDPGTRRMYKCFSYGGGSNISNKPTYDGNFVLEVLSLRKISDTDWTCKQTFTTKGNVEGTYVRYCQNGTWAAWREVVAGVQPINLGGTGATSVADARNNLGIGESQKPAFGGLTINSVGNTDPTVTFDNGAIIRGGRGSSNGALIVAASATAITAGKYIAFRPYGISSNSDIRVKAFGNNETSLEWSQGAGVRSNTEGAFVVYAKAGQALHLRPNGDSANQATVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNTDIGLVKKSNMPGKMAIGKSNSFTVMVSTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNSSVSRALTVSSTATVNGIINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLTGGTVTGPLNITGNQLKTTSLWVTGNSALNGNLEVGGNVVSNTGIGSFVGAVDVKAPAVDNGTTHLWFRHSNGGERGVIYMPGNNNTMMGLRAGGSEWQLDGPTGQMIGPGARWRIHADGNLQGDVYGGYITNYINDRFNQCAQWVRTGAQQDFGPIGRPAPGKTVPGGWVLVGLNGNSNELTRICNLSVDVYKYGNRAFNGLILLLDNKGLRPL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1427 AA molecular weight: 150345,57400 Da isoelectric point: 7,50288 aromaticity: 0,06797 hydropathy: -0,31226
Domains
Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–612
ATT
4–612
DC_0468
STR
476–1075
STR
476–1075
1
1427
Architecture
ATT 4-612 | STR 613-1075 | RBD 1076-1380 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1427
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 773 | 773 | 0,2403 |
| Central domain | 774 | 972 | 200 | 0,2939 |
| C-terminal | 973 | 1427 | 454 | 0,6016 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 550 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 550 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-773
1-773
Central
774-972
774-972
C-terminal
973-1427
973-1427
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage vB_KaeM_Nispero [NCBI] |
2902678 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UGO53401.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL539458.1
[NCBI]
CDS location
range 143351 -> 147634
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATCGCGTTGAATACACATGGGCGTACTCTCGCTATCTATACCAAAGATGAAGCTGATAATGTTGTTCAGCTTGCTGGTAAAGGGGTTCCTTTCTTAGATACATCTGGAACTCTTAGCGTTGATGGAACTACTACATTAAAAGACAACGTTACTATTTCTCCGAATAAAGCGATCAGTTTTGAAACTACTGATTTAAGCGGTGAAATAACTCGTCATATCGTTGGCAAATGTGCTACTAATGATGGCTGGTACATTGGTGCCGGTGGTACAAGCAATAACGGCATTCTTGAAATCGGTACTATTGACGATGGTACTGAAACTATTCAATTCGTACAGCGCGGAGCCGGCAACGTCGAAGCCCGAAAACTTGTCTTACTTGATGGTTCTGGTAATACTACTCTTCCTGGCGATTTGAGATTAACTACTAATAAGACCGTAAAAATTTCAAATGGGTCTACTCTTACTTTAGAAATGGGCGTAGGTGCTAATGATGCATACATTAAAAACCTGAGAGGCTCTGGCGTTCTTCAATTAACTAATGACGGCAATCTGACATTCAGAAATTCCCAGGTTTATTATGCCACGGCTGGAAAAGGTCCTGGTAAAGATGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACGAACGCCAACTTAAGCAGGATAATTTCCCTGTAACGACTGGTAGCGAAGTTAGATGGACAAAAGTTGCTCTTTTAAAAGACCCTGGATCAAGCCAGAGCCGCTTGCAACTGATGGTGACTAATGGCGGTAACTACGGTAGCACTCGCAGTTCTATTGACTTTATTGATTGCAGCGCTAGAAGCTTTCCAACCTCGTTAACAAGCAGTAACATTCGTACTTATCTGCAGGTTCGTCGACTTGGTGATCCGGCACTTGATGAGACCAATCAATTGCGTTATAGTCTAGTTCGTACCTCTGAAGGTTTAGAACTGTGGTTTACGCAGCGCGCATTTATCGGTGGAGTTAAAGTTGCACTGTTATCTATTGCCGGTGGTACTGAATACTATTTGCCTACTGGTTACACGTCTTCTTCAACCGAGCCTGAAGGTTTAGTTGAGAGCACGGCTATTCGCATCTATGACGAATTAAACAAGCCTAACATTGACGGTGGTACTGAGGGTATTCTGCCTATTAGCCGAGGCGGTACTGGTGGTACTTCTTCTGCTGCGGCCCGTAATAACTTAGGTCTAGGTACTGCTGCTATTCGCGACGTCGGCGAATCCACCGGCAACCTTTTAGAAAACGGTGCTTACGGCTTGGGCGGTAACGGTGGCAAATCTATCAATGATATTGTCTCTAACGCGGATATGCTGAATCGTTTAAAAGCATACGGTGGTACTTTCTGGCGTGGTGATGTTAAATCTGGTGTTAGTTTTCAAAACGGTCTTTATAGTCACGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCTGGTGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTATGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGTGGTCTTGCCGCAGGAAATGTTAACTACAATGAACTTTATGGTACAGCAAACAAACCATCTAAGGCTGATGTCGGACTTGGCAATCTGACAAACGATACCCAAGTCAAGAAAGCCGGCGACACCATGACTGGTGATTTAACTGTTCCTAATTTACATGCTTCCAGTACCGGTACTGCGTCGTTGTATATTAACGCAGGAACCGGAAATGCCCATATATGGTTTAGAACAGGAGGTAATGAGCGTGGTGTAATTTGGGCAACTCCGAATACCGCGGACTTGGGTCAGATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGTGATGTTTCTGCCGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGCCGCCTGGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAATTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAATATTACCTCTGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAACGATATCGTTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGCAAGACTGGTGATACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTTGAAAATCCTAATGGAACGTTTGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCAGACAAGTACAGCAGATTAACCCTTGCACGCAAAGTTGGTAGCGGTGCTGCCGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAGATGCAGTTGCTACTCCGTCTCCTAGCAAGTACATCCTGGTTAAATCTAACGGCCTTGAGGTAGAAGGCGATTTGGTTTTTAATCAGACATATCGTGGTGCTGAAGAAGCAGTTGATATTACTGATAAGACTGTTGACCTTAATGATCTTGTCATTAAAGGATCCGACCCAGGTACTCGTCGGATGTATAAATGCTTCTCATATGGTGGTGGTTCTAATATATCGAACAAACCTACCTATGACGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTATCTTTGCGTAAAATTTCTGATACCGATTGGACTTGTAAGCAGACCTTTACTACAAAAGGTAATGTTGAAGGTACATATGTTCGATACTGCCAAAACGGCACATGGGCTGCATGGAGAGAGGTTGTTGCAGGGGTTCAGCCAATTAATTTAGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCCGATGCCCGCAATAACCTCGGTATTGGTGAAAGCCAGAAACCAGCTTTCGGTGGATTGACTATTAATAGTGTTGGAAATACTGATCCGACCGTCACATTTGATAACGGCGCTATAATTCGTGGAGGTCGAGGCTCTAGTAATGGTGCATTAATCGTGGCGGCTTCTGCTACAGCTATTACTGCCGGTAAGTATATTGCTTTCAGGCCATATGGAATTTCGTCCAACTCCGATATTAGAGTCAAAGCATTCGGTAATAACGAGACATCGCTTGAGTGGTCGCAGGGTGCAGGTGTTCGTTCAAATACCGAGGGCGCTTTCGTAGTTTATGCAAAAGCCGGTCAGGCGCTTCATTTAAGACCAAACGGTGACAGTGCGAACCAAGCTACCGTTATCGATCAGAACGGTAAAATGACAGTCGGCGGTGAGTTCGAGGCTCAGAACTCAAAAATCACAGGTAACCTGAACGTATCTGAAGATAACAGAATGATTGTTCTTGGCAAAAATACCGATATCGGTTTAGTCAAGAAAAGTAATATGCCAGGAAAAATGGCTATCGGTAAATCTAACTCGTTTACTGTTATGGTGTCAACCAATACTAACAATCAGATTAATCCTGCTGATACGTTTAACGATATATTCAAAGTTGATGCAGACGGAAACCAAACTGTTTATGGAAATTCATCAGTTTCTAGAGCTTTGACTGTATCAAGTACAGCTACTGTTAACGGTATTATTAATGCCAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACGCAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCCATTAGTAATGCTGGTGATACTTATCTTCCGTTAACAGGTGGTACTGTAACTGGTCCATTAAATATTACTGGAAACCAGTTAAAAACCACATCGCTCTGGGTTACTGGAAATTCGGCACTTAACGGTAATTTAGAAGTAGGCGGTAATGTTGTTAGTAATACTGGTATTGGTAGTTTTGTTGGTGCTGTAGATGTTAAGGCCCCTGCCGTAGATAATGGTACAACGCACCTTTGGTTCCGACATTCTAATGGTGGCGAGCGTGGTGTGATTTACATGCCAGGTAACAATAATACCATGATGGGATTAAGAGCTGGTGGTAGTGAGTGGCAATTGGATGGTCCGACAGGTCAAATGATAGGCCCAGGTGCTCGTTGGCGTATTCATGCAGATGGTAACCTACAGGGTGATGTTTACGGTGGTTATATCACTAACTATATCAACGATAGGTTTAACCAATGTGCACAGTGGGTTCGTACTGGTGCTCAACAAGACTTTGGTCCAATTGGTCGTCCAGCACCTGGTAAAACTGTTCCTGGTGGTTGGGTGCTTGTTGGTCTTAACGGTAACAGTAACGAACTAACCAGAATATGCAACTTATCGGTGGACGTTTACAAGTATGGAAACCGGGCGTTCAATGGGTTGATTCTGCTACTTGATAATAAGGGGCTTCGGCCCCTTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
7de6438abd78db6d64940cfffcca630f378a643073c4d34e28983ac2acf3477d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50