Protein

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Genbank accession
YP_007006628.1 [GenBank]
Protein name
central tail fiber J
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MLRIYDQNSQELYNNSILHLNKVSVGLNGNRTIVIESSSNFTVTSPNENVKLAKLINQDKVSLELSRDYNVQNRFTPVYLNLYSEEEFESIVDLYVTNIDGDSITIKVKTVFEDNSDRLMVLLNNNGVRISDLWYKAIKSSDLNEISCIVLNQKRREFLLDLLTLTGCISSYDNLFAALDFFEWSDIVTVKEYWKDGQFGKYRITDVNNKIIDRKLLNDGFVKTNWLGLYFQLNQPDGTYDSDGFANFEDVNVTVEDLWTKLYYLKQILEETFLPTNVKIIDIVGEHTSIAGLDKTVWVDKTVVTDIEPNPSDIFDEFDIIANSKDHIIIEDSYCLRKLPIYIDLNDDMIKLDPNAISSQPNEPIFKIIKTKEELSQMTDFKDYEVMTQFYRGDFASIEVVFNVINEDLAGLMNYKIALQEDIDDSGQFNQIYLSELMSYSELLASQKLGIRKVGKFRLVIYVFNGWGAMDMVSSTLEFTVSIDSLNIQLYEISDKIDKDLKYDIGFYTTIPTVNQELVVPDAFDPIFDISDRSTAFPGRYFKNSMTERYLETTINQYNMVENRQLQKCRIIDYSTYHEVLLFSFDDTETSLKLKLYDRHEWSEVSNPSSNHSERTELVSKLNDISFRSTDWKNPFNRYTYHLTEYSVDGSLTNTIPVIVAFAKEADNFFENMVLIGNALSEPIEKAYLRLLSLQHAVFRIDKLINPATSDLTIIQDKVTTVIENVTINDLDELVTVLKNAPISKMSLTVSPNGMLIVSSDKDIVLKHDSIGTVYDIVRNVAYDNLKFAKIGQDFQVTIPVFATPEKRYNTYDYVWEVIDRYSGDVVHTENNRVMSWLPFDLGVYDIKLSMLDVLTGNSVISAFKKGGIRISDRPFTETSSNVMFYNTEQTKTVYNTTCLLGTNPEPLIYKVRERKYSSTVSQEDANMKALREIEQNAQDWANAYGYCRVM
Physico‐chemical
properties
protein length:951 AA
molecular weight: 109471,48690 Da
isoelectric point:4,67730
aromaticity:0,11041
hydropathy:-0,25478

Domains

Domains [InterPro]
DC_1826
STR
870–951
DC_1826
IPR046020
STR
885–948
IPR046020
YP_007006628.1
1 951
Architecture
STR
STR 870-951
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Sphingomonas phage PAU
[NCBI] 		1150991 No lineage information
Host Sphingomonas paucimobilis
[NCBI] 		13689 Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Sphingomonadales > Sphingomonadaceae > Sphingomonas

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_007006628.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_019521.1 [NCBI]
CDS location
range 12333 -> 15188
strand +
CDS
ATGCTTAGAATCTACGATCAGAACAGTCAAGAACTGTATAACAATTCAATTCTTCATCTAAATAAAGTTTCAGTTGGGCTTAATGGAAATAGAACTATCGTTATCGAAAGTTCATCTAATTTTACTGTAACTAGTCCTAACGAAAACGTAAAGTTAGCTAAACTGATAAATCAGGACAAAGTATCATTAGAACTTTCTAGGGATTATAATGTTCAGAATAGATTTACCCCAGTTTATTTGAACTTATATTCTGAGGAAGAATTTGAAAGTATTGTAGACTTATACGTAACTAATATCGACGGTGATTCTATAACGATTAAAGTTAAAACAGTATTCGAGGATAACTCAGACCGTTTGATGGTTTTATTGAATAATAATGGTGTACGTATATCAGATTTATGGTATAAGGCTATCAAATCTTCAGACCTTAATGAAATATCTTGTATCGTTCTTAATCAAAAACGTAGAGAATTCTTACTAGATTTATTGACACTTACTGGTTGTATATCAAGTTACGATAATCTATTCGCAGCTTTAGACTTCTTTGAATGGAGTGATATAGTTACAGTAAAGGAGTATTGGAAAGATGGGCAATTTGGAAAGTATCGTATAACTGACGTTAACAATAAAATCATAGACCGAAAACTATTAAATGATGGTTTCGTTAAGACTAATTGGTTAGGATTGTATTTCCAGCTAAATCAACCAGATGGTACATATGATTCAGACGGTTTTGCTAATTTCGAAGACGTAAACGTAACAGTTGAAGACTTATGGACAAAGTTATACTATCTGAAACAGATTTTAGAAGAAACGTTTTTACCAACTAATGTTAAGATTATCGATATAGTAGGTGAACATACTTCAATAGCTGGATTAGATAAAACTGTATGGGTTGATAAAACTGTAGTAACAGATATCGAACCAAATCCTTCAGATATCTTTGATGAATTCGATATCATAGCTAATTCAAAGGATCATATAATTATCGAAGATTCATATTGTTTACGTAAGTTACCTATTTATATCGATCTTAATGATGATATGATAAAACTTGATCCTAATGCTATATCTTCACAACCTAATGAACCGATATTCAAAATCATAAAGACTAAGGAAGAATTAAGTCAAATGACAGATTTCAAAGATTATGAAGTAATGACTCAGTTCTATCGTGGTGATTTCGCTTCAATAGAAGTTGTATTCAATGTTATCAATGAAGATTTAGCTGGATTGATGAATTACAAAATAGCTTTACAGGAAGATATAGATGATTCTGGTCAATTCAATCAAATCTATTTGTCAGAATTAATGTCATATTCTGAACTATTAGCTTCACAAAAACTAGGTATTAGAAAGGTTGGTAAGTTTAGATTAGTGATTTATGTTTTCAATGGATGGGGTGCTATGGATATGGTAAGTTCGACATTAGAATTTACAGTATCTATAGATTCGTTAAACATTCAACTTTATGAAATATCAGACAAGATTGATAAAGATTTGAAATATGATATTGGTTTCTATACAACTATTCCAACAGTAAATCAAGAACTTGTAGTACCGGATGCATTCGATCCTATATTCGATATATCTGATAGAAGTACTGCGTTTCCTGGAAGATACTTCAAAAATTCAATGACTGAAAGATATCTAGAAACTACTATCAATCAGTATAACATGGTTGAGAATCGACAATTACAAAAATGTAGGATTATCGATTATTCAACATATCATGAAGTTCTGTTATTTAGTTTTGATGATACTGAAACTAGCTTGAAACTGAAGTTATACGATAGACATGAATGGTCTGAAGTTTCAAATCCTTCAAGTAATCATTCTGAAAGGACTGAATTAGTTTCAAAACTAAATGATATAAGTTTCAGAAGTACGGATTGGAAGAATCCATTTAATCGATATACTTATCATCTTACAGAATATTCTGTTGACGGTAGTCTTACAAATACTATTCCAGTAATCGTAGCGTTTGCTAAAGAAGCTGATAATTTCTTTGAAAACATGGTGCTAATTGGAAACGCTTTATCAGAACCTATTGAGAAGGCTTATTTACGATTACTATCATTACAACATGCTGTATTTAGAATCGATAAACTTATAAATCCTGCTACTAGTGATTTGACTATCATTCAAGATAAAGTAACTACAGTTATCGAAAACGTAACTATCAATGATTTAGATGAATTGGTAACAGTTCTTAAGAATGCTCCGATTTCAAAAATGTCATTGACGGTTTCACCGAATGGAATGTTAATCGTTTCAAGTGATAAGGATATTGTTTTGAAACATGATTCGATTGGTACCGTTTATGATATTGTCAGAAACGTAGCTTACGATAATTTGAAATTCGCAAAAATCGGTCAGGATTTTCAAGTAACAATTCCGGTATTTGCAACACCCGAAAAACGATATAATACTTATGATTATGTTTGGGAAGTTATCGATAGATATTCAGGTGATGTAGTACATACAGAGAATAACAGAGTAATGTCATGGTTACCTTTTGATTTGGGTGTATATGATATTAAATTATCAATGTTAGACGTTCTTACAGGTAATTCAGTTATATCAGCATTTAAGAAAGGTGGAATACGTATTTCTGATAGACCTTTTACTGAAACTAGTTCTAACGTAATGTTTTACAATACTGAACAAACTAAGACTGTTTATAATACAACTTGCTTACTTGGAACGAATCCTGAACCTTTGATCTACAAAGTAAGGGAACGTAAGTATTCTTCTACAGTTTCACAAGAAGATGCTAATATGAAAGCTTTACGAGAAATCGAACAAAATGCTCAAGACTGGGCTAACGCTTATGGCTATTGTAGGGTGATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3abb65c7515a094d66ade60991b675ec0751b9177171c70a608b6df7a53b5e21
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4968
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50