Protein

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Genbank accession
AVH85827.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MAESNATQVILTDDGIKIINAQNTADNAASQAENANSAVLIAQSTANAAKSAADSTYDYANSEIAVQSTATAKAQSTADNAFSQAQTVGSQASAEIAVQSTATAKAQSTADNAFSQATTAIDNGKVTSQAVTDLKDGSKLTIADLENGLATKVANSDYASYKVQTASQIADRVSNSAFSTYKTQTADLIAQKVATSDFSAYQATTAKSIDSKVSSDDFNTYKTQTANLIDDKVSSSEYASDKTQTASEIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGAFSAYQTTTADLIASKVATKDFSAYQATTAKAIDSKVESSDFNTYKTQTDKMISSKVSTTDFNSQMTQLSSDINLRVTKDDLIDEINLQAGNTLISSSGQLTLSGKTIYFDTVNPVIIPSANITGTLNGKTINAGTQLNQYGNTSYPLTLSPDGSVTSTSFETISNETAALRTVIKNGTVKTNLRGMTQFATGMYSAADVSLGAGQLVLLEGYSTSQDPNFNATGLKTTGYAILDASTGLSLHGTTQAINFSGTDQDQTTGITMNSYGNIIGYPNATWWRIVSNSGSNIANFGIDKAGSNVIQFNRELDIGNFHINTGHTFTSADNGAIHFAMGKGGAADIYAGDVHYTSLVKSSLLSVKKDVQKADTAYWAQLINAIDLATYQYKTDDNTSHIRLSSIVDDVNDTKQWQLPDVFISRDEKGKLNGVDDSVLLNATLATVQEQQKEIDQLNGHNMELEARLNKLEAKLNG
Physico‐chemical
properties
protein length:746 AA
molecular weight: 79055,59350 Da
isoelectric point:4,70515
aromaticity:0,06702
hydropathy:-0,34933

Domains

Domains [InterPro]
DC_1194
STR
3–739
DC_1194
Coil
Unmapped
18–38
Coil IPR030392
Coil
Unmapped
709–743
Coil
AVH85827.1
1 746
Architecture
STR
STR 3-739 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage PM411
[NCBI] 		2079298 No lineage information
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AVH85827.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MG788324.1 [NCBI]
CDS location
range 63988 -> 66228
strand +
CDS
ATGGCGGAATCTAATGCAACTCAAGTCATCTTAACCGATGATGGCATTAAAATTATCAATGCTCAAAATACGGCTGACAATGCGGCTAGTCAGGCAGAAAATGCTAACAGTGCCGTTTTAATTGCACAGTCTACAGCTAATGCCGCTAAATCAGCTGCTGATAGCACCTATGACTATGCTAACTCTGAAATAGCAGTTCAGTCCACAGCTACCGCTAAAGCTCAAAGTACAGCTGATAATGCCTTTAGCCAAGCGCAAACGGTTGGTAGTCAAGCCAGTGCTGAGATAGCCGTTCAGTCCACAGCTACTGCTAAAGCTCAGTCTACAGCTGATAATGCATTTAGCCAAGCTACTACAGCAATAGACAATGGCAAAGTAACTAGTCAAGCAGTGACAGACCTCAAAGACGGTTCAAAGCTAACTATCGCTGACCTAGAAAATGGACTAGCTACTAAGGTTGCTAACTCAGACTATGCCAGTTACAAGGTTCAGACTGCTAGTCAAATAGCAGACAGGGTAAGTAATAGTGCTTTCTCAACTTACAAAACGCAGACAGCTGACTTAATAGCTCAAAAGGTAGCTACTAGTGACTTCTCAGCCTACCAAGCTACAACTGCTAAGTCAATTGATAGCAAGGTATCATCTGACGACTTTAACACGTACAAAACACAGACTGCTAACTTGATTGATGACAAGGTTTCTAGCTCGGAGTATGCGTCTGATAAAACACAAACGGCTAGTGAGATAGCGGATAGAGTAAGTAATAGTGCTTTCTCAACTTACCAAACACAAACTGCTAGCCAGATTGCTAGCAAAGTTGACAATGGCGCTTTCTCAGCATATCAAACAACTACTGCTGACTTGATTGCAAGCAAGGTAGCTACTAAGGACTTTTCAGCCTACCAAGCTACAACAGCTAAAGCAATTGATAGTAAGGTTGAGTCTAGTGATTTTAACACGTACAAAACGCAAACGGACAAAATGATTTCTAGCAAAGTTTCAACCACTGATTTTAATTCACAGATGACACAGCTAAGCAGTGATATTAACCTTAGAGTTACTAAAGATGATTTAATTGATGAAATTAATCTTCAAGCTGGTAACACATTAATTTCATCTAGTGGTCAACTGACGTTGTCTGGTAAAACTATCTACTTTGATACGGTTAACCCCGTGATTATTCCTAGTGCTAATATCACCGGGACTCTAAATGGTAAAACTATCAATGCTGGTACACAGCTAAATCAGTATGGCAACACTAGTTATCCGCTAACACTTTCACCAGATGGTTCAGTTACTAGTACGTCCTTTGAAACAATTTCTAACGAGACCGCCGCATTAAGAACGGTCATCAAAAACGGCACAGTTAAAACTAATTTACGTGGCATGACACAGTTTGCAACTGGCATGTATTCAGCGGCTGACGTTTCACTAGGTGCTGGTCAACTAGTATTACTAGAAGGCTATTCAACCTCACAGGACCCAAACTTTAACGCAACCGGACTAAAGACAACTGGCTATGCAATATTAGATGCCAGCACTGGATTAAGCTTGCACGGCACAACTCAGGCGATTAACTTTAGTGGGACTGATCAAGACCAAACCACTGGGATTACTATGAATAGCTACGGTAACATTATTGGTTACCCCAATGCGACTTGGTGGCGGATTGTTTCTAACTCGGGCTCAAACATAGCTAACTTTGGTATCGACAAGGCTGGCTCTAATGTGATTCAGTTTAACCGTGAGCTAGATATTGGTAACTTCCACATTAATACCGGCCATACGTTTACTAGTGCTGATAACGGTGCTATTCACTTTGCAATGGGTAAAGGTGGTGCCGCCGACATTTATGCTGGTGACGTTCACTATACTAGCTTAGTTAAATCGTCCCTATTAAGCGTTAAGAAGGACGTTCAAAAGGCTGACACAGCTTATTGGGCACAGCTAATTAATGCAATCGACCTAGCCACTTATCAGTACAAAACTGACGATAATACCAGCCATATTAGGCTATCTAGCATTGTTGATGATGTGAATGATACTAAGCAGTGGCAATTGCCAGACGTCTTTATCAGTCGTGACGAAAAAGGCAAGCTAAACGGAGTGGATGACTCAGTACTATTGAATGCCACCCTAGCCACGGTGCAAGAACAGCAGAAAGAAATTGACCAATTAAACGGTCACAACATGGAACTAGAGGCTAGATTAAACAAATTGGAGGCCAAATTAAATGGATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4df542bc4b2c5ded800e601b2a9e2bdaad2d37b94ec3c3f766afeb365857db95
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5593
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50