Protein

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Genbank accession
UCR81185.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,84
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIDAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTVVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMLIFANRLWHFWEAGNEERGIRVEPNTAQFQAQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDMIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSALGKPDQHSMEFRTSGDGFFVYNSNEKLWYVWDGDLQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETEWVLNDVLTFNGDISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETDAGIDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTTPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQSASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQQETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKAMEGLTGIARIATQVEFDAGTLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTYSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGTWNSQGDTLAPIFAEINSTPDAKFHPIVKQRLGQGTFSLGTVNDGTRDFKIHYLPSPGSLESFYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGITTSNGVSTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYRNEDGSFGDEVLGTSGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1349 AA
molecular weight: 146365,36660 Da
isoelectric point:5,43326
aromaticity:0,08228
hydropathy:-0,32557

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1143–1176
IPR048391 IPR048391
UCR81185.1
1 1349
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1142 | ATT 1143-1176 | STR 1177-1235 | ATT 1236-1297 | STR 1298-1331 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PSD2002
[NCBI] 		2880953 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UCR81185.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OK335775.1 [NCBI]
CDS location
range 38277 -> 42326
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGTGGATATAAGAAAGGGTTCGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGCGATATCGATGCTCCGGCAGGAACCTTTGTACCTGGTTATTGGACCGCTACCCGTACGGACCCTAAATGGATTACCGTAGCATCTCCTACACGCCAACTGGCTTCTGGTGAATATATTGCGGTGGATTCCGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCTTGCCTCCTAACCCTACAGACGGCGATACCGTTGTAATTAAAGATATCGGTGGACGTGTTGGTTATAACGAAATAAAGGTTCAGTCTAGTTCTGCTCCTGGTGGTGGTAACCAGAAAATTGTTCGTTTTGGTAATCAGTTTACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCTTATAACATGCTTATCTTTGCTAACCGTCTTTGGCATTTCTGGGAAGCTGGTAACGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACCGCTCAGTTCCAAGCTCAAGCCGGTGATAATGTTCTCCGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGTGATATGATTAAAACCGTTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAGTTCCACTTAATCGTTGAAACGTTTGATGCTTCGTCTGCATTAGGTAAACCTGATCAGCATAGCATGGAATTCCGTACCTCAGGCGATGGATTCTTCGTTTATAACTCTAACGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGCGACCTTCAAACTCGCTTACGTGTAATTCGCGATGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGCGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACCACGCCGCAGACGATTAATATCACATTACCTACAGGCGTAGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACGGTAAATATTAAGGCTGCTGTAGGAGATAAGATTGCTTCTTCTGTTCAATTGCTTCAATTCCCTAAACGTTCAGAATATCCACCAGAAACCGAATGGGTATTGAATGATGTACTGACCTTTAATGGCGATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCCCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTGGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTTTAGGTGTTATTGCCCTTGCGTCCCAGACTCAAGCAAACGTTGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTGGCAATTACTCCGCAGACTTTAGCTAATCGTGTGGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGTCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTGATGCTGGTATAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCGCGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCACTCCTGCGACTGCTAGGGACACCGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACGGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGCCAATCGGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCGGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTATGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTACGTTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCGACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGACAAAACCATCATCACTCCTTTGAAATTACACTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACCAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTTTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAGACCGAAACTACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAATTAACCGAAGGTGCTTTAACCTATTCAGGAAATAAAGTTACCGGTTCTGGTGTTAAATTTAACTCAGGTACAGGCCTTTATGAGAACGACGATACTGTTCTGAACGCAGCTAACTACCCTAAAACAGGTTATGCGGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGAGACGTTGACCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACGTTGACAAAACAATTGAACCTGGCCGCTCCTCTAGTGTCTTCTAGTACGGCTAATATTACCGGCAACACTATTTTAGGTTCTCTAGAAGTAACTGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGACCCCAATCTGGTGCAGGTACTTGGAACTCTCAAGGTGATACTTTAGCTCCGATTTTTGCCGAGATAAATTCGACCCCGGATGCCAAGTTCCATCCTATTGTTAAACAACGTTTAGGGCAAGGTACATTCTCTTTAGGCACTGTAAACGACGGAACTCGTGATTTTAAAATACATTATCTTCCATCGCCGGGTTCTTTAGAATCTTTCTACTGGACCTTTAATACGACTGGTGACTTTGCTGTTAATAGTGGTTCCATTAGTATTTCTAAGAATGCTAATATCACAGGTATAACCACTTCTAACGGTGTTTCTACAACTACATTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCATTGCAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCCACCGGACAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGCTCTGTTGGTGTTAAACCTACATTAGCATCGCAGGCCCCTACTGCAGAAACCGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATTCGGCTACATTTAACCTGTTCCCTGGTTATTGGACGATGAAAACTAAACGTCAGGTTAATATTGATACGGTCCAAACTAAACCTGCCGGTGTTTCTGATGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTGACAGAAACGGGTGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATCGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAGGTTCTCGGTACATCAGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGACTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACGGCAGATAACCCTCCTTCTGCGGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCTACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
941f59e9cf7a40f4ca4e5e55503d7a8217b932c7acb9364d948440e9334c2842
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5354
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Phages are superior to antibiotics on the recovery when treating E. coli O157:H7 infections Wang,Y., Subedi,D. and Tang,F. 2024-01 — GenBank