Protein

Genbank accession
XKC20828.1 [GenBank]
Protein name
colanic acid degradation protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATFPTYPATSLEQGVDLVIFSSNQLHDVINGSATESIETESGLIPTLRKALVDNFFFKSPLDWAQGTNETVFNQLRYFQNGVLSGYYYAPNATLVNPIPMQGTPVGDNNWVLWGLKTEQLATEVTPWVYSGATGYETVISPPYIFDSAIVTINGVIQVLGEAFRIEDSKIILSEPLGHDPATGLPNKLFAYIGKIVASADTDPNLENRLVSLETKTEELTESMDKVPLQTIARKYGLLDNEVAYATAGQSLTGIKALYDPVAQSSYTLPPNITGTLTSLSVSGVMTYSGGSVDLSALAVERGQFVHLPTSFGNNVTLTAKNQTIGRGAGRYRWAGSLPKSILASDTLETSGGLGPNAWVLTNTEGLLTPRGGTYNDLFDVVYLSEFANNTTTYTTPEAAFQAALLAAKASKSKILDAYGCDMTFTTSSFDIQDITLRGGVFRGQRDYRVQNATVEGTTFRNSRVMYWGGAVRMFDCLWDGAPRPGQVGSLVFQGNPISGTFEIDNCTFKNGLYGILQQGTGEPVTRGVFRNLTFMDMQGDAIELNVINKHYDDGCVIENIYLSNIDGTNAPIPLSNWGIGIGVAGKGPYGYGIPDDQYCKNITIRNVFAKRCRQIVHVEVGRNISIENIHGDPDQTVSVGTGLATGAVVMYGSKDFTIDGVYGEPKTDGSTLASNIRMIYLEWGTNAVLDEEGNPVVPAQGRPSNPCFNYSVRNIHTKTGRVFAGVSAGPGYENRVSFENIRCAALQLFGIASWLSMSNITCNIFDCVGQPESGPGTFYDGFFRREKSVLEMVNVNCYPDGKTMVTGRPQWSRCRYSDIHRVNCNVEANMYTNIAGGIGAIVGTTGKVYYLEPNPSRNIDGMHFPTGKEFDKGDMIVKADNTFFLVTTSGAYIPDIPAFGIRATQAGDTFLTQNLTPNGTATNASWLYHYPLSAGTRIRIPGAGVGGADLDTVITRAPYQDNDTWTNPVKIDIADPIVTPTSAGVRIKTIPNDSSNVSVGNTAVIRPTPVVDVPTT
Physico‐chemical
properties
protein length:1017 AA
molecular weight: 109950,36490 Da
isoelectric point:5,02504
aromaticity:0,09538
hydropathy:-0,14484

Domains

Domains [InterPro]
IPR058969
10–113
IPR058969 G3DSA:3.30.2020.50 G3DSA:2.10.10.80 IPR011050
IPR040775
302–361
IPR040775 IPR012334
XKC20828.1
1 1017
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage MirsaeidiM_Esher1
[NCBI] 		3374286 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XKC20828.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ438048 [NCBI]
CDS location
range 49604 -> 52657
strand -
CDS
ATGGCAACATTCCCAACGTATCCAGCAACGTCTCTTGAACAGGGCGTAGATCTGGTTATTTTCTCGTCCAATCAACTTCATGATGTTATTAATGGAAGTGCGACAGAAAGTATTGAGACAGAATCAGGGTTGATACCAACCCTGAGAAAAGCCCTTGTTGATAACTTTTTCTTTAAAAGCCCATTGGATTGGGCGCAAGGCACAAATGAAACGGTTTTTAACCAACTACGTTATTTTCAGAATGGGGTATTGAGCGGTTATTATTATGCTCCTAATGCTACATTGGTAAACCCAATCCCTATGCAAGGTACTCCAGTAGGAGATAACAACTGGGTATTGTGGGGATTGAAGACAGAACAATTGGCAACAGAAGTCACACCTTGGGTATATTCTGGTGCAACTGGTTATGAAACAGTAATCAGTCCTCCTTACATCTTTGATAGTGCTATTGTTACGATTAATGGTGTTATTCAGGTTCTGGGGGAAGCTTTCCGTATAGAAGATAGTAAGATCATCTTATCTGAACCTTTGGGACACGATCCTGCAACAGGACTGCCAAACAAGCTTTTTGCTTATATTGGTAAAATCGTAGCTTCAGCAGATACAGATCCTAATCTAGAGAACCGTCTTGTTAGTTTAGAAACAAAAACGGAAGAACTAACAGAAAGCATGGATAAAGTCCCTCTGCAAACTATTGCTCGTAAATATGGTTTGTTAGATAATGAGGTGGCTTACGCAACAGCAGGTCAATCGTTAACAGGGATTAAAGCTCTGTATGATCCGGTAGCACAGTCTTCCTACACATTACCTCCTAACATCACAGGAACTTTAACATCTTTGTCTGTTTCTGGAGTAATGACTTATTCTGGAGGGTCTGTAGATCTTTCTGCACTAGCTGTTGAACGTGGACAGTTTGTCCATTTGCCTACAAGCTTTGGTAATAATGTAACTCTGACAGCTAAAAATCAGACGATTGGACGTGGTGCTGGTCGTTATCGTTGGGCTGGAAGTTTACCAAAAAGTATTTTGGCCTCCGATACATTGGAGACAAGCGGTGGATTAGGTCCAAATGCATGGGTTTTAACTAATACAGAAGGACTGTTAACCCCTCGTGGTGGAACATACAACGATCTATTCGATGTTGTCTACTTGTCAGAATTTGCTAACAATACAACTACCTATACCACACCAGAAGCAGCTTTCCAGGCGGCACTGTTAGCAGCAAAAGCTTCGAAAAGTAAGATTCTCGATGCTTACGGTTGCGATATGACTTTCACGACAAGCTCTTTTGATATTCAAGATATCACTTTGCGTGGGGGTGTGTTCCGTGGTCAACGCGACTATCGTGTGCAGAATGCTACAGTAGAAGGCACAACTTTCCGTAACTCTCGTGTTATGTATTGGGGTGGTGCTGTGCGCATGTTCGATTGTTTGTGGGACGGTGCTCCTCGCCCAGGTCAAGTTGGTAGCTTGGTATTTCAAGGCAACCCAATATCAGGTACTTTTGAAATTGATAATTGTACTTTTAAAAACGGGTTATATGGCATCCTTCAACAAGGGACAGGGGAACCAGTAACACGCGGTGTCTTCCGTAACCTTACCTTCATGGACATGCAAGGTGATGCAATAGAACTGAACGTCATCAATAAACATTATGATGATGGTTGTGTGATTGAGAATATTTACCTGTCTAATATCGATGGGACTAACGCTCCTATTCCTCTGTCCAACTGGGGTATCGGTATCGGTGTAGCTGGTAAAGGACCATATGGTTACGGAATCCCTGATGATCAATATTGTAAGAATATTACAATTCGTAACGTTTTTGCAAAACGTTGCCGTCAGATTGTCCACGTAGAAGTTGGTCGTAATATCTCTATCGAAAACATTCATGGCGATCCAGATCAAACCGTATCTGTTGGGACAGGTTTGGCAACTGGCGCAGTTGTAATGTATGGAAGTAAAGACTTTACGATTGATGGTGTTTATGGAGAGCCTAAAACAGACGGTAGCACACTTGCAAGTAATATCCGTATGATTTATTTGGAGTGGGGAACTAACGCAGTTCTGGACGAAGAGGGTAATCCGGTAGTTCCGGCACAGGGTAGACCTTCAAACCCATGCTTTAACTATTCTGTTCGTAATATTCACACCAAAACTGGGCGTGTTTTTGCAGGAGTTTCCGCTGGGCCAGGTTATGAAAACAGAGTTAGCTTTGAAAATATTCGTTGCGCTGCATTGCAGTTGTTCGGTATAGCTTCTTGGCTTTCAATGTCTAACATCACCTGTAATATCTTCGATTGTGTTGGTCAACCTGAATCTGGTCCAGGGACATTTTATGATGGATTCTTCCGTAGAGAAAAATCTGTTCTTGAAATGGTTAACGTAAACTGTTACCCAGATGGCAAGACGATGGTTACTGGTCGTCCACAGTGGAGCCGTTGCCGTTACTCGGATATTCATCGTGTCAACTGTAATGTTGAAGCTAATATGTATACCAATATCGCAGGTGGTATTGGAGCTATTGTAGGAACAACTGGCAAAGTTTATTACTTAGAGCCTAATCCTAGTCGAAACATTGATGGAATGCATTTCCCAACAGGGAAAGAGTTTGACAAAGGTGATATGATAGTCAAGGCGGATAATACGTTCTTCCTTGTAACAACAAGTGGGGCATATATTCCAGATATCCCAGCTTTCGGTATTCGAGCTACACAGGCAGGAGATACCTTCCTGACACAGAACTTGACTCCTAACGGGACAGCAACAAATGCTTCTTGGTTGTATCATTACCCTCTGTCAGCAGGGACACGTATCCGTATTCCTGGTGCTGGCGTAGGTGGAGCAGATTTGGACACAGTTATTACTCGTGCACCTTATCAAGATAATGATACGTGGACTAACCCAGTTAAAATAGACATTGCAGATCCAATTGTAACGCCTACAAGTGCTGGAGTTAGAATTAAAACCATACCTAATGATTCCAGTAATGTTTCTGTAGGTAATACTGCGGTTATTCGCCCAACGCCAGTAGTAGATGTGCCAACAACCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
6c58e70094e50edda1a1250eea8aba89587f5d46009d0d16bb77ed76bb97c263
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2354
Evidence 0,2354
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Literature

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