Protein

View in Explore
Genbank accession
XKX17577.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATYPVYPATTFTQAVELTIFASNQLHDVINGDALTTVETENGDIPTLRKALVDNFYFKTPINWVEGESATVFNQLYYFDGTLATSGWYYAPQATLDNPIAMGSTPVDDDNWRLYQTSTQTIPAQVYPWDTEITQITNSIVPPYEFDSAIVTYNGVTLVPNKDYTIANNTITFTPALTPEPEAEVPDILFCYLGKVQEGNASTNYVTYISLSAPTAADIIGTASGLSVQEVLDQSVKNTITFTSGGTLYSKLDRISDGTYLYYWTGTYPKTVPPASTVNNTGGETLGGWACDTSLPLRQNLLGKDGLKWIGKCSDVATLRTIEPTISGQSIILERAVVGGPLLNVVITHNPTPSDTIDNGYSRFVTAGGKVWDADTSNGTNVFLAGYSDTLNNLAQCLNLIINDKVSKVVSRGFVAGGIGSKLIVPANPRADGVTTFTMTTAVKIPTFLALHLPQGCILDYSTFNSATALVLSNEFTGLTQTMMFLNNGPGWGSGAGANAGHNEGGIFGNGALLKGGNTISNPTFTTYPGLRVGNVTYPSGSYAHCSGARVFDLRVSGFAEGLRFGSVDTYIPWIRGCHFTFNTVGIATKTTISGSTAQWANSGERMLVESCLIADNTSHALSRDDRGDFITLKDCNIDYNGGDVVFCGPENLGKTIISGGHVEGNTGRLLNCPTRTTSAGENNLKMTDAVQWYPNKGVGDSYGGVRDIVFGTTIRTVLDMDNVDIFCRAPYVNSAYSSWKAYNTSNLARIRVKYPNSGQTYRFLPSYDGQYGYKINNVLLFTGTENANVPTTKGLSDFWCIKTGSATCVYGGVGDADSDGLIPVKITLTATTETVQLLYSLPQYPARNTQHAHGFCSIKAASATGAVNVSAVARSISSVTRTANITTGAITETENLYGVNQSSSQNILTSLANSTITITANDYMGTQPLAVQLTGGQYSYLGFLFTGFVGTIYVKLPVWMFSDNHPSFGYL
Physico‐chemical
properties
protein length:972 AA
molecular weight: 104319,58620 Da
isoelectric point:5,04215
aromaticity:0,10288
hydropathy:-0,07428

Domains

Domains [InterPro]
DC_0194
STR
1–443
DC_0194
IPR058969
ATT
10–115
IPR058969 IPR040775 DC_0903
G3DSA:2.10.10.80
ATT
236–303
G3DSA:2.10.10.80
XKX17577.1
1 972
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-115 | STR 116-235 | ATT 236-303 | STR 304-968 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XKX17577.1
1 972
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 394 394 0,9967
Central domain 395 736 343 0,9917
C-terminal 737 972 235 0,9596
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-394
Central
395-736
C-terminal
737-972

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage phi1_175008
[NCBI] 		3127744 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XKX17577.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ360875.1 [NCBI]
CDS location
range 87474 -> 90392
strand +
CDS
ATGGCTACTTATCCTGTCTACCCGGCAACAACGTTTACTCAAGCAGTTGAGTTAACAATTTTTGCATCTAACCAATTACATGATGTTATTAATGGTGATGCGCTGACGACAGTAGAAACAGAGAATGGAGATATTCCGACTCTACGTAAAGCTCTCGTAGATAATTTTTATTTTAAGACACCTATTAACTGGGTAGAAGGAGAGTCAGCTACTGTTTTTAATCAGTTATACTATTTTGATGGTACTCTAGCAACTTCAGGGTGGTACTATGCTCCTCAAGCCACCTTAGATAATCCTATTGCTATGGGAAGTACGCCTGTGGATGATGATAATTGGAGATTATATCAAACCTCCACTCAAACTATCCCAGCACAAGTATATCCTTGGGATACAGAGATTACCCAAATAACAAATTCTATTGTTCCGCCATATGAATTTGATTCTGCTATTGTAACATATAACGGCGTTACTTTAGTTCCAAACAAAGATTATACTATTGCTAATAATACTATTACTTTTACTCCGGCACTTACACCAGAACCGGAAGCAGAAGTACCTGATATCTTGTTCTGTTATCTTGGTAAAGTACAAGAAGGTAACGCTAGTACTAATTATGTAACTTATATCAGTTTATCTGCGCCTACAGCAGCAGATATTATAGGTACAGCTTCAGGATTATCTGTACAAGAAGTTTTAGATCAGAGTGTTAAAAATACTATTACTTTTACTTCAGGCGGTACTTTATATTCAAAACTGGATAGGATTAGTGATGGTACATATTTGTATTACTGGACTGGGACATACCCAAAAACCGTTCCTCCAGCTTCTACTGTAAATAATACAGGCGGTGAAACATTAGGGGGATGGGCTTGTGATACATCTTTACCACTTCGTCAGAATCTTTTAGGAAAAGATGGTTTAAAATGGATTGGGAAATGTTCAGATGTTGCCACTTTACGTACTATTGAACCAACGATATCTGGACAAAGTATTATCCTAGAACGAGCTGTAGTTGGTGGCCCACTTTTAAATGTGGTCATTACACATAATCCTACACCATCAGATACCATTGATAATGGCTATAGTCGATTTGTTACAGCAGGTGGAAAAGTCTGGGATGCAGATACTTCTAATGGTACTAATGTATTCCTTGCGGGATATTCAGACACTTTAAATAACCTTGCACAGTGTTTAAATTTAATTATAAATGATAAAGTATCTAAGGTTGTTAGTCGTGGTTTTGTTGCAGGTGGGATTGGTTCTAAATTAATAGTCCCAGCTAATCCTCGTGCGGATGGGGTTACAACATTCACAATGACTACTGCGGTAAAAATCCCAACGTTTTTAGCTTTACACTTACCCCAGGGATGTATATTAGACTATTCTACATTTAATTCTGCAACTGCTTTAGTATTATCTAATGAGTTTACAGGTTTAACTCAAACAATGATGTTCCTTAATAATGGCCCTGGTTGGGGTTCAGGTGCAGGAGCTAATGCGGGTCACAATGAAGGCGGTATTTTTGGTAATGGTGCTTTATTAAAGGGCGGGAATACCATTAGTAATCCTACTTTCACTACTTATCCGGGTCTGCGTGTAGGTAATGTTACCTATCCAAGTGGTTCTTATGCTCACTGTAGTGGAGCACGTGTGTTTGATTTACGTGTTTCTGGTTTCGCAGAAGGTCTACGTTTCGGCTCTGTTGATACATATATACCCTGGATTAGAGGGTGTCATTTTACCTTTAATACTGTTGGTATTGCAACAAAGACAACTATTTCTGGCTCTACTGCGCAGTGGGCTAACTCCGGTGAAAGAATGTTGGTAGAATCTTGTCTGATCGCTGATAATACTAGCCATGCTCTCTCGAGAGATGACCGTGGAGATTTTATTACCCTTAAAGATTGTAATATTGATTATAATGGTGGTGATGTTGTCTTCTGTGGCCCAGAGAATTTAGGTAAAACCATAATATCTGGAGGACATGTTGAAGGAAATACAGGAAGACTTTTAAATTGTCCTACAAGAACAACTTCAGCAGGTGAAAATAACCTTAAAATGACAGATGCAGTTCAGTGGTATCCTAATAAAGGTGTTGGTGATAGTTACGGTGGCGTTCGTGATATTGTATTTGGAACAACTATCCGTACTGTTCTTGATATGGATAATGTCGATATTTTTTGTCGTGCACCATATGTTAACAGTGCATATTCATCTTGGAAAGCATATAATACATCTAACCTTGCAAGAATTCGTGTTAAATATCCAAATAGTGGTCAAACTTATAGGTTCCTTCCCTCTTATGATGGACAATATGGTTACAAAATAAATAATGTTCTATTATTTACAGGGACTGAAAATGCTAATGTTCCTACCACAAAAGGGTTAAGTGATTTTTGGTGCATTAAGACAGGCTCTGCTACTTGTGTTTATGGTGGTGTTGGTGATGCAGATAGCGATGGACTTATTCCTGTTAAAATAACATTAACAGCTACAACTGAAACTGTACAGTTACTTTATAGTTTACCTCAATATCCGGCACGTAATACACAACATGCACATGGATTCTGTTCTATTAAAGCAGCATCCGCTACAGGAGCAGTTAACGTTTCAGCAGTAGCTAGATCAATTTCAAGTGTAACTAGAACAGCTAACATAACAACAGGAGCTATAACGGAGACTGAGAATCTATATGGTGTTAACCAAAGTTCTTCGCAGAATATTTTAACATCTTTAGCTAACTCGACTATCACTATAACTGCCAATGATTATATGGGGACTCAACCATTAGCAGTACAGTTAACTGGTGGTCAGTACTCATATCTTGGATTTCTGTTTACTGGGTTTGTTGGTACTATATATGTAAAACTTCCAGTTTGGATGTTCTCTGATAATCATCCATCTTTTGGATATCTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
fa4d4cd22f020e2f7edf6cfe8880d7f9b28290bb7ebfb895d070854b2f8bd99c
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7054
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The complete genome of Klebsiella pneumoniae phage phi1_175008 Li,J., Feng,Y. and Zong,Z. 2023-04-18 — GenBank