Protein

Genbank accession
ABA47003.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,83
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKTIQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYIIDNRPGDVLYTNVAPIDENSNLDLTSPNNVLYKFNSVEGGVIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTILPSKNINTEEQSPSRTAIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSTETLAPKYSHHKLTCFEFADGRNTLSDLITGGTVPNADYSAVPNILERTDLEIYYQKVSKAFATIPDTSGDPTQDQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGQTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINVSGVTGSTGPQSDIDATLYNGSFTVTSASGNVFTYQMQGEPTGNAVGSNISVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMNADGSKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNESTGNYDVATAGDGAHLDGFAEYRRGWGHRHIVCSNDAFIQSVSVFAVGYDTHFTAESGGDMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAQAFSKDKAGEITHIVPPKALQVISTTATGTSGESSITLVNDGSIEGVIEGTVVSGDGIGSGATVGSVNRSTRVVTLTQPNTATVNGNVIFGEEVSINWVNIDIQRTKVINSALAGQGGTAGTRLYLYGYTTQASPPTTRVQGFTVGARQDGEGANAVADTINCLLVAAGANSASVQQASIAPYGPSVSGVAAGQVGSPIQYDENTYTISGSTQVGGWYLSVSATDNEIYTTLNTNNQYNNVNFTPTTFLKRIPDSRDLQDRTYRVRMVIDKDKTNPLPRNPISGYVMQPLNSDTTNYNLNRAFYIYDIEVVQEFERGVKDGIFYLTLLCASIAPSTSNFNNRKFSQNVNEVYPTFDRDNPIADPNAAVSVADNQTIGLVNSTDGATPTPNLDPKRSITKESIQFLLTDTGWTQPGTTPNYDSINERLSSINLTARAGDEETRKINIRENNDGTVAPIPIELRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLTQNQVRFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVIGEENTTIETFSELVLTDKLTVIGGASNQLESIFAGPVTFQGQTTFTSNLSAKKITYFNQDGTVIKQSLLAPEDANGLPDFSNITGYDTPADGDLVYNINWTPGKSLGWIYSGQTWYEFGLTDTGFINIDPNNGSPIIGIGTAANSNFRVNVDGNVRIDGNVSGTGRGLVGSDKYITKSYTGDGATLTFAVTTYVAPYQHTDDSLLVFLNGVAQIAGTNYTVDSLGANVVFTDAPQSTDTVHILELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1317 AA
molecular weight: 142179,28960 Da
isoelectric point:4,70447
aromaticity:0,09188
hydropathy:-0,28998

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage syn9
[NCBI] 		382359 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales >
Host Synechococcus sp. WH 8012
[NCBI] 		166313 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ABA47003.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
DQ149023 [NCBI]
CDS location
range 23951 -> 27904
strand +
CDS
ATGGCACTAACCCGTCTTAAGAATATTATTACTTCCCGTACGGGAAGAATTATCTACGTTAACCCTGACGATTTTGATGCCTCTGATGCAATTGACAACAGAGGCAACTCGGCATTGCGTCCGTTTAAGACTATTCAGAGAGCATTTCTTGAAGTTGCTAGATTTTCGTATCGAGTAGGTTTGTCAAACGACGAATTTGACGCCTTCTCGATTATGCTGTATCCAGCAGAATATATTATTGATAATAGACCAGGCGATGTGCTTTACACTAACGTTGCTCCCATTGATGAAAACTCTAACCTGGATCTGACATCACCCAATAACGTATTATATAAGTTTAACTCTGTAGAAGGTGGCGTTATCGTCCCCAGAGGTTGCTCTCTGGTTGGCACAGACCTTAGACGTACTAAGATCATTCCTAAGTATGTGCCCTATCCTACCATTCTACCTTCCAAGAATATCAACACAGAAGAGCAATCACCATCCCGCACTGCTATCTTTAAGGTAACGGGTGGTACTTACTTCTGGCAATTCTCCTTCTTTGATGGTGCCGAAGAAGGTGTGTATTTCAAACCTGATAGCACTGAAACGCTTGCACCTAAGTATTCGCACCATAAACTTACCTGCTTTGAGTTTGCTGATGGTCGTAATACTCTTAGTGATCTTATCACTGGTGGCACTGTCCCTAACGCTGATTATTCTGCTGTCCCCAACATTCTAGAGCGGACAGACCTGGAGATTTACTACCAGAAAGTATCGAAAGCATTTGCTACAATTCCTGATACATCTGGTGATCCCACACAAGACCAAATTCAGGCAAGGGTTGAAGAAAACAGAATCGTTGGTCCTATCTCTGATGAATACCGAGTCCTTCAGATCACAAGAAATGGTCAGACAGCAACGGCAGTTACTGTTGACGAGTTTGATAACCCCAGAGACCACGGATTTAGTGTTGGCGTTAACATTAACGTTTCAGGTGTTACTGGATCAACTGGACCGCAGTCCGATATTGATGCAACGCTTTATAACGGATCTTTCACAGTCACGTCCGCATCTGGTAACGTTTTTACTTACCAGATGCAAGGAGAACCCACAGGAAACGCTGTAGGATCTAACATCTCCGTAAAAACTGAAATTGATACTGTTGACTCTGCATCTCCATATGCTTTCAACCTGTCACTGAGAAGTGTCTGGGGTATGAATGGTATGAATGCAGACGGTAGCAAAGCAACTGGTTTCAAATCGATGGTTGTGGCGCAGTTTACTGGTCTGAGTCTTCAGAAAGATGACCGTGCATTTGTAAGATATAATGAATCAACTGGTAACTATGATGTAGCAACTGCTGGTGATGGTGCTCACCTGGATGGTTTTGCTGAATATCGTAGAGGTTGGGGACACAGACACATTGTTTGCTCTAATGATGCATTCATTCAGTCAGTTTCGGTCTTCGCTGTTGGATACGACACACACTTCACTGCTGAAAGTGGTGGTGACATGTCAATTACCAACTCTAACAGTAACTTCGGTAACACAGCTTTAAGATCCGCTGGATTCAAGGCACAGGCATTCTCGAAAGATAAAGCAGGTGAAATTACTCACATTGTCCCACCTAAGGCACTTCAGGTTATTTCTACTACTGCAACTGGCACATCTGGTGAATCTTCAATCACATTAGTTAATGATGGATCGATTGAAGGTGTCATTGAAGGCACAGTAGTAAGTGGTGATGGCATTGGTTCTGGTGCTACAGTTGGATCTGTCAACAGAAGCACCAGAGTCGTTACACTGACTCAACCAAACACAGCAACTGTCAATGGTAATGTAATCTTTGGTGAAGAAGTTTCGATCAACTGGGTAAACATTGACATTCAACGCACCAAAGTAATTAACTCTGCTCTTGCTGGACAGGGTGGCACAGCAGGAACAAGACTTTACCTCTATGGATATACGACTCAAGCTTCACCTCCTACTACAAGGGTCCAAGGTTTCACCGTTGGTGCTCGTCAAGACGGGGAGGGTGCTAATGCTGTCGCAGACACAATCAACTGCCTCTTAGTTGCTGCTGGTGCAAATTCTGCATCAGTCCAACAAGCATCTATTGCACCTTATGGTCCTAGTGTATCTGGTGTTGCTGCTGGACAAGTTGGATCTCCTATTCAATATGACGAAAACACATATACAATCAGTGGTAGCACTCAGGTTGGTGGTTGGTATCTGTCGGTATCTGCTACTGACAATGAAATTTACACAACATTAAACACAAACAACCAATACAATAACGTTAACTTCACTCCTACAACTTTCCTCAAGAGGATTCCTGATAGCAGAGACCTGCAAGACAGAACTTATCGTGTCCGTATGGTAATTGATAAGGATAAGACGAATCCCCTGCCCCGTAATCCTATCAGTGGTTATGTAATGCAACCTCTGAATAGTGATACGACAAATTACAACCTTAATCGTGCATTCTATATCTACGACATTGAGGTTGTCCAAGAATTTGAAAGAGGTGTTAAAGATGGAATCTTCTACCTTACCTTGCTTTGTGCATCTATTGCACCTTCGACTTCTAATTTCAACAACAGAAAATTCTCTCAAAATGTCAACGAAGTCTATCCTACGTTTGACAGAGACAACCCTATTGCTGACCCTAATGCTGCGGTTTCCGTCGCTGACAATCAAACTATCGGACTCGTCAATTCGACAGACGGAGCAACACCCACACCAAATTTAGATCCTAAGAGATCTATCACTAAAGAATCAATTCAATTCTTGTTGACAGATACTGGTTGGACACAACCAGGCACGACACCTAACTATGATTCTATCAACGAAAGATTGTCTTCTATCAATTTAACTGCTCGTGCTGGTGATGAAGAAACTAGAAAGATCAATATCCGCGAAAACAATGATGGGACTGTCGCACCTATCCCAATTGAATTACGGAGGCACTCGATCCTTAGATCTGGTAACCACACGTTTGAATACCTTGGTTTTGGTCCTGGTAACTATTCAACAGCATTCCCTCAGACACAAGTAGAAACACTGACACAGAATCAGGTTAGATTCTCACAGTCTATCAAGGAAGAAGCAGGTGTTGCTTTCTATTCTGGTCTTAACTCTAACGGTGACCTGTTTATTGGTAACCAAGTTATCAACCCTGTTACTGGTCAGATTACTAACGAAGATATTGCACAACTGAATGTCATTGGTGAAGAAAACACTACTATTGAAACATTCTCTGAGTTGGTCCTTACCGACAAATTGACTGTTATTGGTGGTGCATCCAACCAGTTGGAATCTATCTTTGCTGGTCCTGTTACTTTCCAAGGACAAACTACCTTCACTTCCAATCTTTCTGCTAAGAAGATCACATACTTCAACCAGGATGGCACGGTCATCAAACAATCCTTACTGGCACCTGAAGATGCAAATGGACTCCCAGATTTTAGTAATATCACAGGATACGATACGCCTGCTGATGGTGATCTTGTTTACAACATCAATTGGACACCTGGCAAGTCGCTTGGTTGGATTTACTCAGGTCAAACATGGTACGAGTTTGGTCTCACGGATACTGGTTTCATCAATATTGATCCTAACAACGGTAGCCCAATTATCGGTATTGGTACTGCTGCTAACTCTAATTTTAGAGTAAATGTTGATGGTAACGTTAGAATTGATGGTAACGTCTCTGGCACAGGTAGAGGACTAGTTGGATCCGACAAATATATTACTAAATCATATACTGGTGATGGTGCCACGTTGACATTTGCAGTCACAACTTATGTTGCTCCTTATCAACATACCGACGATTCGTTGTTGGTATTCTTGAATGGTGTAGCACAGATTGCAGGCACTAATTATACCGTTGACTCTTTAGGCGCAAACGTGGTATTTACTGATGCACCACAATCGACTGATACGGTGCATATTCTTGAGTTGCCTATCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
93d35d09d5f04472cb6a0a0db3594a822e648ba0b60a81e86960e95f3a46e3ad
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,3775
Evidence 0,3775
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Bacteriophage Syn9 Hendrix,R.W., Pedulla,M.L., Peebles,C.L., Pope,W., Houtz,J.M., Smith,A.L., Hatfull,G.F. and King,J.A. 2003-10 — GenBank