Protein

Genbank accession
YP_010278368.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,55
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRAVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVNTAAGNDITFTLPTSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEDGTHSIEGRTSIDGFLMYDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQDTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTAIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDARIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQVETVAGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTLVRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQSLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTDGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVSVWGNQFSGESNTTRSTVFEVSDETSYHFYSQRDKDGNIAFSINGTVMPINVNALGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSSNAFRAINGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLTINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGVKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1290 AA
molecular weight: 140349,91090 Da
isoelectric point:5,19653
aromaticity:0,07519
hydropathy:-0,30682

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
981–1093
IPR048390 IPR048391
YP_010278368.1
1 1290
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage KNP5
[NCBI] 		1871710 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010278368.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055713 [NCBI]
CDS location
range 150880 -> 154752
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTGCCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACCTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCGGGAGCTTTTAATAGCGTACGTTGGAGAGCATTACGTACTGATGCAAACTGGACAACTGTTTCGTCAGGACCTTATCAATTAAAGTCAGGTGAATCAATTTCAGTTAATACTGCAGCAGGAAATGATATCACATTTACTTTGCCAACTTCTCCAATTGATGGAGATACTATCGTTCTTCAAGATATTGGTGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGCGAACAAGTACGATCAGTACTAATGACCCATCCAAAATCACAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTGGCTGATTATAGCAGAGAAGCGGTAGTTGTGACGCCAGCAAGTCTCTACCAGGCGCAGTCAAACGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCCGCTGCGCCTATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAATTAAATCCTCTTTATCATACAATTGTTACTACATATGATGAAACTACATCAGTACAAGAAGATGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCTATTGACGGTTTCTTGATGTATGATGATAACGAAAAACTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGTATCATAACGACTAATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAACTCAAACGATTGAGCTTCAGCTTCCGACCGATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGGCAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGTTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTTGCTTATATAGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACAGTTGAAAGAGTTGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTGATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACCACTGCTCAAGTGAATCAGGATACTACATTCTCTTTTGCTGACGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACACAGCAAGAAACTAACGCAGGTACTGATGATACTGCAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAGGGTTCTGAATCATTATCAGGTATTGTAACCTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCTCTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGCAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGCGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAAAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTGGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTCTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCGCAAGAAGGCGTTATTAAAGTTGCAACTCAGGTTGAAACTGTAGCTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTACAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCAACTACTCTGGTAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCCGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACCGTTGGTTCAACACAGTCATTAGAATTATACGAAAAAAATAGCTATGCAGTATCGCCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGCAGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCCCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCGCAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACACAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGATCAGTTTCGGCAAATAGTACACTAACTATTTCTAATACTGATGGAACAGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACGAACCCGGCTCAAACGATGACAGTCAGCGTGTGGGGGAATCAATTTAGTGGGGAATCAAACACAACACGTTCTACCGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACATCTTATCACTTTTATTCTCAACGCGATAAAGATGGTAATATAGCATTTAGCATTAATGGTACTGTAATGCCAATAAATGTGAATGCTTTAGGTTCTTTGAACGCGAACGGCGTTGCAACATTCGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTTATCAGTAAATCGTCGAATGCTTTTAGAGCAATAAACGGTGATTATGGATTCTTTATTCGTAATGATGCTGCTAACACCTATTTTATGCTTACTGCATCGGGCGATCAGACTGGTGGATTTAATGGATTACGTCCATTAACTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGCGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTGTTAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCGCCGACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTTACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTCGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACCCCAGAAGCACGTACCACTCGCTGGACGCGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCACAACCATCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
142bdcac756cf0471937b3735c378a4d4fb5a7cf98a0081eb44df2b2b120be01
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7908
Evidence 0,7908
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Bacteriophages as an alternative to combat enteric pathogens Parmar,K., Dafale,N. and Purohit,H. 2018-01-12 — GenBank