Protein
- Genbank accession
- CAL1328734.1 [GenBank]
- Protein name
- Long tail fiber
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSTPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIISTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQQGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVRVWGNQFSGELDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1289 AA molecular weight: 140236,74860 Da isoelectric point: 5,40206 aromaticity: 0,07370 hydropathy: -0,32149
Domains
Domains [InterPro]
IPR048390
980–1092
980–1092
1
1289
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAL1328734.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ034683.1
[NCBI]
CDS location
range 148060 -> 151929
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCGGCAGGAGCTTTTAATAGCGGACGCTGGAGAGCATTACGTACCGATGCTAACTGGATTACGGTTTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCTGGTGAAGCTATTTCAGTTAACACCGCAGCTGGTAATGATATTACATTTACTTTACCATCTACCCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCGGTGCAAAGTATTGTAAACTTCAGAGGTCAACAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGCTAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGTAGTTGTAACACCAGCGAATACTTATCAAGCACAATCAAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAACTGAATCCACTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGTATCATATCGACTAATTCAAACATTCGTCCAAATGAAGAAGTCATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAACTCAGACAATTGAACTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTACTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTTACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAGGCTCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATTACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATACAGGAACCGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCAGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACAAATGTTTATAATAAAAACACTAATAACTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGTCAACAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAGGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACACTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAGGTCGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGGACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCAATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGCTATGCGGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCTAAAGCTGCTGATACAAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACAAACCCAGCCCAAACGATGACTGTTAGAGTGTGGGGAAATCAATTTAGTGGGGAATTAGATACAACACGTTCTACCGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACATCTAGTCATTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCCGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCGATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGCGTAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTTAGAGCAATAAATGGCGATTATGGATTCTTTATTCGCAATGATGCTGCTAACACCTATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGATTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACACAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACACCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCGTCTGATATTGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
537c7e1d8d44dfa6cf7587e85c0f867da6abc47e88c61391879dc4482bc7416d
Literature
No literature entries available.