Protein

Genbank accession
AGN33579.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MARTVPGTGAVIEPIFDDVFGVKAVKVVNGGSGYDVADPPRLVITGCGIPTAEALLYPIIDEDSGKIVHVRVLDRGRGYDPLRLQIIPEQETPDVVTSFDFNRIWQSHPNSLTRGTFALDSNNDITDRLRIESDNHPKPTPFQTERVPGGGPLIDRNFDQTFILRAGKDVPFGIGRVEQKDKVTGILANGGLLHTPDWDTDGGTLPGFSIDTVKYPYVKSANEYDAITEGNVYYYHSSKTLEEFSLDNGVFDWGNIQQFTWNVKVEHDNVMLQVADLDETLGSVEVGRQCEEIGGEAQGSIAKIIRNGQGDITHVYLRAVGTENAFAEDDLVLGSNGFQFRVDAAPTVFTNGIFYIDFGPDAEEFGSFVPGQFYLAPENIQVQRNYLIRWNQSDASNQPSVDHPLGHPMQFSTTQDGLLNGGTLYYNSTGVSAAPAADYENEYQSIFIMNADETARIYYYCKNHRYMSGYTGHEGYMTLSSVVEEEEVTNDYYVGEFFKGQTTINPDDLISQYSGELLRTTLEDTGTGTGTNGGFNIGRHFRYATGSGNRHVAFRLDLRNVFTLDLEVIRGNETNGGELPDIGEDLRIFFSGTVYGSSVVAAYNDTSFDTIKTVTVGIPPDSRNENQLVYVYMLGADGSSFDHWGLRAVTYGGGDDDFARHPNGHSKIIGMSFDGYPIYGPFGYDSTGSVAREVSSYRLKTDAEMPGARPLVSTTGTVTYNITVSGGSFLFDGSTVPFVSLDRGKTYIFNQDDSSNNDQFLLISETDDGWHGTVPITIGDTNQLYAGQGISYYIDGSAVTYATYVSQFNAASQREIRFEVPVDAPRLLYLFAYSNAGYSIRSVQDKYLRGDLVEDYIYEEGLGTLDEYNGKFAVTPEYPNGTYAYFMTEDSSGNPVYPYAIGPKFYGTPLFEGDAVPQQQTILPTGAKGQVILNDTGQISYVKMSASGDNYFGAANARILGGQGTGATGSPIVQTITGLTLTSAGRQYATPPTVIFEGGGGQGAQGRADIDTLGKVTSISVADSGEFYQEPPYVLITGGGGLGAEAVARIDQGAVVGIDVTNPGEGYTSQPNVIFTKLVNLKRKTRARQAFNSSEIYLTGLVKDVAAADTEIFVDSTTAYPGSGDIILGTETISYTSKTDTKFSGLTRGVNFNYDQRVILDSGQDVNGVSTYQFNVGDRVIRRVENAGNKVAKVYDWNPSTKELLVTFEVDELAFIDGGIPSTEDAIVQFDAGVASSAPGGFLPHVVVNSVGDNIFLLTNPPSLLADRTFEDDDELDGAGDGIPDLVNTGTDYESQISLDGGIYSSLYGIEETVGGQNTTLFQVGDSVKDGSIPFKYANISAAGALSDGVEHNAVVYLYLDSDFSNGQNYSVNEIVTGSVSGVRGTVVSWDPSAQLLIVNGVVPFNTGNINIGVNGLLYEFSHNSTVVDFIIQNPGTNYSAVPTVAIENTGDIQCTATVNMTTAGDQVASITITNGGYGIEQTVDGSYNLHPTVTFTNDAGDSTGSGAVAQAVLGGERINGNGGASYRIKRIEYQTVIRS
Physico‐chemical
properties
protein length:1540 AA
molecular weight: 166111,91860 Da
isoelectric point:4,39896
aromaticity:0,10455
hydropathy:-0,25357

Domains

Domains [InterPro]
IPR025924
664–725
IPR025924 IPR025924
AGN33579.1
1 1540
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-IOM18
[NCBI] 		754039 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGN33579.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ317383 [NCBI]
CDS location
range 61154 -> 65776
strand +
CDS
ATGGCAAGAACTGTCCCTGGAACTGGCGCTGTCATCGAACCTATTTTCGATGATGTATTTGGCGTTAAAGCGGTAAAAGTTGTTAACGGTGGGTCTGGGTATGATGTTGCAGATCCTCCTAGATTAGTAATTACTGGGTGTGGTATTCCCACTGCAGAAGCACTACTATACCCAATTATTGATGAAGATTCTGGTAAAATTGTTCATGTTAGAGTTTTAGATAGGGGTAGAGGATACGACCCATTAAGACTCCAAATCATTCCAGAACAAGAAACACCTGACGTTGTAACTTCATTTGATTTTAATAGAATTTGGCAATCACATCCAAACTCTTTAACTAGAGGAACTTTTGCATTAGATTCTAATAATGATATTACAGACAGATTAAGAATTGAATCTGACAATCATCCCAAACCAACTCCATTTCAAACCGAGAGAGTTCCTGGCGGCGGTCCTCTTATTGATAGAAATTTTGACCAGACTTTTATTCTTCGAGCAGGAAAGGATGTACCTTTTGGGATTGGTAGAGTAGAACAAAAAGATAAAGTAACTGGTATTTTAGCGAATGGCGGATTACTTCACACTCCAGACTGGGATACTGATGGCGGCACTCTCCCAGGATTTAGTATTGATACTGTAAAATATCCTTATGTAAAAAGTGCGAATGAATATGATGCTATAACTGAAGGGAATGTTTATTACTATCATAGTAGTAAAACATTAGAAGAATTTTCCTTAGATAATGGAGTTTTTGATTGGGGGAATATACAGCAATTTACTTGGAATGTTAAAGTTGAGCATGATAATGTCATGTTACAAGTTGCAGACCTTGACGAAACTCTTGGTAGTGTTGAAGTTGGTAGACAGTGTGAAGAGATTGGTGGTGAAGCTCAAGGTTCGATTGCAAAAATTATAAGAAATGGGCAGGGTGATATCACTCATGTTTATCTGAGAGCAGTTGGAACTGAAAATGCCTTTGCTGAAGATGATTTAGTTTTAGGTTCTAATGGATTTCAGTTTAGAGTTGATGCTGCCCCAACAGTATTCACAAATGGAATCTTTTATATTGATTTTGGACCTGATGCTGAAGAATTTGGTTCTTTTGTCCCAGGTCAATTTTATCTCGCTCCAGAAAATATTCAGGTACAACGAAATTATTTGATTCGTTGGAATCAAAGTGATGCTTCTAATCAACCATCAGTAGATCATCCTCTTGGACATCCAATGCAGTTCAGTACGACTCAGGATGGTCTCTTGAATGGGGGAACTTTATACTATAATAGTACAGGTGTATCTGCTGCTCCTGCAGCAGATTATGAAAATGAATATCAATCAATATTCATAATGAATGCGGATGAAACCGCTCGAATTTACTATTACTGTAAGAACCATAGATACATGTCTGGATATACAGGACATGAGGGTTATATGACTCTTAGTTCTGTAGTTGAAGAGGAAGAGGTAACGAATGATTATTATGTTGGAGAGTTTTTTAAAGGACAAACAACAATTAATCCAGATGATTTGATTAGTCAATATTCTGGAGAACTCTTACGTACCACTCTCGAAGATACTGGAACTGGTACTGGTACAAATGGTGGATTTAATATTGGCAGGCATTTTAGATATGCTACTGGTAGTGGAAATAGACACGTTGCGTTTAGACTAGACTTAAGAAACGTATTTACTCTGGACTTAGAAGTTATCCGAGGAAATGAAACTAATGGCGGTGAACTCCCTGATATTGGTGAAGATTTAAGAATTTTCTTCTCAGGAACTGTATATGGTTCTAGTGTTGTTGCTGCTTATAACGATACTAGTTTTGATACTATTAAAACAGTAACAGTAGGTATTCCGCCTGATTCTAGAAACGAAAATCAGTTAGTCTATGTTTATATGCTTGGTGCCGATGGTTCTTCCTTTGACCATTGGGGACTTAGAGCAGTAACTTATGGTGGTGGTGATGATGATTTTGCAAGACATCCAAATGGACACTCTAAAATTATCGGCATGTCCTTTGATGGATATCCGATTTATGGACCTTTTGGATATGACTCTACTGGTTCTGTAGCAAGAGAAGTATCTTCTTACAGATTAAAAACTGATGCTGAAATGCCAGGTGCCAGACCTCTGGTTAGTACAACAGGCACAGTAACATACAATATAACTGTTAGTGGCGGTTCTTTCTTGTTCGATGGGAGTACAGTACCATTTGTCTCTCTTGATAGAGGAAAAACTTATATCTTCAATCAAGACGATTCGAGCAATAATGATCAATTCTTATTGATTTCTGAGACAGATGATGGTTGGCATGGAACAGTACCCATTACGATTGGAGATACTAATCAGTTATATGCTGGTCAAGGTATTTCTTATTATATTGATGGTTCTGCAGTAACTTATGCTACTTATGTTTCTCAATTCAATGCTGCATCTCAAAGAGAGATTAGATTTGAAGTTCCTGTTGATGCTCCTAGACTTCTTTACCTATTTGCATACAGTAATGCTGGATATAGTATTAGAAGTGTTCAAGACAAATATCTTCGTGGAGATTTAGTAGAAGATTATATTTACGAAGAAGGTCTTGGAACCTTAGATGAATATAATGGTAAATTTGCTGTTACTCCAGAATATCCTAATGGAACATATGCATATTTTATGACAGAGGATTCTTCTGGAAATCCAGTATATCCATATGCGATTGGTCCAAAATTCTACGGTACTCCGTTATTTGAAGGTGATGCTGTCCCACAGCAACAGACTATTCTCCCGACTGGTGCAAAAGGGCAAGTAATTCTTAATGATACTGGTCAGATATCTTATGTTAAGATGTCTGCAAGCGGAGATAACTATTTTGGTGCTGCAAATGCAAGAATTCTTGGTGGACAGGGAACTGGAGCAACAGGTTCTCCTATAGTTCAAACTATTACAGGTCTTACTCTTACTAGTGCTGGTAGACAATATGCTACTCCACCTACAGTTATTTTTGAAGGTGGTGGTGGACAGGGTGCTCAAGGCAGAGCAGATATTGATACTTTAGGTAAAGTTACTTCAATTAGTGTTGCTGACTCTGGAGAATTTTATCAAGAACCTCCATATGTTTTAATTACTGGTGGTGGCGGTCTGGGTGCTGAAGCTGTTGCTAGGATTGATCAAGGTGCTGTTGTTGGCATCGATGTTACTAATCCTGGCGAAGGATATACAAGTCAACCAAATGTCATTTTTACTAAACTTGTCAACTTAAAACGTAAAACAAGAGCAAGACAGGCATTTAATTCATCGGAAATTTATTTAACAGGTCTTGTAAAAGACGTTGCTGCGGCAGATACTGAAATTTTTGTAGATTCTACTACAGCATACCCTGGTTCTGGTGATATTATTCTTGGAACCGAAACTATTTCGTATACATCAAAAACTGATACTAAGTTTTCTGGATTGACTAGAGGTGTAAACTTCAACTACGACCAAAGAGTTATTCTCGATTCTGGTCAAGACGTTAATGGAGTATCAACCTATCAATTTAATGTTGGTGACAGAGTTATCCGTAGAGTTGAGAATGCAGGAAATAAAGTTGCTAAAGTTTATGATTGGAATCCTTCTACTAAAGAACTTTTAGTTACTTTTGAAGTTGATGAATTGGCATTTATTGATGGTGGTATTCCCTCCACCGAAGATGCTATTGTTCAGTTTGATGCTGGTGTAGCATCTAGTGCCCCTGGAGGATTTTTACCACACGTTGTTGTAAATTCTGTTGGGGATAATATTTTCCTTCTTACAAATCCCCCATCTCTTTTAGCAGATAGAACCTTTGAGGATGATGATGAACTGGATGGCGCTGGTGATGGTATTCCAGACTTGGTGAATACTGGGACTGATTATGAGAGTCAAATTAGTCTTGATGGTGGTATCTATAGTTCTCTATATGGTATTGAAGAAACTGTTGGTGGACAAAATACAACACTATTCCAAGTTGGCGATAGTGTTAAGGATGGTAGTATTCCATTCAAGTATGCAAATATTAGTGCTGCTGGTGCATTGAGTGATGGCGTTGAGCATAATGCTGTCGTTTACTTGTATCTTGATTCAGACTTTAGTAACGGTCAAAACTATAGTGTTAATGAAATTGTAACTGGATCGGTTTCTGGAGTAAGAGGAACGGTAGTAAGTTGGGACCCATCAGCACAACTTCTCATTGTTAATGGTGTTGTTCCTTTCAATACGGGTAATATTAACATTGGTGTTAATGGTCTTTTATATGAATTCTCTCATAATTCAACAGTAGTTGATTTTATCATTCAAAATCCTGGAACAAATTATAGTGCAGTTCCAACAGTTGCAATTGAGAATACTGGTGATATTCAATGTACAGCGACGGTAAATATGACTACTGCGGGTGACCAAGTTGCTTCTATAACTATCACCAATGGCGGTTATGGAATTGAGCAAACTGTTGATGGGTCGTACAATTTACACCCAACAGTAACATTTACCAACGATGCGGGTGATAGCACTGGTTCTGGTGCTGTAGCCCAAGCGGTTCTTGGTGGAGAGAGAATTAATGGTAATGGTGGTGCATCTTATAGAATCAAGCGAATCGAGTATCAGACAGTTATCCGTTCGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
a76e71a8ee914df381b61a4198f9e283d8ed8ff89d342829e10586723d82e508
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8038
Evidence 0,8038
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Synechococcus phage S-IOM18 Henn,M.R., Clokie,M., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Fitzgerald,M.F., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Neiman,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank