Protein

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Genbank accession
QJT71716.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
Protein sequence
MTNKFRATLGLDSAGEKVVNVGLADRTVMTDGVNVEYLIQENTLQQYDPTRRYLKDFAVIYDNRIWVSNRDIPKPAGAFSEPYWISVRVDPKWKLHQSGDFSLQQGDYISVDTDFGADMNFILPLNPSDGTTIVLKDIGGRPGYNKFQISSNPAPGSQSLLYDGQRVRSMQITYAYSEVVLVFSNRLWNVYIGQNESVGTFVTPAAKFLAQANDRIVRRYTSPSIIEVGLPRNANHGDIIYFTDLEAKSPQYHLKVTTFDANSSLGSVGTREMEFRTAGDGFLIYDSAESLWRIWEGDLRTRLRIVRDSVNLMANEHVMVFGANNSTQKTIDINLPENSAVGDSVIISLNYMRKGQIVNITATGNDTIASSLQLLQFPKRSEYPPETNWIQSKTITFNGTSAYVPVLKLSYIEDGGLEYWVVAENNPTVERVDSLNDETRKRLGVIALASQAQANANHEQNPEKELAITPETLANRTATETRRGIARLATTAEVVQDSTFAFLDDVILTPKKLNQRVATETSRGLAEIATQSETNAGTDDSTIITPKKLEARRATETMAGIAPLVVSGGTPGATRDVIGTGIYQRNEHTRQVTPKTLFENKATQTAQGGVWLATSAEVIAAPADDPAMPLAVTPQQLHTKTATETRIGFSEIATQAETNAGADDFRFVTPKKLHERKSSETLEGIARIATQSEFNAGIADNLISTPLKIKTLFNSTARTTVDSASGLRESGTLWSTYSLNIVAPTETLRGTARLATQPETDLGTDDTIVITPRKLHNKKATETAEGIVQIATQAEVVAGVVGNKAVPPKHLKYLVQTEPTWQSTPTLRGFVKMTEGALTWVGNNVDGSTKALDLYEKNGYAISPYELNKTLANYLPLMATAENSRNLGGQGPDKYIRRDIDQTVLGSLTLNSQTNTSAPIVSTNTIESKQGIVKDWLRIDGNGTTGQINFNTGTNTWSIESKNAENNIKFKYGSTGIEALRIDNTGNMALAQTFTSGNRVEANKGFSVEGGTIVINPTVSAIVLGTQSKAMALYTPDANTYNVIDPSGTYQLISTKNLVNVGSNNFVNRAGSIMSGSLGINNTLSVVLSESIAYPSLASLPSTSNQSAWTAEITTPAKYNTLPGYAVPIFGQTTNEQGETIETGIVVDYEYFPGPGTLTQHGNGITGVYQIWAPRPAANQANHNAQTFWIRNFNKVLNKWDGFARMFTSDLPPTASDLGAVSQTGGRLNNLTIRDWFQIGNVRMRPNPDTRTLEFDWIN
Physico‐chemical
properties
protein length:1259 AA
molecular weight: 137556,36710 Da
isoelectric point:5,68239
aromaticity:0,07705
hydropathy:-0,34480

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–121
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1101–1207
IPR048391
QJT71716.1
1 1259
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-121 | STR 343-1100 | ATT 1101-1207 | STR 1208-1245 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shewanella phage Thanatos-1
[NCBI] 		2734808 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QJT71716.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT457552.1 [NCBI]
CDS location
range 30008 -> 33787
strand -
CDS
ATGACTAATAAATTCAGAGCTACGCTGGGCCTTGACTCGGCTGGAGAAAAGGTAGTAAACGTAGGTCTAGCTGACCGTACAGTAATGACTGACGGTGTTAACGTTGAATATCTTATCCAAGAAAATACTTTACAGCAATACGACCCAACACGCAGATATTTAAAAGATTTTGCAGTAATTTATGATAATCGTATTTGGGTATCTAATAGGGATATCCCTAAACCAGCAGGGGCATTTTCTGAGCCATACTGGATTTCTGTACGTGTAGACCCTAAATGGAAATTACATCAAAGTGGTGATTTTTCACTACAGCAAGGTGATTATATTTCAGTAGACACCGACTTTGGTGCAGATATGAATTTCATTCTACCTTTAAATCCATCTGATGGCACTACAATTGTACTTAAGGATATAGGCGGAAGACCAGGGTATAATAAGTTCCAGATTTCTAGTAATCCTGCACCTGGCAGCCAATCTTTATTATACGACGGTCAGCGTGTACGCAGTATGCAGATTACTTATGCATATTCAGAGGTGGTTTTAGTATTCTCTAATAGATTGTGGAACGTTTACATCGGTCAAAATGAATCAGTAGGGACTTTTGTAACCCCTGCTGCTAAATTCTTAGCTCAAGCAAATGATAGGATTGTCCGTAGATATACTTCGCCATCTATCATTGAAGTAGGGTTACCACGAAATGCAAATCACGGTGATATTATCTACTTTACTGATTTAGAAGCAAAGAGCCCTCAATATCATTTAAAAGTTACTACATTCGATGCCAATTCTTCATTAGGCTCTGTAGGAACGCGTGAAATGGAATTCCGTACAGCAGGTGACGGATTTTTGATTTATGATTCTGCGGAAAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGTGATTTAAGAACTCGCCTACGTATTGTTAGAGACTCTGTTAACCTAATGGCTAATGAACATGTGATGGTATTCGGTGCAAATAACTCTACACAAAAGACTATCGACATTAATTTGCCGGAAAATTCAGCTGTTGGTGATTCAGTAATAATTTCGCTTAACTATATGCGAAAAGGACAGATTGTTAATATTACTGCAACAGGCAATGATACTATTGCTTCATCATTGCAACTATTACAATTTCCTAAAAGGTCTGAATATCCACCAGAAACAAATTGGATACAAAGTAAAACTATTACATTTAACGGTACTAGTGCTTATGTTCCGGTATTAAAATTATCTTATATCGAAGACGGTGGATTAGAATATTGGGTAGTAGCAGAAAATAATCCTACGGTTGAACGCGTGGATTCGTTGAATGATGAGACTCGTAAAAGACTAGGTGTTATTGCATTGGCATCTCAAGCACAAGCAAATGCTAATCATGAACAAAACCCGGAAAAAGAGTTAGCTATTACTCCCGAGACTTTAGCTAATAGAACAGCAACAGAAACACGTCGTGGTATTGCTAGATTAGCTACTACAGCAGAAGTTGTACAAGATTCTACATTTGCTTTCTTAGATGATGTTATTCTTACACCTAAGAAACTTAATCAACGAGTAGCTACTGAAACTTCCCGTGGTTTAGCTGAAATTGCAACCCAATCTGAAACTAACGCCGGAACCGACGATTCTACTATTATTACACCAAAGAAACTTGAAGCAAGACGTGCAACTGAAACTATGGCAGGTATAGCACCACTTGTCGTTTCAGGAGGAACACCTGGCGCCACTCGGGATGTTATCGGTACTGGTATCTATCAACGCAATGAACATACCCGTCAGGTCACTCCTAAGACTCTATTTGAGAACAAAGCTACACAAACTGCTCAAGGTGGTGTATGGTTAGCTACATCCGCAGAGGTGATTGCAGCCCCGGCTGATGACCCTGCTATGCCTTTAGCTGTTACACCACAACAATTGCACACTAAAACTGCCACCGAAACACGTATAGGATTTAGTGAAATTGCCACCCAAGCAGAAACCAATGCAGGTGCGGATGATTTTAGATTTGTAACACCTAAAAAGCTACATGAACGTAAATCTTCAGAGACTTTAGAAGGTATTGCTAGAATAGCCACTCAGTCTGAATTTAATGCTGGTATAGCAGATAATTTGATTTCTACTCCATTGAAAATCAAAACATTATTTAATTCTACTGCTCGTACTACAGTAGATTCTGCTTCAGGATTAAGAGAATCAGGTACACTATGGTCTACCTATTCTTTGAATATTGTAGCACCCACTGAGACTTTACGTGGTACAGCTCGTTTAGCTACACAACCGGAGACAGACTTAGGAACAGATGACACTATTGTTATCACCCCTAGAAAGCTTCATAATAAAAAAGCTACAGAAACTGCCGAAGGTATTGTTCAAATTGCTACTCAAGCAGAAGTGGTGGCTGGTGTGGTAGGTAATAAAGCAGTTCCACCTAAACACCTAAAATATCTAGTTCAGACAGAGCCAACATGGCAGAGTACACCTACTCTACGTGGATTTGTCAAAATGACAGAAGGTGCTTTGACTTGGGTTGGCAATAATGTAGACGGTTCTACTAAGGCTTTGGATTTATATGAGAAAAATGGCTATGCTATTTCACCTTATGAATTAAATAAAACATTAGCTAATTATTTACCGTTAATGGCTACTGCAGAGAACAGTCGCAATTTAGGTGGCCAAGGCCCAGACAAATACATTAGACGTGATATTGACCAAACAGTATTAGGTTCATTGACTTTAAACAGCCAGACCAATACAAGTGCCCCTATTGTTTCTACCAATACTATAGAATCTAAGCAAGGAATTGTCAAAGATTGGTTAAGAATTGACGGTAATGGAACTACAGGCCAAATCAATTTTAATACCGGAACTAATACCTGGTCTATAGAGTCAAAAAATGCTGAAAACAATATTAAATTCAAATATGGTTCTACAGGCATAGAGGCTCTTAGGATAGATAACACAGGTAATATGGCTCTTGCTCAAACATTTACCTCAGGTAATAGAGTAGAAGCTAATAAAGGATTTAGTGTTGAAGGTGGTACAATTGTTATTAATCCTACAGTGTCTGCTATTGTATTAGGAACTCAATCTAAAGCTATGGCTTTATATACTCCTGATGCCAATACATATAATGTTATTGACCCTAGTGGAACTTACCAATTAATTTCTACCAAGAATTTAGTTAACGTAGGTAGCAATAATTTTGTAAATAGAGCTGGTTCTATTATGTCAGGTTCTTTAGGAATTAATAATACTTTAAGTGTAGTTTTATCTGAAAGTATTGCTTATCCTTCATTGGCATCTTTACCTAGCACTTCAAACCAAAGTGCGTGGACAGCAGAAATTACTACACCGGCTAAATACAACACCCTCCCAGGATATGCTGTGCCTATTTTTGGTCAGACTACTAATGAACAGGGCGAAACTATTGAAACCGGTATTGTAGTGGATTACGAGTATTTCCCGGGTCCCGGAACTCTTACTCAACACGGTAATGGTATTACAGGTGTTTATCAGATTTGGGCCCCACGTCCTGCTGCTAATCAGGCAAACCATAATGCTCAAACATTCTGGATTCGTAACTTTAACAAAGTTCTGAATAAGTGGGATGGTTTTGCTCGTATGTTTACCAGCGATTTGCCGCCTACTGCTAGTGATTTAGGTGCAGTGTCCCAAACAGGCGGTCGTTTAAATAACTTGACTATTCGTGACTGGTTCCAAATAGGTAATGTTAGAATGAGACCAAACCCAGATACTCGTACTTTAGAGTTTGACTGGATTAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7ffbd37ebf8a569350c8d4c6b0082f14d01a22b803aeca9d5767df4ead45d0ad
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5395
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterization of phage Thanatos infecting and lysing Shewanella oneidensis and promoting nascent biofilm formation Kreienbaum,M., Doerrich,A.K., Brandt,D., Leonhard,T., Hager,F., Brenzinger,S., Hahn,J., Ruwe,M., Briegel,A., Kalinowski,J. and Thormann,K.M. 2020-09-18 — GenBank