Protein

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Genbank accession
UYE93527.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MIDIDKWGAPPPITDNVNHGDLLKALNTLGFKIQTNDAVYGTKPYQVLQEVTTKVNDFLPYVKTLIENHTNKVGISHGETKATTGLSDKDNYRMATIDECKTFANVSAFVHPAGVKATLDNITLDLSGRFQENDLYPIAVISNQLMFKHAPFDSVKRAVVGLGQGTVGVYKDCLLLSPKQNGNINNTFSIFKGFNQAAGVNNRFYDTGGIKNGIVATSENAEIFQQIGETAAGATTLPFPLKNITKQLTVQRPATLKSSNRFNGLMGGSFRSASGNTVYCYFATADKEAYPDNRYAYLHHYTRAIGSTGAEVLLSFNPTYTGGGSTLFNNMTTNGTLDSGTHIGININNICTSNDPDVVLTFEKYIASTCWEVMDKSYIIRLHGVIKHQNNRTNKTLFVHFSCAFRCQITLAPFVDRKLDLSPVYFYTPTVLNEKNLASFNFGYTRLIEKGSVIDTITHSGSMIKGGLYVRLLTHMQHSYVHYSRFTDINSVLDYFKTPINSLEATWVNTVPLAHTGLSPIGNTPQRLIPVEYDDSGFKVLSFGLDNSVAGFSWSLLTWKDKTLTPFRASFLTPSKGERIDTSKVVPSSIACFSGTEGVSYHGLNFVSCNRYTGVAGLQFENSAFKYASEVKLNPANLSGLMKLEEAFIGRAKTYYASAGKVDKFLEFEVGVFTINSGLTTKNNALVVLSDGFGYLEMGIANYSINSGIYNITTPIDSISFSIITPNSKPSRFVGELEKEDTYKIPSTFSDMSVYVYDTGELVISFNRPWGDHRIGKATVHIQRYNADALTMECTSRFVTPVKLVGGETPAGVLLTEAQLNDLYQSAWTEFPIVNSAAFEAFDIAIPGKGMYCNRWAMTGGIGLKRHFVISADKAENSSVDFDYIQPGDIVVPSGYPVVLAGRAMKTYRDTSRSALSNSAWFKYYLKRDGFNLNVESSTMELEPRSDYIEIANYNTALAGYTLTENELTVNGLKLSYERKGSCFPISQFYDGVGNELYGFFYYNDSPHYPPKFEVDLPTSKTVYATQNGAYSVDIYSRVPPIAVDWYVQKPGNAAVKVADQVPASALGNNLYRCSINYPFEHWNLTGSKVWCEAFDERPLSTLSAVCNVTVTIPILRFTTDLPATSSVDYNGNITYSVVAESQAGVVQYQWYQRVGGNVNQIGGDASSVTLFNQVTMFNNSEIWCEVKDLSGQKITSTVCRQTVRQPHLSFITNNVSTKTVMEGGTTQLSVAVNSEVGVTQYQWYMRKGGTTTPIGGNDRVLTILRADYAWNTGELFVVVTDNVGQQITSVSCVLTVIKAVLAFTVQPANTTVAWDGTANFSTTVNSNIGSLVYVWKLDGTVVGGNSNTLSLPNRRANGTVVVEVTDGFGNKITSNVVSLTVNPPTLVFTTNNVTAKSVNYYEGTNFSVAVNSQAGVAAYQWFRKRGANTDLVGGNASLTLNNLVTTDNGATVWCEVTDLAGFKITSAVCTLTVNNPYIVTDLVDRVYHYASPTAKRFTFTVEAHSGTPGYKWYKVTGTNTHTELTQGISSSGETSHLDYVLNNGNEESHYVYCVATFNDGFTLTSKMNFIVIASYPYISVDLNENGGNVKPGETKSFRIIFHGGFSDFNYTWYKRYTPPNGTPVTTTESGTDGRDITLTFPLTGAPGGSWSVWCEATGMLLGERLTSKTQSVGMVNPLVVTYPLPNISASISWLEPTQFFFAVDSDGGPYTFTWSHGTQIMSSGNATLMEIPAQGVPNGTTLTLKVKDPSGFETTFSTLILLSTIEGQQASFSPQFPVALPAYRDSTDPSDMIAFKVHHPVDTKPLSSFFWVDGISDYTTDFVLSNQQNFKALTYTPKYVALDNVGGLRGMAKYESSMELRSTRCDVVSVPVKNDGYGLADFTVNTVTRQYTLNIPANLGRFPYALFIYYIDRTQSTDIYKTTPKQLFSKLTVASSEVITGTLPSELVGKDVELYAVAFDARGKWYTSSAKTVKITGEILDTFRGYHNVYSDGNNPGKLAQATTNFLTNGEMVCPTYSAHNKRWKVDTSTTPNYSIRYLSINSTSNEDMNETPPVNTNVTTSFQKINQTMYFSISTYTPGWDGEHVAEADIVIEIKNDVTGVVSKYEVYLLAVAGRHGGGGEIP
Physico‐chemical
properties
protein length:2125 AA
molecular weight: 233314,53490 Da
isoelectric point:6,03081
aromaticity:0,11341
hydropathy:-0,17012

Domains

Domains [InterPro]
DC_0481
STR
32–121
DC_0481 DC_0444 DC_2066
DC_0444
STR
1203–1302
DC_0444 DC_0444
IPR007110
STR
1385–1473
IPR007110
UYE93527.1
1 2125
Architecture
STR
STR
RBD
STR
STR 32-121 | STR 1098-1302 | RBD 1303-1383 | STR 1384-1478 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
UYE93527.1
1 2125
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 10 10 0,0226
Central domain 11 264 255 0,9410
C-terminal 265 2125 1860 0,2140
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-10
Central
11-264
C-terminal
265-2125

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shewanella phage FishSpeaker
[NCBI] 		2985553 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Shewanella oneidensis MR-1
[NCBI] 		211586 Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Alteromonadales > Shewanellaceae > Shewanella > Shewanella oneidensis

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UYE93527.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP589283 [NCBI]
CDS location
range 127534 -> 133911
strand +
CDS
ATGATTGATATTGATAAATGGGGGGCACCCCCACCAATTACAGATAATGTAAATCATGGGGATTTATTAAAAGCATTGAATACATTGGGATTTAAGATTCAAACCAATGATGCGGTTTACGGTACTAAACCTTACCAAGTGCTTCAAGAAGTCACTACTAAGGTAAATGATTTTTTACCTTATGTAAAAACCTTAATTGAAAATCACACCAATAAAGTAGGGATAAGTCACGGTGAAACAAAAGCCACAACAGGATTGAGCGATAAAGATAACTACCGCATGGCGACTATTGATGAATGTAAAACATTTGCAAATGTAAGCGCATTTGTTCATCCAGCAGGTGTTAAAGCCACACTGGATAACATCACTCTCGACCTTAGTGGGCGTTTCCAAGAAAATGATTTATACCCTATAGCTGTCATTAGCAATCAATTGATGTTTAAACATGCACCATTTGATTCTGTTAAACGCGCGGTAGTTGGTCTAGGTCAAGGGACAGTTGGGGTTTACAAAGATTGTTTATTATTGTCACCAAAACAAAATGGTAACATAAACAACACTTTCTCTATTTTTAAAGGTTTCAATCAAGCGGCGGGTGTAAATAATCGTTTCTATGATACTGGTGGGATTAAAAACGGAATTGTTGCAACATCTGAAAACGCAGAGATTTTTCAACAGATCGGTGAAACCGCCGCGGGGGCGACAACACTCCCCTTCCCGCTCAAAAATATTACAAAGCAATTAACTGTGCAACGTCCTGCAACGTTAAAATCTTCTAATCGTTTTAACGGACTTATGGGAGGTAGTTTTCGTTCTGCATCCGGTAACACAGTATATTGTTATTTTGCTACAGCGGATAAAGAAGCCTATCCTGATAACCGTTATGCATATTTACACCACTACACGCGTGCCATAGGTTCAACCGGTGCTGAAGTGTTGTTATCGTTTAATCCTACCTATACGGGTGGTGGGAGTACGTTATTTAACAACATGACAACCAACGGCACATTAGACAGTGGCACACACATTGGTATCAACATAAACAACATCTGTACAAGCAATGATCCTGATGTGGTACTGACGTTTGAAAAATATATTGCTAGCACATGCTGGGAGGTAATGGATAAAAGTTACATTATCAGATTACACGGGGTGATTAAGCATCAAAATAACCGCACTAATAAAACGTTGTTTGTTCATTTTAGTTGTGCGTTCCGTTGCCAAATCACGTTAGCACCATTCGTTGATAGAAAACTTGATTTATCTCCAGTATATTTTTATACCCCCACAGTGTTAAACGAGAAGAACCTTGCTAGTTTCAATTTTGGTTACACTCGTTTAATCGAAAAAGGCAGCGTTATCGACACCATAACACACTCAGGTAGCATGATTAAAGGTGGGTTGTATGTTCGTCTATTAACACACATGCAACACAGCTACGTGCATTACAGTCGCTTTACCGACATTAATTCGGTGTTGGATTATTTTAAAACCCCTATTAATTCACTTGAAGCGACCTGGGTTAATACGGTTCCGTTAGCACACACTGGTTTGAGCCCCATCGGAAATACACCACAACGTTTGATACCTGTTGAGTATGACGATAGTGGGTTTAAAGTGCTAAGCTTTGGATTAGACAATTCTGTTGCTGGTTTTTCATGGTCTTTGTTAACATGGAAAGATAAAACATTAACGCCCTTTAGAGCAAGTTTCTTAACACCTAGTAAAGGCGAAAGAATAGACACCAGCAAAGTAGTCCCATCCAGCATTGCATGTTTTTCAGGTACGGAGGGTGTGAGTTACCATGGGTTAAATTTTGTGTCTTGTAATCGATACACGGGGGTTGCCGGATTACAATTTGAAAACAGCGCTTTTAAATATGCAAGCGAGGTTAAATTAAATCCTGCTAATTTGTCTGGGTTAATGAAACTCGAAGAAGCTTTTATTGGTAGAGCCAAAACGTACTATGCTTCTGCTGGTAAAGTGGATAAATTCCTTGAATTTGAAGTAGGGGTATTTACCATTAATAGCGGATTAACCACCAAGAATAATGCATTAGTTGTATTATCTGATGGTTTTGGTTATCTTGAGATGGGGATAGCTAATTACAGTATCAATAGTGGAATATACAACATAACCACACCCATTGATTCGATCTCTTTTTCTATTATTACCCCGAATAGTAAGCCCTCTCGGTTTGTTGGGGAACTTGAAAAAGAAGACACTTACAAGATCCCAAGCACTTTTTCTGATATGAGTGTTTATGTTTATGACACGGGTGAATTAGTTATTTCATTTAACCGACCATGGGGAGACCATCGAATAGGTAAAGCGACGGTGCATATTCAAAGATATAATGCTGATGCACTTACAATGGAGTGTACAAGCAGATTTGTTACACCTGTTAAACTGGTGGGAGGGGAAACCCCCGCAGGAGTATTGTTAACAGAAGCACAATTAAATGATCTTTATCAATCTGCTTGGACTGAGTTCCCTATTGTAAACAGCGCTGCGTTTGAAGCATTTGATATTGCAATACCCGGCAAAGGTATGTATTGTAACAGATGGGCGATGACAGGAGGAATTGGGTTAAAACGTCACTTTGTAATTAGCGCTGATAAGGCTGAAAACTCATCAGTCGATTTTGATTACATTCAACCAGGTGATATTGTTGTTCCTAGTGGGTATCCTGTGGTGTTAGCAGGTAGAGCGATGAAAACGTATCGTGATACTTCTCGTAGTGCTTTAAGTAACAGTGCTTGGTTTAAATACTACTTAAAGAGAGACGGATTCAATTTAAATGTTGAGTCTTCGACTATGGAGCTTGAACCTCGTTCAGACTACATCGAAATAGCTAACTACAACACCGCATTAGCGGGGTACACATTAACCGAAAACGAACTCACTGTTAACGGATTGAAATTAAGTTATGAACGTAAGGGGAGTTGTTTCCCCATCAGTCAGTTTTATGATGGAGTGGGTAATGAACTGTATGGATTTTTCTATTACAACGACTCCCCACATTACCCACCTAAGTTTGAGGTAGATTTGCCAACATCAAAAACGGTGTATGCCACACAAAATGGTGCGTATTCTGTAGATATCTATTCTCGGGTACCTCCTATTGCTGTTGACTGGTATGTTCAAAAACCCGGTAATGCGGCAGTAAAGGTAGCTGACCAAGTACCAGCTTCGGCATTAGGAAATAATTTGTATCGTTGTTCAATTAATTACCCATTTGAACATTGGAATTTGACAGGAAGTAAAGTGTGGTGTGAAGCATTCGATGAGCGCCCATTATCTACGTTAAGTGCGGTATGTAACGTTACTGTCACAATACCTATTCTGCGTTTTACAACTGATTTACCTGCGACGTCTTCAGTTGACTACAACGGTAATATAACGTATTCAGTAGTAGCAGAATCCCAAGCGGGTGTGGTGCAATATCAATGGTACCAACGTGTAGGTGGTAATGTCAACCAAATAGGAGGAGACGCAAGTTCTGTAACTTTGTTTAATCAAGTGACGATGTTTAACAACTCAGAAATTTGGTGTGAGGTTAAGGATCTAAGTGGTCAAAAAATTACATCAACTGTTTGTAGACAAACAGTGAGACAACCTCACTTGTCGTTTATCACAAACAACGTGTCAACTAAGACTGTTATGGAAGGGGGCACAACACAACTTTCAGTGGCTGTTAATTCTGAAGTGGGTGTGACACAATATCAGTGGTATATGAGGAAAGGAGGCACTACTACTCCGATTGGAGGTAATGACCGCGTGCTCACTATTCTTAGAGCGGATTATGCTTGGAATACAGGTGAATTGTTTGTGGTTGTTACAGATAACGTCGGACAACAGATTACGTCTGTGTCTTGTGTGTTGACTGTAATTAAAGCAGTACTTGCGTTTACCGTTCAACCTGCTAACACCACGGTTGCATGGGATGGTACAGCAAACTTCTCAACGACGGTTAATTCAAACATCGGAAGTTTGGTGTATGTCTGGAAGTTAGACGGAACAGTTGTTGGTGGCAATAGCAACACGTTATCTCTGCCTAATCGTAGAGCTAATGGAACAGTTGTGGTCGAAGTTACTGACGGATTTGGTAACAAGATTACATCCAATGTGGTATCGTTAACGGTTAATCCACCAACACTGGTGTTTACTACTAACAACGTTACAGCTAAGTCAGTTAACTACTACGAAGGTACTAACTTCTCCGTCGCTGTCAACTCACAAGCTGGTGTAGCTGCTTACCAATGGTTTAGGAAAAGAGGTGCAAACACAGACCTTGTCGGTGGTAATGCCTCGTTGACTTTAAACAATCTCGTGACTACGGATAACGGTGCGACTGTATGGTGCGAAGTAACAGACCTCGCAGGCTTCAAGATTACGTCAGCGGTCTGCACACTCACCGTTAACAACCCATACATCGTGACTGACTTAGTGGATAGAGTGTACCATTACGCGTCTCCAACAGCAAAACGATTCACCTTTACTGTTGAAGCTCATAGTGGGACACCTGGATACAAGTGGTATAAAGTAACTGGGACTAACACACACACTGAACTCACTCAGGGCATTAGTTCATCAGGAGAAACATCACATTTAGATTATGTGTTAAATAATGGAAATGAAGAAAGTCATTATGTTTACTGTGTGGCTACATTCAATGATGGTTTCACACTAACCTCTAAGATGAACTTCATTGTCATAGCAAGTTACCCATACATTTCTGTCGACTTAAATGAAAACGGAGGAAATGTTAAACCCGGTGAAACGAAGAGTTTCAGAATCATCTTCCATGGAGGGTTCAGTGACTTTAACTACACTTGGTATAAACGTTATACACCACCGAATGGTACACCGGTTACTACGACTGAAAGCGGTACAGATGGCAGGGATATCACTCTGACATTCCCATTAACAGGGGCGCCAGGTGGTTCGTGGAGTGTCTGGTGTGAAGCAACTGGCATGCTGTTAGGTGAAAGGTTAAC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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a7f0ce989815b2723b84bc9f3ffb0a72349df23462cc59208ee254027d0acf86
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3360
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The outer-membrane cytochrome OmcA is essential for infection of Shewanella oneidensis by a zebrafish-associated bacteriophage Grenfell,A.W., Intile,P., McFarlane,J., Leung,D., Abdalla,K., Wold,M., Kees,E. and Gralnick,J. — — GenBank