Protein

Genbank accession
YP_010669918.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,75
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MGLSRLDNFLKSTKGEILYVDPSSLDSTDSIENKGNSLARPFKTIQRALLEAARFSYQAGENNDRFGKTTILLYPGEHVVDNRPGWIPIHDQVANTYRLRSGTTSDDFPPLDVNSNFDLDSPNNALYKLNSIHGGVIIPRGTSLVGLDLRKTKIIPKYVPNPENDQIERSAIFRVTGACYMWQFSIFDGDQTGTVYKDYTNNSFVPNFSHHKLTVFEYADGVNPVSINDDFLVYDDTNTDLDMFYQKVGFAYGKPSGREVSPDYPSDSLDIEPKVDEYRIVGSTGAEVGITSIKAGDGAISSTEITVTLENEVPGLDVNTPIRIEGIADEGYDGQFAVFEVLSTTEIKYQVSVPPTNPLPATTSGATLNISVDTVTSASPYIFNISLRSVYGMCGLHADGSKATGFKSMVLAQYTGIGLQKDDNAFVKYNSSTGLYEGTLAAGNENIHTDSNARFKPEYENHHIKCSNNALLQIVSVFAIGFNNHFLLESGGDASITNSNSNFGAKALVSRGFRPDAFPRDDIGYISHFVTPKEIESVEGGIEFLGIDVGVTTSVGIATTSKLFLYGEDNLDVPPATVIDGYRIGSKKDEALKVLLASGNEIETYHSQVVMPSTEGTANEKISEKIHKVKQSNDINVIVSNTLTLEENHTFLNGETIRIISENGGLPDGITEDKIYYAITTAIAPNPALGANQLKIAATLNDANNDVPITINNTGGILSIVSRVSDKSAGDLGHPVQWDETQQQWYVNVSTGSTDVSIYKQLWMRGVAELGETTPRTFVLRKPTDRNVEGSLYKVRYVLPKDSPTLGRPPVDGFVIQESNNIDGTSNSEVEKYLSFDSQTLSNSTEFRNFKFIADAEWSSVDSKATIRTEIPHNLNAGAQVEITNVYSGFNTTGKDNNGFNGTFIVDSVENRKEFKIGIAVNPGDFTSDTSIRNQNLPKLKKKKNSGTFLVYKSDEIQPYVQNEQDGVYHLTIINSSNTPTVSPFTGVKLLQPLDNLYPEYDRDNPSSDPDPARCFAVPDPIGKVVINDPEKSITKETVISTLENNGVGFAVTDILSEDAIDGYRHTVYTSADHGLNRVIEVEIVDPGTNYGSGIGITENLYNAQLVGFAGSVTGSNATARVQVSSAGTLANVQIIDGGSSYGIGNTMSVVGIATTSGHTTGSVRVTKIYDNVGDSVTIERISDLYHGYNTTYQINSIDVGESNSFDVVSATAVGIGSTISGIGNKNSSLGYAYLNGKAYAISASDYTPATGIATFTTGINAHGLQVNDKIYIGGATGDSVLFNGEYLIERTDSLTSLVVNVGVSTLTTITLGGSPTIFSTTLNSKGGEITVGDESYSSRLSIPYGNLQGTLALAMTKVDSNMNVTDLDDLDLEIGDYILVNDEIMRVKQTVVGNPVKVYRGLLGTQAESHVSGSVFRRINARPIEFRRHSIIRASGHTFEYLGYGPGNYSTAFPDRHDRQLSAAEEVLSQSFTEEGGFVVYTGMNSDGDFYISNKRVITTAGDEEVFSTPRPRFRGESKTIPDTKLGFNVIKASEVNVSEAVRVDGGEDKTTISQFDGPLLVNNKLTVTSNKGLESPSLFLQGDETVSRKYTVGVTQPASSVELVGEGAGNPGDIIFNGNPFKGQNAGWVYTTDNDWYPWGAISNKTDVFEIGGYFIGTFTGDGSGLYDVSDIWAIDATGIHTTRNVGFGSTNSSKADVSMYVQGNAEIRGTMKVFEIIENTTLDNATVLGIGTTVINVDLDTSSIYYYTQDAGANWAVNMRARAGLALTDFLEVSESITVAITTKQGGTPYYNDEVYIDDIRMSPRYYGSLTINTGNANSLDLYTYVLVRKSNTGDPVTDFDVLYSQSQYQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1853 AA
molecular weight: 200730,98220 Da
isoelectric point:4,71550
aromaticity:0,08904
hydropathy:-0,28149

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SCSM1
[NCBI] 		2588487 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010669918.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_070962.1 [NCBI]
CDS location
range 176745 -> 182306
strand +
CDS
ATGGGTCTTAGTCGTCTGGATAATTTTCTAAAGAGCACCAAGGGTGAGATTCTTTATGTAGATCCCTCAAGTCTCGATTCTACGGACAGTATCGAGAATAAAGGTAACTCTTTAGCAAGGCCATTTAAAACAATTCAAAGGGCACTGCTGGAAGCAGCACGTTTCTCCTATCAAGCAGGAGAAAATAATGATAGATTTGGTAAAACAACCATTCTACTCTATCCTGGTGAGCACGTAGTAGATAATAGACCAGGATGGATACCAATTCATGATCAAGTGGCAAACACGTACAGACTTAGATCTGGTACTACTTCTGATGACTTTCCACCACTTGATGTCAATAGCAACTTTGACCTAGACAGTCCTAATAACGCATTATATAAACTTAACAGTATTCATGGTGGTGTTATCATTCCTAGAGGTACATCACTAGTAGGTCTCGACCTTAGAAAAACCAAAATTATTCCTAAGTATGTTCCTAATCCAGAAAACGACCAAATTGAAAGATCTGCTATCTTCCGTGTAACTGGTGCTTGTTACATGTGGCAGTTCTCCATCTTTGATGGTGATCAAACTGGAACTGTATATAAAGACTATACTAATAATTCTTTCGTTCCTAATTTCTCACACCATAAGCTAACAGTATTTGAATATGCTGATGGTGTAAATCCAGTATCTATTAATGACGACTTCCTAGTCTATGATGATACAAATACCGATCTTGATATGTTCTATCAAAAGGTTGGTTTTGCATATGGTAAACCATCTGGAAGAGAAGTTTCTCCTGATTATCCTTCTGATAGCCTAGACATCGAACCAAAGGTTGATGAATATCGTATTGTTGGTTCTACTGGTGCTGAAGTAGGAATTACCAGTATTAAGGCAGGTGATGGAGCAATTTCTTCAACAGAAATTACAGTTACACTAGAGAATGAAGTTCCTGGTCTTGACGTAAATACCCCAATTCGTATTGAAGGTATTGCTGATGAGGGTTATGACGGTCAGTTTGCTGTATTTGAAGTTCTTTCAACTACAGAGATTAAGTATCAAGTTTCTGTTCCACCAACAAATCCACTACCAGCAACAACTTCTGGTGCAACACTGAATATTTCCGTTGATACTGTTACATCTGCATCACCATATATCTTTAACATCTCTCTGAGGTCTGTTTATGGTATGTGTGGACTTCATGCTGATGGATCTAAGGCAACTGGATTCAAGTCCATGGTTCTTGCACAATATACTGGTATTGGACTCCAGAAAGACGATAATGCATTTGTAAAATATAATTCTTCTACTGGATTATATGAAGGAACTCTAGCAGCAGGTAATGAAAATATTCATACCGACTCCAATGCTAGATTCAAACCAGAGTATGAGAACCATCATATTAAGTGCAGCAACAATGCACTTTTACAGATCGTTTCGGTTTTCGCAATTGGTTTCAACAATCACTTCTTGCTAGAGTCTGGTGGTGACGCATCTATCACCAACTCCAACTCTAACTTTGGTGCAAAAGCTCTTGTCTCTAGAGGTTTCAGACCAGATGCATTCCCAAGAGATGATATTGGTTATATCTCACATTTTGTAACACCAAAAGAAATTGAATCTGTTGAAGGTGGTATTGAATTCTTAGGTATTGATGTAGGTGTTACTACTTCTGTTGGTATCGCAACAACTAGCAAACTTTTCCTATATGGAGAGGATAATTTAGACGTTCCACCAGCAACCGTAATTGATGGTTATCGTATTGGTTCTAAGAAAGATGAAGCACTAAAAGTTCTTCTTGCATCAGGTAATGAGATTGAGACATATCATTCTCAAGTTGTAATGCCTAGTACTGAAGGTACTGCAAATGAAAAAATATCTGAAAAAATTCATAAAGTTAAACAATCTAATGATATTAATGTAATTGTATCAAATACACTTACTCTTGAAGAAAATCACACATTCTTGAATGGTGAGACTATTAGGATTATTAGTGAAAATGGTGGTCTTCCTGATGGTATTACTGAGGATAAGATATACTACGCAATTACTACAGCAATTGCTCCCAATCCAGCACTCGGTGCAAATCAATTAAAAATTGCTGCAACTCTAAATGATGCTAACAACGATGTTCCAATTACTATCAATAATACTGGTGGTATCCTCAGTATTGTAAGTAGAGTATCTGATAAATCTGCTGGAGATCTTGGGCACCCAGTTCAGTGGGATGAAACACAGCAACAGTGGTACGTTAATGTTTCTACTGGAAGCACTGATGTAAGTATCTACAAGCAATTGTGGATGAGAGGTGTTGCAGAACTAGGTGAAACGACACCAAGAACATTTGTTCTCAGAAAACCAACTGATAGAAATGTTGAGGGAAGTCTTTATAAAGTTCGTTATGTTCTACCAAAAGATTCTCCAACATTGGGTAGACCTCCAGTTGATGGATTTGTTATTCAAGAGTCCAATAATATAGATGGAACTAGCAATTCTGAGGTTGAAAAGTATTTAAGTTTTGACAGTCAAACTCTCTCAAACTCGACAGAGTTTAGAAACTTTAAATTTATTGCAGATGCCGAGTGGTCATCTGTTGATAGCAAAGCAACGATTAGAACAGAAATACCACACAATTTAAATGCTGGGGCACAGGTAGAAATTACCAATGTGTATAGTGGTTTTAATACTACAGGAAAAGATAATAATGGATTTAATGGGACATTTATTGTTGATAGTGTTGAAAATAGAAAAGAATTTAAGATTGGTATTGCAGTAAATCCTGGTGATTTTACAAGTGATACTTCTATTCGTAATCAAAATTTACCAAAACTTAAGAAAAAGAAGAACAGTGGAACATTCTTAGTATATAAGAGTGATGAGATACAACCATATGTTCAAAATGAACAAGATGGTGTATATCATTTAACTATTATTAACTCATCAAATACTCCCACTGTATCACCATTTACTGGTGTAAAACTATTACAACCTCTGGATAATCTTTATCCTGAGTATGATAGAGATAACCCAAGTTCTGATCCAGATCCCGCAAGGTGTTTTGCTGTTCCCGATCCTATCGGTAAAGTTGTTATTAATGACCCAGAAAAGAGTATTACTAAAGAAACAGTAATTTCTACCTTAGAGAATAATGGGGTTGGATTTGCAGTTACTGATATTTTATCAGAAGATGCTATTGATGGGTATAGACATACTGTTTATACAAGTGCCGATCATGGACTCAATAGAGTTATTGAAGTTGAAATTGTTGATCCAGGAACTAATTATGGTTCAGGAATTGGTATTACAGAAAATCTTTACAATGCACAACTAGTAGGTTTTGCTGGTTCTGTTACTGGATCAAATGCAACAGCAAGAGTCCAAGTATCATCAGCAGGTACACTTGCTAATGTTCAAATTATTGATGGTGGTTCATCTTATGGTATCGGAAACACTATGTCTGTTGTTGGTATTGCAACTACATCTGGACATACAACAGGAAGTGTAAGAGTAACTAAAATTTATGATAACGTTGGAGATTCTGTCACTATTGAAAGAATCAGTGATCTTTATCATGGATACAATACAACTTATCAAATCAATAGTATTGATGTTGGTGAATCTAATAGTTTTGATGTAGTCTCAGCAACTGCTGTTGGAATTGGATCCACTATTTCTGGAATTGGAAATAAAAATTCCTCTCTTGGATATGCTTATCTAAATGGAAAAGCATATGCCATCTCAGCATCAGACTATACTCCAGCAACTGGCATTGCTACATTTACAACTGGCATTAATGCTCATGGATTGCAGGTAAATGATAAGATTTATATTGGTGGAGCCACAGGTGATAGTGTTTTATTTAATGGTGAATATTTAATTGAAAGAACAGATTCTTTAACATCACTGGTTGTAAACGTAGGTGTTTCTACTTTAACAACGATAACACTTGGTGGATCACCAACTATTTTCTCAACTACATTAAATTCAAAAGGTGGTGAGATTACTGTTGGTGATGAAAGTTATAGCAGTAGACTTTCTATTCCTTATGGCAATCTTCAGGGAACACTCGCACTTGCGATGACAAAAGTTGATAGTAATATGAATGTAACTGATCTTGATGACTTAGATTTGGAAATCGGTGATTATATTCTTGTCAATGATGAGATTATGAGAGTTAAGCAGACAGTAGTTGGAAATCCAGTTAAGGTTTACAGAGGTCTTTTAGGAACGCAAGCAGAATCACACGTATCTGGATCTGTATTCAGAAGAATTAATGCAAGACCAATTGAATTTAGAAGGCACTCTATTATTCGTGCTTCTGGTCATACGTTTGAATATCTTGGTTATGGTCCTGGTAACTACTCTACTGCATTCCCTGATCGTCATGATCGTCAACTAAGTGCAGCAGAAGAAGTTCTTTCACAATCATTTACTGAAGAAGGTGGATTTGTAGTTTACACTGGCATGAATAGTGATGGTGACTTCTACATCTCTAACAAGAGAGTTATCACTACTGCTGGTGATGAAGAAGTGTTCTCCACTCCACGTCCAAGATTTAGAGGTGAGTCTAAGACAATTCCAGATACTAAACTCGGATTTAATGTTATTAAAGCATCTGAAGTTAATGTTTCTGAGGCAGTAAGAGTTGATGGTGGTGAAGACAAGACAACTATTTCACAGTTTGATGGTCCACTTCTAGTCAATAATAAACTCACTGTTACTTCAAACAAAGGACTAGAATCACCAAGTCTATTCTTACAGGGTGATGAAACAGTTTCTAGAAAATATACTGTAGGTGTTACTCAACCAGCATCTTCTGTTGAACTTGTTGGTGAAGGTGCAGGAAACCCAGGTGATATTATCTTTAACGGAAACCCATTCAAAGGTCAAAATGCTGGTTGGGTGTACACCACTGATAATGATTGGTATCCTTGGGGTGCTATCTCTAATAAGACAGATGTCTTTGAGATTGGCGGATACTTCATCGGTACATTCACAGGTGATGGATCTGGTCTCTATGACGTGTCTGATATCTGGGCAATTGACGCAACAGGTATTCACACCACTCGTAATGTAGGTTTTGGTTCTACAAATAGTTCCAAAGCAGACGTTTCCATGTATGTTCAAGGAAACGCAGAGATTAGAGGCACCATGAAGGTGTTTGAAATTATTGAAAACACCACTTTAGATAATGCTACTGTTCTTGGTATTGGTACTACAGTCATTAATGTGGACTTAGATACCTCATCTATCTACTACTATACACAGGATGCTGGTGCTAACTGGGCAGTGAACATGAGAGCACGTGCAGGACTTGCACTTACCGATTTCCTAGAAGTTAGTGAGTCTATCACAGTTGCTATAACCACAAAACAAGGTGGAACACCATATTATAATGATGAAGTCTATATTGATGATATTAGGATGTCTCCAAGATACTATGGTTCATTGACTATAAATACTGGAAACGCAAATAGTTTAGATCTTTACACGTATGTGTTAGTCAGAAAATCAAATACTGGAGATCCAGTAACTGACTTTGATGTTCTATACTCTCAATCACAATATCAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
a747756b9dda050d4f2362c50465a82685e0e93a8e41432b93bbfd8c0c644d4f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8694
Evidence 0,8694
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic and proteomic characterization of cyanophage S-SCSM1 provides new insights into understanding the viral gene diversity and phage-host interactions Wang,Q., Xu,Y., Jiao,N. and Zhang,R. 2022-10-26 — GenBank