Protein

View in Explore
Genbank accession
QOI69068.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
Protein sequence
MAKLTINRGSLANDGTGDNLREGANKINLNFDEIYTAIGDGSTVDGTIKIADDSSTVATISANGETLRVLGGTAITSTLSGNTLTIAADTSSLLSASGTATITNKTIDLDANTVTGTTAEFNTALQDGSFTTLAGTEALTNKDLTGSGNTFPTITIRDDSSTEDAVSLGETLIATGGTGITSTVGSNQLTFAIDSTVATLTGSQTLTNKTIVAGNNTISGITNAMLSGSAGITNANLANSSITLGDDAISLGGTQTTVTNLSLDGATGTIDLTSSGNKIRFNFATDGDFPTASTYEGMYAWDVADSLPYVADDGGWVKILTENASVGDLSNVNISGVADGNVLVWSSAQGRFNAGAASAGFTAGTDLDQAGADVQDVGYVGHRSPDATVTQTLTVTVAAKTTEHYRYGQGSSNGYLIDGHEGPVLQLSPGTYRFDQADSSNSGHPLRFYYDALKTRAYTTNVTTAGTPGSSGAYTEILIEGATPTPLYYQCSAHSYMGHAITPLTGRQARLNITTDKSNTGDGSTTGFTILADRSVDDILVFVNGICLVPTDDYTISSTTLTFTTAPASSAEIVFRYLG
Physico‐chemical
properties
protein length:579 AA
molecular weight: 59428,19520 Da
isoelectric point:4,23947
aromaticity:0,06390
hydropathy:-0,09050

Domains

Domains [InterPro]
DC_0533
ATT
1–59
DC_0533 DC_0210
IPR036240
STR
2–108
IPR036240
IPR008987
ATT
5–93
IPR008987
G3DSA:1.20.5.960
Unmapped
13–43
G3DSA:1.20.5.960
QOI69068.1
1 579
Architecture
ATT
STR
STR
ATT 1-93 | STR 94-108 | STR 136-579
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage Mosig EXVC030M
[NCBI] 		2759214 No lineage information
Host Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062
[NCBI] 		335992 Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Pelagibacterales > Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QOI69068.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT647606 [NCBI]
CDS location
range 83107 -> 84846
strand -
CDS
ATGGCAAAACTAACAATAAACAGAGGTTCTTTAGCAAACGACGGAACAGGTGATAATCTTCGTGAGGGTGCTAATAAAATCAATCTAAACTTTGACGAAATTTATACTGCTATTGGTGACGGCAGTACAGTTGACGGTACTATTAAAATTGCTGATGACAGTTCAACAGTTGCTACAATTTCAGCAAATGGTGAAACACTAAGAGTTTTAGGTGGTACGGCCATTACTTCAACTTTATCAGGTAATACTTTAACTATCGCTGCTGACACATCTTCTCTTCTATCTGCTTCGGGTACTGCTACAATCACAAATAAAACTATTGACTTAGACGCAAATACAGTTACAGGTACAACAGCAGAATTTAATACAGCATTACAAGATGGCTCATTTACTACATTAGCTGGTACAGAGGCATTAACAAATAAAGATTTAACGGGAAGTGGTAACACTTTTCCCACAATTACCATTAGAGACGATAGTTCAACTGAGGATGCCGTATCATTAGGTGAAACATTAATTGCAACAGGTGGTACAGGTATCACTTCAACAGTAGGTTCTAATCAATTAACATTTGCCATTGATTCTACAGTTGCAACACTTACTGGTTCACAAACACTTACAAATAAAACTATTGTTGCTGGTAATAATACAATTTCAGGTATTACAAATGCAATGTTATCAGGTAGTGCCGGTATAACAAATGCAAATTTAGCAAACTCATCAATTACTTTAGGTGATGACGCAATTAGTTTAGGTGGCACACAAACTACGGTAACAAATTTAAGTTTAGATGGTGCAACAGGAACAATTGACTTAACAAGTTCAGGTAACAAAATAAGATTTAACTTTGCAACAGATGGTGATTTTCCAACTGCTTCAACTTATGAAGGAATGTATGCGTGGGATGTTGCTGATAGTTTACCTTATGTTGCTGATGACGGTGGTTGGGTAAAAATTTTAACTGAAAATGCTTCAGTAGGCGATTTATCAAATGTTAATATTTCAGGTGTTGCAGACGGTAATGTTTTAGTATGGAGTTCAGCACAAGGTAGATTTAATGCAGGTGCGGCTTCAGCTGGGTTTACAGCAGGAACAGATTTAGACCAAGCAGGCGCTGATGTTCAAGATGTTGGTTATGTTGGTCACCGTTCACCAGACGCAACAGTAACACAAACATTAACAGTTACAGTTGCAGCTAAAACAACTGAACACTATAGATATGGCCAAGGTTCATCTAATGGTTATTTAATTGATGGACATGAGGGTCCCGTTTTACAATTATCACCAGGAACATATAGATTTGACCAAGCAGATTCTTCAAACTCAGGTCATCCATTAAGATTTTATTATGACGCATTAAAAACAAGGGCATATACTACAAATGTGACAACAGCAGGAACGCCAGGTTCATCTGGTGCATACACAGAAATTTTAATTGAAGGTGCAACACCAACACCTTTATACTATCAATGTTCAGCACACTCTTATATGGGTCATGCAATCACACCTTTAACAGGTAGACAAGCAAGACTAAATATTACAACTGATAAGTCAAATACAGGTGACGGTTCTACAACAGGTTTTACAATCTTAGCTGATAGGTCAGTTGATGACATTTTAGTATTTGTAAATGGTATTTGTTTAGTACCAACAGATGACTATACAATCAGTTCAACAACATTAACATTCACAACAGCGCCAGCAAGTTCGGCCGAGATTGTGTTCAGATATTTGGGGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7ea5666bb987f3e9a256d78934f233b0a89b54154744b5a216e1c58ae5eec132
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6945
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50