Protein

View in Explore
Genbank accession
CAB5214297.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,65
Protein sequence
PLFFIRNNSSIYNSSNPNPDLQGFWSGFGIDDLGDSNNNTGLNMYGYDGDGKVVTQIYGSGDSVMMWGWTGTDPIPANRFVDFPNENVNIKNGNLRVTGSFGITGQMTTDNGISMINTGATLNTYRIASQGSNDLKIDVNTPGNLRINSVTTAVTGSIDITGNYYINGVPFSGSTGTSGTSGTSGVAGSSGTSGGTGSSGTSGTSGINGTSGSSGTSGTSGVVDYTSVITTGSISSVQSITGSLNISGSGNSSIKQTYVFVSGALQVTSDGNINIISSSYINRFNGDIQNSFKSNLNTFSGNTEVTGTLVTTGDITSSGGALVSNASAGNEGGEIRLALAQSGQTLTGSITFDVFNNKVRLFETAGTNRGGYWDISTLAAGVGTNLAAGGGGSAFPFTGSAVITGSLAITGSVVGAVNSLSISSQTASLNLNNGDFFTLQLVSGSATHINPSNIKPGQTVNILLNTTGSGTVTWPANVVRQPASGSQYVPTTTTGKDIISLVSFDGSNLYLTSVKNLS
Physico‐chemical
properties
protein length:518 AA
molecular weight: 52491,63140 Da
isoelectric point:4,59585
aromaticity:0,07336
hydropathy:-0,08475

Domains

Domains [InterPro]
DC_2298
STR
105–270
DC_2298
IPR008160
STR
173–221
IPR008160 DC_1593
CAB5214297.1
1 518
Architecture
STR
STR 105-517 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Uroviricota > Caudoviricetes > Peduoviridae > Maltschvirus maltsch >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB5214297.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR798242 [NCBI]
CDS location
range 34320 -> 35876
strand -
CDS
CCATTATTCTTTATTAGAAACAATAGTTCAATATATAACTCGTCAAATCCTAATCCTGATTTACAAGGTTTTTGGAGTGGGTTTGGTATTGATGATTTAGGTGATAGTAATAATAATACAGGTCTTAATATGTATGGTTATGATGGTGATGGTAAAGTTGTAACTCAAATATACGGTTCAGGTGATAGTGTTATGATGTGGGGTTGGACTGGTACTGACCCAATACCAGCAAATAGATTTGTTGATTTTCCTAATGAAAATGTTAATATTAAAAATGGTAATTTAAGAGTTACAGGTTCATTTGGTATTACAGGTCAAATGACTACCGATAATGGTATTAGTATGATTAATACTGGTGCTACTTTAAACACATATCGTATTGCTAGCCAAGGAAGTAATGATTTAAAAATTGATGTTAATACACCAGGTAATTTAAGAATTAATTCAGTAACAACAGCAGTAACTGGTTCAATAGATATAACAGGAAACTATTACATTAATGGTGTTCCATTTAGTGGTAGTACTGGAACTTCAGGTACAAGTGGAACTAGTGGGGTTGCGGGGTCATCAGGTACAAGTGGTGGAACAGGTTCAAGTGGAACAAGTGGTACATCAGGAATTAACGGTACGAGTGGTTCATCTGGAACATCAGGAACAAGTGGTGTAGTTGATTATACAAGTGTTATTACCACAGGTTCAATTTCATCAGTACAATCAATCACTGGTTCATTAAACATATCTGGTTCAGGTAATTCAAGTATTAAACAAACTTATGTATTTGTAAGTGGTGCACTTCAAGTTACTTCCGATGGTAATATAAACATTATTAGTTCATCATATATAAACAGATTTAATGGTGATATACAAAACTCATTTAAATCTAACTTAAACACTTTCTCAGGTAATACAGAAGTTACTGGTACATTAGTTACAACAGGTGATATTACATCATCAGGTGGTGCATTAGTATCAAACGCAAGTGCTGGTAATGAAGGTGGTGAAATTAGATTAGCATTGGCACAATCAGGACAAACTTTAACAGGTTCAATTACTTTTGATGTGTTTAATAATAAAGTTAGATTATTTGAAACGGCAGGAACTAATAGAGGAGGATATTGGGATATATCAACATTAGCGGCAGGAGTTGGAACAAACTTAGCTGCAGGTGGTGGAGGTTCTGCATTTCCATTCACAGGTTCAGCGGTAATAACTGGTTCGTTGGCAATAACAGGTTCAGTTGTAGGTGCGGTGAATAGTTTATCTATCTCGTCACAAACGGCCTCATTGAATTTAAACAATGGTGACTTTTTTACATTACAATTAGTATCAGGTTCAGCAACACATATCAACCCTTCTAATATTAAACCAGGTCAAACTGTTAATATATTATTAAACACAACAGGTTCAGGAACAGTAACTTGGCCAGCGAATGTTGTAAGACAACCAGCATCAGGTTCACAATATGTTCCAACAACCACAACAGGTAAAGACATAATTAGTTTAGTTAGTTTTGATGGTTCAAACCTATACTTAACTTCAGTTAAAAACTTATCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
aa25820c99ed15793c6f316a4551960d90ca8693750d7b23f59b5addcebc25b5
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5516
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50