Protein

Genbank accession
AMO43285.1 [GenBank]
Protein name
putative short tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPYQFSASPLYVEEGQSIQFRYEAPPLFNDITQVKIEIGELTVFWIIETKLEDFEPDPFFLRNVDDAEPDTLLTYAATTDPDNGVAYTGLASDPDPLREGEEVITITGLDPGTQAPLIVSSNVIDVNNWSYRLRLYNEGSSSYGAWGAWTRALNNTVSNLDQIQVRLVSSSSPSDTKNVVVTVGTGSATWDVTTGAIPVNTPNPAPDFGSLNNLPLGQLVYSDIAQILGLTTSAIISVDNGAEIAVSNFNTTFTNADGYEVLNNISNGWGNNLTVSNGQYVQLRGTSSATPTATINFSVTVGDGAGISVWQITSGQGIDDNPTNFVFQDLVGQIPGQTGLRSETASGSSTSVAGRNIALVGGLDAGLFVPVTVRPADTNIVPKISINGGSSGLINNVTVQNGDTIELVVDNSTDITNPVIPGQGVVTVGINVGNRFIQTWTVANWTGPDTIPAFTPINQVINRTPGGASIIGPIGLTDFNLPITISATNPESFNEFNFATNENIGDVLFSINGDSATVGPRTVNPDPGGDPVFITIIMQQPGNADLDPVQGLSNYGQTVITFGDASPFQLRSINYAVKPIPPAYLGVWYSEKNAYFDDTAWAAAGEDPNNARDYYRAPKFDGYSIGTVVPITKETPLNDGNFGYGDIEERYPGFLPCDGATFAAADYPWLWEAIGNTYGGNGAYIPATKSYTGNFNVPDYRNVRMVGAGIVDSNRGSSSFVPVTSAGGSFELTGSTGGYWYVDDVDVAGPDPLEQVVAPAGSSDGIESEYFTLGTPRTFGTEELEADVEFTVTGEVVANIGPVSDVSVRPPQHEHEVISGQIDSDDGDPLIPWGTRAYYGTSASGSQNWSGRPDSDTDAVDDGYWEDAGFWNFGQFNSEVENSGRGSLIDLLPGVGSSSVAFGNYWGSPFSEISGLSDDYFTKNGNPNNGDCGVIDTTETRARIDNYLSIYTGTLNHSHLLGTDPVTNPQTDFSYGNVNSDATAFRQGLATFNSIFALKFTQNASTDGGSGVDIELNPATFSWNNTSKPIPTAAMNPQRKVPIIAPFHKVKYIIKAY
Physico‐chemical
properties
protein length:1057 AA
molecular weight: 112615,10990 Da
isoelectric point:4,06452
aromaticity:0,10123
hydropathy:-0,21627

Domains

Domains [InterPro]
IPR037053
620–701
IPR037053
SSF88874
652–742
SSF88874
IPR011083
652–702
IPR011083
AMO43285.1
1 1057
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM44
[NCBI] 		1278485 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AMO43285.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU594607 [NCBI]
CDS location
range 43957 -> 47130
strand +
CDS
ATGCCATATCAGTTTAGTGCCAGTCCGCTGTATGTTGAAGAGGGACAGTCTATCCAGTTTCGTTACGAAGCTCCTCCTCTGTTCAACGATATTACTCAAGTCAAGATTGAGATTGGCGAGCTTACTGTCTTCTGGATTATTGAGACTAAACTAGAAGATTTTGAACCTGATCCGTTCTTCCTTAGAAATGTTGATGATGCAGAACCCGATACTCTATTAACATATGCAGCAACAACAGATCCTGATAATGGTGTTGCATATACTGGACTAGCAAGTGATCCTGATCCACTAAGAGAAGGTGAAGAAGTTATTACAATCACTGGTCTTGATCCTGGAACACAGGCACCATTGATTGTTAGTTCCAATGTTATTGATGTAAACAACTGGTCTTATCGTCTAAGACTATACAACGAAGGATCCAGTAGTTATGGTGCTTGGGGTGCATGGACTAGAGCACTTAACAATACCGTATCTAATCTTGACCAGATTCAGGTCAGACTAGTATCTTCTTCTTCACCATCAGACACAAAGAATGTTGTTGTTACTGTTGGAACAGGTTCTGCTACTTGGGATGTTACAACTGGTGCAATTCCAGTCAACACACCAAATCCAGCACCAGATTTTGGTTCGCTAAACAATCTACCACTAGGACAACTTGTATACAGTGATATTGCACAAATTCTAGGATTAACTACTTCTGCTATCATTAGTGTTGATAATGGTGCAGAGATTGCAGTATCTAATTTTAATACTACATTTACTAATGCTGATGGATATGAAGTTCTGAATAATATTTCAAATGGATGGGGCAACAACCTGACAGTAAGTAATGGTCAGTATGTTCAGTTAAGGGGCACATCATCAGCAACACCAACAGCAACTATTAACTTCAGTGTTACTGTTGGTGATGGTGCTGGTATTTCTGTATGGCAGATTACATCTGGACAAGGTATTGATGATAATCCAACTAATTTTGTATTCCAAGATCTAGTTGGTCAGATTCCTGGACAAACTGGTCTTAGATCAGAAACTGCATCAGGTTCTTCTACATCAGTTGCTGGCAGAAATATAGCACTGGTTGGTGGACTTGACGCTGGACTATTTGTTCCTGTTACAGTCAGACCTGCTGATACTAATATTGTTCCTAAGATTAGTATTAATGGTGGTTCTTCTGGTCTCATCAACAATGTCACAGTTCAGAATGGTGATACTATCGAACTGGTTGTTGATAACTCTACAGATATCACTAACCCTGTAATTCCTGGTCAAGGTGTTGTTACTGTTGGTATTAACGTAGGAAACAGATTTATTCAGACATGGACTGTAGCAAACTGGACTGGTCCAGATACTATTCCAGCATTCACACCTATCAACCAAGTTATCAATAGAACTCCTGGTGGTGCTAGTATCATTGGTCCTATTGGATTGACTGACTTCAATCTACCAATCACTATTAGTGCAACAAATCCTGAATCATTTAATGAATTTAACTTTGCTACCAATGAGAACATTGGTGATGTTCTATTCTCAATCAATGGTGATTCAGCAACTGTAGGACCACGAACAGTTAATCCTGATCCTGGTGGTGATCCTGTATTCATTACCATTATTATGCAACAACCTGGGAATGCAGATCTTGATCCTGTTCAAGGACTGTCAAATTATGGTCAAACAGTCATTACATTTGGTGATGCATCTCCATTTCAGTTGAGATCTATCAACTATGCTGTTAAACCTATCCCTCCTGCATATCTTGGTGTGTGGTATTCTGAGAAGAATGCATATTTTGATGATACAGCATGGGCAGCAGCAGGCGAAGATCCTAACAATGCTAGAGATTACTATAGAGCACCTAAGTTTGATGGTTACTCTATTGGAACTGTTGTTCCCATCACTAAAGAAACACCACTAAATGATGGTAACTTTGGTTATGGTGATATTGAAGAAAGATATCCAGGATTCTTACCATGTGATGGAGCAACCTTTGCTGCAGCAGATTATCCTTGGTTGTGGGAAGCAATTGGTAACACATATGGTGGCAATGGTGCATATATTCCTGCAACTAAATCCTACACTGGAAACTTCAATGTTCCAGACTATCGTAATGTTAGAATGGTAGGTGCTGGTATCGTTGACTCTAATAGAGGATCATCTTCTTTTGTTCCTGTAACAAGTGCTGGTGGTTCATTTGAACTGACTGGATCAACTGGTGGTTACTGGTATGTTGATGATGTTGATGTTGCTGGTCCAGATCCACTAGAACAAGTTGTTGCACCTGCTGGATCTAGTGATGGTATAGAATCAGAATACTTTACACTAGGAACTCCAAGAACATTTGGAACTGAAGAACTAGAGGCAGATGTTGAATTTACTGTCACTGGTGAAGTTGTTGCTAACATTGGTCCTGTTAGTGATGTTTCTGTTCGTCCTCCACAGCACGAACACGAAGTGATTAGTGGACAAATTGATAGTGATGATGGTGATCCACTCATTCCATGGGGCACTAGAGCATACTATGGCACATCTGCTAGTGGTTCACAAAACTGGAGTGGAAGACCTGATAGTGATACAGATGCTGTTGATGATGGTTACTGGGAAGATGCAGGATTCTGGAACTTTGGTCAGTTTAATTCAGAAGTTGAAAACTCTGGCAGAGGATCACTTATAGATCTGTTGCCTGGTGTAGGTAGCAGTAGTGTAGCATTTGGTAACTACTGGGGTTCACCATTCTCGGAGATTAGTGGTCTAAGTGATGACTACTTCACTAAAAATGGTAATCCAAATAATGGTGACTGTGGAGTTATTGACACAACAGAAACTCGTGCTAGAATAGATAACTATCTGTCTATCTACACTGGCACACTAAATCACTCTCACTTACTAGGAACTGATCCTGTTACTAATCCACAAACTGACTTTAGTTATGGTAACGTCAACTCAGACGCTACTGCATTCAGACAAGGACTAGCAACATTCAACTCTATATTCGCACTTAAGTTTACTCAGAATGCATCGACAGATGGTGGATCAGGTGTTGATATTGAGCTCAATCCAGCAACATTCTCATGGAACAATACCAGCAAACCAATTCCTACTGCTGCTATGAATCCACAGCGCAAGGTTCCTATCATTGCACCATTCCATAAAGTTAAATATATAATTAAGGCATACTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
6882d16f74914122015168615d904ba5a840eea12a40c98fb606cc2d46edd5bb
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5059
Evidence 0,5059
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The genomic content and context of auxiliary metabolic genes in marine cyanophages Marston,M.F., Martiny,J.B.H. and Crummett,L.T. 2016-12 — GenBank