Protein

Genbank accession
AIX45815.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MEISGSQIVDSLITGDLEVTGVTTTKELRFTDAVGVGLTLTNLVVTGNAELNGSGIVTAGQDINFRNLEVAGLSTFVGLQSFRSAVGTALTVYNLRVPENGIVSLPGIPVQGGDAEFRNVNVTGVSSFSGVSTFGSDLYVDGNLFVSGLDFRETLAGENLLVAGVGTVNNLNSNIGIITHLQAGISTFTGITTFQSDASFLSDVYVDGNLNVTGDIRYDEVNGRNLNISGIATIGYSSITDAKIGVATISTLSFGDGVGTALTLTDLTVTGDANLNGSGIVTAGSDVAFRNLEVTGLSTFTGVGTFLSDLYVGGDLFVFNDIKYDEINGRNLNISGISTLGFTSISDIRVSGGSTFLGNVEIDGNLDVTGDLTFDEFDATNANITGIATIGNLLAGVGTITTLSSTDGEITTLTSTDTVVGTLTATDATITTLGVTDSIVGTSTITTLSVTDSVVGTSTITTLNFTDGVGVALTLTDLNVLGEANLNGSGIATAGSDIEFRNLSITGLSTFVGVATFQDDLYVAGNLNVLGDLTYDEVNGRNLNISGIATIGFASITDLRVSGVTTFLGPVNIDGGQQTDFIQTTDLIVTGVATIGYATVTKLIADHSDMRNLNVSGIATIGSLVSDGNGGIIVDGAVSISGIVTIGENSIILDGRKDVEAIYLGDTGRAIVSGITTDGKRTYVKFDDGRFDRLNVSGISTFNDVVSTSSTITNLDVTTATVGFLTATQGYVGVLTVGTFTNDGGGSVIGDDITTRNLNVTGVSTFAGIVTTTGDLYVGGDLFVFNDIFYDEINGRNLNITGVATIGYSSITDVRVSGVATFLGDVNISGVTSVTTLEATGIDAYRVTTQRLIVPDDGFVQLPGIPVSGGSAEFSELLITGISSFVGVATFKDDVYIDGDFIVGGSQVIDNVATENIIISGIATIRTGEITELNVGIATVGFLTATDGYIGVLTAQNYTSLSDERLKSNIETIDDALAGVLRLDGVMFQWNNTGKTDMGVIAQQVEAVFPEIVHGDDTKGVNYNGLIGVLIEAVKELKVENDSLRERLDRLE
Physico‐chemical
properties
protein length:1052 AA
molecular weight: 108796,73690 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06559
hydropathy:0,30722

Domains

Domains [InterPro]
IPR036388
951–1034
IPR036388
IPR030392
962–1048
IPR030392
IPR030392
962–1013
IPR030392 Coil
AIX45815.1
1 1052
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX45815.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019159 [NCBI]
CDS location
range 204577 -> 207735
strand +
CDS
GTGGAGATCAGTGGATCACAGATTGTTGACTCACTAATAACTGGTGACTTGGAAGTTACTGGTGTTACTACAACTAAGGAACTAAGATTTACAGACGCTGTTGGTGTAGGACTCACACTCACCAATCTAGTTGTAACTGGTAACGCGGAACTCAATGGTTCTGGTATTGTTACCGCTGGTCAAGACATCAACTTCAGAAACCTAGAAGTTGCTGGTCTATCAACCTTTGTTGGTCTCCAGTCCTTCAGGTCAGCAGTTGGAACGGCACTCACAGTTTATAACCTAAGAGTTCCTGAAAATGGTATTGTTTCACTACCTGGTATTCCTGTTCAGGGTGGGGACGCTGAGTTTAGAAACGTCAATGTAACTGGTGTATCTTCCTTCAGTGGAGTATCAACTTTCGGTAGTGACCTCTATGTGGATGGAAACCTATTTGTTTCTGGTCTAGACTTCAGAGAGACACTTGCTGGTGAGAACCTATTAGTTGCTGGTGTTGGTACTGTTAATAATCTCAATAGTAATATTGGTATTATCACTCATCTACAGGCAGGTATATCAACCTTCACTGGTATCACCACCTTCCAGAGTGATGCCTCCTTCTTGAGTGATGTATATGTAGATGGAAACCTTAATGTTACGGGTGACATTAGATATGATGAGGTGAATGGTAGGAACTTGAATATCAGTGGTATCGCTACCATTGGTTACTCCTCTATCACAGACGCCAAGATTGGTGTTGCTACTATCTCCACACTATCCTTTGGTGATGGTGTTGGAACAGCACTCACACTTACAGACCTCACGGTAACAGGTGACGCCAACCTCAATGGTTCTGGTATTGTAACCGCTGGTTCTGATGTAGCGTTTAGAAATCTAGAAGTAACTGGACTATCTACCTTCACTGGTGTTGGTACTTTCCTCAGTGACTTGTATGTTGGTGGTGACCTCTTTGTATTCAATGATATCAAGTATGATGAGATTAATGGTAGAAACCTAAACATCTCTGGTATCTCCACACTTGGTTTCACTTCTATCTCCGACATCAGAGTATCTGGTGGTTCTACCTTCTTAGGTAATGTAGAGATTGATGGAAACCTAGATGTAACTGGTGACCTAACCTTTGATGAGTTTGATGCCACTAACGCTAACATCACTGGTATTGCCACTATTGGTAACCTACTAGCGGGTGTGGGAACTATCACCACACTATCATCTACTGATGGTGAGATTACAACACTAACCTCTACTGATACTGTTGTTGGTACTCTAACCGCCACTGATGCCACTATCACTACACTAGGTGTTACTGATAGTATAGTTGGAACCTCTACCATTACAACACTCAGTGTTACTGATAGTGTAGTTGGAACTTCTACTATAACAACACTCAACTTCACTGATGGTGTTGGAGTAGCACTCACACTCACTGACCTCAATGTTCTAGGTGAAGCTAACCTCAATGGTTCTGGTATCGCAACCGCTGGTTCTGATATAGAGTTTAGGAACCTCAGTATTACTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGTGTAGCAACCTTCCAAGATGACTTGTATGTGGCAGGTAACCTGAATGTATTGGGTGACCTAACCTATGATGAAGTGAATGGTAGAAACCTTAACATCTCTGGTATCGCTACCATTGGTTTCGCCTCTATCACAGACCTAAGAGTATCTGGTGTAACTACCTTCCTCGGTCCTGTTAATATCGATGGTGGTCAGCAAACCGACTTCATTCAAACCACAGACTTGATTGTCACTGGTGTTGCCACTATTGGTTACGCAACTGTCACTAAGTTGATCGCTGATCACAGTGATATGAGGAACCTGAATGTATCAGGTATCGCCACTATTGGTAGTCTCGTATCAGATGGTAATGGTGGAATCATTGTAGATGGTGCTGTATCTATCAGTGGTATTGTTACTATTGGTGAAAACTCTATCATTCTCGATGGTAGAAAGGATGTAGAAGCAATCTACTTGGGTGATACAGGAAGAGCAATCGTCTCTGGTATTACTACTGATGGTAAGAGAACTTATGTCAAATTTGATGATGGTAGATTTGATAGACTAAATGTATCTGGTATCTCTACCTTCAATGATGTAGTATCCACATCATCTACTATCACTAACCTAGATGTAACCACAGCAACTGTTGGTTTCCTAACCGCAACTCAGGGTTATGTTGGAGTTCTAACTGTAGGAACATTCACCAATGATGGTGGTGGTTCTGTTATTGGTGACGATATCACAACCAGAAACCTGAATGTAACTGGTGTATCTACCTTCGCAGGTATTGTTACTACTACTGGTGACCTCTATGTGGGTGGTGACCTCTTTGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATCAATGGTAGAAACCTGAATATCACGGGTGTCGCCACTATCGGTTACTCCTCTATCACTGATGTTAGAGTATCTGGTGTAGCAACATTCCTAGGTGATGTGAATATCTCTGGTGTTACTTCTGTAACCACACTGGAGGCAACTGGCATTGATGCCTATCGGGTTACTACTCAGAGATTGATCGTACCTGATGATGGTTTCGTACAACTACCTGGTATCCCAGTTAGTGGTGGTTCCGCTGAGTTCTCAGAACTATTAATAACTGGTATATCTAGTTTCGTTGGAGTCGCCACCTTCAAGGATGATGTGTATATCGATGGTGACTTTATTGTTGGTGGATCTCAGGTTATTGATAATGTTGCTACTGAGAACATTATCATCAGTGGTATTGCTACAATAAGAACAGGTGAGATCACTGAACTAAATGTAGGAATTGCTACAGTTGGATTCCTCACAGCCACTGATGGATACATTGGAGTTCTAACAGCTCAGAACTACACTTCACTCTCTGATGAGAGACTCAAGTCTAACATTGAAACTATTGATGATGCTCTAGCGGGTGTTCTCAGACTCGATGGTGTAATGTTCCAGTGGAATAATACTGGCAAAACTGATATGGGTGTTATCGCCCAACAGGTGGAGGCGGTATTCCCCGAGATCGTACATGGGGATGATACAAAGGGAGTCAATTATAACGGTCTTATTGGTGTACTGATCGAAGCAGTCAAGGAACTCAAAGTAGAAAACGATAGTCTCAGAGAGAGACTAGACAGACTGGAGTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
1730282b0084cff16af7fb5ef26d033442b81bdc4636d0e9e947798988ac2c78
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5349
Evidence 0,5349
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank