Protein

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Genbank accession
QPB12125.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,76
Protein sequence
MIKNPSPAKMVLSSIAVGYTKALVYHSPFADPDTIGKTFWIKTGDTEVAQTSQDLNTFYMILEKLVPNTTYSVTGAYWDSMIDSELLANKISILISDSSNITTLLAPRIKSYKSEMEAAVVGVGTSYLIVDFEGSGQLVELQLSKDGNTWETVYSGEIKEGVRLANVPAGTYKARCRGRVALPDGFTTDVSDWTQYPADLVVNYAFTPPSKPTNLTFTAARILDGNERYDVQVKWNWAVGNGANIREFVLYYVPKAEFDKTGWAKAARVNTGATQAAIITGFPWEIPTVFKVEAISWGPSDKNTTASDNANFTLNSSTPLDSSFTKTTGIEITYSHIKGQKQVNGKWEQTFLLNASDGSFSLGMLNDKGVAPISMDPVTGTVNVDGKVISNEIYAASVVLSNLTGQDNPKIYSVGKTYGGDTSGVWMGMGKDGLARFDVGNKDSFIRFDGEKIWMSAGVTIGTPNGDITIGDGITGIRQVTIYQLNTAAPSIPVSQEYPPPGWSKTPPSIQDPFKQKIYASTGQLDPVTDKLVFGTNYSQPVQWSGEVGADGGNGKPGLDGQGVVYSYQLGLVNVTPAKPSGTQYPPAGWSKTTPAVPNPLTHCIYATMGILDPKTNALKAGTTWDTPVKFTGNDGEKGNDGKNGTNGTNGLPGADGKGTVSIYQLGNKGTIPSASTLSDYPPNGWSVNPPAIPNPLTQCVYVSIGQLDPKTNKLVSGTKWATPVQFTGNNGSNGQDGKPGADGKPGTNGTNGLPGQDGFGLTYVYQVSRTQPVIPSGIEYPPTNWSKTPPANYNPTVEAVYASMGTLDPRTNKLVAGTGWSTPIQWSGIPANPVNNNLLTGTTDLIIVDSSNTSVSKSSSLANEFMPTVQFFNINRGKKITVSCFIETNGIVEGVSGGRHRLGCEMSITYADNTVHYIGAWYSSPNSFSGVKSSTYTIQNKEVIRVDRIGVYIQGKTTFGKVSQVKLEEGGTATAWVDAGKNGAEGRPGTNGTNGAPGKDGANGLDGQGVVSIYVLGNIGTVPGRPTPIDYPPSGWSAAPPAVPNPLTQCVYVAVGKLDPKTNKLASGGTWSTPIQWSGKNGDKGNTGDKGANGTNGLPGLDGRGTVSIYQLGNIGSVPSASTLADYPPNGWAISPPSVPNPLTQCVYSSVGTLDPKTNKLASGTKWSTPVQWTGKNGDKGANGANGLPGKDGADGRPGKDGTNGTNGAPGANGQRGPGFYRQGRSAAGWSDADATAFFRSTFNSTPVQYDVLTQYHTSNPKAGTTRQWNGSSWINPALMVHGDMVLDGTITSKKIVADQAFFAQTGINVIYDRAAALSSNPEGTYKMKIDLQNGSIHIR
Physico‐chemical
properties
protein length:1341 AA
molecular weight: 141723,51020 Da
isoelectric point:8,05470
aromaticity:0,08725
hydropathy:-0,37077

Domains

Domains [InterPro]
IPR057550
STR
10–97
IPR057550 IPR057551 IPR057552 IPR057549 IPR057549 IPR057549 DC_1333 IPR057549 DC_1191
IPR036116
STR
14–296
IPR036116 DC_0392 IPR057549 DC_1191 IPR057549
IPR057551
STR
105–193
IPR057551 DC_1191 PTHR24637
DC_0392
STR
642–747
DC_0392 IPR057549
QPB12125.1
1 1341
Architecture
STR
STR 10-1341
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Providencia phage PSTCR5
[NCBI] 		2783547 Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Priunavirus PSTCR5 >
Host Providencia stuartii
[NCBI] 		588 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPB12125.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW057857 [NCBI]
CDS location
range 23463 -> 27488
strand -
CDS
ATGATTAAAAACCCATCTCCAGCAAAGATGGTTCTGAGTTCAATAGCGGTAGGGTACACTAAAGCTTTAGTGTACCACTCCCCTTTTGCTGACCCAGACACTATCGGTAAGACATTCTGGATTAAGACAGGTGATACGGAAGTTGCACAAACTTCACAAGACCTGAATACTTTCTATATGATCCTAGAGAAACTAGTCCCTAACACTACTTATAGTGTTACAGGGGCATACTGGGACTCTATGATCGATTCCGAACTGCTTGCTAATAAGATAAGCATTTTAATTTCTGATTCGAGCAACATAACAACTCTTCTAGCTCCAAGAATAAAATCATATAAATCAGAGATGGAAGCAGCAGTTGTTGGTGTTGGTACATCTTATTTAATCGTCGACTTTGAAGGATCCGGTCAGTTGGTGGAGCTACAGTTGTCTAAAGACGGTAATACGTGGGAAACTGTTTACTCCGGAGAAATCAAAGAAGGGGTACGATTAGCTAACGTTCCTGCCGGTACTTATAAGGCACGTTGTAGAGGGCGTGTTGCATTGCCAGATGGGTTTACTACAGATGTTTCTGACTGGACTCAGTACCCTGCTGACTTAGTTGTAAACTACGCATTTACTCCACCTAGTAAGCCAACTAACTTAACTTTCACAGCTGCTAGAATCTTAGATGGCAATGAGAGATATGACGTTCAGGTCAAGTGGAACTGGGCTGTGGGTAATGGCGCTAATATACGTGAGTTTGTCCTATACTATGTACCTAAAGCAGAGTTTGACAAAACTGGATGGGCTAAGGCAGCACGTGTCAATACCGGTGCTACTCAAGCAGCAATTATCACAGGTTTTCCTTGGGAAATCCCAACAGTATTTAAAGTGGAAGCAATCTCATGGGGTCCTTCCGACAAGAATACTACTGCAAGTGATAACGCTAACTTTACATTAAACTCAAGCACACCCTTAGATTCTTCATTTACTAAGACTACGGGTATTGAGATAACTTATTCCCATATCAAAGGTCAGAAACAAGTAAACGGTAAGTGGGAACAAACTTTCCTATTAAATGCATCAGATGGGTCTTTTAGTCTTGGTATGTTAAACGATAAAGGGGTTGCCCCAATATCTATGGACCCAGTTACTGGTACAGTAAACGTTGATGGTAAAGTTATCTCTAACGAGATATATGCTGCTAGCGTAGTACTTTCAAATCTGACTGGACAAGACAACCCTAAAATCTACTCTGTAGGTAAGACCTATGGCGGTGATACATCTGGTGTTTGGATGGGTATGGGTAAAGACGGTCTTGCAAGATTTGACGTTGGTAATAAAGATAGTTTTATCCGGTTTGACGGTGAAAAGATCTGGATGTCTGCTGGAGTAACTATTGGTACACCTAATGGGGATATTACCATAGGTGATGGTATTACTGGTATCAGACAAGTTACTATTTACCAGCTAAACACCGCAGCTCCTAGTATACCCGTTTCTCAGGAGTACCCACCTCCAGGATGGAGTAAGACTCCTCCTAGCATTCAAGACCCCTTTAAGCAAAAGATTTATGCAAGTACTGGTCAACTAGACCCAGTTACTGATAAGCTTGTGTTTGGAACAAACTACTCGCAACCAGTGCAATGGAGTGGTGAAGTAGGGGCAGACGGTGGTAATGGTAAGCCTGGGTTAGACGGGCAAGGTGTGGTTTACTCCTACCAGCTAGGTCTAGTTAATGTAACACCAGCTAAACCATCTGGAACTCAATATCCACCAGCTGGGTGGTCCAAGACTACTCCTGCGGTACCAAACCCATTAACTCACTGTATATACGCCACGATGGGTATTTTAGATCCTAAAACTAATGCTCTTAAAGCAGGAACAACATGGGACACTCCCGTTAAGTTCACTGGTAATGATGGTGAAAAGGGTAATGATGGTAAAAATGGTACTAATGGTACTAACGGGTTGCCTGGAGCAGATGGTAAGGGTACTGTATCTATTTACCAACTTGGCAATAAGGGTACTATACCATCAGCATCAACCCTGTCGGATTACCCACCAAACGGTTGGAGTGTTAATCCTCCTGCCATACCAAACCCACTAACTCAATGTGTCTATGTATCCATTGGTCAGTTAGACCCTAAGACTAATAAGTTAGTCTCTGGTACTAAATGGGCGACCCCAGTTCAGTTCACTGGTAATAATGGTAGTAACGGGCAAGATGGTAAACCAGGTGCCGACGGTAAACCTGGTACTAACGGTACTAATGGGTTGCCTGGTCAGGATGGCTTTGGTTTAACCTACGTATATCAAGTATCTAGAACTCAGCCAGTTATTCCTAGTGGTATTGAGTACCCTCCTACTAACTGGTCTAAAACTCCACCAGCAAACTATAACCCAACTGTAGAAGCTGTTTATGCCTCTATGGGTACATTAGACCCTAGAACTAATAAGCTTGTGGCTGGCACTGGATGGTCTACCCCAATACAATGGAGTGGTATACCAGCTAATCCAGTTAATAATAACTTACTAACTGGTACTACAGACTTGATTATTGTGGATTCTAGTAATACTAGTGTTAGCAAATCCTCTTCCCTAGCTAATGAGTTTATGCCGACTGTTCAGTTCTTCAATATCAATAGAGGGAAAAAAATTACAGTATCTTGTTTTATAGAGACTAACGGGATAGTAGAAGGAGTTTCTGGAGGTAGACACAGACTGGGATGTGAAATGAGTATTACTTATGCTGATAATACTGTGCATTATATTGGTGCGTGGTACTCTTCTCCAAATTCATTTAGTGGAGTGAAGTCATCTACTTATACTATTCAAAATAAAGAAGTAATACGGGTAGATAGGATAGGGGTCTATATTCAGGGTAAAACTACATTTGGTAAAGTATCTCAAGTTAAGCTAGAAGAGGGGGGTACAGCGACTGCTTGGGTCGATGCTGGTAAGAATGGTGCTGAAGGTAGGCCGGGAACTAACGGTACTAACGGGGCGCCCGGTAAAGACGGAGCAAATGGGTTAGATGGTCAAGGTGTAGTATCTATCTATGTTTTAGGCAATATTGGAACAGTACCTGGCAGACCAACTCCTATTGATTACCCTCCAAGTGGGTGGTCTGCTGCTCCACCAGCAGTACCTAACCCATTGACACAATGTGTCTATGTGGCTGTTGGTAAGTTAGACCCTAAAACTAATAAGTTAGCCTCTGGTGGGACTTGGTCTACTCCTATACAGTGGTCTGGTAAGAACGGTGATAAGGGAAATACCGGTGACAAAGGTGCTAATGGTACTAATGGATTGCCGGGTCTGGATGGTAGAGGTACTGTATCTATATATCAACTTGGTAATATTGGGTCTGTACCTTCAGCATCAACTCTAGCTGACTATCCACCAAATGGTTGGGCTATAAGTCCTCCATCTGTTCCTAATCCTCTCACTCAGTGCGTGTATAGTTCAGTAGGTACTCTGGATCCTAAAACTAATAAACTTGCTTCTGGGACTAAATGGAGTACTCCAGTCCAGTGGACTGGTAAAAACGGTGATAAAGGGGCTAACGGAGCTAATGGGTTGCCTGGTAAAGATGGTGCCGACGGTAGGCCAGGTAAGGACGGTACTAATGGTACTAACGGGGCGCCTGGAGCAAACGGGCAGCGAGGGCCTGGGTTCTATAGGCAGGGTCGAAGTGCTGCTGGATGGTCAGATGCTGATGCTACAGCTTTCTTTAGATCCACATTTAACTCGACCCCTGTACAGTACGACGTTTTAACACAGTATCACACATCCAACCCTAAAGCTGGCACTACTAGGCAGTGGAATGGTAGTTCGTGGATTAACCCAGCACTTATGGTTCACGGAGATATGGTATTAGATGGCACTATTACATCTAAAAAGATAGTTGCAGATCAAGCATTCTTTGCACAAACAGGTATTAACGTTATATATGACCGTGCTGCTGCGTTGTCTTCTAACCCAGAGGGTACATATAAAATGAAGATAGATCTACAAAATGGGTCTATTCATATAAGGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
d395d73724e7b5c48ad7eff579cf218242878fab95a48f956d6ead04420b2c07
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7665
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Novel bacteriophages targeting Providencia spp. as potential agents for phage therapy Rakov,C., Alkalay-Oren,S., Coppenhagen-Glazer,S. and Hazan,R. 2021-04-02 — GenBank