Protein

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Genbank accession
YP_013395997.1 [GenBank]
Protein name
structural component of the tail fiber
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Protein sequence
MAGGRRFQAGLGSEHKRLYKEGQQINTLLLAQVIQVNYKYNTVDLLALQHKEVFQNSYANEGRFSARLPMEFGGRNLAGQPYGQVNPIAVGTVVLVGFINSDKDMPIVISVYNNNDVNKQLSRTRFANADPTDMALAGQMYQKFSLYPSLTYDSIDGDGNRVVTFSGKSFIAFDTKDMQNSPMTDASYGSRYEDLGTSYYNDGELIEPMKGRAPNVLFKHQGILDDDNKPDTHNFMIHINPDGTYRTSMMDTEQDWRTMFEMTPEGKIRLRRQGDTVRLNDGFEIGELGINEEGIVYLRNGDMDLEVREDGIYSQGKLITENINLDDIYEKLANVTFEINKTNESLQILTEKSELQDGKIVNLETEITIVAGKVESKVSATEVQDMIDSSIVDMTDAIKKAQEDADRANKVISDMASDNRLAPSEKLELLKEWDTIKNEYPTYLAQAELYEVDSTTYTAKYKALETFVTPLLEDMEATSVVDGSIMRKTFSAYYTERINLLNAITKGLKDGLEEAMKKASQASVDATQALADSAQAQIDANNAKQLIADIASDGKLTASEKYQLKKEWDVIVKEYPTTIAQATKYKVNTDNYTAKYKALETFVTPLFANMDETSVVNGEQLRAVFSDYYAVKITLLKEITDIARDELTDYGNRITVAETKITQTSEAITLMASRVETVENDVKTNTAQLKVQADLISQKVTASEVKDAIDNAIDNMSIGGSNLFVIKTQTAGLLNENNGTVGTAVDKSVVSNYIKVTAKMPYVASLYGNTGTNSIIIAWYDTSKTFISGQAVADSGDFHKTYVAPENAVYARLSYKKADTVKMKFEVGTKPTDYSPSWDDIKGDQTALEEYIKQVEEQAKQAQQEAENAKNEAENANSAIADMSNDNMLTANEKQQILLQWEEIKTEYPINLDQATKFGVSATQYTTAYNALKTYLDPLLADMTTTSVIVGSTMRSTFNTYYDRRTTLLNRVAELAKQVADQAKDTADKVDDDLNNIGGYNYIGFSSGDHMYPRLMIKNIGYYYVPSMGSAEFVDDMVCLKPKTTEKKVQYEIGSSSANISGVGLANYRMKEVKTGQWLTASANLKVVGTGKAYITIFTLENGSWQFSLSDMVTASQGVTRVVAQRKVTDQTQGVFIRISGDIIDEVHFGNTQLEVGIRSTPWKKSDIDIQEDINNVADDIKDYIGARSDNLITNGFGELGNNTNIGGIFDGADRIVGKGSFRQEEGNKSLLFSEHIVIDNKKVYNFDYYMHTLKGVGRSYAMIAPYDVDGKRITFPSLGGRNYNSITPVKFTKLAKPLKVGDTEVFVEDASLWNGQAPQDYQRSIIMWGYKNSFGYTYPDGTYSQLMQMKTYDIGAVDTTANKITLNKPWAVANPNSSDGIFPVGHTLSPTSDGSTYLYLNGHVNIQVPTTYTKYSHLISGSSEFANTTLIPVETGSIQLGFLLNRDTTGEKSWLNGLRLRDYTDTYKLNDDVRETQENVDKAQADADKANQSIADLSNDNLVTPNEKLDLKKEWEIIVAEKPKNDAQADKFGVSKVAYGTAYTALDTYLKPILASTTTNSAIVGQTMRDTFKAYYTARTDLLNTIASKAKELADNAQDTADNIAVGTRNLLIGTQDFSKGKYPGNANVTITDEKLFGNAVMKNDYTTGTGYSDMYQMTTSIIPTGTQYTLSFYAKADLEGTKMSCYFYNPNTTTSSVNSQGGKLSSSDGRTVFVLSTEWTKYWVTWTQTQADKPKSVIIGRKTGGEEPNSAFYMSSPMMVEGNKPQTWMKAPEDIETAINGKEGAWVYSPTAPTNPAVGLVWVDSSKTPNQPKRWVGGETGWVALTPEEVKDLPWGEDGSSLADWVAQAEQKISSDAIISTVLGSEDFTGIFDSKANTEDLNNLASYDDLDAMQAEYERLLKEGIAGIDFSPYVTNTELEQLKDSFTFSVQQAGGVNMLKNSLGFSGTDFWQASSGIDTTQNEQLSKLGFGSGFMINRVQNATLAQTIELPEAKQGLQYALSFYMNVATFGDVTDFQCGAHIYEEGVLKYTVGVTDATQEIPSDYHLYKLVFEPESPNTVIELFVTNGAQATVIISGVMYNIGNIALKWQPYPSEIYNTNVKIDINGITVKNNQTDGYTMITPQEFSGYARVNGEMERIFTLNGQVTEVKMLQAEKRITMEPISVFAMNSKETNTIGWAFVAFGEVAHSAIASSTQ
Physico‐chemical
properties
protein length:2198 AA
molecular weight: 243278,22230 Da
isoelectric point:4,78564
aromaticity:0,09236
hydropathy:-0,41915

Domains

Domains [InterPro]
DC_1874
ATT
73–506
DC_1874 DC_0293 Coil
Coil
Unmapped
391–418
Coil Coil DC_0015
YP_013395997.1
1 2198
Architecture
ATT
STR
ATT 73-506 | STR 555-2198
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterococcus phage PEf771
[NCBI] 		2601638 Uroviricota > Caudoviricetes > Herelleviridae > Schiekvirus > Schiekvirus Pef771
Host Enterococcus faecalis
[NCBI] 		1351 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_013395997.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_129615.1 [NCBI]
CDS location
range 30798 -> 37394
strand -
CDS
TTGGCAGGAGGACGTAGATTTCAGGCAGGGTTAGGTTCCGAACATAAAAGATTATACAAAGAAGGACAACAAATTAATACTTTGTTGCTAGCCCAAGTTATCCAAGTTAATTATAAATACAATACAGTTGATTTACTAGCATTACAGCATAAAGAAGTTTTCCAAAACTCCTATGCCAATGAAGGTAGATTTTCTGCTCGTTTACCAATGGAATTTGGTGGACGAAACCTTGCAGGACAACCATATGGTCAAGTAAACCCTATTGCCGTTGGTACTGTTGTCCTAGTAGGTTTTATTAACTCTGATAAAGACATGCCGATTGTTATTAGTGTATACAATAACAACGATGTAAATAAACAATTATCCCGTACACGTTTTGCTAATGCAGACCCTACAGATATGGCTTTAGCGGGACAAATGTATCAAAAATTTAGTTTGTACCCATCTTTAACTTACGATAGTATTGATGGGGATGGTAACCGAGTAGTTACATTCTCTGGTAAATCATTTATTGCATTCGATACAAAAGATATGCAAAACTCTCCAATGACAGATGCTAGTTATGGTTCTCGTTATGAAGACCTAGGAACCTCTTACTATAATGATGGAGAACTAATTGAGCCGATGAAAGGTCGAGCACCTAATGTGTTGTTCAAGCACCAAGGGATTCTTGACGATGATAATAAACCAGATACACATAATTTCATGATTCACATTAACCCAGATGGAACATACCGTACATCTATGATGGATACGGAACAAGACTGGCGGACAATGTTTGAGATGACACCGGAGGGTAAAATCCGTTTACGTAGACAAGGGGATACTGTACGTCTAAACGATGGTTTTGAAATTGGTGAACTAGGTATTAATGAAGAAGGTATCGTTTATTTACGTAATGGGGACATGGACTTAGAAGTTCGTGAAGATGGTATCTATTCCCAAGGTAAACTAATCACAGAAAATATCAATCTTGATGATATTTATGAGAAATTAGCTAATGTTACTTTTGAAATTAATAAGACAAATGAGTCCTTACAAATTTTAACTGAGAAATCAGAGCTACAAGATGGTAAGATTGTAAATCTAGAAACAGAGATTACAATTGTAGCTGGAAAAGTAGAATCTAAAGTAAGTGCAACAGAAGTACAAGACATGATTGATAGCTCTATTGTAGACATGACGGATGCTATTAAAAAAGCCCAAGAAGATGCAGATAGAGCAAATAAAGTTATTTCTGATATGGCTAGTGATAACCGTTTAGCTCCTAGTGAGAAGCTAGAATTACTAAAAGAGTGGGACACTATCAAGAATGAATACCCAACTTATTTAGCACAAGCTGAACTATACGAAGTAGATAGTACAACTTATACTGCTAAGTACAAAGCTTTAGAAACATTTGTTACTCCTTTATTGGAAGACATGGAAGCTACTAGTGTAGTAGATGGTTCTATTATGCGTAAAACATTTAGTGCATATTACACAGAACGAATCAATTTACTAAATGCAATCACTAAAGGGTTAAAAGATGGTTTAGAAGAGGCAATGAAGAAAGCTTCTCAGGCTTCTGTAGATGCTACACAAGCTTTAGCTGATTCTGCACAGGCACAAATTGATGCAAACAATGCAAAACAATTGATTGCAGATATTGCTAGTGACGGTAAGCTGACTGCTTCTGAAAAGTACCAATTGAAAAAAGAATGGGATGTTATTGTTAAGGAGTATCCTACAACAATTGCCCAAGCAACAAAGTACAAAGTAAATACAGATAACTATACTGCTAAGTATAAAGCTTTAGAAACATTTGTCACTCCTTTGTTTGCGAATATGGATGAAACAAGCGTAGTTAACGGGGAACAACTACGTGCAGTATTTTCTGATTACTATGCTGTAAAGATTACTTTATTAAAAGAAATCACAGATATTGCTCGTGATGAATTGACTGATTATGGTAACCGTATTACTGTAGCAGAAACAAAAATCACACAAACATCCGAAGCTATTACGTTAATGGCTTCCAGAGTGGAAACTGTTGAAAATGATGTTAAAACAAACACAGCGCAATTGAAAGTGCAAGCAGACTTAATTAGTCAGAAAGTAACTGCTAGTGAAGTAAAAGATGCTATTGATAATGCAATTGATAACATGTCTATTGGTGGTTCTAACTTGTTTGTAATCAAAACGCAAACAGCAGGACTATTGAATGAAAATAATGGTACTGTAGGAACAGCCGTAGATAAATCTGTAGTATCTAACTATATCAAGGTAACAGCTAAAATGCCTTATGTAGCTTCTTTATATGGAAACACAGGGACAAACAGTATTATCATTGCATGGTATGACACAAGCAAAACGTTTATCTCTGGTCAAGCTGTAGCTGATTCTGGTGATTTCCATAAAACTTATGTTGCACCAGAAAACGCAGTATATGCTCGTTTAAGTTATAAAAAAGCTGACACTGTTAAAATGAAATTTGAAGTAGGTACGAAGCCAACTGATTACAGCCCGTCATGGGATGATATTAAAGGTGACCAGACTGCTTTAGAGGAATACATTAAACAGGTAGAGGAACAAGCTAAACAAGCACAACAAGAAGCAGAAAACGCTAAGAATGAAGCAGAAAACGCAAATAGTGCTATTGCTGATATGTCTAATGACAATATGTTAACAGCAAATGAGAAACAACAAATTTTACTACAATGGGAAGAAATTAAAACGGAATATCCAATTAATTTAGACCAAGCAACTAAATTTGGTGTTTCTGCTACGCAGTATACAACAGCGTACAATGCTCTAAAAACATATTTAGACCCATTATTAGCAGATATGACAACAACTTCTGTAATTGTTGGTTCTACTATGCGCAGTACATTTAATACTTACTACGACCGTAGAACAACATTGCTTAATCGTGTAGCTGAACTAGCTAAACAAGTAGCTGACCAAGCTAAGGATACAGCAGACAAAGTAGACGATGACTTAAACAACATTGGTGGGTACAACTACATCGGATTCTCTTCCGGAGACCATATGTATCCTCGTTTAATGATTAAGAACATTGGTTACTACTATGTACCTTCTATGGGGAGTGCAGAATTTGTAGATGACATGGTATGTTTAAAGCCAAAAACAACAGAAAAGAAAGTTCAGTATGAAATTGGCTCCTCATCAGCTAACATATCCGGTGTTGGTTTAGCAAATTATCGGATGAAAGAAGTTAAAACAGGTCAATGGTTGACTGCTTCTGCAAACTTAAAAGTTGTTGGTACTGGTAAAGCATATATTACTATCTTTACTTTAGAGAACGGCTCTTGGCAATTTTCACTAAGTGATATGGTTACAGCAAGTCAAGGAGTAACTCGTGTAGTAGCTCAAAGAAAAGTGACAGACCAAACACAAGGGGTATTCATACGCATCAGTGGAGATATTATTGATGAAGTTCATTTTGGTAATACACAACTTGAAGTTGGTATTCGCTCTACCCCTTGGAAGAAATCAGATATTGACATTCAAGAAGACATCAACAATGTTGCGGACGATATTAAAGATTATATTGGTGCTCGTTCTGATAACTTAATCACAAATGGTTTTGGTGAATTAGGGAACAATACGAACATTGGTGGTATCTTTGATGGTGCTGATAGGATTGTAGGTAAAGGTTCCTTCCGTCAAGAAGAAGGAAACAAATCACTATTATTCAGTGAACACATTGTTATTGACAATAAGAAAGTTTATAACTTTGATTACTACATGCACACATTAAAAGGTGTTGGTAGAAGTTACGCAATGATTGCCCCGTATGACGTAGACGGGAAACGTATCACATTTCCTTCTCTCGGGGGACGAAACTACAACTCTATTACCCCTGTTAAATTTACAAAACTAGCAAAACCACTTAAAGTCGGAGATACAGAGGTTTTTGTAGAAGATGCTAGTCTATGGAACGGACAGGCACCGCAAGACTACCAACGTAGTATTATCATGTGGGGTTATAAAAACTCGTTCGGCTATACTTATCCCGATGGAACGTATAGTCAGTTAATGCAGATGAAGACATATGATATTGGTGCAGTTGACACCACAGCTAACAAGATTACGTTAAACAAGCCATGGGCAGTTGCAAACCCAAATAGTTCAGATGGGATTTTCCCAGTAGGGCATACACTTAGCCCAACTTCTGACGGTTCCACATATCTATATTTGAATGGTCACGTAAATATACAAGTACCTACTACGTACACCAAGTACAGCCATTTGATTAGTGGCTCTTCTGAGTTTGCTAATACAACGCTTATCCCAGTAGAAACAGGTTCTATCCAACTTGGATTCTTGTTGAACCGTGATACAACAGGTGAAAAATCTTGGCTAAACGGTTTACGTCTACGTGATTATACAGATACGTATAAGCTAAACGATGACGTTAGAGAAACACAAGAAAATGTGGATAAAGCCCAAGCAGATGCAGATAAAGCTAACCAGTCAATTGCTGATTTATCTAATGATAATTTAGTTACTCCTAACGAGAAACTAGATTTGAAAAAAGAGTGGGAAATCATTGTTGCTGAAAAACCTAAGAATGATGCTCAGGCAGATAAATTCGGAGTAAGTAAAGTAGCTTACGGTACTGCGTATACTGCTCTAGATACGTATTTAAAACCCATCTTAGCAAGCACAACAACGAACTCTGCGATTGTTGGACAAACTATGCGGGATACGTTTAAGGCGTATTACACGGCTCGTACAGACCTGTTAAACACTATTGCATCTAAAGCTAAGGAATTGGCTGATAATGCACAAGATACCGCAGATAATATAGCTGTCGGTACTCGTAACCTTTTAATCGGAACACAGGACTTTTCCAAAGGTAAATATCCGGGTAATGCTAACGTTACCATTACAGATGAAAAGCTGTTTGGAAATGCAGTAATGAAGAACGATTACACTACAGGTACCGGATATTCAGATATGTACCAAATGACGACCTCAATTATTCCAACAGG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
88a426fa03a9d9a5d255c4e7c394f12cf2ee20fe9d056466ae024cdbaa1163e1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7311
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characteristics and whole genome analysis of the Enterococcus faecalis phage PEf771 Xiang,Y., Ji,X., Wei,Y., Song,F., Li,W. and Yang,X. 2020-09 — GenBank