Protein

Genbank accession
ABI79098.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MLPIPLLKLGRHFLDKRGGIKELAVLSYPIDNSDGTSNTVSYVNSLAILFDDGQLNITGYNRFGECRTGDLDTINYPNEAAWNVDHVWRADRAFVIRTFDNKFFYIGCTAGLIGSEAAGGNDVCVREWTPLPEQIVTGLHLDTHPERLVEVMGGVNNTVWVIAAPEADGMLHLYGSGNNTYGSLHVDKSQHATPVKIGETSESPETGPWKNPRINCEVHDNSVIFGGPNGFWIAGYDFLRNNSKNTLVYPAEHVTLDQFKGIPVGETWKGFMCGPNGAIIATERMHKPDDQQLVNVFYGQDVWGDDTWRSLNITYTHEVIMARGYGTSGIFFNNGTKQYRGFSRNLCNDIGAQSANNSPRANFIHYRALATAKFVEQTEPVSWTESVYFQGIHREGFLGTFCVVNGKLWWSGIPRGSFSGSNNLFGGRLNSQGFTEIPENWYKNVPVDSWGIEDIFDVNGVSNVSNIYIGDTVKMKLKPQPEGATFIIDKIELVNAAGTVVTDANYQFSTNWNHGGANEVVVTQYNRNINRRGLYSIKITYHDKHGTGRTYTTRTLNWNTIVPAYPSNGKWHTVGRNKQFHVNDTVYFGLNGTQPAVEGDTSYMVRLHRMDAGSVTYDVTQEIYDQRRNTYNNLVQTQAVWEFNPNGRGGKMLQVNEQNGTSLTVHEHPDPWPDPGKPHPGARTLKIVSHDVGYFGIRWEATVRYADGTTNNIGITLGGTSEDNSLKIAYTPRGISIDNMDVVRNGYGDVNVKVTLGEHLGGERIIMYAFDHDPRTNGTYANQAWSYLINAPEPNTKEFYYGMKRDVCKKTGTHDWIAICVKDERTAWDEPVNRWFIGIPTRSDKYVAEYIVCMGGTNLNMCWNEDVNKYSDYDYMRDYSCNLWFNQTTGYPPRQARVNPAIFTDTQVFLTKQANEVQTFKNKYDPNKWFYNCYGAFFWGPGELPGGGSCFEAATYASDRFMGQVKKYKIIPGPETLGNAVDPYIIMSDLRSNMDGTSISMQVPVTNGYKRVVMIIKCDLIGKQVLAENGTSTHLFETALHYQFADSPFAGDKRISDTDAVRCKKFMLGGGWWWYEFDLTDKFTDTSKVVTGLRLDLGENMHKSVCDGTYGDPTVYLKYVSFEHPEDVVYGPKLRLFGNWIAKDREGMGRKVRGFLVDAGTEDMLVNAVWPELPGTQWDNSAKSINWFNIHRAMWATNCYLWKELNDGAFGFTGGRRMAIICWTTLQRCYDHDYEIGGRAWKNIRDRIITNFADPNGGGAYGFDCSRLIHLNGSSAYKKEGYSGSMIEWGLVKDARVLMGQQLAAAIGPNAVQSVKPAWFDIPLWSSGTPGTAAINPTTGDLEISWEDLKQVGGWDKTGYQVQWWRADGSLAAEEFVKDNFYTMSSAKAQELFGQAAPSTITMSMCCKDNRTGALGPRVAKVFSGIKWNLPVQSVSWKQIGDNKLLVTPACQFNATLNVDPAVAANSAKASDFSVSNTAMADVRKIDTLNARITCKNTYGTFQIINNFTDADSKVVRTASQTLSLGTLAYAALITEQSATLQGGGVGKSIATPVWKPNEWVVFDLAVDFSSDNNWTWVRNCLPQLMGGPSSVSDSHDSTDPSVFQVGKTHPETGATLPDRKYALVCISYGKADVTFSGTHTYNGTYNFSRKYSLKAGNIIDEVGVLYNPGNGIGIVGGKLQMQEPSITPSNVAGIRKTWESSNTNIATVDATTGLVTFKATGNVTIKFVVTDDAGRKTSSTSFTVKQMAPQWRMWIGTATNGAYPNPAGTSGMKTFSTSKPMEYGSGPKVGQMVYFGAYIPEIIGLPRSQLQLLFGAGVDDLATFGYSDNIEAARSSGWVGFRMESGKEGRILGTASIGVMFPGDQQYRLEAYATFSR
Physico‐chemical
properties
protein length:1878 AA
molecular weight: 208332,48250 Da
isoelectric point:6,26038
aromaticity:0,11555
hydropathy:-0,37540

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage V5
[NCBI]
399183 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli O157
[NCBI]
1045010 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ABI79098.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
DQ832317 [NCBI]
CDS location
range 13497 -> 19133
strand -
CDS
ATGCTTCCAATCCCTTTGCTAAAACTTGGTCGTCATTTCCTCGATAAGAGGGGTGGAATTAAGGAACTTGCTGTTCTGTCATACCCAATAGACAACAGTGATGGCACAAGCAATACAGTATCCTATGTAAATAGCTTAGCTATACTTTTTGATGATGGTCAGCTTAATATTACTGGCTATAATAGGTTCGGAGAGTGTCGGACTGGAGATCTTGATACAATAAACTATCCTAATGAGGCAGCTTGGAACGTAGACCATGTTTGGAGAGCTGACCGTGCATTTGTAATCCGCACATTCGATAATAAATTTTTCTATATTGGTTGCACAGCTGGTCTTATCGGATCGGAGGCAGCAGGTGGAAACGATGTTTGTGTCAGAGAGTGGACACCTTTGCCGGAACAGATCGTAACAGGGTTGCATTTGGACACCCATCCTGAGAGACTTGTTGAAGTAATGGGTGGCGTAAACAATACCGTGTGGGTAATTGCTGCACCAGAGGCTGATGGTATGCTTCACCTGTACGGCTCTGGCAATAATACTTACGGCTCTCTTCATGTTGACAAAAGTCAACACGCTACTCCAGTTAAGATCGGTGAAACATCTGAAAGTCCAGAGACAGGTCCTTGGAAAAATCCAAGAATTAATTGTGAAGTTCATGACAACTCGGTTATTTTTGGTGGTCCTAACGGATTCTGGATTGCAGGTTACGATTTCTTACGAAATAACAGCAAAAACACACTAGTTTATCCAGCCGAGCATGTGACTCTTGACCAGTTTAAAGGCATCCCGGTGGGCGAGACATGGAAAGGGTTCATGTGTGGACCTAATGGTGCAATTATAGCCACAGAAAGGATGCACAAACCTGATGACCAACAGCTTGTTAATGTGTTTTATGGTCAGGATGTTTGGGGTGACGACACGTGGAGAAGCCTTAACATCACCTATACCCATGAAGTAATTATGGCTCGCGGGTACGGGACTAGTGGAATTTTCTTCAATAATGGTACAAAACAGTACCGTGGTTTCTCCAGAAACCTGTGTAACGATATTGGTGCTCAATCTGCTAATAATAGTCCTAGGGCCAATTTTATTCATTACAGAGCGCTGGCAACAGCTAAGTTTGTTGAACAGACAGAGCCAGTAAGCTGGACAGAAAGCGTTTATTTTCAAGGGATCCACAGGGAAGGTTTCTTAGGCACATTCTGTGTGGTAAATGGAAAGCTTTGGTGGTCAGGAATACCACGTGGTAGTTTTTCAGGATCTAATAACCTCTTTGGCGGCAGACTTAACAGCCAAGGGTTCACAGAGATTCCGGAGAATTGGTATAAAAATGTCCCGGTAGATAGCTGGGGTATCGAAGACATCTTTGATGTCAATGGTGTGAGCAATGTTAGCAACATTTACATCGGAGATACTGTCAAGATGAAATTGAAACCTCAGCCGGAGGGTGCTACGTTCATTATTGACAAGATTGAGTTGGTAAATGCTGCAGGCACTGTTGTTACAGATGCAAACTATCAGTTCTCCACTAACTGGAACCATGGTGGTGCTAACGAAGTTGTGGTCACCCAGTATAACCGTAACATCAACAGACGTGGTTTGTATTCTATCAAGATCACCTACCATGACAAGCATGGCACTGGAAGAACCTATACGACAAGGACTTTGAACTGGAACACTATAGTTCCTGCGTATCCGTCCAACGGCAAGTGGCATACTGTCGGTAGAAACAAACAGTTCCATGTTAACGATACTGTATACTTCGGACTGAATGGGACTCAGCCTGCAGTAGAAGGGGATACATCGTATATGGTCCGACTCCACAGAATGGATGCTGGATCAGTCACTTATGATGTTACCCAAGAGATTTATGATCAGAGACGAAATACCTACAACAACTTGGTGCAGACACAGGCCGTATGGGAGTTCAACCCTAACGGCAGAGGTGGTAAAATGTTGCAGGTTAACGAGCAAAACGGAACGTCGTTGACTGTCCACGAACACCCAGACCCTTGGCCTGATCCTGGAAAACCTCACCCTGGCGCTCGTACACTGAAAATTGTCAGCCATGATGTAGGATATTTCGGAATACGCTGGGAAGCTACAGTAAGATATGCCGACGGGACAACAAACAACATAGGGATCACTCTTGGTGGCACTAGTGAGGATAACTCACTGAAAATTGCCTACACTCCTAGAGGCATCTCTATTGACAATATGGATGTTGTTCGCAACGGTTACGGCGATGTGAATGTCAAAGTTACTCTTGGCGAACATCTTGGTGGGGAAAGGATCATCATGTATGCCTTTGATCATGATCCGCGCACCAATGGGACTTATGCAAATCAGGCATGGAGTTACCTGATAAATGCACCTGAGCCAAATACTAAAGAGTTCTACTATGGTATGAAGCGAGATGTGTGCAAGAAAACAGGAACACATGATTGGATTGCTATCTGCGTTAAAGATGAGCGCACAGCTTGGGATGAGCCTGTTAACAGATGGTTCATAGGTATTCCTACCAGAAGTGATAAGTATGTCGCAGAATATATTGTATGCATGGGCGGTACCAACCTAAACATGTGTTGGAACGAAGATGTAAACAAATACTCTGATTATGACTATATGAGGGATTACTCTTGTAATTTGTGGTTTAACCAAACTACAGGTTACCCTCCGCGTCAGGCAAGGGTAAATCCTGCAATCTTTACAGATACGCAGGTTTTCTTGACAAAACAGGCCAACGAGGTCCAGACCTTCAAGAACAAATACGACCCTAATAAGTGGTTCTATAACTGCTATGGGGCATTTTTCTGGGGACCTGGAGAATTACCTGGTGGTGGCTCTTGTTTTGAGGCTGCAACTTACGCCAGTGACAGATTTATGGGCCAGGTCAAGAAATACAAGATAATTCCAGGGCCTGAAACTTTAGGTAACGCTGTCGACCCCTATATCATCATGAGTGATCTAAGATCGAACATGGATGGAACATCCATATCTATGCAAGTTCCGGTAACAAACGGATACAAGCGTGTTGTGATGATCATTAAGTGCGATCTGATAGGTAAGCAAGTTCTTGCAGAGAACGGAACTTCCACCCACCTATTTGAGACTGCTCTGCACTATCAGTTTGCTGATTCACCTTTTGCAGGGGATAAGAGAATATCTGACACAGACGCTGTGCGATGCAAGAAATTTATGCTAGGTGGTGGGTGGTGGTGGTATGAATTTGACTTAACAGACAAATTCACCGACACATCTAAAGTGGTGACAGGACTTCGTCTAGACCTGGGTGAGAACATGCATAAAAGTGTTTGTGATGGCACCTACGGTGATCCTACGGTATACTTGAAGTATGTTTCTTTTGAGCACCCTGAAGATGTTGTTTATGGTCCAAAACTGAGGCTGTTTGGCAATTGGATTGCTAAAGACAGAGAAGGGATGGGTAGGAAGGTAAGAGGCTTCCTGGTCGATGCTGGCACAGAGGATATGCTGGTGAATGCGGTGTGGCCTGAATTACCGGGAACTCAGTGGGACAATTCTGCTAAGTCTATAAACTGGTTCAATATCCACAGAGCTATGTGGGCAACTAACTGCTATCTGTGGAAAGAGTTGAATGACGGCGCTTTCGGGTTTACTGGTGGCAGAAGAATGGCAATCATTTGCTGGACAACGCTGCAGAGATGTTATGACCATGACTATGAGATTGGAGGCAGGGCATGGAAAAATATAAGGGATAGAATCATAACTAACTTTGCAGATCCTAACGGTGGCGGGGCGTATGGTTTCGACTGCAGCAGACTTATCCATTTGAACGGATCTTCGGCCTATAAGAAAGAAGGCTACTCCGGGTCCATGATTGAATGGGGCTTGGTAAAAGATGCTCGTGTGTTGATGGGTCAGCAACTTGCTGCTGCAATAGGACCGAACGCAGTACAATCTGTTAAACCAGCGTGGTTCGATATCCCATTATGGTCCTCTGGAACACCAGGAACTGCTGCAATCAACCCTACCACTGGGGATCTGGAAATCTCCTGGGAGGACTTGAAGCAGGTTGGTGGCTGGGATAAGACAGGGTACCAGGTGCAATGGTGGAGAGCTGACGGATCTTTAGCCGCTGAGGAGTTTGTTAAGGACAATTTCTACACCATGTCCTCTGCAAAAGCACAGGAATTGTTCGGTCAGGCAGCTCCGTCAACGATCACCATGTCTATGTGCTGTAAAGACAACAGGACTGGAGCTTTGGGGCCAAGGGTTGCTAAGGTTTTCTCAGGTATTAAATGGAATCTCCCTGTTCAAAGTGTTTCATGGAAGCAAATAGGTGATAACAAGCTGCTGGTTACCCCCGCCTGTCAGTTCAACGCAACTCTTAACGTTGATCCTGCTGTTGCGGCAAACTCAGCTAAAGCTTCTGACTTCTCTGTGTCTAACACTGCTATGGCAGATGTGAGGAAGATTGACACACTGAACGCCAGAATTACCTGTAAAAACACTTATGGCACATTCCAGATTATCAACAACTTCACAGATGCTGATTCTAAGGTAGTGAGGACAGCAAGCCAGACTCTGAGTTTAGGAACTCTGGCCTATGCGGCCCTGATCACTGAACAGTCGGCAACACTCCAAGGAGGTGGCGTAGGTAAATCTATTGCAACACCAGTATGGAAGCCAAATGAGTGGGTTGTATTTGATCTGGCTGTTGACTTCTCTAGCGATAATAACTGGACGTGGGTAAGGAATTGCTTACCTCAATTGATGGGTGGTCCAAGCTCTGTCAGCGATAGCCACGATTCTACTGACCCCAGCGTGTTCCAGGTTGGTAAAACTCACCCAGAGACGGGAGCAACGTTGCCTGACAGGAAGTATGCTTTGGTTTGCATCTCTTACGGAAAAGCAGATGTCACCTTCTCAGGGACACACACTTATAACGGAACTTACAACTTCTCAAGGAAGTATAGTCTCAAAGCAGGGAACATTATAGACGAGGTTGGTGTGCTGTATAATCCGGGCAACGGCATAGGGATTGTTGGTGGTAAACTGCAGATGCAGGAACCTTCTATTACCCCTTCCAACGTAGCCGGGATTAGAAAGACTTGGGAAAGTAGTAATACCAACATTGCAACAGTGGATGCCACCACAGGACTGGTAACATTTAAAGCTACTGGGAATGTCACCATAAAGTTTGTAGTTACTGATGATGCAGGGCGCAAAACGTCTTCAACATCTTTTACTGTCAAACAGATGGCACCACAGTGGAGAATGTGGATAGGTACAGCAACAAACGGGGCATACCCTAATCCGGCAGGTACTTCTGGTATGAAGACTTTCTCTACAAGCAAACCGATGGAGTACGGCAGCGGTCCTAAGGTAGGGCAGATGGTGTACTTTGGTGCGTATATTCCTGAAATTATAGGGCTTCCGAGAAGTCAGCTTCAGTTGCTGTTTGGGGCTGGTGTTGACGATCTTGCCACTTTCGGGTATAGCGACAACATCGAGGCTGCAAGGAGTTCAGGATGGGTAGGGTTCAGAATGGAGTCTGGAAAGGAAGGCAGGATTCTAGGGACAGCCTCTATAGGTGTTATGTTCCCTGGTGACCAGCAGTATCGTCTAGAAGCCTACGCAACCTTTTCTCGTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
f1bf3baaf1ed15c6f86c78946b759f99c8956abb9e2bbff4b126e0d95f45d7fc
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4164
Evidence 0,4164

Literature

Title Authors Date PMID Source
The host-range, genomics and proteomics of Escherichia coli O157:H7 bacteriophage rV5 Kropinski,A.M., Waddell,T., Meng,J., Franklin,K., Ackermann,H.W., Ahmed,R., Mazzocco,A., Yates,J., Lingohr,E.J. and Johnson,R.P. 2013 23497209 GenBank