Protein

Genbank accession
YP_010070073.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,59
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGTFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAVIATPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEDGTHSIEGRTSIDGFLMYDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGITQTIELQLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTTGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRIATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQSLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPVQTMTIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAISGNYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140062,56740 Da
isoelectric point:5,40274
aromaticity:0,07448
hydropathy:-0,31777

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
YP_010070073.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_G50
[NCBI] 		2502303 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010070073.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_054917 [NCBI]
CDS location
range 148239 -> 152108
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACCTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCGGCAGGAACTTTTAATAGTGGACGCTGGAGAGCATTGCGTACTGATGCTAACTGGATCACAGTCTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCCGGTGAAGCTATTTCGGTTAACACTGCAGCTGGTAATGATATTACATTTACTTTACCATCTTCCCCAATTGACGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTCAGAGGTGAACAAGTACGATCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCACAGTTGGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAATTGCGACACCAGCGAATACTTATCAAGCGCAATCCAATGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCCGCACCGATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCACGGTGATATTATTAATTTCGTCGATTTGGACAAATTAAATCCACTTTATCATACAATTGTCACAACATACGATGAAACTACTTCAGTACAAGAAGATGGAACTCATTCTATTGAAGGCCGTACATCAATTGACGGTTTCTTGATGTATGATGATAATGAAAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGACAGTAAAGCACGTTTACGTATTATAACGACTAATTCAAACATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAATGGAATAACTCAAACAATTGAACTCCAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTAGTACAGCAAAACGTTCCAACCGTAGAAAGAGTTGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCGAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTAGCAATTACACCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACAACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCTGACGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGCGTTGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTAATGCAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGACAAGGTTCTGAATCATTATCAGGTATTGTAACCTTTGTATCTACTACAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTCGTTTCGCCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACACAAAAAGACATCGACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTATAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTAACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCCGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCTACACAGAGCTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCGTACGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCCGCTGACGCGAATTTATTAGATGGTCTAGATTCATCCCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTAAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGATCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGTACAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGTATCAATGGTACTGTAATGCCGATAAATGTTAACGCTTCAGGTTCTTTGAATGCGAATGGCGTTGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGTGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAATGCTTTTAGAGCAATAAGTGGTAATTATGGATTCTTTATTCGCAATGATGCTGCTAACACCTATTTTATGCTCACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACATCTGACTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACCGTAGGATTCTGGTCAATTGACATTAATGATTCAGCTACTTATAATCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGTGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACTCCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGCACATGGCAGAAAACCAAAAACTCCTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAACCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
e81a81fdac16ef916845ff71666c21de555ce00b56f2b56f7606d1e37e6f0ad1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2312
Evidence 0,2312
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Still something new to discover - new insights into E. coli phage diversity and taxonomy Korf,I.H.E., Adriaennsens,E., Dreiseikelmann,B., Kropinski,A., Nimtz,M., Meier-Kolthoff,J.P., Rohde,M., van Raaij,M. and Wittmann,J. 2019-05-17 — GenBank