Protein

Genbank accession
QBJ03766.1 [GenBank]
Protein name
minor structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MSGVNGLDTKYVICDQKGKVISALDCAGSTPFFDDTITNAIATNSDQSSDGTVNFPDNFLASRDLNANSKEWESTLEISVPISSPISKRCVLGNILMDYDEVTNKWYAYKIWSESNDHTDMSGHQVNKLQCINLLNWRLAKYIPTVKQISNINGKTAFQMLLAPSGWTLDWKAKSQMFGNIDFDGQNNAQSYLQTMLQTYDVEIEAYVKVDGKGITRKICTVVDKLGSKTPVQSFYYGRNITGITKTTIDSNLITKLWVRDANGKDISDINGGNGFLVDNEANDLYNGGNDDYLEGVVVSQTIKNHAALLTWGHQVLKVYNHPRANYEITVPSNYNIKLGDTVSVVDYTMTPAITITARAIQVEKSKANRNFKITFGEFIPIKVVTPNAIQALRNELNNNIDNLITQAKNDITLLTSTISTPDGTSFRQNEEYKRAIGKVFINSVNVTNYCTPQAFLWSLNNPNGTPNVDWINRWDNGAKGGYLQGVDEATFGDLQLNVDLDAISDTPQITIDEKPNNSWISSYNIQKIRYDASTKALYFIEGNKLHRTTDFGKTVTTMTINNIYTYDFATDGFTIYMMSETNGIVSFTFTNGSMIDITKVTAQKMALSQSYHFDYDASNNMAALISGKQILIVQDNSDDTNPFYYISDYSKLGISGNVSDFVLKYPNMYMVLDTHKVVGYNVINESPIFSHSFDYKSGMPTGNEVSISQDSNHFYIATNTTDSSASTEIVDVPAILRADPTAITEDPKVDLVPNAVEQAGFSSLNSKLAAIQNSGTVSFGYITDTHVSGYGNDTAHTVPALRHIKAFSYFAKNNSSVKMTIHNGDLDDGEAPIQDTMNDVDMAIEALQLSGKPFAVSQGNHDDNSGYARDFSGRLVSQVFDPQKSYEHRINKFSEYITLNKYDRTNMYGTYALTDKIDMIFLNSFDLPYNYAPDTVEDWVAHQRSCFMQQQISWLITTLQNIPDDHQVLIVTHCPIRNGAISNSSFVIKQRNGNLISGILEAFQNGTKFSQRGYTWSATYKTPLNTGVFTAEANVDFSGKPTKRIIAVLSGHTHEDKDNFHSNVLYTQTLDSLPGRCPTISRVMGESSEDAWDIITIDPSARKIYFSRYGAGVDREYNY
Physico‐chemical
properties
protein length:1120 AA
molecular weight: 124797,81600 Da
isoelectric point:5,16544
aromaticity:0,10268
hydropathy:-0,36696

Domains

Domains [InterPro]
IPR007119
65–371
IPR007119 IPR029052
IPR010572
153–379
IPR010572 IPR029052
IPR004843
780–1011
IPR004843
QBJ03766.1
1 1120
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage ATCCB
[NCBI] 		2510944 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBJ03766.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK504445 [NCBI]
CDS location
range 52469 -> 55831
strand -
CDS
ATGAGTGGAGTAAATGGACTAGACACGAAATATGTGATTTGCGACCAAAAAGGTAAGGTTATTTCAGCTCTCGATTGTGCTGGATCAACACCATTTTTTGATGATACAATTACAAATGCAATTGCGACAAATAGTGACCAATCGTCTGATGGAACAGTTAATTTCCCTGATAATTTTCTAGCAAGCCGTGACTTAAATGCAAACTCAAAAGAGTGGGAAAGTACGCTTGAAATTAGTGTGCCAATTAGTTCTCCTATTTCTAAGCGTTGTGTTTTAGGAAATATTTTAATGGACTATGATGAAGTTACTAATAAGTGGTATGCTTATAAAATATGGAGTGAAAGTAATGACCACACTGATATGTCAGGGCATCAAGTAAATAAATTACAATGCATTAATTTATTAAATTGGAGATTAGCAAAATATATTCCAACAGTAAAACAAATTAGTAATATCAATGGTAAGACGGCATTCCAAATGCTGTTAGCTCCATCTGGTTGGACATTAGATTGGAAAGCAAAATCGCAAATGTTCGGTAATATCGATTTTGATGGACAAAATAATGCGCAATCTTATTTACAAACAATGTTACAAACCTATGATGTTGAAATTGAAGCATATGTTAAGGTTGATGGAAAAGGCATTACACGTAAGATCTGTACAGTTGTTGATAAACTTGGTAGTAAGACACCTGTGCAAAGTTTTTACTATGGTCGAAATATCACAGGAATTACTAAAACAACTATTGATAGTAATTTAATTACTAAGTTATGGGTTCGTGATGCAAATGGTAAAGATATTTCTGATATTAATGGTGGAAATGGATTTTTAGTTGATAATGAAGCAAATGATTTGTACAATGGTGGAAATGATGATTATCTTGAGGGAGTTGTTGTTTCACAAACAATTAAAAATCACGCGGCCTTACTAACGTGGGGTCATCAAGTTCTAAAAGTTTATAATCATCCTCGGGCAAATTACGAAATTACAGTGCCATCAAATTATAATATTAAATTGGGTGATACAGTTTCTGTTGTTGATTACACAATGACTCCAGCAATTACGATTACGGCTCGTGCTATTCAAGTTGAAAAAAGTAAAGCAAATCGTAATTTTAAAATTACTTTTGGTGAATTTATACCTATTAAAGTTGTTACACCAAATGCAATTCAAGCACTGCGAAATGAATTAAATAACAATATTGACAATTTAATTACTCAAGCTAAAAATGATATTACTTTGTTAACATCAACTATTTCAACACCTGACGGAACTTCATTTAGACAAAATGAAGAATATAAGCGGGCAATTGGTAAAGTTTTCATTAATTCTGTAAATGTTACTAATTATTGTACTCCTCAAGCATTTTTGTGGTCACTAAATAACCCAAATGGAACTCCAAACGTCGATTGGATAAATAGATGGGATAATGGTGCAAAAGGTGGATATTTACAAGGTGTTGATGAAGCAACTTTTGGTGATTTACAACTAAATGTTGATTTGGATGCAATTTCAGATACTCCACAAATTACGATTGATGAAAAACCAAACAATTCTTGGATAAGTTCTTACAATATTCAAAAAATAAGATATGATGCATCTACAAAAGCCTTGTATTTCATTGAAGGAAATAAATTGCACCGCACTACAGATTTTGGTAAAACAGTAACAACGATGACGATTAATAATATTTACACTTATGATTTTGCCACTGATGGTTTTACTATTTATATGATGAGTGAAACAAACGGTATTGTTTCATTTACGTTCACAAATGGTTCAATGATTGATATTACGAAAGTTACAGCACAAAAAATGGCCTTATCTCAATCATACCATTTTGATTATGATGCATCGAATAATATGGCTGCATTAATTTCTGGAAAACAAATCCTTATCGTTCAAGATAATTCAGATGATACAAATCCATTTTACTATATTTCTGATTATAGCAAATTAGGAATTTCTGGAAATGTTAGCGATTTTGTTTTAAAATATCCCAATATGTATATGGTATTAGATACTCATAAAGTTGTTGGATATAATGTAATTAATGAATCTCCTATATTTTCACATTCTTTTGATTATAAATCAGGCATGCCAACCGGTAATGAAGTAAGTATTTCTCAAGATTCTAATCATTTTTATATTGCTACAAACACAACTGATTCTAGTGCGTCAACAGAAATTGTCGATGTACCAGCAATTTTAAGAGCTGACCCAACTGCAATTACTGAAGACCCTAAGGTTGATTTAGTTCCAAATGCAGTTGAACAAGCCGGTTTTTCATCACTAAATTCTAAATTAGCCGCAATTCAAAACAGTGGAACAGTTAGTTTTGGATATATTACCGATACTCATGTTTCGGGATATGGAAATGATACTGCGCACACGGTACCGGCACTTCGTCATATTAAAGCATTTTCTTATTTTGCTAAAAATAATAGTTCTGTGAAAATGACGATTCATAATGGCGATTTAGATGATGGTGAAGCACCTATTCAAGATACAATGAATGATGTTGATATGGCAATTGAAGCCTTACAATTAAGTGGAAAACCTTTTGCTGTTTCTCAAGGGAATCATGATGATAATTCCGGTTATGCACGAGATTTTAGTGGTAGATTAGTTTCACAAGTGTTTGACCCACAAAAATCTTATGAACATCGTATTAATAAGTTTAGTGAATATATTACACTAAATAAATACGATAGAACAAATATGTATGGAACTTATGCATTAACAGATAAAATTGATATGATTTTCTTAAACAGTTTTGATTTGCCATATAATTATGCACCTGATACAGTTGAAGATTGGGTTGCTCACCAACGTTCTTGTTTTATGCAACAACAAATTAGTTGGCTAATTACTACATTACAAAATATTCCAGACGACCATCAAGTCTTAATTGTTACACATTGTCCAATTCGTAATGGAGCAATTTCTAATAGCTCGTTTGTTATTAAGCAACGCAATGGCAATTTAATTTCTGGAATTTTGGAAGCATTTCAAAACGGAACTAAATTTAGTCAACGTGGATATACTTGGTCAGCAACTTATAAAACCCCGTTAAACACAGGTGTCTTTACTGCTGAAGCAAACGTTGATTTTTCTGGAAAACCAACTAAAAGAATTATTGCTGTTTTAAGTGGGCACACTCATGAAGACAAAGATAATTTTCACAGCAATGTTTTATACACACAAACATTGGATAGCTTACCAGGACGTTGCCCAACTATTTCTCGAGTTATGGGGGAAAGCTCAGAAGATGCGTGGGATATTATTACAATTGACCCATCAGCAAGAAAAATTTATTTTAGTCGATATGGTGCTGGTGTAGATAGAGAATATAACTATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
9107e8b522143d87877970ece1c25ada0cf7e04b9468bde230c6593b65bd2b4d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2285
Evidence 0,2285
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation of virulent Lactobacillus brevis phages Feyereisen,M., Mahony,J., O'Sullivan,T. and van Sinderen,D. 2019-04-26 — GenBank